Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0778
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0778, 1020 aa
1>>>pF1KSDA0778 1020 - 1020 aa - 1020 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6448+/-0.00111; mu= 19.4014+/- 0.066
mean_var=71.6815+/-14.556, 0's: 0 Z-trim(103.0): 65 B-trim: 169 in 2/47
Lambda= 0.151485
statistics sampled from 7121 (7186) to 7121 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020) 6699 1474.3 0
CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 5942 1308.8 0
CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026) 5927 1305.5 0
CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 5918 1303.6 0
CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1013) 5917 1303.4 0
CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024) 5917 1303.4 0
CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 ( 992) 5862 1291.3 0
CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 (1029) 5412 1193.0 0
CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035) 4419 976.0 0
CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1039) 4385 968.5 0
CCDS53858.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1045) 4363 963.7 0
CCDS44255.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 ( 165) 948 217.0 2.6e-56
CCDS46913.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 888) 519 123.6 1.8e-27
CCDS56281.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 903) 519 123.6 1.8e-27
CCDS46914.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 919) 519 123.6 1.9e-27
CCDS56280.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 923) 519 123.6 1.9e-27
CCDS46912.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 939) 519 123.6 1.9e-27
CCDS56279.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 944) 519 123.6 1.9e-27
CCDS33856.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 949) 519 123.6 1.9e-27
CCDS75006.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 953) 519 123.6 1.9e-27
CCDS56278.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 973) 519 123.6 2e-27
CCDS42207.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 946) 515 122.8 3.5e-27
CCDS42234.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1029) 515 122.8 3.8e-27
CCDS11041.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1043) 515 122.8 3.8e-27
CCDS11042.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1052) 515 122.8 3.8e-27
CCDS45580.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 998) 513 122.3 5e-27
CCDS45579.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 999) 513 122.3 5e-27
CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 (1042) 511 121.9 7e-27
CCDS9143.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 ( 997) 507 121.0 1.2e-26
CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 869) 496 118.6 5.8e-26
CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 994) 496 118.6 6.5e-26
CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (1001) 495 118.4 7.6e-26
CCDS67088.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 975) 463 111.4 9.5e-24
CCDS41817.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1176) 400 97.7 1.6e-19
CCDS9035.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1220) 400 97.7 1.6e-19
CCDS30977.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1170) 399 97.4 1.8e-19
CCDS1440.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1205) 399 97.4 1.8e-19
CCDS14722.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1173) 398 97.2 2.1e-19
CCDS35440.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1220) 398 97.2 2.2e-19
CCDS82733.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1154) 396 96.8 2.8e-19
CCDS2601.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1198) 396 96.8 2.9e-19
CCDS33701.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1243) 396 96.8 3e-19
>>CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020 aa)
initn: 6699 init1: 6699 opt: 6699 Z-score: 7905.0 bits: 1474.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6699; 100.0% identity (100.0% similar) in 1020 aa overlap (1-1020:1-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETRNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETRNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NSTNKYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSTNKYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKAC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTDK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSYG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEETA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKETYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKETYY
970 980 990 1000 1010 1020
>>CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023 aa)
initn: 3207 init1: 3207 opt: 5942 Z-score: 7010.9 bits: 1308.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5942; 87.0% identity (95.9% similar) in 1025 aa overlap (1-1020:1-1023)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGRE-YSPAATTAENGG--GKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDL
::.:.::. : :::.. :.: ::: .:....:::::::.::::::::::: ::: .::
CCDS88 MGKGVGRDKYEPAAVS-EQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQA
:.:::. :: ..::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:::
CCDS88 SRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQ
: :.::.::::::::::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::.
CCDS88 ATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLET
:::::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS88 INAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLET
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVA
::: :::::::::::::::. :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..:::::
CCDS88 RNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
::::::::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..::: : ::
CCDS88 NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAE
::::::::::::::.:.:::. . :: .::::::::::::::: ::::..::.: :..:
CCDS88 ALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IPFNSTNKYQLSIHEREDS--PQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAF
::::::::::::::. .. :: :.:::::::::::::::.::..::: :::.:..:::
CCDS88 IPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQ-HLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAA
::::.:::::::::::::.: ::. .::.::.::::..::: ..::::::.:::::::::
CCDS88 QNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS88 VPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDG
.::::::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAY
:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRN
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS88 TLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRN
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDL
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:.::::: .::.
CCDS88 PKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDV
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGL
::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS88 EDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGL
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVE
.::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::.:: ::::::
CCDS88 FEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVE
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KSD KETYY
:::::
CCDS88 KETYY
1020
>>CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026 aa)
initn: 3185 init1: 3185 opt: 5927 Z-score: 6993.2 bits: 1305.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5927; 86.8% identity (95.4% similar) in 1026 aa overlap (1-1020:1-1026)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGREYSPAATT--AENGGGKKKQKEKE---LDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQV
:: :.. : :.. .. . ::.: :: ::.::::::: .::.:..:. :::..
CCDS58 MGSGGSDSYRIATSQDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DLSKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGI
: .:::...::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEK
::. ::.::.::::::.:::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS58 QAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD MQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPL
::.::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::.:::
CCDS58 MQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITG
::::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::
CCDS58 ETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: : :
CCDS58 VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD WTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKV
:.:::.:::::::::::.::.:: : :::.:::::::::::::::: :::. ::.:: ::
CCDS58 WVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AEIPFNSTNKYQLSIHERED-SPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDA
::::::::::::::::: :: . . ..::::::::::::::::::.:::: :::.::..:
CCDS58 AEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FQNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRA
:::::.:::::::::::::. :: .::.:: :: :..:: :..:::::::::::::::
CCDS58 FQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS58 AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNP
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD REAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
:.:::::.::.::::.::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD YTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPR
:::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPR
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMND
: .:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::. :.::::.:::::.::
CCDS58 NPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVND
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD LEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
:::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LLEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWV
:.::::::::::::::: ::::::::: .:::::::::.:::.:::.::::::: :::::
CCDS58 LFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWV
970 980 990 1000 1010 1020
1020
pF1KSD EKETYY
::::::
CCDS58 EKETYY
>>CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023 aa)
initn: 3207 init1: 3207 opt: 5918 Z-score: 6982.6 bits: 1303.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5918; 86.8% identity (95.7% similar) in 1025 aa overlap (1-1020:1-1023)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGRE-YSPAATTAENGG--GKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDL
:. .::. : :::.. :.: ::: .:....:::::::.::::::::::: ::: .::
CCDS53 MAFKVGRDKYEPAAVS-EQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQA
:.:::. :: ..::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:::
CCDS53 SRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQ
: :.::.::::::::::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::.
CCDS53 ATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLET
:::::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS53 INAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLET
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVA
::: :::::::::::::::. :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..:::::
CCDS53 RNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
::::::::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..::: : ::
CCDS53 NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAE
::::::::::::::.:.:::. . :: .::::::::::::::: ::::..::.: :..:
CCDS53 ALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IPFNSTNKYQLSIHEREDS--PQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAF
::::::::::::::. .. :: :.:::::::::::::::.::..::: :::.:..:::
CCDS53 IPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQ-HLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAA
::::.:::::::::::::.: ::. .::.::.::::..::: ..::::::.:::::::::
CCDS53 QNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS53 VPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDG
.::::::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAY
:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRN
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS53 TLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRN
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDL
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:.::::: .::.
CCDS53 PKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDV
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGL
::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGL
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVE
.::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::.:: ::::::
CCDS53 FEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVE
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KSD KETYY
:::::
CCDS53 KETYY
1020
>>CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1013 aa)
initn: 3185 init1: 3185 opt: 5917 Z-score: 6981.4 bits: 1303.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5917; 88.4% identity (96.7% similar) in 1001 aa overlap (22-1020:13-1013)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEK-ELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSK
:.: ::. .::.::::::: .::.:..:. :::..: .
CCDS12 MGDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAM
:::...::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 GLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQIN
::.::.::::::.:::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:
CCDS12 EDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETRN
:::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::.:::::::
CCDS12 AEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVF
: :::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::
CCDS12 ITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: : ::.::
CCDS12 EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVAL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIP
:.:::::::::::.::.:: : :::.:::::::::::::::: :::. ::.:: ::::::
CCDS12 SHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FNSTNKYQLSIHERED-SPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNA
::::::::::::: :: . . ..::::::::::::::::::.:::: :::.::..:::::
CCDS12 FNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQNA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD YMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPD
:.:::::::::::::. :: .::.:: :: :..:: :..:::::::::::::::::::
CCDS12 YLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::
CCDS12 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
:::.::.::::.::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQT
:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: .:
CCDS12 SNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRT
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDS
::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::. :.::::.:::::.::::::
CCDS12 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLEDS
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD YGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEE
:::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS12 YGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKET
::::::::::::: ::::::::: .:::::::::.:::.:::.::::::: :::::::::
CCDS12 TALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKET
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KSD YY
::
CCDS12 YY
>>CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024 aa)
initn: 3185 init1: 3185 opt: 5917 Z-score: 6981.4 bits: 1303.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5917; 88.4% identity (96.7% similar) in 1001 aa overlap (22-1020:24-1024)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEK-ELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDL
:.: ::. .::.::::::: .::.:..:. :::..:
CCDS58 MGGWEEERNRRATDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQA
.:::...::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQ
. ::.::.::::::.:::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS58 GTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD INAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLET
.::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::.:::::
CCDS58 VNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLET
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVA
::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS58 RNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: : ::.
CCDS58 NLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAE
:::.:::::::::::.::.:: : :::.:::::::::::::::: :::. ::.:: ::::
CCDS58 ALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IPFNSTNKYQLSIHERED-SPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQ
::::::::::::::: :: . . ..::::::::::::::::::.:::: :::.::..:::
CCDS58 IPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQ
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD NAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAV
:::.:::::::::::::. :: .::.:: :: :..:: :..:::::::::::::::::
CCDS58 NAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS58 PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRD
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
:::::.::.::::.::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNS
:::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNP
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLE
.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::. :.::::.:::::.::::
CCDS58 RTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLE
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLL
:::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 DSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLF
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD EETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEK
::::::::::::::: ::::::::: .:::::::::.:::.:::.::::::: :::::::
CCDS58 EETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEK
970 980 990 1000 1010 1020
1020
pF1KSD ETYY
::::
CCDS58 ETYY
>>CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (992 aa)
initn: 3207 init1: 3207 opt: 5862 Z-score: 6916.6 bits: 1291.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5862; 88.3% identity (96.5% similar) in 993 aa overlap (30-1020:1-992)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKG
.:::::::.::::::::::: ::: .:::.:
CCDS53 MDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAME
::. :: ..::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:::: :
CCDS53 LTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAATE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINA
.::.::::::::::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::.:::
CCDS53 EEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSINA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETRNI
::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::::::::.::.:::::::::
CCDS53 EEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVFL
:::::::::::::::. :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::::::::
CCDS53 AFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVFL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLE
:::::.::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..::: : :: :::
CCDS53 AVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLALS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPF
:::::::::::.:.:::. . :: .::::::::::::::: ::::..::.: :..::::
CCDS53 RIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEIPF
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KSD NSTNKYQLSIHEREDS--PQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNA
:::::::::::. .. :: :.:::::::::::::::.::..::: :::.:..::::::
CCDS53 NSTNKYQLSIHKNPNTSEPQ-HLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNA
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD YMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPD
:.:::::::::::::.: ::. .::.::.::::..::: ..::::::.::::::::::::
CCDS53 YLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVPD
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::
CCDS53 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQT
::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::: .:
CCDS53 SNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKT
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:.::::: .::.:::
CCDS53 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVEDS
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD YGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEE
:::.:::::::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS53 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKET
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::.:: :::::::::
CCDS53 TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKET
940 950 960 970 980 990
1020
pF1KSD YY
::
CCDS53 YY
>>CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 (1029 aa)
initn: 5410 init1: 2840 opt: 5412 Z-score: 6384.9 bits: 1193.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5412; 80.5% identity (94.1% similar) in 999 aa overlap (22-1020:32-1029)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGR
:.........::::::.::::::.:.::.
CCDS11 GLWGKKGTVAPHDQSPRRRPKKGLIKKKMVKREKQKRNMEELKKEVVMDDHKLTLEELST
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KYQVDLSKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFL
::.:::.:: ..:::...:.: :::..:::::::::::::.:::::::.::: ::::::.
CCDS11 KYSVDLTKGHSHQRAKEILTRGGPNTVTPPPTTPEWVKFCKQLFGGFSLLLWTGAILCFV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AYGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIR
::.:: ...::..:::::..::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS11 AYSIQIYFNEEPTKDNLYLSIVLSVVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EGEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTH
:::::::..:::.:::::.:::::::::::.::..::::::::::::::::.:::.:::
CCDS11 GGEKMQINVQEVVLGDLVEIKGGDRVPADLRLISAQGCKVDNSSLTGESEPQSRSPDFTH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQ
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:.::: ::.:::: ::::::.
CCDS11 ENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDSTVMGRIASLTSGLAVGQTPIAAEIEHFIH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LITGVAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMAR
::: :::::::.::.:::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LITVVAVFLGVTFFALSLLLGYGWLEAIIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMAR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..::::::.:.: :: :
CCDS11 KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDMTVYEADTTEEQTGKTFTK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RSPTWTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDR
: :: :.::::::::: :::.:: . ..:: :.:::::::::: :: : .:: .::..
CCDS11 SSDTWFMLARIAGLCNRADFKANQEILPIAKRATTGDASESALLKFIEQSYSSVAEMREK
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD NPKVAEIPFNSTNKYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEM
::::::::::::::::.::: :::: :.:::.:::::::::. :::.:..:.: .. ::
CCDS11 NPKVAEIPFNSTNKYQMSIHLREDSSQTHVLMMKGAPERILEFCSTFLLNGQEYSMNDEM
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QDAFQNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDP
..::::::.::::::::::::: :::::. : .:: :.:::.::: ..::::::.:::::
CCDS11 KEAFQNAYLELGGLGERVLGFCFLNLPSS-FSKGFPFNTDEINFPMDNLCFVGLISMIDP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQ
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:..::::.::.:.
CCDS11 PRAAVPDAVSKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGTETAEEVAARLKIPISK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VNPREAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAV
:. ::: ::::..:::. :.:::.::.:: ::::::::::::::::::::: ::.:::
CCDS11 VDASAAKAIVVHGAELKDIQSKQLDQILQNHPEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRLGAVVAV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD TGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKR
:: ::::::::::::::.::: .:::::::.::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS11 SIMYTLTSNIPEITPFLMFIILGIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYESAESDIMKR
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QPRNSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRT
::: .::.:::.:::.::::::::::::.:::::::::::::: : :::::: :.:.
CCDS11 LPRNPKTDNLVNHRLIGMAYGQIGMIQALAGFFTYFVILAENGFRPVDLLGIRLHWEDKY
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD MNDLEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKIL
.:::::::::.:::::::::::::.::::..::::::::::: ::::::.:::::.::.:
CCDS11 LNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCQTAFFVTIVVVQWADLIISKTRRNSLFQQGMRNKVL
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD IFGLLEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPG
:::.:::: ::::::: ::: :::::::::.:::.::.:::.:::.:::.:::..:..:
CCDS11 IFGILEETLLAAFLSYTPGMDVALRMYPLKITWWLCAIPYSILIFVYDEIRKLLIRQHPD
970 980 990 1000 1010 1020
1020
pF1KSD GWVEKETYY
::::.::::
CCDS11 GWVERETYY
>>CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035 aa)
initn: 4164 init1: 2136 opt: 4419 Z-score: 5212.0 bits: 976.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4419; 63.1% identity (86.1% similar) in 1024 aa overlap (1-1020:14-1035)
10 20 30 40
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAEN-GGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSL
.: : : ... . .. ::: :.::: :...:::. ..::.::.
CCDS12 MGKAENYELYSVELGPGPGGDMAAKMSKKKKAGGGGGKRKEK-LENMKKEMEINDHQLSV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD DELGRKYQVDLSKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGA
:: .:::.. .:::. . : ..: ::::::: :: :::.::: ::: ::.. :.:..:
CCDS12 AELEQKYQTSATKGLSASLAAELLLRDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVAA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQ
.:..:..:::. : ..:::::...: :::.:::::.:::: ::..:. ::::.::::
CCDS12 AICLIAFAIQASEGDLTTDDNLYLAIALIAVVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRS
: :::.:.:.::::...:::::::.:::::::::.::....:::::::::::::::::::
CCDS12 ATVIRDGDKFQINADQLVVGDLVEMKGGDRVPADIRILAAQGCKVDNSSLTGESEPQTRS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PEFTHENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEI
:: :::.::::::: :::: :.:::..:.:. :::::..::::.::::.: .::::.::
CCDS12 PECTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTVQGLVVNTGDRTIIGRIASLASGVENEKTPIAIEI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EHFIQLITGVAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTA
:::...:.:.:...:..::.... .::..:.:..:...:.:: :::::::::::::.:::
CCDS12 EHFVDIIAGLAILFGATFFIVAMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLATVTVCLSLTA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSG
::.: :::.::::::::::::::.::::::::::::::::.:.::::.:: :::::::::
CCDS12 KRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIHTADTTEDQSG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD ATFDKRSPTWTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVR
:::. : :: :: :. :::::.::.::. . : :: . :::::.:::: ::. :..
CCDS12 QTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDAVPVPKRIVIGDASETALLKFSELTLGNAM
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KMRDRNPKVAEIPFNSTNKYQLSIHERED--SPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKE
.::: ::: :::::::::.::::: :: .:. :.:::::::::.:.:::.::..:.:
CCDS12 GYRDRFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPR-HLLVMKGAPERVLERCSSILIKGQE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD IPLDKEMQDAFQNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVG
.:::.. ..:::.::. :::::::::::::: : .: :. ::.. .:::. :::.:
CCDS12 LPLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLNEKDYPPGYAFDVEAMNFPSSGLCFAG
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR
:.::::::::.::::: :::.:::.:::::::::::::::: .:::::::.:::::::::
CCDS12 LVSMIDPPRATVPDAVLKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGIISEGSETVEDIAAR
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LNIPMSQVNPREAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQR
: .:..::: ..:.:::..: .:::: .: : :..: :.:::::::::::.:::.:::
CCDS12 LRVPVDQVNRKDARACVINGMQLKDMDPSELVEALRTHPEMVFARTSPQQKLVIVESCQR
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRL
:::::::::::::::::::::::.::::.:::..:.:::::::::::::::::::.:::
CCDS12 LGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQGRL
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD IFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAA
::::::::::::::.::::.::.:..: ...::::: .::: :.: ::. :..::::: :
CCDS12 IFDNLKKSIAYTLTKNIPELTPYLIYITVSVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYEKA
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD ESDIMKRQPRNSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIR
:::::. .::: . :.:::: : ...: ::: ::...:: ::. .:..:..: .:.:
CCDS12 ESDIMHLRPRNPKRDRLVNEPLAAYSYFQIGAIQSFAGFTDYFTAMAQEGWFPLLCVGLR
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LDWDDRTMNDLEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQ
.:.:. ..::.::::::::. :: ..::.:.:: :: : : ::..: :::: :.:::
CCDS12 AQWEDHHLQDLQDSYGQEWTFGQRLYQQYTCYTVFFISIEVCQIADVLIRKTRRLSAFQQ
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD GM-KNKILIFGLLEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRK
:. .::::..... .. .. :: ::::: . ..:.. ::. .::..:::.:::.::
CCDS12 GFFRNKILVIAIVFQVCIGCFLCYCPGMPNIFNFMPIRFQWWLVPLPYGILIFVYDEIRK
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020
pF1KSD LILRRYPGGWVEKETYY
: .: ::.: ..: ::
CCDS12 LGVRCCPGSWWDQELYY
1020 1030
>>CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1039 aa)
initn: 4377 init1: 2109 opt: 4385 Z-score: 5171.8 bits: 968.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4385; 65.8% identity (86.8% similar) in 1001 aa overlap (23-1020:42-1039)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRK
::...:: :..::. .:::::: :: .:
CCDS31 ELSGTKDIVKTDKGDGKEKYRGLKNNCLELKKKNHKE--EFQKELHLDDHKLSNRELEEK
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YQVDLSKGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLA
: .:. ::.. :: ..:::::::.:::: ::: ::: .:. ::::::::.::.::..:
CCDS31 YGTDIIMGLSSTRAAELLARDGPNSLTPPKQTPEIVKFLKQMVGGFSILLWVGAFLCWIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD YGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIRE
:::: . . : .:.::: ::. :::.:: :.:::::::..::.::..:.::::::::.
CCDS31 YGIQYSSDKSASLNNVYLGCVLGLVVILTGIFAYYQEAKSTNIMSSFNKMIPQQALVIRD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHE
.:: : .:..::::.:::::::..:::.:..::.::.::::::::::::: :: :::::
CCDS31 SEKKTIPSEQLVVGDIVEVKGGDQIPADIRVLSSQGCRVDNSSLTGESEPQPRSSEFTHE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQL
:::::.::::.::.:.:::. :.:: :::::..:.::.::::. .::::.:::::...
CCDS31 NPLETKNICFYSTTCLEGTVTGMVINTGDRTIIGHIASLASGVGNEKTPIAIEIEHFVHI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ITGVAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARK
..:::: .:. ::.... : :. :...::::::::::::::::::::: :.:::::::.:
CCDS31 VAGVAVSIGILFFIIAVSLKYQVLDSIIFLIGIIVANVPEGLLATVTVTLSLTAKRMAKK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKR
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::: :::.::.:. .::.
CCDS31 NCLVKNLEAVETLGSTSIICSDKTGTLTQNRMTVAHLWFDNQIFVADTSEDHSNQVFDQS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SPTWTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRN
: ::..::.: ::::: :: ::::. . :. . :::::.:::: :. :.: ..: ::
CCDS31 SRTWASLSKIITLCNRAEFKPGQENVPIMKKAVIGDASETALLKFSEVILGDVMEIRKRN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PKVAEIPFNSTNKYQLSIHEREDSPQSH--VLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKE
::::::::::::.:::::: .: :... ..::::::::::..::::...:.: ::::
CCDS31 RKVAEIPFNSTNKFQLSIHEMDD-PHGKRFLMVMKGAPERILEKCSTIMINGEEHPLDKS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD MQDAFQNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMID
.:..::::::::::::::::.: ::. .::. ..:: : .:::: .::::::.::::
CCDS31 TAKTFHTAYMELGGLGERVLGFCHLYLPADEFPETYSFDIDAMNFPTSNLCFVGLLSMID
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMS
:::..::::: :::::::::::::::::::::::::.::::: ..::::::: :::: .
CCDS31 PPRSTVPDAVTKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISANSETVEDIAHRLNIAVE
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QVNPREAKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVA
::: :.::: :: : .::::.:::::::: :. :::::::::::::::::::::: :.::
CCDS31 QVNKRDAKAAVVTGMELKDMSSEQLDEILANYQEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQDAVVA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
:::::::::::::::::::::::.:::..:.::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTGDGVNDSPALKKADIGIAMGIAGSDAAKNAADMVLLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KSIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMK
:.:::.::.:: :. :::..::...:::.::.::: ::::::..:.:.:::: ::::::.
CCDS31 KTIAYSLTKNIAELCPFLIYIIVGLPLPIGTITILFIDLGTDIIPSIALAYEKAESDIMN
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RQPRNSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDR
:.::... :.:::. : ..: .::..::::.:..::.. :..:::: :...:..:.
CCDS31 RKPRHKNKDRLVNQPLAVYSYLHIGLMQALGAFLVYFTVYAQEGFLPRTLINLRVEWEKD
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KSD TMNDLEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGM-KNK
.:::.:::::::: ::. .:.: .::::..:.: : ::::: ::::::.::::. .::
CCDS31 YVNDLKDSYGQEWTRYQREYLEWTGYTAFFVGILVQQIADLIIRKTRRNSIFQQGLFRNK
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ILIFGLLEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRY
.. :. . .. .::: : .:: . :.. .:: : :...::..:::::::..: :
CCDS31 VIWVGITSQIIIGLILSYGLGSVTALSFTMLRAQYWFVAVPHAILIWVYDEVRKLFIRLY
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020
pF1KSD PGGWVEKETYY
::.: .:. ::
CCDS31 PGSWWDKNMYY
1030
1020 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:04:49 2016 done: Thu Nov 3 03:04:50 2016
Total Scan time: 4.110 Total Display time: 0.500
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]