Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0755
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0755, 1032 aa
1>>>pF1KSDA0755 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.9775+/-0.000565; mu= -38.2105+/- 0.035
mean_var=815.6992+/-170.762, 0's: 0 Z-trim(122.5): 129 B-trim: 1387 in 1/59
Lambda= 0.044907
statistics sampled from 40612 (40773) to 40612 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 14.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055637 (OMIM: 607186,616294) protein transport (1032) 7109 476.9 2.5e-133
XP_005263436 (OMIM: 607186,616294) PREDICTED: prot (1033) 7097 476.1 4.3e-133
NP_001304995 (OMIM: 607186,616294) protein transpo (1033) 7097 476.1 4.3e-133
NP_004913 (OMIM: 607185) protein transport protein (1094) 3887 268.2 1.8e-70
NP_940999 (OMIM: 607185) protein transport protein (1094) 3887 268.2 1.8e-70
XP_016864364 (OMIM: 607186,616294) PREDICTED: prot ( 588) 3867 266.7 2.7e-70
XP_016872457 (OMIM: 607185) PREDICTED: protein tra (1069) 3860 266.4 6e-70
XP_011538683 (OMIM: 607185) PREDICTED: protein tra (1117) 3845 265.4 1.2e-69
XP_011538682 (OMIM: 607185) PREDICTED: protein tra (1117) 3845 265.4 1.2e-69
XP_016872456 (OMIM: 607185) PREDICTED: protein tra (1092) 3837 264.9 1.7e-69
XP_011529839 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1241) 1318 101.8 2.6e-20
XP_011529838 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1244) 1318 101.8 2.6e-20
NP_006314 (OMIM: 607184) protein transport protein (1268) 1318 101.8 2.6e-20
XP_005262745 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1299) 1318 101.8 2.7e-20
XP_016863141 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1172) 1305 100.9 4.4e-20
XP_011529841 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1203) 1305 100.9 4.5e-20
NP_001036199 (OMIM: 607184) protein transport prot (1233) 1295 100.3 7.1e-20
XP_011529837 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1264) 1295 100.3 7.3e-20
NP_001305014 (OMIM: 607184) protein transport prot (1267) 1288 99.8 1e-19
NP_001287742 (OMIM: 607184) protein transport prot (1298) 1288 99.8 1e-19
NP_001305015 (OMIM: 607184) protein transport prot (1232) 1265 98.3 2.7e-19
XP_005262748 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1263) 1265 98.3 2.8e-19
XP_016864450 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra (1067) 1221 95.4 1.8e-18
NP_068817 (OMIM: 607183) protein transport protein (1093) 1221 95.4 1.8e-18
XP_011529842 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra ( 733) 1203 94.2 2.9e-18
XP_006714586 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra (1035) 1170 92.1 1.7e-17
XP_016864451 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra ( 603) 1011 81.7 1.4e-14
NP_001239160 (OMIM: 607183) protein transport prot ( 613) 497 48.4 0.00015
XP_016864452 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra ( 555) 446 45.0 0.0014
>>NP_055637 (OMIM: 607186,616294) protein transport prot (1032 aa)
initn: 7109 init1: 7109 opt: 7109 Z-score: 2514.6 bits: 476.9 E(85289): 2.5e-133
Smith-Waterman score: 7109; 99.9% identity (99.9% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQANSGPQMAGAQLSYPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEET
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKST
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFL
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KSD CCVHKEICQLLN
::::::::::::
NP_055 CCVHKEICQLLN
1030
>>XP_005263436 (OMIM: 607186,616294) PREDICTED: protein (1033 aa)
initn: 5495 init1: 5495 opt: 7097 Z-score: 2510.4 bits: 476.1 E(85289): 4.3e-133
Smith-Waterman score: 7097; 99.8% identity (99.8% similar) in 1033 aa overlap (1-1032:1-1033)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KSD PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQA-NSGPQMAGAQLSYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_005 PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQAANSGPQMAGAQLSYP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
:::::::::::::
XP_005 LCCVHKEICQLLN
1030
>>NP_001304995 (OMIM: 607186,616294) protein transport p (1033 aa)
initn: 5495 init1: 5495 opt: 7097 Z-score: 2510.4 bits: 476.1 E(85289): 4.3e-133
Smith-Waterman score: 7097; 99.8% identity (99.8% similar) in 1033 aa overlap (1-1032:1-1033)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGMMKPAGPLGATATRGMLPPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPPPGPHQFGQNGAHATGHPPQRFPGPPPVNNVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSQLSAMQINSYGSGMAPPSQGPPGPLSATSLQTPPRPPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KSD PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQA-NSGPQMAGAQLSYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_001 PGASPLPLPMYRPDGLSGPPPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQAANSGPQMAGAQLSYP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
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660 670 680 690 700 710
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
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900 910 920 930 940 950
pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
:::::::::::::
NP_001 LCCVHKEICQLLN
1030
>>NP_004913 (OMIM: 607185) protein transport protein Sec (1094 aa)
initn: 3844 init1: 3668 opt: 3887 Z-score: 1386.1 bits: 268.2 E(85289): 1.8e-70
Smith-Waterman score: 3988; 56.5% identity (79.5% similar) in 1063 aa overlap (12-1032:44-1094)
10 20 30 40
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGM
:. : :: .::. . :: : :..
NP_004 GQPQPIYPGYHQSSYGGQSGSTAPAIPYGAYNGPVPGYQQTPPQGMSRAPPSSGAPPAST
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80
pF1KSD MKPAGPLGATAT----RGMLPPGPPP-------PGPHQFGQNGAHATGHPPQRFP-GPPP
. .: : .: .: . :: :: . ::. : . ..:: : ::::
NP_004 AQ--APCGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRLPGSQPFGSPLAPVGNQPPVLQPYGPPP
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90 100 110 120 130
pF1KSD VN----------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP
.. ..... :: ::. .. : : .:.. :: .. .:: .:.:::
NP_004 TSAQVATQLSGMQISGAVAPAPPSSGLGFGPPTSLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPP
140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ---SQGPPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMY
.:: :: .::: : : : : . : .. : :. ..:: : : .
NP_004 LSQAQGHPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVS
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KSD RPDGLSGPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFP
.:. .:.:: ::..:. : ::: . :: ::: .: :: : : .: : .:
NP_004 QPNHVSSPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYP
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250 260 270 280 290
pF1KSD GGPA--QMAGPPQP--QKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
..:. .. ::::: :.::::.:::::::::.:: .:: . ..:..:::.::::::.
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.: .: .:. :.:.:::::
NP_004 LVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESG
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
:.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: ::::::: :.:.: :..:::::
NP_004 PLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSL
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pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
::::..::.:::...: :.::::::::::::. :..:::.:.:::::..:. .:.: :
NP_004 GSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLCEELKSLLDFLPREGGAE
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pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
:::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...::::::::::: .::..:: .:
NP_004 ESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRAVITSL
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540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
:::::.::::. :.::::. ::::::::::::.: ::::.::.::: ::::::::::::.
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600 610 620 630 640 650
pF1KSD KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.::::::.:..:::::::..:
NP_004 KLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYVDVATLSVVPQLTGGSVY
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660 670 680 690 700 710
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
:: .::.. :...::.::: :..: .::::.::::::::.::.::::.. :.::::::.:
NP_004 KYASFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELA
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::. .::::::::::.::: .::::::..
NP_004 GLDGDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRN
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780 790 800 810 820 830
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
::::.:::..:: :...::..:.:..:. :..: :..::::::::::::.:.:::::. :
NP_004 CETDTLINYMAKFAYRGVLNSPVKAVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECM
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840 850 860 870 880 890
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
:.::::.::.::. :: :..::.::: :::: .: :.....::::.:::. :.:
NP_004 KLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVTETNVFFYPRLLPLTKSPVES
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pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
: : ::: :: :::. :.:: :::..:::.:.: ..:..:.: ::..:.. ...:
NP_004 TTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQSLFSVSSFSQITSGLSVL
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pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
: . :: :...: .. .. .: ::::.:::... ::.:..::::::.: ::.:::::
NP_004 PVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQEDKMEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
:: .:::: :::.
NP_004 LCHMHKEIRQLLS
1090
>>NP_940999 (OMIM: 607185) protein transport protein Sec (1094 aa)
initn: 3844 init1: 3668 opt: 3887 Z-score: 1386.1 bits: 268.2 E(85289): 1.8e-70
Smith-Waterman score: 3988; 56.5% identity (79.5% similar) in 1063 aa overlap (12-1032:44-1094)
10 20 30 40
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGM
:. : :: .::. . :: : :..
NP_940 GQPQPIYPGYHQSSYGGQSGSTAPAIPYGAYNGPVPGYQQTPPQGMSRAPPSSGAPPAST
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80
pF1KSD MKPAGPLGATAT----RGMLPPGPPP-------PGPHQFGQNGAHATGHPPQRFP-GPPP
. .: : .: .: . :: :: . ::. : . ..:: : ::::
NP_940 AQ--APCGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRLPGSQPFGSPLAPVGNQPPVLQPYGPPP
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130
pF1KSD VN----------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP
.. ..... :: ::. .. : : .:.. :: .. .:: .:.:::
NP_940 TSAQVATQLSGMQISGAVAPAPPSSGLGFGPPTSLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPP
140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ---SQGPPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMY
.:: :: .::: : : : : . : .. : :. ..:: : : .
NP_940 LSQAQGHPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVS
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KSD RPDGLSGPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFP
.:. .:.:: ::..:. : ::: . :: ::: .: :: : : .: : .:
NP_940 QPNHVSSPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYP
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KSD GGPA--QMAGPPQP--QKKLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDC
..:. .. ::::: :.::::.:::::::::.:: .:: . ..:..:::.::::::.
NP_940 AAPTFGSQPGPPQPLPPKRLDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGTEPFVTGVRGQVPPLVTTNF
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESG
...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.: .: .:. :.:.:::::
NP_940 LVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESG
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSL
:.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: ::::::: :.:.: :..:::::
NP_940 PLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSL
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEE
::::..::.:::...: :.::::::::::::. :..:::.:.:::::..:. .:.: :
NP_940 GSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLCEELKSLLDFLPREGGAE
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNL
:::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...::::::::::: .::..:: .:
NP_940 ESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRAVITSL
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDK
:::::.::::. :.::::. ::::::::::::.: ::::.::.::: ::::::::::::.
NP_940 LDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDR
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600 610 620 630 640 650
pF1KSD KLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLY
::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.::::::.:..:::::::..:
NP_940 KLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYVDVATLSVVPQLTGGSVY
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMA
:: .::.. :...::.::: :..: .::::.::::::::.::.::::.. :.::::::.:
NP_940 KYASFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELA
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KSD AIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKS
..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::. .::::::::::.::: .::::::..
NP_940 GLDGDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRN
790 800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSM
::::.:::..:: :...::..:.:..:. :..: :..::::::::::::.:.:::::. :
NP_940 CETDTLINYMAKFAYRGVLNSPVKAVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECM
850 860 870 880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKS
:.::::.::.::. :: :..::.::: :::: .: :.....::::.:::. :.:
NP_940 KLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVTETNVFFYPRLLPLTKSPVES
910 920 930 940 950 960
900 910 920 930 940 950
pF1KSD TMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLL
: : ::: :: :::. :.:: :::..:::.:.: ..:..:.: ::..:.. ...:
NP_940 TTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQSLFSVSSFSQITSGLSVL
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDF
: . :: :...: .. .. .: ::::.:::... ::.:..::::::.: ::.:::::
NP_940 PVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQEDKMEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030
pF1KSD LCCVHKEICQLLN
:: .:::: :::.
NP_940 LCHMHKEIRQLLS
1090
>>XP_016864364 (OMIM: 607186,616294) PREDICTED: protein (588 aa)
initn: 3867 init1: 3867 opt: 3867 Z-score: 1383.0 bits: 266.7 E(85289): 2.7e-70
Smith-Waterman score: 3867; 99.8% identity (99.8% similar) in 588 aa overlap (445-1032:1-588)
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MIDVSYSNIKNGLVKLICEELKTMLEKIPK
10 20 30
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQS
40 50 60 70 80 90
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLK
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIHNLLDQIPDMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLK
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD NRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLVPQLT
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD GGTLYKYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGTLYKYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGILMNNTT
220 230 240 250 260 270
720 730 740 750 760 770
pF1KSD DVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRIHNLGLNCSSQLA
280 290 300 310 320 330
780 790 800 810 820 830
pF1KSD DLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLI
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD LPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHT
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900 910 920 930 940 950
pF1KSD LDVKSTMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDVKSTMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQGIFNVPSFAHINT
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGS
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1020 1030
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::::::::::::::::::
XP_016 SYVDFLCCVHKEICQLLN
580
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: :: . : : .:. :: :
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::. : . ..:: : ::::.. ..... :: ::. .. :
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: .:.. :: .. .:: .:.::: .:: :: .::: : : : : . :
XP_016 SLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPPLSQAQGHPG------IQTPQRSAPSQASSFTPP
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170 180 190 200 210
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.. : :. ..:: : : . .:. .:.:: ::..:. : ::: .
XP_016 ASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVSQPNHVSSPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQ
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220 230 240 250 260 270
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:: ::: .: :: : : .: : .:..:. .. ::::: :.::::.:::::::::
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.:: .:: . ..:..:::.::::::. ...::::::::.::::.: .:::::::::::.:
XP_016 DDRNNRGTEPFVTGVRGQVPPLVTTNFLVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVP
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD LAAVIKPFATIPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVN
:::::::.: .: .:. :.:.::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.:
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pF1KSD DVPPFYFQHLDHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSN
:::: ::::::: :.:.: :..:::::::::..::.:::...: :.::::::::::::.
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460 470 480 490 500 510
pF1KSD IKNGLVKLICEELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVT
:..:::.:.:::::..:. .:.: : :::::::.::::::::.::::.:::::::::.
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pF1KSD DVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAAD
::...::::::::::: .::..:: .::::::.::::. :.::::. ::::::::::::.
XP_016 DVADMFVPLLDGFLVNVNESRAVITSLLDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAE
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580 590 600 610 620 630
pF1KSD CPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSV
: ::::.::.::: ::::::::::::.::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: :
XP_016 CAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCV
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pF1KSD TLFLFPSQYVDVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMR
:::::.::::::.:..:::::::..::: .::.. :...::.::: :..: .::::.::
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pF1KSD VRTSTGFRATDFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYT
::::::.::.::::.. :.::::::.:..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::
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pF1KSD TISGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQ
. .::::::::::.::: .::::::..::::.:::..:: :...::..:.:..:. :..:
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:..::::::::::::.:.:::::. ::.::::.::.::. :: :..::.::: :::
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pF1KSD VMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLG
: .: :.....::::.:::. :.:: : ::: :: :::. :.:: :::..:::.:
XP_016 VTSMDVTETNVFFYPRLLPLTKSPVESTTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVG
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pF1KSD VSSPPELIQGIFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQ
.: ..:..:.: ::..:.. ...:: . :: :...: .. .. .: ::::.:::
XP_016 ASVQQGVVQSLFSVSSFSQITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQ
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1000 1010 1020 1030
pF1KSD REQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHKEICQLLN
... ::.:..::::::.: ::.::::::: .:::: :::.
XP_016 EDKMEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS
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pF1KSD ------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP---SQG
..... :: ::. .. : : .:.. :: .. .:: .:.::: .::
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150 160 170 180 190
pF1KSD PPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMYRPDGLS
:: .::: : : : : . : .. : :. ..:: : : . .:. .:
XP_011 HPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVSQPNHVS
200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KSD GPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFPGGPA--
.:: ::..:. : ::: . :: ::: .: :: : : .: : .:..:.
XP_011 SPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYPAAPTFG
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280
pF1KSD QMAGPPQP----------------------QK---KLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQV
.. ::::: :: ..:::.:::::::::.:: .:: .
XP_011 SQPGPPQPLPPKRLDPDAIPSPQLSELPPQQKTRHRIDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGTEP
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pF1KSD YATNTRGQIPPLVTTDCMIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFAT
..:..:::.::::::. ...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.:
XP_011 FVTGVRGQVPPLVTTNFLVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLAR
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD IPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHL
.: .:. :.:.::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: :::::
XP_011 LPPEEASPYVVDHGESGPLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHL
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pF1KSD DHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLIC
:: :.:.: :..:::::::::..::.:::...: :.::::::::::::. :..:::.:.:
XP_011 DHTGKRVDAYDRPELSLGSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLC
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pF1KSD EELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLL
::::..:. .:.: : :::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...:::::
XP_011 EELKSLLDFLPREGGAEESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLL
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD DGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHS
:::::: .::..:: .::::::.::::. :.::::. ::::::::::::.: ::::.::.
XP_011 DGFLVNVNESRAVITSLLDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHT
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pF1KSD SLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYV
::: ::::::::::::.::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.:::
XP_011 SLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYV
670 680 690 700 710 720
650 660 670 680 690 700
pF1KSD DVASLGLVPQLTGGTLYKYNNFQMHLDRQQFLNDLRNDIEKKIGFDAIMRVRTSTGFRAT
:::.:..:::::::..::: .::.. :...::.::: :..: .::::.::::::::.::.
XP_011 DVATLSVVPQLTGGSVYKYASFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAV
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD DFFGGILMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTISGQRRLRI
::::.. :.::::::.:..: ::.:::::::::.:.:.::::.:::.:::. .:::::::
XP_011 DFFGAFYMSNTTDVELAGLDGDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRI
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pF1KSD HNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRK
:::.::: .::::::..::::.:::..:: :...::..:.:..:. :..: :..::::::
XP_011 HNLALNCCTQLADLYRNCETDTLINYMAKFAYRGVLNSPVKAVRDTLITQCAQILACYRK
850 860 870 880 890 900
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pF1KSD NCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKNCVLLSRPEISTDERAYQRQLVMTMGVADSQ
::::::.:.:::::. ::.::::.::.::. :: :..::.::: :::: .: :....
XP_011 NCASPSSAGQLILPECMKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVTETN
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pF1KSD LFFYPQLLPIHTLDVKSTMLPAAVRCSESRLSEEGIFLLANGLHMFLWLGVSSPPELIQG
.::::.:::. :.:: : ::: :: :::. :.:: :::..:::.:.: ..:.
XP_011 VFFYPRLLPLTKSPVESTTEPPAVRASEERLSNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQS
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pF1KSD IFNVPSFAHINTDMTLLPEVGNPYSQQLRMIMGIIQQKRPYSMKLTIVKQREQPEMVFRQ
.:.: ::..:.. ...:: . :: :...: .. .. .: ::::.:::... ::.:..
XP_011 LFSVSSFSQITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLTVVKQEDKMEMLFKH
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pF1KSD FLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHKEICQLLN
::::::.: ::.::::::: .:::: :::.
XP_011 FLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS
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>>XP_011538682 (OMIM: 607185) PREDICTED: protein transpo (1117 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTA-SPTGMMK
: :.. .:: : . :. :: .: :.
XP_011 QSSYGGQSGSTAPAIPYGAYNGPVPGYQQTPPQGMSRAPPSSG--APPASTAQAPCGQAA
30 40 50 60 70 80
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pF1KSD PAGPLGATATRGMLPPGPPP-------PGPHQFGQNGAHATGHPPQRFP-GPPPVN----
: .: .: . :: :: . ::. : . ..:: : ::::..
XP_011 -YGQFG----QGDVQNGPSSTVQMQRLPGSQPFGSPLAPVGNQPPVLQPYGPPPTSAQVA
90 100 110 120 130
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pF1KSD ------NVASSHAPYQPSAQSSYPGPISTSSVTQLGSQLSAMQINSYGSGMAPP---SQG
..... :: ::. .. : : .:.. :: .. .:: .:.::: .::
XP_011 TQLSGMQISGAVAPAPPSSGLGFGPPTSLASAS--GSFPNSGLYGSYPQGQAPPLSQAQG
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190
pF1KSD PPGPLSATSLQTPPR--PPQPSILQPGSQVLPPPPTTLNGP---GASPLPLPMYRPDGLS
:: .::: : : : : . : .. : :. ..:: : : . .:. .:
XP_011 HPG------IQTPQRSAPSQASSFTPPASGGPRLPS-MTGPLLPGQSFGGPSVSQPNHVS
200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KSD GPP---PPNAQYQPP--PLPGQ--TLGAGYPPQQANS-GPQMAGAQLSYPGGFPGGPA--
.:: ::..:. : ::: . :: ::: .: :: : : .: : .:..:.
XP_011 SPPQALPPGTQMTGPLGPLPPMHSPQQPGYQPQQNGSFGPAR-GPQSNYGGPYPAAPTFG
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250 260 270 280
pF1KSD QMAGPPQP----------------------QK---KLDPDSIPSPIQVIENDRASRGGQV
.. ::::: :: ..:::.:::::::::.:: .:: .
XP_011 SQPGPPQPLPPKRLDPDAIPSPQLSELPPQQKTRHRIDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGTEP
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KSD YATNTRGQIPPLVTTDCMIQDQGNASPRFIRCTTYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFAT
..:..:::.::::::. ...::::::::.::::.: .:::::::::::.::::::::.:
XP_011 FVTGVRGQVPPLVTTNFLVKDQGNASPRYIRCTSYNIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLAR
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KSD IPSNESPLYLVNHGESGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCNCVNDVPPFYFQHL
.: .:. :.:.::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::.:.::::: :::::
XP_011 LPPEEASPYVVDHGESGPLRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHL
430 440 450 460 470 480
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DHIGRRLDHYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKSKPPNPPAFIFMIDVSYSNIKNGLVKLIC
:: :.:.: :..:::::::::..::.:::...: :.::::::::::::. :..:::.:.:
XP_011 DHTGKRVDAYDRPELSLGSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYNAIRTGLVRLLC
490 500 510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EELKTMLEKIPKEEQEETSAIRVGFITYNKVLHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLL
::::..:. .:.: : :::::::.::::::::.::::.:::::::::.::...:::::
XP_011 EELKSLLDFLPREGGAEESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLL
550 560 570 580 590 600
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPDMFADSNENETVFASVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHS
:::::: .::..:: .::::::.::::. :.::::. ::::::::::::.: ::::.::.
XP_011 DGFLVNVNESRAVITSLLDQIPEMFADTRETETVFVPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHT
610 620 630 640 650 660
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SLPTAEAPGKLKNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTNVYDSLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYV
::: ::::::::::::.::.:::::: ::::::..:..:::.:::.:: : :::::.:::
XP_011 SLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGAYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNQYV
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::. : . ..:: : ::::.. ..... :: ::. .. :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]