Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0813, 1534 aa
1>>>pF1KSDA0813 1534 - 1534 aa - 1534 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1312+/-0.00177; mu= 16.8761+/- 0.106
mean_var=322.6122+/-62.781, 0's: 0 Z-trim(106.7): 305 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.071406
statistics sampled from 8783 (9111) to 8783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 4.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 10855 1135.0 0
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 7433 782.4 0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 7345 773.4 0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 6692 706.1 2.1e-202
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 6094 644.5 7.4e-184
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 5519 585.3 5e-166
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 844 103.5 4.3e-21
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 822 101.6 2.6e-20
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 809 99.5 4e-20
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 788 98.2 3.2e-19
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 776 97.0 8e-19
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 777 97.4 8.8e-19
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 774 96.8 9.1e-19
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 631 81.5 1.7e-14
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 631 81.6 1.7e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 615 79.8 5.1e-14
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 606 78.5 7.1e-14
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 606 78.5 7.3e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 603 78.8 1.4e-13
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 587 76.6 3e-13
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 571 76.0 2e-12
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 571 76.0 2e-12
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 542 72.0 7.7e-12
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 527 70.6 2.4e-11
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 527 70.9 3.1e-11
>>CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534 aa)
initn: 10855 init1: 10855 opt: 10855 Z-score: 6064.9 bits: 1135.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10855; 99.9% identity (100.0% similar) in 1534 aa overlap (1-1534:1-1534)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS74 RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTANQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFDTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFRCE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPGQL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLSLH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQDME
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKGRD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGGVC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGDNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPKSPCEGTECQNGA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQMVNL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIRNLYIN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCDQPADGP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQASGTKGA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGCCQG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530
pF1KSD LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
1510 1520 1530
>>CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529 aa)
initn: 6576 init1: 3063 opt: 7433 Z-score: 4159.7 bits: 782.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7433; 66.1% identity (87.5% similar) in 1516 aa overlap (21-1533:15-1527)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKNIP
:. : ... .:::: :.:.:.:::::: .:...:.:::
CCDS34 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLNRNQ
::::::.::::::::: :.:::::..:::::::::.:...:::::.:.:::::::::::.
CCDS34 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRAL
:...::::: .. : ::::::: ::::::::::::.:.:::::: :::::::.::::::
CCDS34 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFT
: :::::::::::: . :.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::: .::.:
CCDS34 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGL
:: ::. ::: ::::::: :: :::. .. .:.:.. ::: :::::.:::::::::
CCDS34 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGH-QSFMAPSCSVLH--CPAACTCSNNIVDCRGKGL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLN
: ::.:::::.:::::: : :: :::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS34 TEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSL
::::::::::.::...: ::..:::::::::::::.: ::::::.::.::::::::.:..
CCDS34 SLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQI
:::::. ::::::.:::::::::::.::::::.:.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 AKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDY--QLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERI
::::::::::::::::::::: .:...: .:..::.:::::...:.::. ::.::::.:
CCDS34 KSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHLTA
:: ::::::::::...:::::.:::: .:.:::.::::...::.::::::..:.:. ::.
CCDS34 PQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGAFD
:.::... ::.::..:.:::::.:::.:. :::: :: .::::::::::::::.:::::
CCDS34 NRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFD
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD TLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPDFR
::.:::::::::::::::: ::::: ::::..:::::::::.: ::..::.::::. ::
CCDS34 TLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD CEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLVPG
:..:.....: : .:: ::.::::::::::: :..::::::..:::::::::::::::
CCDS34 CDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRLLS
.::..:.: :.:::::.::.:::.::.::.:: ::::::: :.:::: .:.::.::::::
CCDS34 ELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGPQD
:::::::.. :: : :...:::::::::::::::...:::.:::. :::::::::::: .
CCDS34 LHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGE
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD MEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGYKG
: :::::::.::: :::: . . :::. :::.::.:.:::..::.. :::.:: :.::
CCDS34 MADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKG
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD RDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACANGG
.::.: . .: :.::..::::: .:::. : : : :::: .: ::.::: :. : :..
CCDS34 QDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNS
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYAGD
.::::..:::: :: .: :. ::. .:.:. :::::::...:. :: : .:.: :::.:.
CCDS34 TCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGE
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pF1KSD NCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTECQ
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CCDS34 NGAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD EDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFDQM
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CCDS34 EDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQS
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CCDS34 LSLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNL
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CCDS34 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
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CCDS34 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
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CCDS64 ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
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CCDS64 FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP--HSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
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CCDS64 FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
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CCDS64 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
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CCDS64 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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CCDS64 CACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDC
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CCDS64 EDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSC
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
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CCDS64 WTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKC
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CCDS64 HHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIME
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pF1KSD CRGSCPGQGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
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CCDS64 CRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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CCDS75 YINSELQDFQKVPMQTGILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
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CCDS75 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
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CCDS43 PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
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CCDS43 LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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CCDS43 KGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCEN
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...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:. : :::.:::.
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pF1KSD GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPAPK-SPCEGTE
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CCDS43 GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
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pF1KSD CQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVS
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CCDS43 CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
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pF1KSD TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
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CCDS43 TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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pF1KSD QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
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CCDS43 QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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CCDS43 EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
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pF1KSD QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
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CCDS43 QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
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::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
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CCDS13 NVCGPHGKCKSQSGGK-FTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCIC
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:. :... : .: : . ..:: . : : : : .. :
CCDS13 SDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFY-CDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATC
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. ..: : : : .:: : :. .. : . : .: :: ... :..: :..:
CCDS13 NNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCV-VNGESFTCVCKEG
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pF1KSD YSGALCNQAGALAEPCRGLQCLH-GHCQASGTKGAHCVCDPGFSGELCEQE-SECRGDPV
. : .: : .. : : . : : ..: . .: : :::.: :. . .::...:
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CCDS13 AFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGR
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. ..... : . .:: : . :: :. . .: .. :.: : .:
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: :: . .: :. .: .. : :: . : . .
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. . : ::: : . . : :: :: .. : :..::.: .:. : : .
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:.:: : : . .:.: : ::.: :.. :.. ::.: . : .:.
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pF1KSD CDPGFSGELCEQESE-CRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPGQGC-CQGL
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CCDS34 CPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPC--FNG-----GTC-VNRPGTF-SCLCAMGFQGPRCEG-
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pF1KSD RLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
.:. : . .. . . : .: :
CCDS34 KLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGP-RCLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTG
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CCDS53 QPW-------------QCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC
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CCDS53 RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLEN---SYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADG
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CCDS53 QAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCS------APVSRC
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CCDS53 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS
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CCDS12 CLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRC---------PRGFRGP
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. : . .: . : .: :. :: . .. : : .. ::.. :::
CCDS12 DCSLPDPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCL
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: : .:: ::.:: : :: :. .::.:::::. : : : . :.: :::: .
CCDS12 NTP-GSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCR-QSG-DLTYDCACLPGFEGQN
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: ::.::: : : :::.:::::..:.:::: .. :. : . :: :. . : :.. . :
CCDS12 CEVNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCF
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.: : : :. :..:..::.: ::: : .:: : :.: :. : : : .: ::
CCDS12 NTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLC---
300 310 320 330 340
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CCDS12 -HLD---DACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQ-------DVDE----
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.. : .. :.: ....: : . : : : : . :. .
CCDS12 CSIGANPCEHLGRCVNT--QGSFLCQCGRG-------YTGP-RCETDVNECLSGPCRNQA
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