Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0724, 963 aa
1>>>pF1KSDA0724 963 - 963 aa - 963 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8067+/-0.00042; mu= 18.4818+/- 0.026
mean_var=76.1942+/-15.464, 0's: 0 Z-trim(111.7): 21 B-trim: 15 in 1/52
Lambda= 0.146931
statistics sampled from 20387 (20403) to 20387 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 10.960
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055467 (OMIM: 610411) importin-13 [Homo sapiens ( 963) 6374 1361.5 0
NP_036602 (OMIM: 610032) transportin-3 isoform 1 [ ( 923) 506 117.6 3e-25
NP_001177957 (OMIM: 610032) transportin-3 isoform ( 859) 494 115.0 1.7e-24
XP_011514291 (OMIM: 610032) PREDICTED: transportin ( 857) 371 89.0 1.2e-16
>>NP_055467 (OMIM: 610411) importin-13 [Homo sapiens] (963 aa)
initn: 6374 init1: 6374 opt: 6374 Z-score: 7296.4 bits: 1361.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6374; 100.0% identity (100.0% similar) in 963 aa overlap (1-963:1-963)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERREEQPGAAGAGAAPALDFTVENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MERREEQPGAAGAGAAPALDFTVENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQDCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQDCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALIQAAFAALQDSELFDSSVEAIVNAISQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQEQLRQAVQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALIQAAFAALQDSELFDSSVEAIVNAISQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQEQLRQAVQNG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHYPVNETTSSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHYPVNETTSSLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYGFWSSDEKEQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYGFWSSDEKEQF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RIYRVDISDTLMYVYEMLGAELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEALLYGFQSIAETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RIYRVDISDTLMYVYEMLGAELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEALLYGFQSIAETI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DVNYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINSVLPLVLHALGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DVNYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINSVLPLVLHALGN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMKQIHKTSQCMWLMQALGFLLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMKQIHKTSQCMWLMQALGFLLSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVHILGLLSNLFTTLDISHHEDDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVHILGLLSNLFTTLDISHHEDDH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EGPELRKLPVPQGPNPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLNDAQVVEAVCAIFEKSVKTLLDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EGPELRKLPVPQGPNPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLNDAQVVEAVCAIFEKSVKTLLDDF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD APMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEPAHFPPIEALFLLVTSVTLTLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEPAHFPPIEALFLLVTSVTLTLFQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD QGPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QGPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRMLLIAVLEAIGGQASRSLMDCFADILFALNKHCFSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRMLLIAVLEAIGGQASRSLMDCFADILFALNKHCFSLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SMWIKEALQPPGFPSARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMWIKEALQPPGFPSARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYT
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ADY
:::
NP_055 ADY
>>NP_036602 (OMIM: 610032) transportin-3 isoform 1 [Homo (923 aa)
initn: 404 init1: 249 opt: 506 Z-score: 574.2 bits: 117.6 E(85289): 3e-25
Smith-Waterman score: 772; 24.0% identity (56.3% similar) in 977 aa overlap (14-952:3-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERREEQPGAAGAGAAPALDFTVENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWH
:: :.:.. : .:.. ::.::. .:. :. :: . : : .::.
NP_036 MEGAKPTLQL----VYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVL
.: :::: . : ::.:.....::. . ..:::.. ::. .:.:.: . . : ...
NP_036 ISDQLLQIRQDVESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTS
:.: .:.:.:::.: : .: : .:. .. . . . :::.::::::: ..
NP_036 TQLALAIADLALQM-P-SWKGCVQTLVEKYSNDVTSLP------FLLEILTVLPEEVHSR
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD --RLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQD
:. :. . .:: ..: :: ... .. . .::..:..:: .: : ..
NP_036 SLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDEKMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CEA---LIQAAFAALQD----SELFDSSVEAIVNAI-SQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQ
: :. : .::. :.: ... . . .:. . ... . ..:. :: :.
NP_036 FMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVETNLPLAMQLFQGVLTLE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EQLRQAVQNGDMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHY
..:: :.. . ::: . : :. . .. . . : ......:.: : .:
NP_036 TAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLLICAGHP-QY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVNETTSSLTLTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYG
: : ....::: : . . . . : : . ... .:. .: .. :. :.: :
NP_036 EVVE----ISFNFWYRLGEHLYKTNDE---VIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHE-G
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KSD FWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLGA-ELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEAL
.: ..: .:. .:: . . ..:. : ...::. : . .. : :. :::.
NP_036 V--PEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKE----GNPP--WEVTEAV
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LYGFQSIAETIDV-NYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMIN
:. . .::...: : .: : :.. .. . : . .: .:: . .: ...
NP_036 LFIMAAIAKSVDPENNPTLVEVLEGVVRLPETVHTAVRYTSIELVGEMSEVVDRNPQFLD
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SVLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMKQIHKTSQCM
:: ....: . :. ........:: :. . . ... .... : . . . .
NP_036 PVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARS-LDSFLLSPEAAV
510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KSD WLMQALGFLLSALQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVHILGLLSNLF
:... ...:. : ...: . : : : .. :.:: . .::: :. :.
NP_036 GLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQ--EPSN--------GISSDPT
560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KSD TTLDISHHEDDHEGPELRKLPVPQGP-NPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLNDAQVVEAVCA
. :: : .: : .: .: :.:... .....:.: : ..:: :
NP_036 VFLDRLAVIFRHTNP-----IVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCR
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KSD IFEKSVKTLLDDFAPMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEPAHFPPIEAL
.. .:. . : .. : .. .: . .. : : :: .. : . . .
NP_036 CLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDM
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KSD FLLVTSVTLTLFQQ--GPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLA
. . :. :..: : ..::: ::....: .. ..:.: .: .. : ..: :. .
NP_036 LQALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQV-VIPILQWAIAS
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LKFPEAPTVKASCGF--FTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRM---LLIAVLEAIGGQASRS
. . :.:. : . : . : :.. .:: .. :. :.. .: : .
NP_036 TTLDHR---DANCSVMRFLRDLIHTG----VANDHEEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQ
790 800 810 820 830
890 900 910 920
pF1KSD LMD--CF----------ADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFP------SARLSPEQ
:. :: :..:. . . . :....:. :.: .. .. .:
NP_036 LLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLK--GLPKETTVGAVTVTHKQ
840 850 860 870 880 890
930 940 950 960
pF1KSD KDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYTADY
: .:. . :. : ...:: : :
NP_036 LTDFHKQVTSAEECKQ-VCWALRDFTRLFR
900 910 920
>>NP_001177957 (OMIM: 610032) transportin-3 isoform 2 [H (859 aa)
initn: 404 init1: 249 opt: 494 Z-score: 561.0 bits: 115.0 E(85289): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 601; 23.7% identity (53.1% similar) in 976 aa overlap (14-952:3-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERREEQPGAAGAGAAPALDFTVENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWH
:: :.:.. : .:.. ::.::. .:. :. :: . : : .::.
NP_001 MEGAKPTLQL----VYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVL
.: :::: . : ::.:.....::. . ..:::.. ::. .:.:.: . . : ...
NP_001 ISDQLLQIRQDVESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTS
:.: .:.:.:::.: : .: : .:. .. . . . :::.::::::: ..
NP_001 TQLALAIADLALQM-P-SWKGCVQTLVEKYSNDVTSLP------FLLEILTVLPEEVHSR
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD --RLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQD
:. :. . .:: ..: :: ... .. . .::..:..:: .: : ..
NP_001 SLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDEKMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CEA---LIQAAFAALQD----SELFDSSVEAIVNAI-SQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQ
: :. : .::. :.: ... . . .:. . ... . ..:. :: :.
NP_001 FMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVETNLPLAMQLFQGVLTLE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EQLRQAVQNGDMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHY
..:: :.. . ::: . : :. . .. . . : ......:.: : .:
NP_001 TAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLLICAGHP-QY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVNETTSSLTLTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYG
: : ....::: : . . . . : : . ... .:. .: .. :. :.: :
NP_001 EVVE----ISFNFWYRLGEHLYKTNDE---VIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHE-G
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KSD FWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLGA-ELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEAL
.: ..: .:. .:: . . ..:. : ...::. : . .. : :. :::.
NP_001 V--PEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKE----GNPP--WEVTEAV
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LYGFQSIAETIDVNYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINS
:. . .::...: . . : :. .. . :.: .:: : .. .
NP_001 LFIMAAIAKSVDPENN---PTLVEVLEGV----VRLPETV-------------HTAVRYT
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMKQIHKTSQCMW
. :: :.: . . .. : .
NP_001 SIELV------GEMS----------------------------------EVVDRNPQ--F
490
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LMQALGFLLSALQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVHILGLLSNLFT
: :: .:. : ...: . : : : .. :.:: . .::: :. :. .
NP_001 LGTAL--VLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQ--EPSN--------GISSDPTV
500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KSD TLDISHHEDDHEGPELRKLPVPQGP-NPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLNDAQVVEAVCAI
:: : .: : .: .: :.:... .....:.: : ..:: :
NP_001 FLDRLAVIFRHTNP-----IVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRC
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KSD FEKSVKTLLDDFAPMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEPAHFPPIEALF
.. .:. . : .. : .. .: . .. : : :: .. : . . ..
NP_001 LRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDML
610 620 630 640 650 660
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LLVTSVTLTLFQQ--GPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLAL
. :. :..: : ..::: ::....: .. ..:.: .: .. : ..: :. .
NP_001 QALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQV-VIPILQWAIAST
670 680 690 700 710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KFPEAPTVKASCGF--FTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRM---LLIAVLEAIGGQASRSL
. . :.:. : . : . : :.. .:: .. :. :.. .: : .:
NP_001 TLDHR---DANCSVMRFLRDLIHTG----VANDHEEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQL
730 740 750 760 770
890 900 910 920
pF1KSD MD--CF----------ADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFP------SARLSPEQK
. :: :..:. . . . :....:. :.: .. .. .:
NP_001 LHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLK--GLPKETTVGAVTVTHKQL
780 790 800 810 820 830
930 940 950 960
pF1KSD DTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYTADY
: .:. . :. : ...:: : :
NP_001 TDFHKQVTSAEECKQ-VCWALRDFTRLFR
840 850
>>XP_011514291 (OMIM: 610032) PREDICTED: transportin-3 i (857 aa)
initn: 270 init1: 115 opt: 371 Z-score: 420.1 bits: 89.0 E(85289): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 637; 22.8% identity (55.2% similar) in 909 aa overlap (82-952:1-857)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AQVSPQAWHFSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITR
...::. . ..:::.. ::. .:.:.:
XP_011 MKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQN
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD FASGSKIVLTRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLT
. . : ...:.: .:.:.:::.: : .: : .:. .. . . . :::.::
XP_011 LKDLSPVIVTQLALAIADLALQM-P-SWKGCVQTLVEKYSNDVTSLP------FLLEILT
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220
pF1KSD VLPEEFQTS--RLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSW
::::: .. :. :. . .:: ..: :: ... .. . .::..:..::
XP_011 VLPEEVHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDEKMLMKVFRCLGSW
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VQLEVPLQDCEA---LIQAAFAALQD----SELFDSSVEAIVNAI-SQPDAQRYVNTLLK
.: : .. : :. : .::. :.: ... . . .:. . ... . ..
XP_011 FNLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVETNLPLAMQ
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LIPLVLGLQEQLRQAVQNGDMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIM
:. :: :. ..:: :.. . ::: . : :. . .. . . : .....
XP_011 LFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLL
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KSD FCTGIPGHYPVNETTSSLTLTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKA
.:.: : .: : : ....::: : . . . . : : . ... .:. .: ..
XP_011 ICAGHP-QYEVVE----ISFNFWYRLGEHLYKTNDE---VIHGIFKAYIQRLLHALARHC
270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QFPSDEEYGFWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLGA-ELLSNLYDKLGRLLTSSEEP
:. :.: : .: ..: .:. .:: . . ..:. : ...::. : .:
XP_011 QLEPDHE-GV--PEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTL------KEGN
320 330 340 350 360
470 480 490 500 510
pF1KSD YSWQHTEALLYGFQSIAETIDV-NYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEW
:. :::.:. . .::...: : .: : :.. .. . : . .: .::
XP_011 PPWEVTEAVLFIMAAIAKSVDPENNPTLVEVLEGVVRLPETVHTAVRYTSIELVGEMSEV
370 380 390 400 410 420
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LADHPVMINSVLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMK
. .: ... :: ....: . :. ........:: :. . . ... .... : .
XP_011 VDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARS-LDS
430 440 450 460 470 480
580 590 600 610 620 630
pF1KSD QIHKTSQCMWLMQALGFLLSALQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVH
. . . :... ...:. : ...: . : : : .. :.:: . .:::
XP_011 FLLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQ--EPSN------
490 500 510 520 530
640 650 660 670 680 690
pF1KSD ILGLLSNLFTTLDISHHEDDHEGPELRKLPVPQGP-NPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLND
:. :. . :: : .: : .: .: :.:... .....:.: :
XP_011 --GISSDPTVFLDRLAVIFRHTNP-----IVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRAD
540 550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AQVVEAVCAIFEKSVKTLLDDFAPMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEP
..:: : .. .:. . : .. : .. .: . .. : : :: .. :
XP_011 NRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEE
590 600 610 620 630 640
760 770 780 790 800 810
pF1KSD AHFPPIEALFLLVTSVTLTLFQQ--GPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVK
. . .. . :. :..: : ..::: ::....: .. ..:.: .: .. :
XP_011 GCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQV-VI
650 660 670 680 690 700
820 830 840 850 860 870
pF1KSD AVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGF--FTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRM---LLIAVLE
..: :. . . . :.:. : . : . : :.. .:: .. :. :..
XP_011 PILQWAIASTTLDHRD---ANCSVMRFLRDLIHTG----VANDHEEDFELRKELIGQVMN
710 720 730 740 750 760
880 890 900 910
pF1KSD AIGGQASRSLMD--CF----------ADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFP-----
.: : .:. :: :..:. . . . :....:. :.:
XP_011 QLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLK--GLPKETTV
770 780 790 800 810
920 930 940 950 960
pF1KSD -SARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYTADY
.. .. .: : .:. . :. : ...:: : :
XP_011 GAVTVTHKQLTDFHKQVTSAEECKQ-VCWALRDFTRLFR
820 830 840 850
963 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:49:17 2016 done: Thu Nov 3 02:49:19 2016
Total Scan time: 10.960 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]