Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0792
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0792, 807 aa
1>>>pF1KSDA0792 807 - 807 aa - 807 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4253+/- 0.001; mu= 20.1169+/- 0.060
mean_var=69.7400+/-13.860, 0's: 0 Z-trim(104.9): 23 B-trim: 98 in 2/48
Lambda= 0.153580
statistics sampled from 8142 (8147) to 8142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 3.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1 ( 807) 5453 1217.9 0
CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6 ( 832) 2892 650.4 3.5e-186
CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14 ( 806) 2089 472.5 1.2e-132
>>CCDS31042.1 TMEM63A gene_id:9725|Hs108|chr1 (807 aa)
initn: 5453 init1: 5453 opt: 5453 Z-score: 6522.9 bits: 1217.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5453; 99.9% identity (100.0% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-807)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSC
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CCDS31 MMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FLFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEADSESRFQRLSSTSSSGQQDFENELGCCPWLTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEADSESRFQRLSSTSSSGQQDFENELGCCPWLTAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLSLCVILPVNLSGDLLDKDPYSFGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLSLCVILPVNLSGDLLDKDPYSFGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFFTVGFMRHHTQSIKYKEENLVRRTLFITGLPRDAR
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CCDS31 TTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFLTVGFMRHHTQSIKYKEENLVRRTLFITGLPRDAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKKKTEKSLTYYTNLQVKTGQRTLIN
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CCDS31 KETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKKKTEKSLTYYTNLQVKTGQRTLIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRLLERITEEERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRLLERITEEERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTVTFAADPEDICWKNLSIQGLRWWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTVTFAADPEDICWKNLSIQGLRWWL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHALNNPIISQFFPTLLLWSFSALLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHALNNPIISQFFPTLLLWSFSALLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILPSLGLTSLDFFFRWLFDKTSSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILPSLGLTSLDFFFRWLFDKTSSEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLIYILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLE
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CCDS31 QAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLIYILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPATLFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCF
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CCDS31 KGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPATLFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTPYVPRILNGLASERTALSPQQQQQQTYGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTPYVPRILNGLASERTALSPQQQQQQTYGAI
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KSD HNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA
790 800
>>CCDS34461.1 TMEM63B gene_id:55362|Hs108|chr6 (832 aa)
initn: 2146 init1: 1862 opt: 2892 Z-score: 3456.1 bits: 650.4 E(32554): 3.5e-186
Smith-Waterman score: 3085; 59.0% identity (83.8% similar) in 753 aa overlap (27-755:19-767)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSC
:.: :::.. ::::::. :::.:::: .: :
CCDS34 MLPFLLATLGTTALNNSNPKD-YCYSARIRSTVLQGLPFGGVPTVLALDFMC
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KSD FLFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEAD----------------------SESRFQRLSS
:: :...:::.:. :::::.:::..:: :..:..::.:
CCDS34 FLALLFLFSILRKVAWDYGRLALVTDADRLRRQERDRVEQEYVASAMHGDSHDRYERLTS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TSSSGQQDFEN-ELGCCPWLTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLS
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CCDS34 VSSS--VDFDQRDNGFCSWLTAIFRIKDDEIRDKCGGDAVHYLSFQRHIIGLLVVVGVLS
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LCVILPVNLSGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFFTVGFMRHHTQS
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CCDS34 VGIVLPVNFSGDLLENNAYSFGRTTIANLKSGNNLLWLHTSFAFLYLLLTVYSMRRHTSK
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD IKYKEENLVRRTLFITGLPRDARKETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKK
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CCDS34 MRYKEDDLVKRTLFINGISKYAESEKIKKHFEEAYPNCTVLEARPCYNVARLMFLDAERK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KTEKSLTYYTNLQVKTGQRTLINPKPCGQFCCCEVLGCEWEDAISYYTRMKDRLLERITE
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CCDS34 KAERGKLYFTNLQSKENVPTMINPKPCGHLCCCVVRGCEQVEAIEYYTKLEQKLKEDYKR
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EERHVQDQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTV
:...:...:::::::::....... ::::::.::::. :.:::.::: :. :. :.:::
CCDS34 EKEKVNEKPLGMAFVTFHNETITAIILKDFNVCKCQGCTCRGEPRPSSCSESLHISNWTV
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TFAADPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHA
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CCDS34 SYAPDPQNIYWEHLSIRGFIWWLRCLVINVVLFILLFFLTTPAIIITTMDKFNVTKPVEY
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LNNPIISQFFPTLLLWSFSALLPSIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLIL
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CCDS34 LNNPIITQFFPTLLLWCFSALLPTIVYYSAFFEAHWTRSGENRTTMHKCYTFLIFMVLLL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PSLGLTSLDFFFRWLFDKTS-SEASIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLP
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CCDS34 PSLGLSSLDLFFRWLFDKKFLAEAAIRFECVFLPDNGAFFVNYVIASAFIGNAMDLLRIP
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGL
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CCDS34 GLLMYMIRLCLARSAAERRNVKRHQAYEFQFGAAYAWMMCVFTVVMTYSITCPIIVPFGL
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD IYILLKHMVDRHNLYFVYLPAKLEKGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPA
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CCDS34 MYMLLKHLVDRYNLYYAYLPAKLDKKIHSGAVNQVVAAPILCLFWLLFFSTMRTGFLAPT
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD TLFTFLVLLLTILVCLAHTCFGCFKHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTPYVPRI
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CCDS34 SMFTFVVLVITIVICLCHVCFGHFKYLSAHNYKIEHTETDT-VDPRSNGRPPTAAAVPKS
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KSD LNGLASERTALSPQQQQQQTYGAIHNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA
CCDS34 AKYIAQVLQDSEVDGDGDGAPGSSGDEPPSSSSQDEELLMPPDALTDTDFQSCEDSLIEN
770 780 790 800 810 820
>>CCDS45141.1 TMEM63C gene_id:57156|Hs108|chr14 (806 aa)
initn: 1336 init1: 696 opt: 2089 Z-score: 2494.7 bits: 472.5 E(32554): 1.2e-132
Smith-Waterman score: 2089; 41.4% identity (74.1% similar) in 761 aa overlap (32-782:22-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSPFLELWQSKAVSIREQLGLGDRPNDSYCYNSAKNSTVLQGVTFGGIPTVLLIDVSCF
:..: .: ::::: :::.:::: .... .
CCDS45 MSASPDDLSTGGRLQNMTVDECFQS-RN-TVLQGQPFGGVPTVLCLNIALW
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KSD LFLILVFSIIRRRFWDYGRIALVSEADSESR--FQRLSSTSSSGQQDFENEL---GCCPW
.....:.:..:. :::::.::. . :: . . . : .: .. ..: : : : :
CCDS45 VLVLVVYSFLRKAAWDYGRLALLIHNDSLTSLIYGEQSEKTSPSETSLEMERRDKGFCSW
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LTAIFRLHDDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIIFLLVVVSFLSLCVILPVNLSGDLLDKDPY
. . ..:..... ::.:: :. :: :.:...... . :: .:::.: .:..:: . .
CCDS45 FFNSITMKDEDLINKCGDDARIYIVFQYHLIIFVLIICIPSLGIILPINYTGSVLDWSSH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SFGRTTIANLQTDNDLLWLHTIFAVIYLFFTVGFMRHHTQSIKYKEENLVRRTLFITGLP
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CCDS45 -FARTTIVNVSTESKLLWLHSLLSFFYFITNFMFMAHHCLGFAPRNSQKVTRTLMITYVP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RDARK-ETVESHFRDAYPTCEVVDVQLCYNVAKLIYLCKEKKKTEKSLTYYTNLQVKTGQ
.: . : . .::..::: :. :..::.: .:: : ..... .. .:: :::
CCDS45 KDIEDPELIIKHFHEAYPGSVVTRVHFCYDVRNLIDLDDQRRHAMRGRLFYTAKAKKTG-
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RTLINPKPCGQFCCCEVLGCEWE-DAISYYTRMKDRLLERITEEERHVQDQPLGMAFVTF
...: .::...: :. : : :: .::......: .... : .: . : . ::::
CCDS45 KVMIRIHPCARLCFCKCWTCFKEVDAEQYYSELEEQLTDEFNAELNRVPLKRLDLIFVTF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QEKSMATYILKDFNACKCQSLQCKGEPQPSSHSRELYTSKWTVTFAADPEDICWKNLSIQ
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CCDS45 QDSRMAKRVRKDY-----KYVQCGVQPQQSSVTTIVKSYYWRVTMAPHPKDIIWKHLSVR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GLRWWLQWLGINFTLFLGLFFLTTPSIILSTMDKFNVTKPIHALNNPIISQFFPTLLLWS
. :: ....:: ::. .::::::.::..:.: .:::.::. :.:::..::::...::.
CCDS45 RFFWWARFIAINTFLFFLFFFLTTPAIIMNTIDMYNVTRPIEKLQNPIVTQFFPSVMLWG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FSALLPSIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILPSLGLTSLDFFFRWLFD
:...:: :::.:..::.:::.:..: .:. : ::::.:::.::::.:::::: :.:::::
CCDS45 FTVILPLIVYFSAFLEAHWTRSSQNLVMVHKCYIFLVFMVVILPSMGLTSLDVFLRWLFD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KTSSE-ASIRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMELLRLPGLILYTFRMIMAKTAAD
: ::::..::::::.:::::::::..:..:.::::::: .:. :. :...... .
CCDS45 IYYLEQASIRFQCVFLPDNGAFFVNYVITAALLGTGMELLRLGSLFCYSTRLFFSRSEPE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RRNVKQNQAFQYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLIYILLKHMVDRHNLYFV
: :...:::....:: ::::. ::.:..:::::::::.::::.:. .::..::.:.:.
CCDS45 RVNIRKNQAIDFQFGREYAWMMNVFSVVMAYSITCPIIVPFGLLYLCMKHLTDRYNMYYS
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD YLPAKLEKGIHFAAVNQALAAPILCLFWLYFFSFLRLGMKAPATLFTFLVLLLTILVCLA
. :.::.. ::.:::.::. ::.: :::. :::.:::: :.:.. .::..... ..
CCDS45 FAPTKLNEQIHMAAVSQAIFAPLLGLFWMLFFSILRLGSLHAITIFSLSTLLIAMVIAFV
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD HTCFGCFKHLSPLNYKTEEPASDKGSEAEAHMPPPFTP-YVPRILNGLASERTALSPQQQ
.: .. .. . . :: . : . : . :: .:. . :.: ..
CCDS45 GIFLGKLRMVADYEPEEEEIQTVFDMEPSSTSSTPTSLLYVATVLQ---EPELNLTPASS
710 720 730 740 750
780 790 800
pF1KSD Q-QQTYGAIHNISGTIPGQCLAQSATGSVAAAPQEA
..:::...:
CCDS45 PARHTYGTMNNQPEEGEEESGLRGFARELDSAQFQEGLELEGQNQYH
760 770 780 790 800
807 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:11:13 2016 done: Thu Nov 3 03:11:13 2016
Total Scan time: 3.170 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]