Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0763
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0763, 841 aa
1>>>pF1KSDA0763 841 - 841 aa - 841 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8351+/-0.00101; mu= 9.4479+/- 0.061
mean_var=139.5452+/-27.369, 0's: 0 Z-trim(109.0): 33 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.108572
statistics sampled from 10581 (10608) to 10581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 4.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 ( 963) 5562 883.4 0
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (1114) 5458 867.1 0
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX ( 949) 1690 276.9 1.2e-73
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX (1488) 1691 277.1 1.5e-73
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 ( 759) 1335 221.2 5.3e-57
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 (1182) 1335 221.3 7.7e-57
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs108|chr19 ( 399) 565 100.5 6.2e-21
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 397) 542 96.9 7.5e-20
CCDS42392.2 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 398) 542 96.9 7.5e-20
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs108|chr7 ( 399) 540 96.6 9.4e-20
CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs108|chr8 (1849) 536 96.3 5.3e-19
CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs108|chr20 (1785) 515 93.0 5e-18
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs108|chr22 ( 394) 499 90.1 7.9e-18
CCDS7533.1 GBF1 gene_id:8729|Hs108|chr10 (1859) 459 84.2 2.3e-15
CCDS3820.1 FBXO8 gene_id:26269|Hs108|chr4 ( 319) 376 70.8 4.2e-12
>>CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (963 aa)
initn: 5562 init1: 5562 opt: 5562 Z-score: 4713.6 bits: 883.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5562; 100.0% identity (100.0% similar) in 841 aa overlap (1-841:123-963)
10 20 30
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQAEEEAIKRSRSLSESYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSP
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALD
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KSD AARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDL
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDL
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAIN
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQ
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFS
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDG
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRR
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQ
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KSD VLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRI
820 830 840 850 860 870
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEA
880 890 900 910 920 930
820 830 840
pF1KSD GKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS
940 950 960
>>CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (1114 aa)
initn: 5458 init1: 5458 opt: 5458 Z-score: 4624.6 bits: 867.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5458; 100.0% identity (100.0% similar) in 827 aa overlap (1-827:109-935)
10 20 30
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KQAEEEAIKRSRSLSESYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSP
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALD
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD AARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDL
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDL
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAIN
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNS
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD WDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQ
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFS
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDG
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRR
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQ
740 750 760 770 780 790
700 710 720 730 740 750
pF1KSD VLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRI
800 810 820 830 840 850
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEA
860 870 880 890 900 910
820 830 840
pF1KSD GKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS
:::::::::::::::::
CCDS74 GKRGRRSSAGSLESNVEGSIISSPHMRRRATSTRECPSRPHQTMPNSSSLLGSLFGSKRG
920 930 940 950 960 970
>>CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX (949 aa)
initn: 2414 init1: 1406 opt: 1690 Z-score: 1435.9 bits: 276.9 E(32554): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 3161; 62.2% identity (78.9% similar) in 850 aa overlap (1-811:131-946)
10 20 30
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
:::::::: ...:.::::::::::::.:::
CCDS35 RKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNK
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80
pF1KSD NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGALVS
:::::::: ::.::::::.::::::::::: ::... .::::: .:. ..:.. ::
CCDS35 NFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGARSH
170 180 190 200 210
90 100 110 120 130
pF1KSD ------P---ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCR-
: :: . .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.::::.
CCDS35 RLERGLPYGGSCGGGIDGGG-SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHP
220 230 240 250 260 270
140 150 160 170 180 190
pF1KSD SLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQA
: : :. . :... : . : ..:.::. ::.:. .: .:.
CCDS35 SGPMSEEPGSAQLEKRESKEQ---------QEDSSATSFSDLPLYLDDT-----VP-QQS
280 290 300 310 320
200 210 220 230 240
pF1KSD GDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAH------------KEDKADTDTSCRSTPSLERQE
.: ::: . : :..:: : .:: . . . :. :: ..
CCDS35 PERLPSTEPPPQGR-----PEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRD
330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKH-GPHSGAP-
:::. :::::::::::::::::::::.:::..:: .:: . . .:. :: :: . ::
CCDS35 FRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPI
380 390 400 410 420 430
310 320 330 340 350
pF1KSD --KSLPREEPELRPRPPRPL----DSHLAINGSAN--RQSKSES--DYSDG-DNDSINST
. : : : :: :: .: . .: :. : .: :. . ::: ::.:..:.
CCDS35 PHRHYPAPEGPA-PAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESS
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SNSNDTINCSSESSSRDSLREQT---LSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLN
::::.:::::: ::::::::: : ::::..:.:.:::::::.:::...::::::::
CCDS35 SNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLN
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV
:::::::::.::::::::. :::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV
560 570 580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIF
:::::::.:.::.::::::.:::::::::::::::::::::::.:::..:::::::::::
CCDS35 VDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIF
620 630 640 650 660 670
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELK
::::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::.::::::..:.:::.::. :::.
CCDS35 ILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELR
680 690 700 710 720 730
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGL
::.::::::: ::..:::::: ::::::::::: :.:.::::::.::.:::
CCDS35 TNDDHVSQVQAVERMIVGKKP----------VLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGL
740 750 760 770 780
660 670 680 690 700 710
pF1KSD HQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPG
::::.::::::::::::::::: ::::::::: : :.. ::.:.:: ::.: :.:::
CCDS35 HQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPG
790 800 810 820 830 840
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSL
.. :::: ::::. ::: .::.::::::::::::::.:.:::::::::..::. :: ..
CCDS35 GERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGG-
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPF
:.: :::..:. :.:.:..:.::::.::::::::::.::
CCDS35 AKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGVCY
910 920 930 940
840
pF1KSD EPLQPSVLCS
>>CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX (1488 aa)
initn: 2481 init1: 1406 opt: 1691 Z-score: 1433.8 bits: 277.1 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 3237; 62.4% identity (79.3% similar) in 866 aa overlap (1-827:336-1167)
10 20 30
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
:::::::: ...:.::::::::::::.:::
CCDS48 RKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNK
310 320 330 340 350 360
40 50 60 70 80
pF1KSD NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGALVS
:::::::: ::.::::::.::::::::::: ::... .::::: .:. ..:.. ::
CCDS48 NFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGARSH
370 380 390 400 410 420
90 100 110 120 130
pF1KSD ------P---ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCR-
: :: . .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.::::.
CCDS48 RLERGLPYGGSCGGGIDGGG-SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHP
430 440 450 460 470 480
140 150 160 170 180 190
pF1KSD SLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQA
: : :. . :... : . : ..:.::. ::.:. .: .:.
CCDS48 SGPMSEEPGSAQLEKRESKEQ---------QEDSSATSFSDLPLYLDDT-----VP-QQS
490 500 510 520
200 210 220 230 240
pF1KSD GDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAH------------KEDKADTDTSCRSTPSLERQE
.: ::: . : :..:: : .:: . . . :. :: ..
CCDS48 PERLPSTEPPPQGR-----PEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRD
530 540 550 560 570 580
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKH-GPHSGAP-
:::. :::::::::::::::::::::.:::..:: .:: . . .:. :: :: . ::
CCDS48 FRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPI
590 600 610 620 630 640
310 320 330 340 350
pF1KSD --KSLPREEPELRPRPPRPL----DSHLAINGSAN--RQSKSES--DYSDG-DNDSINST
. : : : :: :: .: . .: :. : .: :. . ::: ::.:..:.
CCDS48 PHRHYPAPEGPA-PAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESS
650 660 670 680 690 700
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SNSNDTINCSSESSSRDSLREQT---LSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLN
::::.:::::: ::::::::: : ::::..:.:.:::::::.:::...::::::::
CCDS48 SNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLN
710 720 730 740 750 760
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV
:::::::::.::::::::. :::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV
770 780 790 800 810 820
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIF
:::::::.:.::.::::::.:::::::::::::::::::::::.:::..:::::::::::
CCDS48 VDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIF
830 840 850 860 870 880
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELK
::::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::.::::::..:.:::.::. :::.
CCDS48 ILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELR
890 900 910 920 930 940
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGL
::.::::::: ::..:::::: ::::::::::: :.:.::::::.::.:::
CCDS48 TNDDHVSQVQAVERMIVGKKP----------VLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGL
950 960 970 980 990
660 670 680 690 700 710
pF1KSD HQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPG
::::.::::::::::::::::: ::::::::: : :.. ::.:.:: ::.: :.:::
CCDS48 HQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPG
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD ADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSL
.. :::: ::::. ::: .::.::::::::::::::.:.:::::::::..::. :: ..
CCDS48 GERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGG-
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780 790 800 810 820 830
pF1KSD KKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPF
:.: :::..:. :.:.:..:.::::.::::::::::.:::::::.:.:::.:..:
CCDS48 AKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
840
pF1KSD EPLQPSVLCS
CCDS48 SSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASAS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFE
:::.::::.::.:.:: ::::::::::..::::..:.:. :.:. ::: :
CCDS31 MLEHKYGGHLVSRRAACTIQTAFRQYQLSKNFEKIRNSLLESRLPRRISL----------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSPECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDA
.::.: : :.. . . . . : .. : ..::. :: ..:::::.
CCDS31 --RKVRSPTAE----SLAAEKALMEGY-----GLVGLPL-VRSPSLPPTFAGTLTELEDS
60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KSD FSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALDAARARDTEPQTALH--GMDHRKLDEMTASY
:..::.:::.::::::. ::.: . ..: :.: :.. : :
CCDS31 FTEQVQSLAKSIDDALSTWSLKTMCSLRESGAYQLHQALQAAAGPPGLEA----EGRAPE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCR
: :. .: :: ...: . . :. .. .. .. . . : . ..:
CCDS31 SAGPGPGDDAAETPGLPPAHSGTLMMAFR-DVTVQIANQN-----ISVSSSTALSVANCL
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD STPSLERQEQRL--RVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSP
.. ... . ..:. : : .: : : . : . .: :. .:.
CCDS31 GAQTVQAPAEPAAGKAEQGETSGREAPEAPAVGREDASAEDSCAEAAAS----GAADGAT
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSN
:::. .:: : .. ..: ...:. :: ....:.:.
CCDS31 -------APKTEEEEEEEE--------------TAEVGRGAEAEA----GDLEQLSSSST
270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SNDTINCSSESS---SRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLF
:. . . .::.: :.:.:. . :: :: : : ::..:.:..::: ::::::::
CCDS31 STKSAKSGSEASASASKDALQAMILSLPRYHCENPASCKSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLF
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVD
: .:.::.:.:: :::.::::.::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::
CCDS31 NINPDKGIQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVD
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFIL
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::.::.::::::::
CCDS31 EMDFSSMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFIL
420 430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KSD AFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTN
:::::::::::::::.::.::: :::::.:::::::: :::::...::::::...:::.:
CCDS31 AFAIILLNTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSN
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD EDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQ
::::. : :::: ::: : :::.::::::: ::::: : :: :: . ::
CCDS31 EDHVTYVTKVEKSIVGMKT----------VLSVPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQ
540 550 560 570 580
660 670 680 690 700 710
pF1KSD REIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPGAD
::.::::::::. :. :::.: ::.: .: .: ::: ::::.:: .:: :.. . :..
CCDS31 REVFLFNDLLVILKLCPKKKSSSTYTFCKSVGLLGMQFQLFENEYYSHGITLVTPLSGSE
590 600 610 620 630 640
720 730 740 750 760 770
pF1KSD IKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSL--
: ...: : . .. .::..::.:::::: :.:. ::: :::::.:. :.. :..
CCDS31 KKQVLHFCALGSDEMQKFVEDLKESIAEVTELEQIRIEWELEKQQGTKTLSFKPCGAQGD
650 660 670 680 690 700
780 790 800 810 820 830
pF1KSD -KKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQP
....:. : .:
CCDS31 PQSKQGSPTAKREAALRERPAESTVEVLINASPARLTILPISRDTIKSYC
710 720 730 740 750
>>CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 (1182 aa)
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10 20 30
pF1KSD MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNK
:::.::::.::.:.:: ::::::::::..:
CCDS53 QPALATALCPHAPAASDYELSLDLKNKQIEMLEHKYGGHLVSRRAACTIQTAFRQYQLSK
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pF1KSD NFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSP
:::..:.:. :.:. ::: : .::.: : :.. . . . .
CCDS53 NFEKIRNSLLESRLPRRISL------------RKVRSPTAE----SLAAEKALMEGY---
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pF1KSD ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALD
: .. : ..::. :: ..:::::.:..::.:::.::::::. ::.: . .
CCDS53 --GLVGLPL-VRSPSLPPTFAGTLTELEDSFTEQVQSLAKSIDDALSTWSLKTMCSLRES
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pF1KSD AARARDTEPQTALH--GMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTES
.: :.: :.. : : : :. .: :: ...: . .
CCDS53 GAYQLHQALQAAAGPPGLEA----EGRAPESAGPGPGDDAAETPGLPPAHSGTLMMAFR-
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD DLRLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRL--RVEHLPLLTIEPPSDS
:. .. .. .. . . : . ..: .. ... . ..:. : :
CCDS53 DVTVQIANQ-----NISVSSSTALSVANCLGAQTVQAPAEPAAGKAEQGETSGREAPEAP
490 500 510 520 530 540
270 280 290 300 310 320
pF1KSD SVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSH
.: : : . : . .: :. .:. :::. .:: :
CCDS53 AVGREDASAEDSCAEAAAS----GAADGAT-------APKTEEEEEEEE-----------
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pF1KSD LAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESS---SRDSLREQTLSKQTY
.. ..: ...:. :: ....:.:.:. . . .::.: :.:.:. . :: :
CCDS53 ---TAEVGRGAEAEA----GDLEQLSSSSTSTKSAKSGSEASASASKDALQAMILSLPRY
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD HKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQ
: : : ::..:.:..::: ::::::::: .:.::.:.:: :::.::::.::::::::
CCDS53 HCENPASCKSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLFNINPDKGIQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQ
640 650 660 670 680 690
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVE
::::::::::::::: .::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVE
700 710 720 730 740 750
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pF1KSD RLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKN
:::::::::::.::: ::.::.:::::::::::::::::::::::.::.::: :::::.:
CCDS53 RLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRN
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pF1KSD LRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCV
::::::: :::::...::::::...:::.:::::. : :::: ::: : :
CCDS53 LRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNEDHVTYVTKVEKSIVGMKT----------V
820 830 840 850 860
630 640 650 660 670 680
pF1KSD LSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQS
::.::::::: ::::: : :: :: . ::::.::::::::. :. :::.: ::.: .:
CCDS53 LSVPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFNDLLVILKLCPKKKSSSTYTFCKS
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD FSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQ
.: ::: ::::.:: .:: :.. . :.. : ...: : . .. .::..::.::::::
CCDS53 VGLLGMQFQLFENEYYSHGITLVTPLSGSEKKQVLHFCALGSDEMQKFVEDLKESIAEVT
930 940 950 960 970 980
750 760 770 780 790
pF1KSD EMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSL---KKESGNGTLSR-ACLDDSYASG--EGLKR
:.:. ::: :::::.:. :.. :.. ....:. : .: : : . : . : .
CCDS53 ELEQIRIEWELEKQQGTKTLSFKPCGAQGDPQSKQGSPTAKREAALRERPAESTVEVSIH
990 1000 1010 1020 1030 1040
800 810 820 830 840
pF1KSD SALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS
. :..: .. . ...:: .:. . : :: :
CCDS53 NRLQTSQHNSGLGAERGAPVPPPDLQPSPPRQQTPPLPPPPPTPPGTLVQCQQIVKVIVL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
CCDS53 DKPCLARMEPLLSQALSCYTSSSSDSCGSTPLGGPGSPVKVTHQPPLPPPPPPYNHPHQF
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KSD SSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIE
:. . :.:.. .: . :: :.::.:.:.:
CCDS12 KQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMAMGRKKFNMDPKKGIQFLVE
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pF1KSD RGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEAL
.. .:: .:.:: . .::.. ::..::.:. ..: :: :: .:. ..: .::
CCDS12 NELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGERE-ELNLAVLHAFVDLHEFTDLNLVQAL
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD RKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYS
:.: .:. :::::..:..:::.::::.::::: :.. :: ..:.::.:.:::....
CCDS12 RQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPGV---FQSTDTCYVLSFAVIMLNTSLHN
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pF1KSD PNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKL
:::. : :: :. ::...: :.:.:.: ..:. ::.. .: ::
CCDS12 PNVRD--KPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGNDLTHTFFN
210 220 230 240 250
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pF1KSD IVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVT
CCDS12 PDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVDDPRKP
260 270 280 290 300 310
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:... .: . :: :.::.:.::: ..
CCDS32 ADIQRLKDEIAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLK
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQA
.: .:.:: . .::.. ::..::.:. .:: .:: :. .:. ..: .:::.:
CCDS32 NTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERD-EFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLW
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD HIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKP
.:. :::::..:..:::.:::: :: :: :.. :: ..:.::::.:::....::::
CCDS32 SFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNGV---FQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKD
160 170 180 190 200
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pF1KSD ERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKK
: .: :: ::..:: :.:.:.: ..:: :... .: ::
CCDS32 --KPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREG
210 220 230 240 250 260
620 630 640 650 660 670
pF1KSD PIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQK
CCDS32 WLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFEL
270 280 290 300 310 320
>>CCDS42392.2 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 (398 aa)
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380 390 400 410 420 430
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