Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0782, 1205 aa
1>>>pF1KSDA0782 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4799+/-0.000406; mu= 16.6868+/- 0.025
mean_var=119.5556+/-25.344, 0's: 0 Z-trim(115.0): 501 B-trim: 1281 in 1/57
Lambda= 0.117298
statistics sampled from 24540 (25122) to 24540 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 11.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056057 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP doma (1205) 8099 1383.0 0
NP_001035207 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP d (1450) 8099 1383.1 0
NP_001128662 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP d (1133) 4359 750.1 1.8e-215
XP_016863188 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP wit (1704) 2743 476.8 5.3e-133
NP_056045 (OMIM: 606645) arf-GAP with Rho-GAP doma (1704) 2743 476.8 5.3e-133
XP_016863187 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP wit (1710) 2739 476.1 8.5e-133
XP_016863190 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP wit (1659) 2712 471.5 2e-131
XP_016863191 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP wit (1636) 2378 415.0 2e-114
XP_016863189 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP wit (1681) 2378 415.0 2e-114
XP_011535979 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit (1349) 1685 297.6 3.5e-79
XP_005268556 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit (1466) 1685 297.7 3.7e-79
XP_005268554 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit (1531) 1685 297.7 3.8e-79
NP_071926 (OMIM: 606647) arf-GAP with Rho-GAP doma (1544) 1685 297.7 3.9e-79
XP_005268555 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit (1524) 1394 248.4 2.5e-64
XP_005268557 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit ( 934) 1219 218.7 1.4e-55
XP_006714855 (OMIM: 606647) PREDICTED: arf-GAP wit (1473) 1214 218.0 3.7e-55
XP_011523379 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1117) 335 69.1 1.8e-10
XP_016880391 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1119) 335 69.1 1.8e-10
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 333 68.7 1.8e-10
XP_011523378 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1159) 335 69.1 1.8e-10
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 333 68.7 1.8e-10
XP_006722056 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1249) 335 69.2 1.9e-10
XP_011523377 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1285) 335 69.2 2e-10
XP_011523376 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1397) 335 69.2 2.1e-10
XP_006722055 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1408) 335 69.2 2.1e-10
XP_006722054 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1473) 335 69.2 2.2e-10
XP_011523375 (OMIM: 610590) PREDICTED: rho GTPase- (1476) 335 69.2 2.2e-10
NP_001186346 (OMIM: 610590) rho GTPase-activating (1491) 335 69.2 2.2e-10
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 333 68.8 2.3e-10
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 333 68.8 2.4e-10
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 333 68.8 2.4e-10
NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating pro (1499) 331 68.6 3.6e-10
XP_016882203 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1499) 331 68.6 3.6e-10
NP_001123537 (OMIM: 602129,609753) unconventional (2022) 328 68.1 6.4e-10
NP_004136 (OMIM: 602129,609753) unconventional myo (2157) 328 68.2 6.7e-10
NP_067049 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating pro ( 698) 313 65.2 1.6e-09
XP_011538306 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 704) 313 65.2 1.7e-09
NP_001242954 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 704) 313 65.2 1.7e-09
XP_011519925 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (1737) 318 66.4 1.8e-09
XP_011517909 (OMIM: 609870) PREDICTED: rho GTPase- (1491) 317 66.2 1.8e-09
XP_005268459 (OMIM: 605370,607785) PREDICTED: rho ( 722) 310 64.7 2.4e-09
XP_016864739 (OMIM: 605370,607785) PREDICTED: rho ( 725) 310 64.7 2.4e-09
XP_016877719 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2547) 318 66.5 2.4e-09
NP_008832 (OMIM: 604875) unconventional myosin-IXa (2548) 318 66.5 2.4e-09
XP_016877718 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2566) 318 66.5 2.5e-09
XP_011519924 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2566) 318 66.5 2.5e-09
XP_011519923 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2598) 318 66.5 2.5e-09
NP_001129080 (OMIM: 605370,607785) rho GTPase-acti ( 759) 310 64.8 2.5e-09
XP_011519922 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2618) 318 66.5 2.5e-09
XP_011519921 (OMIM: 604875) PREDICTED: unconventio (2619) 318 66.5 2.5e-09
>>NP_056057 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP domain, (1205 aa)
initn: 8099 init1: 8099 opt: 8099 Z-score: 7409.3 bits: 1383.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8099; 100.0% identity (100.0% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:1-1205)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFEHTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 NERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFEHTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD ILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD APETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 APETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD EWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEVRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEVRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LLRNV
:::::
NP_056 LLRNV
>>NP_001035207 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP domai (1450 aa)
initn: 8099 init1: 8099 opt: 8099 Z-score: 7408.2 bits: 1383.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8099; 100.0% identity (100.0% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:246-1450)
10 20 30
pF1KSD MTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPKPVRLFPEFDDSDYDEVPEEGPGAPARVMTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSG
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLD
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNR
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNK
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSEL
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAG
520 530 540 550 560 570
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPST
580 590 600 610 620 630
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDP
640 650 660 670 680 690
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVPRLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVPRLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTAS
700 710 720 730 740 750
520 530 540 550 560 570
pF1KSD AGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFE
760 770 780 790 800 810
580 590 600 610 620 630
pF1KSD HTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLS
820 830 840 850 860 870
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQLRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQLRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQ
880 890 900 910 920 930
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKC
940 950 960 970 980 990
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEAS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
820 830 840 850 860 870
pF1KSD EIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLF
1060 1070 1080 1090 1100 1110
880 890 900 910 920 930
pF1KSD QTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
940 950 960 970 980 990
pF1KSD CTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD HFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAMLLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAMLLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLP
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD SGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPP
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD TCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1180 1190 1200
pF1KSD RLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV
1420 1430 1440 1450
>>NP_001128662 (OMIM: 606646) arf-GAP with Rho-GAP domai (1133 aa)
initn: 4358 init1: 4358 opt: 4359 Z-score: 3989.2 bits: 750.1 E(85289): 1.8e-215
Smith-Waterman score: 7424; 94.0% identity (94.0% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:1-1133)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEEEDDHAYEGVPNGGWHTSSLSLSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLRYFDSNKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAMAEQRARA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTSEVAERIWAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIE--
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPLFGNQEELDKA
:
NP_001 -----------------------------------------------------------A
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVP
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFE
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFEHTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTHGFEHTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCI
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQ
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQL
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pF1KSD GDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVD
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKAL
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD ISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEE
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD LRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLE
840 850 860 870 880 890
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pF1KSD ILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSHLVVKKHQAMEAM
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRS------
960 970 980 990 1000 1010
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD APETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----HRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELR
1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KSD EWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEVRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEVRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFTADPLS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD LLRNV
:::::
NP_001 LLRNV
1130
>>XP_016863188 (OMIM: 606645) PREDICTED: arf-GAP with Rh (1704 aa)
initn: 2499 init1: 1026 opt: 2743 Z-score: 2508.8 bits: 476.8 E(85289): 5.3e-133
Smith-Waterman score: 2902; 41.7% identity (70.7% similar) in 1144 aa overlap (84-1203:484-1591)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
.:.::::: :::. ..:::::..: .
XP_016 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
460 470 480 490 500 510
120 130 140 150 160 170
pF1KSD YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
:....:. ::: .: .. :: : . ::.::::.:..:::.::.:.. ::..:.. : .:.
XP_016 YYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNAL
520 530 540 550 560 570
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
: .. :.: . :.. : :::::.: :..... :..: : :: .... :.
XP_016 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
580 590 600 610 620
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
:::.: :.:.:::.::: .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::
XP_016 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY
630 640 650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
::::.:: :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.:: ::::::::: .
XP_016 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS
690 700 710 720 730 740
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL
.:.. :::::. .:: .: :::.:. .: :. .: :. . ::.:::.:.
XP_016 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
750 760 770 780 790 800
420 430 440 450 460 470
pF1KSD FGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF
..:::.:::::::. :. ::.::: :: . : .::: :: ::..:::.:::::
XP_016 SLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEF
810 820 830 840 850 860
480 490 500 510 520
pF1KSD LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR
: .:. .. :. : : : .. : .. :::.. ::. :: .... :: ...
XP_016 LYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS---QSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKK
870 880 890 900 910 920
530 540 550 560 570 580
pF1KSD WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL
:::: : :::.::....:::: : .:..:::. : . : ::.: .::..:
XP_016 WCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFL
930 940 950 960 970 980
590 600 610 620 630 640
pF1KSD FGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGS
:: :... ..:.. ::: ::: .::.: :.. .:.: :: .:.. ..:::... :
XP_016 FGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKS
990 1000 1010 1020 1030 1040
650 660 670 680 690
pF1KSD ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
:. . . . ..::.::::.: :. . .::.:::. :::::.:. .:::
XP_016 SLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
700 710 720 730 740 750
pF1KSD WLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRL
: ::.:::.. :..:..:::. .:.:.:: :. ..:: :: . ::.: :. . ..:
XP_016 WHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIYQKNGDPLHISEL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKV
:::...:::: .:. :.....::...:: :: :. :.:.:. :. : . .:..:..
XP_016 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI
1170 1180 1190 1200 1210 1220
820 830 840 850 860 870
pF1KSD SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA
..: .. :: :::::. :.: ::: :: :. :.::.::::.::. :::: :: .
XP_016 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
880 890 900 910 920 930
pF1KSD GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK
:.:::::.:: .: : :...... : . :.: . . ...:::.. ::.:.:.
XP_016 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE
1290 1300 1310 1320 1330
940 950 960 970 980 990
pF1KSD AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
. :.. : ::::: .:: .:. . : :. ::: : :: :::::. :.::
XP_016 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ
1340 1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KSD ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAMLLYLASR--VGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSG
.:. .:. ...::::. . ... . ..: .:. :.:..:..:. : . : ..
XP_016 VLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIK-HCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI---LSGN
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTC
:.::::.: .. : :::.:.:.. : .: . ..:.: : :::::..:::
XP_016 KFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSK---------H--DKMFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTS
1460 1470 1480 1490 1500
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD WGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-R
::.:. .::: .:.::::.. ::.......::. .:: .. .:.. . .
XP_016 WGLTAY--SEKH---HWHLCCDSSRTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPK
1510 1520 1530 1540 1550
1180 1190 1200
pF1KSD LGSVSLIPLR--GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV
.:.. :::.. :. . :... . :. : ::
XP_016 IGGLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAE-LERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLE
1560 1570 1580 1590 1600 1610
XP_016 HKDDKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPS
1620 1630 1640 1650 1660 1670
>>NP_056045 (OMIM: 606645) arf-GAP with Rho-GAP domain, (1704 aa)
initn: 2499 init1: 1026 opt: 2743 Z-score: 2508.8 bits: 476.8 E(85289): 5.3e-133
Smith-Waterman score: 2902; 41.7% identity (70.7% similar) in 1144 aa overlap (84-1203:484-1591)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
.:.::::: :::. ..:::::..: .
NP_056 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
460 470 480 490 500 510
120 130 140 150 160 170
pF1KSD YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
:....:. ::: .: .. :: : . ::.::::.:..:::.::.:.. ::..:.. : .:.
NP_056 YYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNAL
520 530 540 550 560 570
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
: .. :.: . :.. : :::::.: :..... :..: : :: .... :.
NP_056 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
580 590 600 610 620
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
:::.: :.:.:::.::: .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::
NP_056 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY
630 640 650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
::::.:: :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.:: ::::::::: .
NP_056 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS
690 700 710 720 730 740
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL
.:.. :::::. .:: .: :::.:. .: :. .: :. . ::.:::.:.
NP_056 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
750 760 770 780 790 800
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