FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0742, 1321 aa
1>>>pF1KSDA0742 1321 - 1321 aa - 1321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3206+/-0.00106; mu= 13.5864+/- 0.064
mean_var=119.7928+/-23.195, 0's: 0 Z-trim(107.4): 21 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.117181
statistics sampled from 9572 (9582) to 9572 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 5.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321) 8980 1530.3 0
CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761) 2173 379.6 4.2e-104
CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2358) 1509 267.4 3.3e-70
CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2540) 1509 267.4 3.5e-70
CCDS6023.1 HR gene_id:55806|Hs108|chr8 (1134) 397 79.2 6.9e-14
>>CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321 aa)
initn: 8980 init1: 8980 opt: 8980 Z-score: 8203.7 bits: 1530.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8980; 99.9% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIH
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVINGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTTVFKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTTVFKEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LLGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LLGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KASSKAELEIANPPELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGKKVEPSALACR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KASSKAELEIANPPELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGKKVEPSALACR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 AQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVRE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD MPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDLKQTSLAGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDLKQTSLAGEKP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TLGAVLQQNPSVLEPAAVGGEAASKPAGSMKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKENKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 TLGAVLQQNPSVLEPAAVGGEAASKPAGSMKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKENKEKQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD P
:
CCDS19 P
>>CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761 aa)
initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1982.5 bits: 379.6 E(32554): 4.2e-104
Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:871-1760)
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ
..:: . .::: : .:.:::.:::: :.:
CCDS34 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
850 860 870 880 890 900
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT
: ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::.
CCDS34 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS
910 920 930 940 950 960
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW
:.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..:::
CCDS34 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL
::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..::::
CCDS34 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
710 720 730 740 750 760
pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK
::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .::
CCDS34 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
770 780 790 800
pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS
. ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :..
CCDS34 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
810 820 830 840 850
pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL
. . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : .
CCDS34 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
860 870 880 890
pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK-----------------
.... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. ::
CCDS34 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
900 910 920 930 940
pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T
. :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. :
CCDS34 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE
: ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::.
CCDS34 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS
:.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::.
CCDS34 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH
::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. ::::::
CCDS34 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK
::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: .:. .:::::::::::::::
CCDS34 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV
:.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::.
CCDS34 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.:
CCDS34 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1310 1320
pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP
::::::::. ::: ::....
CCDS34 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS
1750 1760
>--
initn: 436 init1: 142 opt: 418 Z-score: 379.0 bits: 82.9 E(32554): 8.6e-15
Smith-Waterman score: 418; 25.3% identity (55.5% similar) in 510 aa overlap (13-484:9-503)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWP--------WLSGTIRAVS
::.:.: : : ....: .. . .. : : .::.::.:
CCDS34 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KSD HTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RI
.. .:: . ::::: .:... :..:.. ..:.: .:: : :..: . . :
CCDS34 --GAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIV
.::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. ::: . :. .: ..: : .. .
CCDS34 AQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCE
. .::: . . . .: .. : .::::. . :. ..: . . .. ..:.
CCDS34 RETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD EIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPS
: .: ::: :::: .. :: . .... . ::: :.... .. .:... . :: :
CCDS34 ESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KSD MC-PVQSVPTTVFKEILL----GCTAATPPSKDPRQQSTP---QAANSPPNLGAKIPQGC
: :... :. : :. : : .. : : :..::. . .::
CCDS34 GCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPS--TFVPQI-
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT
.... . : .. ... .: :.. :. .::. . : :.
CCDS34 -NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYST--ATGQTPLAPEVGGA-----E
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KSD NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSD
: . . ::.: :.... . : .:. ..:.. :: :: . : .
CCDS34 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KSD VSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNN
:. ...: .. :.. ::.. ..:: ... :
CCDS34 SRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQK
CCDS34 SKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKP
530 540 550 560 570 580
>>CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2358 aa)
initn: 2315 init1: 756 opt: 1509 Z-score: 1373.9 bits: 267.4 E(32554): 3.3e-70
Smith-Waterman score: 2598; 41.7% identity (71.3% similar) in 1027 aa overlap (363-1315:1341-2349)
340 350 360 370 380
pF1KSD IPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEP------
.:.. ..:....:.:. . ..:
CCDS60 QYKSSNASETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICST--INKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL
1320 1330 1340 1350 1360
390 400 410 420 430 440
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:. :. . . . :..:. .... . : : : ...:: . . . ..:...
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.. ... ..:: .. : . : .:. ..:: :.. . .....
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::.. :.:.:: .... . .. :. .:.... ::.::....::
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.: ::.. : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..:::
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. .:::... .:. ::::::..:::..:..::::: ::. .. .:: ... : :..
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pF1KSD TIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSL
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. . .:..:.:::: :::.:::.: ::: :.: .. ..::::::.:::::::.
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CCDS41 EEPEESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSG
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CCDS41 KYVSYISPLSAVSVMEDKLHKRSPPPETIKSKLNTSVDTHKIKSSPSPEVVKPKITHSPD
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CCDS60 --EVQGAMGSPAPK----RPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTS--IGNKDVDSGQHDEQKG
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