Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0814
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0814, 1523 aa
1>>>pF1KSDA0814 1523 - 1523 aa - 1523 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9624+/-0.00174; mu= 17.6623+/- 0.103
mean_var=317.5843+/-61.586, 0's: 0 Z-trim(106.6): 294 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.071969
statistics sampled from 8786 (9097) to 8786 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 5.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 10662 1123.7 0
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 10638 1121.2 0
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 7517 797.2 0
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 7503 795.7 0
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 6287 669.5 2.2e-191
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 5521 589.9 2e-167
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 951 115.3 1.2e-24
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 836 103.3 4.7e-21
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 809 100.5 3.3e-20
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 811 101.1 3.7e-20
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 764 96.3 1.2e-18
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 726 92.4 1.9e-17
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 723 92.1 2.3e-17
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 701 88.9 5.9e-17
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 634 81.8 6.7e-15
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 634 81.8 6.8e-15
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 635 83.1 1.5e-14
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 635 83.1 1.5e-14
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 614 79.9 3.2e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 570 75.8 1.1e-12
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 569 75.6 1.1e-12
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 587) 537 71.8 7.3e-12
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19 ( 618) 537 71.8 7.5e-12
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 535 72.8 2.1e-11
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 518 70.1 3.5e-11
>>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523 aa)
initn: 10662 init1: 10662 opt: 10662 Z-score: 6004.3 bits: 1123.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10662; 99.9% identity (100.0% similar) in 1523 aa overlap (1-1523:1-1523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD HRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNYVC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYKGD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD LPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD EHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KSD CTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
:::::::::::::::::::::::
CCDS43 CTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1510 1520
>>CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530 aa)
initn: 6294 init1: 6084 opt: 10638 Z-score: 5990.8 bits: 1121.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10638; 99.5% identity (99.5% similar) in 1530 aa overlap (1-1523:1-1530)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KSD HRFQCK-------GPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCT
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCT
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVD
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD GINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCET
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD DNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD CIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GHRCHHGKCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSK
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CCDS64 RRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
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.:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :: ::::.:
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::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::: ::...:
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::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.::::::: :
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::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.:::::::::
CCDS75 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
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.::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...:::::::::
CCDS75 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
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.:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.:.::::::
CCDS75 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
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::.: .:.:::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: :::..:.:.:.: :: :.
CCDS75 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
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:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .:::::... ::.:::::
CCDS75 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
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CCDS75 QKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNK
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pF1KSD CHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQ
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CCDS75 CVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECS
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pF1KSD PGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQCCQPTRSKR
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CCDS75 SGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKR
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pF1KSD RKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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CCDS75 RKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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CCDS75 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
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CCDS75 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
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CCDS75 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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::.:::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.::::::::::::
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CCDS75 VQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSL
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CCDS75 STLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGN
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CCDS75 DDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNY
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CCDS75 KHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGND
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CCDS75 ISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKL
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CCDS75 LLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDV
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pF1KSD PINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDG
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CCDS75 PIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDG
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pF1KSD INNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETD
::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:.::: :. :. :
CCDS75 INNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDID
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pF1KSD NDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQC
::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...:::::::
CCDS75 FDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQC
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pF1KSD IVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGI
:: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.:.::
CCDS75 IVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGI
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pF1KSD LLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVV
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CCDS75 LLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSV
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .:::::... ::.:
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1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KSD CLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQCCQPT
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CCDS75 CECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPL
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CCDS75 RSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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CCDS34 DSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSL
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CCDS34 SLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLY
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pF1KSD INNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEA
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CCDS34 INSELQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
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CCDS34 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
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CCDS34 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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CCDS74 LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
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CCDS74 PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
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CCDS74 QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGY
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CCDS74 KGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACAN
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pF1KSD NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
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CCDS74 GGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYA
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CCDS74 GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPA-PKSPCEGTE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KSD CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
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CCDS74 CQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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CCDS74 TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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CCDS74 QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
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CCDS74 NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
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CCDS74 QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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CCDS74 SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
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::: : ::::..:.:.::.::.::::. .::: :.
CCDS74 QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
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.: . .: ..::. : : .::::.::.: :.: . . ..: :
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.. : :.. :. : : :.:::::. . .::.: :: . :. :... ..:: .
CCDS13 SPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQ---DLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAK
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CCDS13 PCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDC---LGQCQNDASCRDLVNGYRCICP
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CCDS13 PGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQ-------LDIDYC
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CCDS13 EPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHL-------KD-HCRTTPCEVIDSCTVA
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pF1KSD LQVATDKDNGILLYKGDN--DPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSV
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CCDS13 M-ASNDTPEGVR-YISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDC-NKGFTGTYCHENINDCE--SN
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. . .. : . : : ..:: .: . :: : : .
CCDS13 PCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGG--TCRDLVNDFYCDCK
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pF1KSD PLGGFHG--C------IHEVRINN------ELQDFKALPPQSL-GVSPGCK-----SC--
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:.:. . . . .: . . : . :::. : ... .: .:.: .
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pF1KSD EVERHLECGCLACS
.. .: :.
CCDS13 ILDD--QCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTE
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CCDS99 GWKGKTCHSR---EFQ---------------CDAYTCSNGGTCYD-SGDTFRCACPPGWK
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: : . :: . : . : ::..:.:. : : .:. : : . ..: :. . :..
CCDS99 GSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTH---NTNDCNPLPCYN
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: .. . : : :::.: :. : .:: : . . : .:: :: .
CCDS99 GGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEI---NGYRCSCPPGR
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CCDS99 AGPRCQEVIGFGRSC------WSRGTPF--PHGSSWVEDCNS---CRCLDGRRDCSKVWC
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CCDS99 GNKACMDGWMGKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGS
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CCDS99 CVEPW--QCNCETNWGGLLCDK--DLNY---CGS--HHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPD
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CCDS99 GYSGRNCEKAEHACTSNPCANGGSCHEVPS---GFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPC
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CCDS99 AAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDANEC--EGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPG
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CCDS99 WKGINCHINVNDCRG-QCQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCE-------LERDECAS
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CCDS99 SPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCE--VDVDLC-EPSPCR-NGARCYNLEG-DYY
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pF1KSD VATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSP--PTTVYSVETVNDGQFHSVEL
: : : : : . : : . : :. .: : .. . : :. .
CCDS99 CACPDDFG-----GKNCSVPREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGP-HGRCV
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. ... . :.: . . . . .: .: :: . ..:.: : .:..
CCDS99 SQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLG--QPCRNGGTCIDE-VDAFRCFC--P-SGWE
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CCDS99 GELCDTNPNDCLPD----PCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSN
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CCDS99 GGTCYD-SGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWE
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CCDS99 GRTCTH---NTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYG
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CCDS99 ATCVDEI---NGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSC------WSRGTPF--PHGSSWVED
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pF1KSD VERHLECGCLACS
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CCDS99 CNS---CRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEA
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CCDS34 SCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQCHCPPGFEGHACERDVNECFQDPG
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pF1KSD SVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEW--VKAGYKEP-GIARCSSPEPMADR
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CCDS34 PCPKG-----TS-CHNTLGS--FQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEK
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CCDS34 ---DSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTC-QDGLDTYTCLCPETWTGWDC
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CCDS34 SEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNS---AGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDCIAATCAPGS
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CCDS34 TCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLC-HLEDMCLSQ--PCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYS
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CCDS34 GPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEA-------DHNE
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