FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0742, 1321 aa 1>>>pF1KSDA0742 1321 - 1321 aa - 1321 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3206+/-0.00106; mu= 13.5864+/- 0.064 mean_var=119.7928+/-23.195, 0's: 0 Z-trim(107.4): 21 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.117181 statistics sampled from 9572 (9582) to 9572 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 5.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321) 8980 1530.3 0 CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761) 2173 379.6 4.2e-104 CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2358) 1509 267.4 3.3e-70 CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2540) 1509 267.4 3.5e-70 CCDS6023.1 HR gene_id:55806|Hs108|chr8 (1134) 397 79.2 6.9e-14 >>CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321 aa) initn: 8980 init1: 8980 opt: 8980 Z-score: 8203.7 bits: 1530.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8980; 99.9% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD SHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIH 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 KNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNK 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KSD GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KSD LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS19 AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD P : CCDS19 P >>CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761 aa) initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1982.5 bits: 379.6 E(32554): 4.2e-104 Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:871-1760) 480 490 500 510 520 530 pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: CCDS34 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ 850 860 870 880 890 900 540 550 560 570 580 590 pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. CCDS34 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS 910 920 930 940 950 960 600 610 620 630 640 650 pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: CCDS34 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW 970 980 990 1000 1010 1020 660 670 680 690 700 pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: CCDS34 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 710 720 730 740 750 760 pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: CCDS34 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT 1090 1100 1110 1120 1130 1140 770 780 790 800 pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. CCDS34 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 1150 1160 1170 1180 1190 1200 810 820 830 840 850 pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . CCDS34 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 1210 1220 1230 1240 1250 1260 860 870 880 890 pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: CCDS34 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 900 910 920 930 940 pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : CCDS34 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1330 1340 1350 1360 1370 1380 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. CCDS34 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. CCDS34 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH ::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. :::::: CCDS34 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK ::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: .:. .::::::::::::::: CCDS34 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV :.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::. CCDS34 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: CCDS34 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1310 1320 pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::. ::: ::.... CCDS34 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS 1750 1760 >-- initn: 436 init1: 142 opt: 418 Z-score: 379.0 bits: 82.9 E(32554): 8.6e-15 Smith-Waterman score: 418; 25.3% identity (55.5% similar) in 510 aa overlap (13-484:9-503) 10 20 30 40 50 pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWP--------WLSGTIRAVS ::.:.: : : ....: .. . .. : : .::.::.: CCDS34 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KSD HTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RI .. .:: . ::::: .:... :..:.. ..:.: .:: : :..: . . : CCDS34 --GAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSI 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KSD VQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIV .::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. ::: . :. .: ..: : .. . CCDS34 AQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAAL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KSD SKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCE . .::: . . . .: .. : .::::. . :. ..: . . .. ..:. CCDS34 RETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVT 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KSD EIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPS : .: ::: :::: .. :: . .... . ::: :.... .. .:... . :: : CCDS34 ESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KSD MC-PVQSVPTTVFKEILL----GCTAATPPSKDPRQQSTP---QAANSPPNLGAKIPQGC : :... :. : :. : : .. : : :..::. . .:: CCDS34 GCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPS--TFVPQI- 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KSD HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT .... . : .. ... .: :.. :. .::. . : :. CCDS34 -NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYST--ATGQTPLAPEVGGA-----E 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KSD NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSD : . . ::.: :.... . : .:. ..:.. :: :: . : . CCDS34 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KSD VSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNN :. ...: .. :.. ::.. ..:: ... : CCDS34 SRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDL 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KSD KIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQK CCDS34 SKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKP 530 540 550 560 570 580 >>CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2358 aa) initn: 2315 init1: 756 opt: 1509 Z-score: 1373.9 bits: 267.4 E(32554): 3.3e-70 Smith-Waterman score: 2598; 41.7% identity (71.3% similar) in 1027 aa overlap (363-1315:1341-2349) 340 350 360 370 380 pF1KSD IPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEP------ .:.. ..:....:.:. . ..: CCDS60 QYKSSNASETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICST--INKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL 1320 1330 1340 1350 1360 390 400 410 420 430 440 pF1KSD -KGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKEC---LPTKASSKAELEIANPPELQKHLEH :. :. . . . :..:. .... . : : : ...:: . . . ..:... CCDS60 KKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDSKIIVDKYVKD 1370 1380 1390 1400 1410 1420 450 460 470 480 490 pF1KSD APSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGK----KVEPSALACRSQN-LKESSVKVDNE--- .. ... ..:: .. : . : .:. ..:: :.. . ..... CCDS60 DKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKP 1430 1440 1450 1460 1470 1480 500 510 520 530 540 pF1KSD ------SCCSRSNNKIQNAPSR---KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPK : ::. :.:. . .::: : :.:::.:.::.:.::::: .: .: : CCDS60 NGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQK 1490 1500 1510 1520 1530 1540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD CRECRLDSLRKDK-EQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAIGLWL :::::: .:. : :. :::::::..::::.:.:.::.:..:: .:..::.::..:: CCDS60 CRECRL--IRSKKGEEPAHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWT 1550 1560 1570 1580 1590 1600 610 620 630 640 650 660 pF1KSD PLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVREMCDV . . .:..:.:::: :::.:::.: ::: :.: .. ..::::::.:::::::. CCDS60 HENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDA 1610 1620 1630 1640 1650 1660 670 680 690 700 710 720 pF1KSD CDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQ :..:.::.:::: .::: ::.:::. :... .. . ..:.::::.: :. ..::::: CCDS60 CEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDK--ELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQ 1670 1680 1690 1700 1710 1720 730 740 750 760 770 780 pF1KSD IIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQ-FKLFSKPASK--EDLKQTSLA-GEKP ::::..: :. : .:..: :.:::..: :.:.: ... . :. . .. :. : ..: CCDS60 IIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQVLQNVLNHSNKI 1730 1740 1750 1760 1770 1780 790 800 810 820 830 pF1KSD TL--GAVLQQN-PSVLEPAAVGGEAASKPAGS-MKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKEN .: ::: : : :: . . .:. : . : : :::.:::::. .. .:. CCDS60 SLCMPESQQQNTPPKSEKN--GGSSPESDVGTDNKLTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEK 1790 1800 1810 1820 1830 1840 840 850 860 870 880 890 pF1KSD KEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGK- ::.. :.:.:: .... . .. :. .:.... ::.::....:: CCDS60 KENKEL--TLENQIK-----EEREQDNSESPNGRTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKL 1850 1860 1870 1880 1890 900 910 920 930 pF1KSD ----TENGL----------------KNTPKILDDIFASLVQNKT----TSDLSKRPQGLT :. :. .. :.:::::.::.:.:: :: .. .:. : CCDS60 RVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPE-LK 1900 1910 1920 1930 1940 1950 940 950 960 970 980 pF1KSD IKP--SILGF---------DTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSG .: ::.. : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..::: CCDS60 EEPEESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSG 1960 1970 1980 1990 2000 2010 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD VHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-E ::.:.: ::: ::. .::....::.::. . ::..:.: .::::::.: .: ::.. : CCDS60 VHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCK-DSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGE 2020 2030 2040 2050 2060 2070 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KSD PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPK .:::::::: ::::. :::.:..::. ..::::: .::.::::.::..::::::::. 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CCDS60 LCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDI 2140 2150 2160 2170 2180 2190 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD TIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSL ::. ...: :::::::::.::..::::::.:.:.::: : .::::.:::::....: CCDS60 LRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKL 2200 2210 2220 2230 2240 2250 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD RKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQ :.:: .::::. ...:::::.. .:::: :::.:..:::.:.::::::::. . : ::: CCDS60 RQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQ 2260 2270 2280 2290 2300 2310 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD EFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP :.: :.. . :..:::::::..:::::. : :: : CCDS60 ELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN 2320 2330 2340 2350 >>CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2540 aa) initn: 2574 init1: 756 opt: 1509 Z-score: 1373.4 bits: 267.4 E(32554): 3.5e-70 Smith-Waterman score: 2598; 41.7% identity (71.3% similar) in 1027 aa overlap (363-1315:1523-2531) 340 350 360 370 380 pF1KSD IPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEP------ .:.. ..:....:.:. . ..: CCDS41 QYKSSNASETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICST--INKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL 1500 1510 1520 1530 1540 1550 390 400 410 420 430 440 pF1KSD -KGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKEC---LPTKASSKAELEIANPPELQKHLEH :. :. . . . :..:. .... . : : : ...:: . . . ..:... CCDS41 KKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDSKIIVDKYVKD 1560 1570 1580 1590 1600 1610 450 460 470 480 490 pF1KSD APSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGK----KVEPSALACRSQN-LKESSVKVDNE--- .. ... ..:: .. : . : .:. ..:: :.. . ..... CCDS41 DKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKP 1620 1630 1640 1650 1660 1670 500 510 520 530 540 pF1KSD ------SCCSRSNNKIQNAPSR---KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPK : ::. :.:. . .::: : :.:::.:.::.:.::::: .: .: : CCDS41 NGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQK 1680 1690 1700 1710 1720 1730 550 560 570 580 590 600 pF1KSD CRECRLDSLRKDK-EQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAIGLWL :::::: .:. : :. :::::::..::::.:.:.::.:..:: .:..::.::..:: CCDS41 CRECRL--IRSKKGEEPAHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWT 1740 1750 1760 1770 1780 610 620 630 640 650 660 pF1KSD PLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVREMCDV . . .:..:.:::: :::.:::.: ::: :.: .. ..::::::.:::::::. CCDS41 HENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDA 1790 1800 1810 1820 1830 1840 670 680 690 700 710 720 pF1KSD CDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQ :..:.::.:::: .::: ::.:::. :... .. . ..:.::::.: :. ..::::: CCDS41 CEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDK--ELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQ 1850 1860 1870 1880 1890 1900 730 740 750 760 770 780 pF1KSD IIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQ-FKLFSKPASK--EDLKQTSLA-GEKP ::::..: :. : .:..: :.:::..: :.:.: ... . :. . .. :. : ..: CCDS41 IIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQVLQNVLNHSNKI 1910 1920 1930 1940 1950 1960 790 800 810 820 830 pF1KSD TL--GAVLQQN-PSVLEPAAVGGEAASKPAGS-MKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKEN .: ::: : : :: . . .:. : . : : :::.:::::. .. .:. CCDS41 SLCMPESQQQNTPPKSEKN--GGSSPESDVGTDNKLTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEK 1970 1980 1990 2000 2010 2020 840 850 860 870 880 890 pF1KSD KEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGK- ::.. :.:.:: .... . .. :. .:.... ::.::....:: CCDS41 KENKEL--TLENQIK-----EEREQDNSESPNGRTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKL 2030 2040 2050 2060 2070 900 910 920 930 pF1KSD ----TENGL----------------KNTPKILDDIFASLVQNKT----TSDLSKRPQGLT :. :. .. :.:::::.::.:.:: :: .. .:. : CCDS41 RVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPE-LK 2080 2090 2100 2110 2120 2130 940 950 960 970 980 pF1KSD IKP--SILGF---------DTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSG .: ::.. : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..::: CCDS41 EEPEESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSG 2140 2150 2160 2170 2180 2190 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD VHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-E ::.:.: ::: ::. .::....::.::. . ::..:.: .::::::.: .: ::.. : CCDS41 VHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCK-DSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGE 2200 2210 2220 2230 2240 2250 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KSD PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPK .:::::::: ::::. :::.:..::. ..::::: .::.::::.::..::::::::. CCDS41 TVVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPR 2260 2270 2280 2290 2300 2310 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD MYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQ-CEQEEEVLKTIQDGDSDEL . .:::... .:. ::::::..:::..:..::::: ::. .. .:: ... : :.. CCDS41 LCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDI 2320 2330 2340 2350 2360 2370 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD TIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSL ::. ...: :::::::::.::..::::::.:.:.::: : .::::.:::::....: CCDS41 LRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKL 2380 2390 2400 2410 2420 2430 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD RKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQ :.:: .::::. ...:::::.. .:::: :::.:..:::.:.::::::::. . : ::: CCDS41 RQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQ 2440 2450 2460 2470 2480 2490 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD EFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP :.: :.. . :..:::::::..:::::. : :: : CCDS41 ELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN 2500 2510 2520 2530 2540 >-- initn: 538 init1: 168 opt: 547 Z-score: 494.5 bits: 104.7 E(32554): 3.2e-21 Smith-Waterman score: 555; 24.4% identity (55.0% similar) in 667 aa overlap (7-650:4-607) 10 20 30 40 50 pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEW-PWLSGTIRAVSHTDVTKK :. :::.::: ....: .. . :. : : : .:.:::::: : . CCDS41 MAVETRAELVGKRFLCVAVGD--EARSERWESGR--GWRSWRAGVIRAVSHRDSRNP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD DLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RIVQWPAIT :: : :::: : ::.:..:: . .::::..:. :.:..: .. . .::::.: CCDS41 DLAVYVEFDDLEWDKREWVKVYEDFS-TFLVEYHLIWAKRNDPSQTQGSKSKQIQWPALT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD YKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKD-LLKPIQD-VNSLRLSLTDNQIVSKEFQAL .:::... .:.:.:.:: :.: ::..: ..: :: ..:: : :: . .: .. CCDS41 FKPLVERNIPSSVTAVEFLVDKQLDFLTEDSAFQPYQDDIDSLNPVLRDNPQLHEEVKVW 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD IVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKI . .. . ...: .: : .:..: : .::::.. ... . ..:. : ... . CCDS41 VKEQKVQEIFMQGPYSLNGYRVRVYRQDSATQWFTGIITHHDLFTRTMIVMNDQVLEPQN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD VDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVP ::::.... . : . . .. :: ..:. :. : .. . ... . : :... CCDS41 VDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRANQNVNAVHSHYTRAQANSPRPAMNSQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KSD TTVFKEIL---LGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKI-----PQGCHKQSL--- ..: :. . : .. ..: :. . . : :.: .:. . CCDS41 AAVPKQNTHQQQQQRSIRPNKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYDYISRGENPKGKNKHLMNKR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KSD --PEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQE ::: . :: : : . : ... .:.::. ... .:. . .. : ... . CCDS41 RKPEEDEKKLNMK----RLRTD--NVSDFSESSDSENSNKRIID----NSSEQKPENELK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KSD NRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANPP--ELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAG :. : .. : :.. .. ... :. ..:: ..:. .: . : . . CCDS41 NKNTSKINGEEGKPHN---NEKAGEETLKNSQPPWDQIQEDKKHEEA--------EKRKS 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KSD VNSDSPNNCSGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPA :... .. .. : :... ...: . . : ... .. :..: : :. 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