FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0742, 1321 aa 1>>>pF1KSDA0742 1321 - 1321 aa - 1321 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9228+/-0.000413; mu= 10.1753+/- 0.026 mean_var=132.6023+/-26.220, 0's: 0 Z-trim(115.3): 43 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.111378 statistics sampled from 25577 (25615) to 25577 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 15.540 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060903 (OMIM: 611512) lysine-specific demethyla (1321) 8980 1455.5 0 XP_016859982 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1321) 8980 1455.5 0 NP_001140160 (OMIM: 611512) lysine-specific demeth (1321) 8980 1455.5 0 XP_016859983 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1036) 7116 1155.9 0 XP_006712114 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec ( 661) 4588 749.6 1.6e-215 XP_016865073 (OMIM: 609373) 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pF1KSD P : NP_001 P >>XP_016859983 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-specific (1036 aa) initn: 7116 init1: 7116 opt: 7116 Z-score: 6182.4 bits: 1155.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7116; 100.0% identity (100.0% similar) in 1036 aa overlap (286-1321:1-1036) 260 270 280 290 300 310 pF1KSD RIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTTVFKEILLGCTAATPPSKDPR :::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MCPVQSVPTTVFKEILLGCTAATPPSKDPR 10 20 30 320 330 340 350 360 370 pF1KSD QQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 QQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQI 40 50 60 70 80 90 380 390 400 410 420 430 pF1KSD GTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANPPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 GTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANPPE 100 110 120 130 140 150 440 450 460 470 480 490 pF1KSD 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 STILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGL 220 230 240 250 260 270 940 950 960 970 980 990 pF1KSD TIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 TIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELW 280 290 300 310 320 330 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD KPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 KPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPP 340 350 360 370 380 390 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD GEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 GEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPE 400 410 420 430 440 450 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD DRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 DRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKP 460 470 480 490 500 510 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD GALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 GALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQG 520 530 540 550 560 570 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KSD WAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 WAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNH 580 590 600 610 620 630 1300 1310 1320 pF1KSD EDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 EDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP 640 650 660 >>XP_016865073 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-specific (1512 aa) initn: 3307 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1887.2 bits: 361.7 E(85289): 2.2e-98 Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 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XP_016 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 900 910 920 930 940 950 810 820 830 840 850 pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_016 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 960 970 980 990 1000 1010 860 870 880 890 pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: XP_016 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 900 910 920 930 940 pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_016 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1080 1090 1100 1110 1120 1130 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. 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XP_005 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS 710 720 730 740 750 760 600 610 620 630 640 650 pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: XP_005 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW 770 780 790 800 810 820 660 670 680 690 700 pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: XP_005 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL 830 840 850 860 870 880 710 720 730 740 750 760 pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: XP_005 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT 890 900 910 920 930 940 770 780 790 800 pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. XP_005 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 950 960 970 980 990 1000 810 820 830 840 850 pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_005 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 1010 1020 1030 1040 1050 1060 860 870 880 890 pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: XP_005 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 900 910 920 930 940 pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_005 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. XP_005 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. 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XP_005 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: XP_005 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1310 1320 pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::. ::: ::.... 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XP_005 SNYFTTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKPG-SKAGSSVDRKVPA 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KSD ESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANPPELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDS ::.: ..:. : ... . : . .::.:.. . :: .. . .:. . :. XP_005 ESMPTLTPAFPRSLLNARTPENHENLFLQPPKLSR---EEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSF 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KSD PNNCSGKKVEPSALACR-SQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR------KSVLTD .. ::.. .... . . . :: ..:. : ... : . :. :.::. XP_005 ASQASGSSSSATTVTSKVAPSWPESHSSADSASLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALTS 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KSD PAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRL . . . .:.. .: .. . ..: . :.:.:.. : . XP_005 GGPSLSAMGNGRSSSPTSSLTQPI-EMPTLSSSPTEERPTVGPGQQDNPLLKTFSNV--- 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KSD QFNKHGVLRVEGFLT-PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVIS :..:. :::. : ...: XP_005 -FGRHS----GGFLSSPADFSQENKAPFEAVKRFSLDERSLACRQDSDSSTNSDLSDLSD 570 580 590 600 610 620 >>XP_011541791 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-specific (1713 aa) initn: 3550 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1886.4 bits: 361.7 E(85289): 2.5e-98 Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:823-1712) 480 490 500 510 520 530 pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: XP_011 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ 800 810 820 830 840 850 540 550 560 570 580 590 pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. XP_011 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS 860 870 880 890 900 910 600 610 620 630 640 650 pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: XP_011 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW 920 930 940 950 960 970 660 670 680 690 700 pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: XP_011 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL 980 990 1000 1010 1020 1030 710 720 730 740 750 760 pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: XP_011 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 770 780 790 800 pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. XP_011 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 1100 1110 1120 1130 1140 1150 810 820 830 840 850 pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_011 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 860 870 880 890 pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: XP_011 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 900 910 920 930 940 pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_011 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1280 1290 1300 1310 1320 1330 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. 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XP_011 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: XP_011 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1310 1320 pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::. ::: ::.... XP_011 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS 1700 1710 >-- initn: 433 init1: 142 opt: 382 Z-score: 331.0 bits: 73.9 E(85289): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 382; 25.4% identity (55.2% similar) in 464 aa overlap (53-484:7-455) 30 40 50 60 70 80 pF1KSD ADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYS ... .: ::. ::::: .:... :..:.. XP_011 MKPFLENSNKAKCYLKIFVEFDGCNWKQHSWVKVHA 10 20 30 90 100 110 120 130 pF1KSD LLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RIVQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQ ..:.: .:: : :..: . . :.::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. XP_011 EEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSIAQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRE 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KSD RVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVK ::: . :. .: ..: : .. . . .::: . . . .: .. : .:: XP_011 LRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVK 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KSD IYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSAR ::. . :. ..: . . .. ..:. : .: ::: :::: .. :: . .... XP_011 IYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSAPQSEGGT 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KSD IGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMC-PVQSVPTTVFKEILLGCTAATPPSKDP . ::: :.... .. .:... . :: : : :... :. . . . :. : XP_011 LKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGP 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KSD RQQSTPQAANSPPNLG--AKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKS . .. :.. :.: :: : . .. ..: :: : :: :. .. XP_011 WKGGN---ASGEPGLDQRAKQPPSTFVPQINRNIRFATYTK-ENGRT--------LVVQD 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KSD SQIGTGDLKILTEPKGSCT-----QPKT----NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKAS .: :: : .. : :.. : . . ::.: :.... . : .: XP_011 EPVG-GDTPASFTPYSTATGQTPLAPEVGGAENKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 pF1KSD SKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGK . ..:.. :: :: . : . :. ...: .. :.. ::. XP_011 TPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGENSRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGR 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KSD KVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAF . ..:: ... : XP_011 SQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLAD 450 460 470 480 490 500 >>XP_011541790 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-specific (1717 aa) initn: 3550 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1886.3 bits: 361.7 E(85289): 2.5e-98 Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:827-1716) 480 490 500 510 520 530 pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: XP_011 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ 800 810 820 830 840 850 540 550 560 570 580 590 pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. XP_011 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS 860 870 880 890 900 910 600 610 620 630 640 650 pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: XP_011 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW 920 930 940 950 960 970 660 670 680 690 700 pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: XP_011 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL 980 990 1000 1010 1020 1030 710 720 730 740 750 760 pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: XP_011 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 770 780 790 800 pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. XP_011 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 1100 1110 1120 1130 1140 1150 810 820 830 840 850 pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_011 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 860 870 880 890 pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: XP_011 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 900 910 920 930 940 pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_011 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1280 1290 1300 1310 1320 1330 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. XP_011 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. 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XP_011 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: XP_011 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1310 1320 pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::. ::: ::.... XP_011 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS 1700 1710 >-- initn: 352 init1: 142 opt: 374 Z-score: 324.1 bits: 72.7 E(85289): 2.6e-11 Smith-Waterman score: 374; 25.4% identity (55.0% similar) in 456 aa overlap (61-484:19-459) 40 50 60 70 80 90 pF1KSD DSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLV :.. ::::: .:... :..:.. ..:. XP_011 MSSKLCTLCCLSWCRSLHLNIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLL 10 20 30 40 100 110 120 130 140 pF1KSD EHNLVLAERKSPEISE----RIVQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-D : .:: : :..: . . :.::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. ::: . 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XP_011 GKKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGN--- 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ANSPPNLG--AKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDL :.. :.: :: : . .. ..: :: : :: :. .. .: :: XP_011 ASGEPGLDQRAKQPPSTFVPQINRNIRFATYTK-ENGRT--------LVVQDEPVG-GDT 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 pF1KSD KILTEPKGSCT-----QPKT----NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIA : .. : :.. : . . ::.: :.... . : .:. ..:. XP_011 PASFTPYSTATGQTPLAPEVGGAENKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRIS 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 pF1KSD NP-------PELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALA . :: :: . : . :. ...: .. :.. ::.. ..:: XP_011 DTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGENSRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KSD CRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVN ... : XP_011 TENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADDSSSRDSF 460 470 480 490 500 510 >>NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethylase 3 (1761 aa) initn: 3607 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1886.2 bits: 361.7 E(85289): 2.5e-98 Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:871-1760) 480 490 500 510 520 530 pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: NP_057 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ 850 860 870 880 890 900 540 550 560 570 580 590 pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. 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