Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0696
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0696, 542 aa
1>>>pF1KSDA0696 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8749+/-0.00133; mu= 9.9940+/- 0.077
mean_var=137.4051+/-29.987, 0's: 0 Z-trim(104.2): 177 B-trim: 299 in 1/51
Lambda= 0.109414
statistics sampled from 7565 (7780) to 7565 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 542) 3696 596.1 3.5e-170
CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 529) 3361 543.2 2.9e-154
CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 ( 508) 3359 542.9 3.5e-154
CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 569) 3049 494.0 2e-139
CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 605) 3049 494.0 2.1e-139
CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 ( 579) 3045 493.3 3.2e-139
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 ( 415) 434 81.1 2.9e-15
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 589) 411 77.6 4.7e-14
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 627) 411 77.6 4.9e-14
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 707) 411 77.6 5.4e-14
CCDS75680.1 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7 ( 248) 394 74.6 1.6e-13
CCDS5925.2 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7 ( 376) 394 74.7 2.1e-13
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9 ( 334) 370 70.9 2.7e-12
CCDS3108.1 COPB2 gene_id:9276|Hs108|chr3 ( 906) 369 71.1 6.4e-12
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10 ( 800) 358 69.3 1.9e-11
CCDS11291.1 NLE1 gene_id:54475|Hs108|chr17 ( 485) 348 67.5 4e-11
CCDS45619.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17 ( 752) 348 67.7 5.5e-11
CCDS11199.3 FBXW10 gene_id:10517|Hs108|chr17 (1052) 349 68.0 6.4e-11
CCDS73996.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17 ( 714) 346 67.4 6.6e-11
>>CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 3696 init1: 3696 opt: 3696 Z-score: 3168.8 bits: 596.1 E(32554): 3.5e-170
Smith-Waterman score: 3696; 100.0% identity (100.0% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SR
::
CCDS34 SR
>>CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (529 aa)
initn: 3441 init1: 3361 opt: 3361 Z-score: 2883.1 bits: 543.2 E(32554): 2.9e-154
Smith-Waterman score: 3408; 94.3% identity (95.8% similar) in 543 aa overlap (1-542:1-529)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCL-QISNGTSSVIV
::::::::::::::: . ...:.. . :. : :::::::::::
CCDS47 MEPDSVIEDKTIELMNT----------SVMEDQNE----DESPKKNTLWQISNGTSSVIV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSEN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD STVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTY
470 480 490 500 510 520
540
pF1KSD ISR
:::
CCDS47 ISR
>>CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5 (508 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 2881.6 bits: 542.9 E(32554): 3.5e-154
Smith-Waterman score: 3370; 93.7% identity (93.7% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-508)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
::::::::::::::: :::::::::::
CCDS47 MEPDSVIEDKTIELM----------------------------------ISNGTSSVIVS
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
450 460 470 480 490 500
pF1KSD SR
::
CCDS47 SR
>>CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 (569 aa)
initn: 2160 init1: 2160 opt: 3049 Z-score: 2616.5 bits: 494.0 E(32554): 2e-139
Smith-Waterman score: 3049; 84.2% identity (93.0% similar) in 530 aa overlap (20-542:41-569)
10 20 30 40
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLV---ESMC-ALSCLQSMPSV
:. . .:: : :..: : . ... :
CCDS75 KALKFMNSSEREDCNNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCV
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RCLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHG
...:::::.:: ..: ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 AKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHG
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KSD HINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWK
::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.:::::
CCDS75 HINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNW
:::::::::: ::.::.::::: ::::::.: :: :::::::.::::::::::::::::
CCDS75 KLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNW
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KSD RCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSV
:::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::
CCDS75 RCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIA
::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.:::::::::::
CCDS75 LCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIA
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KSD VWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHK
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS75 VWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHK
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KSD RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVP
::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS75 KIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLN-D
500 510 520 530 540
530 540
pF1KSD PSAQNET-RSPSRTYTYISR
:.:: : ::::::::::::
CCDS75 PAAQAEPPRSPSRTYTYISR
550 560
>>CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10 (605 aa)
initn: 2304 init1: 2160 opt: 3049 Z-score: 2616.2 bits: 494.0 E(32554): 2.1e-139
Smith-Waterman score: 3049; 84.2% identity (93.0% similar) in 530 aa overlap (20-542:77-605)
10 20 30 40
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLV---ESMC-ALSCLQSMPSV
:. . .:: : :..: : . ... :
CCDS75 ALTAFQNSSEREDCNNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCV
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RCLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHG
...:::::.:: ..: ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 AKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHG
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KSD HINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWK
::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.:::::
CCDS75 HINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWK
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNW
:::::::::: ::.::.::::: ::::::.: :: :::::::.::::::::::::::::
CCDS75 KLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNW
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KSD RCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSV
:::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::
CCDS75 RCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSV
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIA
::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.:::::::::::
CCDS75 LCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIA
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KSD VWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHK
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS75 VWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHK
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KSD RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVP
::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS75 KIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLN-D
530 540 550 560 570 580
530 540
pF1KSD PSAQNET-RSPSRTYTYISR
:.:: : ::::::::::::
CCDS75 PAAQAEPPRSPSRTYTYISR
590 600
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10 20 30
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESM----------------------CALS
.:...:....:::.::::::::..:..:: ::
CCDS73 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQTYNSCARL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KSD CLQ---------SMPSVRCL---QISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSE
::. .: . :. ...:::::.:: ..: ..:.:::.::.:::.::::
CCDS73 CLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSE
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD SDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLC
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::
CCDS73 SDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLC
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD AAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNS
::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: ::::::.: :: ::::
CCDS73 AAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIK
:::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::
CCDS73 FYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIK
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270 280 290 300 310 320
pF1KSD IWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAV
::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: :::
CCDS73 IWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAV
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330 340 350 360 370 380
pF1KSD LHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDR
:::::.::.::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDR
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD TIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHE
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD ELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEF
::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEF
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510 520 530 540
pF1KSD QIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNET-RSPSRTYTYISR
::.::::::::::::::: :.:: : ::::::::::::
CCDS73 QIVSSSHDDTILIWDFLN-DPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
550 560 570
>>CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 (415 aa)
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220 230 240 250 260
pF1KSD IQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDD---EKIISGLRDNSIKIWDKTS
:: . ... .:: .: :.. :.:. .
CCDS24 FITGSYDRTCKLWDTASGEELNTLEGHRNVVYAIAFNNPYGDKIATGSFDKTCKLWSVET
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LECLKVLTGHTGSVLCLQYDER--VIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLR
.: ... :::. ..::... . ...::: :.:...::...:: . :: :. .. :
CCDS24 GKCYHTFRGHTAEIVCLSFNPQSTLVATGSMDTTAKLWDIQNGEEVYTLRGHSAEIISLS
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KSD F--SNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDF--DDKYIVSASGDR
: :. ..: : :....::: .. .. .:.:: : .. ..: : . :...: :.
CCDS24 FNTSGDRIITGSFDHTVVVWDADTGRKVN---ILIGHCAEISSASFNWDCSLILTGSMDK
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD TIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGI--ACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEG
: :.:.... . : ::.:: : .:..: .:....:.:.: :... :. :::
CCDS24 TCKLWDATNGKCVATLTGHDDEILDSCFDYTGKLIATASADGTARIFSAATRKCIAKLEG
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490
pF1KSD HEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQ
:: . : :. . ....:. : ..:: :.. ::..: :. ..:
CCDS24 HEGEISKISFNPQGNHLLTGSSDKTARIWDAQTG---------QCLQVLEGHTDEIFSCA
350 360 370 380 390
500 510 520 530 540
pF1KSD FDEFQ---IISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
:. .. .:..:.:.: ::
CCDS24 FN-YKGNIVITGSKDNTCRIWR
400 410
>>CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (589 aa)
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pF1KSD CLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGH
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CCDS34 TFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSCEPTQVKH
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110 120 130 140 150 160
pF1KSD INSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKK
. . ..:..:::::. ::.. .: .::.:. ..: : .:. : :...: :
CCDS34 MMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW-RILAEDNL---
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL-FKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRC
::. ...: :. : .: : . : .: .: . . . :..:::
CCDS34 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLC
:. . .. ...... . :::. ..:.:: ::..:.:. .. .::..:.::::.:
CCDS34 GELKSPKVL-KGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLVGHTGGVWS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVW
:. . .:..::.: :..::...::: ..:: :. .: ... . .:. :.: .. ::
CCDS34 SQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGSRDATLRVW
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD DMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRG
:. .. . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:::. : ..::.::
CCDS34 DIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLHTLQGHTNR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKI
. ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :. ... .. .::: :. .
CCDS34 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNV
:.::.... ::.:: .:.. : :::.. .:.:: : :. .::.
CCDS34 KIWDIKTGQ---------CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTG
490 500 510 520 530
530 540
pF1KSD PPSAQNETRSPSRTYTYISR
CCDS34 EFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDMK
540 550 560 570 580
>>CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (627 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KSD CLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGH
.:.:..:: ... ...::. : :
CCDS37 TFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSCEPTQVKH
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110 120 130 140 150 160
pF1KSD INSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKK
. . ..:..:::::. ::.. .: .::.:. ..: : .:. : :...: :
CCDS37 MMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW-RILAEDNL---
190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL-FKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRC
::. ...: :. : .: : . : .: .: . . . :..:::
CCDS37 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLC
:. . .. ...... . :::. ..:.:: ::..:.:. .. .::..:.::::.:
CCDS37 GELKSPKVL-KGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLVGHTGGVWS
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVW
:. . .:..::.: :..::...::: ..:: :. .: ... . .:. :.: .. ::
CCDS37 SQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGSRDATLRVW
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD DMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRG
:. .. . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:::. : ..::.::
CCDS37 DIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLHTLQGHTNR
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKI
. ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :. ... .. .::: :. .
CCDS37 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNV
:.::.... ::.:: .:.. : :::.. .:.:: : :. .::.
CCDS37 KIWDIKTGQ---------CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTG
530 540 550 560 570
530 540
pF1KSD PPSAQNETRSPSRTYTYISR
CCDS37 EFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDMK
580 590 600 610 620
>>CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 (707 aa)
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Smith-Waterman score: 848; 32.0% identity (64.9% similar) in 447 aa overlap (77-519:238-651)
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CCDS37 TFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSCEPTQVKH
210 220 230 240 250 260
110 120 130 140 150 160
pF1KSD INSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKK
. . ..:..:::::. ::.. .: .::.:. ..: : .:. : :...: :
CCDS37 MMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW-RILAEDNL---
270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL-FKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRC
::. ...: :. : .: : . : .: .: . . . :..:::
CCDS37 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLC
:. . .. ...... . :::. ..:.:: ::..:.:. .. .::..:.::::.:
CCDS37 GELKSPKVL-KGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLVGHTGGVWS
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVW
:. . .:..::.: :..::...::: ..:: :. .: ... . .:. :.: .. ::
CCDS37 SQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGSRDATLRVW
430 440 450 460 470 480
350 360 370 380 390 400
pF1KSD DMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRG
:. .. . .::.:: ::: :..: . .::.. : .:::. : ..::.::
CCDS37 DIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLHTLQGHTNR
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKI
. ::. ::::: :..::.::.: : :...: ::. :. ... .. .::: :. .
CCDS37 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
550 560 570 580 590 600
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNV
:.::.... ::.:: .:.. : :::.. .:.:: : :. .::.
CCDS37 KIWDIKTGQ---------CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTG
610 620 630 640 650
530 540
pF1KSD PPSAQNETRSPSRTYTYISR
CCDS37 EFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDMK
660 670 680 690 700
542 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:44:13 2016 done: Thu Nov 3 02:44:13 2016
Total Scan time: 2.120 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]