Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0814
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0814, 1523 aa
1>>>pF1KSDA0814 1523 - 1523 aa - 1523 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8240+/-0.000765; mu= 12.1573+/- 0.046
mean_var=331.5622+/-67.071, 0's: 0 Z-trim(113.3): 709 B-trim: 1207 in 2/48
Lambda= 0.070436
statistics sampled from 21725 (22581) to 21725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 13.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 10667 1100.8 0
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 10643 1098.3 0
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460) 10213 1054.6 0
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521) 7517 780.7 0
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525) 7503 779.3 0
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529) 6287 655.7 8.2e-187
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495) 6083 635.0 1.4e-180
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 5521 577.9 2.2e-163
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159) 5082 533.1 5.1e-150
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499) 5082 533.2 5.9e-150
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533) 5082 533.3 5.9e-150
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509) 3592 381.8 2.2e-104
XP_016883196 (OMIM: 118450,187500,601920) PREDICTE (1059) 951 113.2 1.1e-23
NP_000205 (OMIM: 118450,187500,601920) protein jag (1218) 951 113.3 1.2e-23
NP_660142 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1200) 836 101.6 4e-20
NP_002217 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1238) 809 98.9 2.7e-19
NP_004548 (OMIM: 164951) neurogenic locus notch ho (2003) 811 99.4 3.1e-19
XP_005259981 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) P (2269) 764 94.7 9e-18
NP_000426 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) neur (2321) 764 94.7 9.1e-18
NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogen (1235) 726 90.5 9.3e-17
XP_005270958 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 726 90.9 1.4e-16
XP_016856862 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 726 90.9 1.4e-16
XP_011539822 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 726 90.9 1.4e-16
XP_016856861 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2455) 726 90.9 1.4e-16
XP_011539821 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2467) 726 90.9 1.4e-16
NP_077719 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic (2471) 726 90.9 1.4e-16
NP_060087 (OMIM: 109730,190198,616028) neurogenic (2555) 723 90.6 1.7e-16
NP_061947 (OMIM: 605185,616589) delta-like protein ( 685) 701 87.5 3.9e-16
NP_001136272 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3144) 635 81.8 9.5e-14
NP_001278938 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3165) 635 81.8 9.5e-14
NP_005609 (OMIM: 606582) delta-like protein 1 prec ( 723) 614 78.7 1.9e-13
XP_011509239 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido ( 905) 570 74.4 4.7e-12
XP_016859267 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 570 74.7 5.7e-12
XP_016859268 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 570 74.7 5.7e-12
XP_016859269 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 570 74.7 5.7e-12
XP_016859270 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 570 74.7 5.7e-12
XP_011509236 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1315) 570 74.7 5.7e-12
XP_011509235 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1351) 570 74.7 5.8e-12
XP_011509234 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1404) 570 74.7 5.9e-12
NP_001073906 (OMIM: 616634) sushi, nidogen and EGF (1413) 570 74.7 6e-12
XP_016859265 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1420) 570 74.7 6e-12
XP_016859264 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1425) 570 74.7 6e-12
XP_016859263 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1434) 570 74.7 6e-12
XP_011509233 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1437) 570 74.7 6e-12
XP_011516858 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1276) 569 74.5 6e-12
XP_016859262 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1458) 570 74.7 6.1e-12
NP_775960 (OMIM: 219730,609720,616220) protein cru (1285) 569 74.5 6.1e-12
XP_011516859 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1220) 548 72.4 2.6e-11
XP_011516860 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1220) 548 72.4 2.6e-11
NP_982353 (OMIM: 277300,602768) delta-like protein ( 587) 537 70.8 3.7e-11
>>NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein isofor (1523 aa)
initn: 10667 init1: 10667 opt: 10667 Z-score: 5880.3 bits: 1100.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10667; 100.0% identity (100.0% similar) in 1523 aa overlap (1-1523:1-1523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD HRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNYVC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYKGD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD LPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD EHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KSD CTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
:::::::::::::::::::::::
NP_003 CTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1510 1520
>>NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein iso (1530 aa)
initn: 6299 init1: 6089 opt: 10643 Z-score: 5867.1 bits: 1098.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10643; 99.5% identity (99.5% similar) in 1530 aa overlap (1-1523:1-1530)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTINL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQ
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pF1KSD LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLI
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pF1KSD DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPE
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850 860 870 880 890 900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPT
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910 920 930 940 950
pF1KSD HRFQCK-------GPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCT
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRFQCKVLWFCCPGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCT
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pF1KSD VPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVD
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pF1KSD GINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD CIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNG
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pF1KSD ILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KSD VDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KSD ELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCL
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pF1KSD GHRCHHGKCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHRCHHGKCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KSD CQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGCGPQCCQPTRSK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520
pF1KSD RRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1510 1520 1530
>>XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolog 3 (1460 aa)
initn: 10213 init1: 10213 opt: 10213 Z-score: 5631.2 bits: 1054.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10213; 99.9% identity (100.0% similar) in 1457 aa overlap (67-1523:4-1460)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQ
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMGDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQ
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pF1KSD VSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGI
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pF1KSD TDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNH
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pF1KSD LYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNAN
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pF1KSD SISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRI
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pF1KSD DISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 DISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRV
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD NTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNP
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pF1KSD IETSGARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IETSGARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIV
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pF1KSD DCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGA
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pF1KSD FDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSL
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pF1KSD YDNRITTITPGAFTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YDNRITTITPGAFTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFL
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pF1KSD KEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTE
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pF1KSD LYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPV
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pF1KSD HAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGY
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pF1KSD KEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPV
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pF1KSD ELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEIN
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pF1KSD PDDCEDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDDCEDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDK
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KSD LLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KSD RPQANISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPQANISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KSD QFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTD
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD RPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCTVCKHGLCRSVEKDSVVCECR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KSD PGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVATGTSYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD CHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIM
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD ECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ECRGGCGPQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
1420 1430 1440 1450 1460
>>NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso (1521 aa)
initn: 4490 init1: 3671 opt: 7517 Z-score: 4150.4 bits: 780.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7517; 67.0% identity (88.4% similar) in 1522 aa overlap (7-1522:3-1519)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::: . . :.:.:.:: .:. :::..:.::...::::::.::.:::.::
NP_001 MRGVGWQMLS-LSLGLVLA-ILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
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pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHS-EPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLM
::.: :::: :::.:::.:.:: . .: :::.. . ::. :::::::::::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRGKGLT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
:::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.:
NP_001 EIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS
::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
NP_001 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
NP_001 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRL
::::::::.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:.:...:::
NP_001 SKKFRCSGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD NDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGR
:.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:.::.:. .
NP_001 NNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSLSTIN
.:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :: ::::.:
NP_001 MFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLN
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCD-GNEESS
::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::: ::...:
NP_001 LLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD CQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLT
:. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.::: .:::
NP_001 CSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSV
::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.::::::: :
NP_001 LIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD PEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTT
:::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :::.:::::
NP_001 PEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTT
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINT
:...: :.::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:::..::.:: :::..
NP_001 PSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHA
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD CIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNY
::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.:::::::::
NP_001 CISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNY
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDC
.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:.::: :. :. : :::
NP_001 TCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD VAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQ
.::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...:::::::::
NP_001 QDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRI
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD QEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYK
.:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.:.::::::
NP_001 NEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYK
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD GDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGT
::.: .:.:::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: :::..:.:.:.: :: :.
NP_001 GDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGN
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD PKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDF
:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .:::::... ::.:::::
NP_001 PKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDF
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD KALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHR
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NP_001 QKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNK
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD CHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQ
: :: :. .. :: ::: ::.:: :::...: : :.:.::.::.:..: :.::: :.
NP_001 CVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECS
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD PGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQCCQPTRSKR
:..:. :..: : :. .:. ..:.:::.: :..:: .:::::: : ::: : ::::
NP_001 SGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKR
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1500 1510 1520
pF1KSD RKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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NP_001 RKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1500 1510 1520
>>NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein iso (1525 aa)
initn: 5360 init1: 3023 opt: 7503 Z-score: 4142.7 bits: 779.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7503; 66.8% identity (88.1% similar) in 1526 aa overlap (7-1522:3-1523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::: . . :.:.:.:: .:. :::..:.::...::::::.::.:::.::
NP_001 MRGVGWQMLS-LSLGLVLA-ILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
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pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
NP_001 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
NP_001 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
NP_001 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP---HSE--PPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRG
::.: :::: :::.:::.:.:: :. :::.. . ::. ::::::::::::
NP_001 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLK
::: :::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.
NP_001 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD SLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKL
::.:::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.::::::::::::
NP_001 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRI
:::.:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::
NP_001 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVT
.:::::::::::.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:.:..
NP_001 GQIKSKKFRCSGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTA
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD DLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGNQLET
.::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:.::.
NP_001 ELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLEN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTTLVSL
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NP_001 VQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD STINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCD-GN
::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::: ::
NP_001 STLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGN
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSAL
...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:::
NP_001 DDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNY
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD RHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGND
.:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:::::
NP_001 KHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGND
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD ISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRL
:: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :::.:
NP_001 ISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKL
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD LLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTV
:::::...: :.::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:::..::.:: :
NP_001 LLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDV
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDG
::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.:::::
NP_001 PIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDG
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD INNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETD
::::.:.:::.::::::.: .: :. .:: :::..::: :::.:.:.::: :. :. :
NP_001 INNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDID
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD NDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQC
::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...:::::::
NP_001 FDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQC
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD IVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGI
:: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.:.::
NP_001 IVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGI
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD LLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVV
::::::.: .:.:::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: :::..:.:.:.: :
NP_001 LLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSV
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD DKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNE
: :.:: . .:.:: .....::::.::.: ......:::. . .:::::... ::.:
NP_001 DGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD LQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPC
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NP_001 LQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPC
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD LGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPY
::..: :: :. .. :: ::: ::.:: :::...: : :.:.::.::.:..: :.::
NP_001 LGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPY
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD CLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQCCQPT
: :. :..:. :..: : :. .:. ..:.:::.: :..:: .:::::: : ::: :
NP_001 CECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPL
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1500 1510 1520
pF1KSD RSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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NP_001 RSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1500 1510 1520
>>NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein isofor (1529 aa)
initn: 6255 init1: 3023 opt: 6287 Z-score: 3474.9 bits: 655.7 E(85289): 8.2e-187
Smith-Waterman score: 7491; 66.6% identity (88.0% similar) in 1530 aa overlap (7-1522:3-1527)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
::: . . :.:.:.:: .:. :::..:.::...::::::.::.:::.::
NP_004 MRGVGWQMLS-LSLGLVLA-ILNKVAPQACPAQCSCSGSTVDCHGLALRSVPRNIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
::.:::::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
NP_004 RNTERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
NP_004 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
NP_004 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHS-EPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLM
::.: :::: :::.:::.:.:: . .: :::.. . ::. :::::::::::::::
NP_004 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRGKGLT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
:::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.::.:
NP_004 EIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTIS
::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
NP_004 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
NP_004 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP
::::::: :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:
NP_004 SKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN
.:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:
NP_004 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT
.::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..:::: :
NP_004 RLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC
: ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
NP_004 LHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTC
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
: ::...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:
NP_004 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL
:: .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:
NP_004 LSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSL
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
:::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :
NP_004 HGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEM
840 850 860 870 880 890
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pF1KSD ADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGK
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NP_004 ADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQ
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNAT
:: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.:
NP_004 DCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNST
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD CVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKL
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NP_004 CVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEH
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD CETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQN
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NP_004 CDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQN
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD GAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDK
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NP_004 GAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD DNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTL
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NP_004 DSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD NLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVR
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NP_004 SLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLY
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD INNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEA
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NP_004 INSELQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD RDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQ
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NP_004 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD GEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQC
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NP_004 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1490 1500 1510 1520
pF1KSD CQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
: : ::::::: :.::::::::.:::. ..::: :
NP_004 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1500 1510 1520
>>XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2 (1495 aa)
initn: 6058 init1: 3023 opt: 6083 Z-score: 3363.0 bits: 635.0 E(85289): 1.4e-180
Smith-Waterman score: 7287; 66.2% identity (87.0% similar) in 1508 aa overlap (29-1522:2-1493)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
: : : :: :.. :. :: .:
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pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
: : ::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
XP_016 --ASR-DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
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pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
XP_016 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
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pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
XP_016 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
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::.: :::: :::.:::.:.:: . .: :::.. . ::. :::::::::::::::
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pF1KSD EIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTS
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::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.:::::::::::::::.
XP_016 LVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTIA
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD KGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIK
:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::
XP_016 KGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIK
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pF1KSD SKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLP
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pF1KSD EYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELMLTGN
.:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..::.:
XP_016 QYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSN
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pF1KSD QLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGAFTT
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XP_016 RLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDT
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pF1KSD LVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTC
: ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
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pF1KSD D-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRE
: ::...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..: ::.:
XP_016 DDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKE
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pF1KSD LSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTL
:: .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.:
XP_016 LSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSL
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pF1KSD HGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPM
:::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :
XP_016 HGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEM
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pF1KSD ADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGK
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XP_016 ADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQ
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pF1KSD DCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNAT
:: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::::.:
XP_016 DCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNST
920 930 940 950 960 970
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pF1KSD CVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKL
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XP_016 CVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEH
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pF1KSD CETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQN
:. : ::: .::..::.:.:..::::: ::.:.:: ::: ::::: .:::::...:::
XP_016 CDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD GAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDK
:::::: .:: :.: ::. : .::::..:::..:.::... :::::::.::.::.:::.
XP_016 GAQCIVRINEPICQCLPGYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDE
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pF1KSD DNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTL
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XP_016 DSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSL
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pF1KSD NLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVR
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XP_016 SLSVDGGNPKIITNLSKQSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLY
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD INNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEA
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XP_016 INSELQDFQKVPMQT-GILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRT
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pF1KSD RDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQ
:::::..: :: :. .. :: ::: ::.:: :::...: : :.:.::.::.:..:
XP_016 NDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGL
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD GEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQC
:.::: :. :..:. :..: : :. .:. ..:.:::.: :..:: .:::::: : ::
XP_016 GQPYCECSSGYTGDSCDREISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQC
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1490 1500 1510 1520
pF1KSD CQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
: : ::::::: :.::::::::.:::. ..::: :
XP_016 CGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
1460 1470 1480 1490
>>NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein precur (1534 aa)
initn: 4532 init1: 1903 opt: 5521 Z-score: 3054.2 bits: 577.9 E(85289): 2.2e-163
Smith-Waterman score: 6713; 59.4% identity (83.2% similar) in 1538 aa overlap (1-1523:3-1534)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRG
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NP_003 MALTPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLG--ASACPALCTCTGTTVDCHGTGLQAIPKN
10 20 30 40 50
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pF1KSD IPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNK
::::.:::.:. :::::: : ::::::.::::.: .::....:::::.:.:.:::::::.
NP_003 IPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNR
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pF1KSD NKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFR
:.:..:::::::.. :.::::::: ::.:::::::: ::.::::::.:.:::::.::::
NP_003 NQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFR
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD ALRDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQ
::: ::.::::::::. : :.:::::::.::.:::::::.:::::::::.::::: :.:
NP_003 ALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGL
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD FTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPH--SEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGK
:: : .:. :::.:::.:::.:. : . .. :.:. .: :::. :::::.:::::::
NP_003 FTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGK
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD GLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKS
:: ::::::: ..::::: :.::.:: :::. :.::.:::.:.:::..:::::::::.:
NP_003 GLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRS
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pF1KSD LTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQ
:.::::::::::.. .:.: :: .:::::::::::::.: ..:::::::.::::::::.:
NP_003 LNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD TISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRIS
...:: :. :..:::::::::::.:::.::::::.:. ::::::::::.::::::::::.
NP_003 SLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIG
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD QIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPS
:::::::::: :.:::. ..::: :.:::.:::::...:.::. ::..::
NP_003 QIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYQ--LNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPE
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD HLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELML
..:. ...::::.::.:.:::::.:::: .:.::::::::..:...:::.:::::.:: :
NP_003 RIPQSTAELRLNNNEISILEATGMFKKLTHLKKINLSNNKVSEIEDGAFEGAASVSELHL
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD TGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPGA
:.::::.... .::::.::.:::::.: :.:. ::.:.:: .:::::::::.:::..:::
NP_003 TANQLESIRSGMFRGLDGLRTLMLRNNRISCIHNDSFTGLRNVRLLSLYDNQITTVSPGA
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD FTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQD
: :: ::::.:::.:::::::.::::: :::::.::.::::::.: ::..::.::::. :
NP_003 FDTLQSLSTLNLLANPFNCNCQLAWLGGWLRKRKIVTGNPRCQNPDFLRQIPLQDVAFPD
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD FTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAV
: :. :.::..: :.::..:.:..:::::::: :::::.:.::.::::::.::..: :
NP_003 FRCEEGQEEGGCLPRPQCPQECACLDTVVRCSNKHLRALPKGIPKNVTELYLDGNQFTLV
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRV
: .::....: :.:::::.:: :.: .:.:::.:.::::::: :.::: ::.::::::.
NP_003 PGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLRSLRL
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSP
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NP_003 LSLHGNDISTLQEGIFADVTSLSHLAIGANPLYCDCHLRWLSSWVKTGYKEPGIARCAGP
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KSD EPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSY
. : .::::::...:.:.:: . . :::. ::::::.:.::: .::.:.:::::: .:
NP_003 QDMEGKLLLTTPAKKFECQGPPTLAVQAKCDLCLSSPCQNQGTCHNDPLEVYRCACPSGY
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD KGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCEN
::.:: : ...: ..::..::::: .... :.:::: :::: : .: ::: :. : :
NP_003 KGRDCEVSLDSCSSGPCENGGTCHAQEGEDAPFTCSCPTGFEGPTCGVNTDDCVDHACAN
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD NATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYS
...::::..::.: :: .: :. :....: : :.:: :::::.:. : :::.:::.
NP_003 GGVCVDGVGNYTCQCPLQYEGKACEQLVDLCSPDLNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMPGYA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD GKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYE
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NP_003 GDNCSENQDDCRDHRCQNGAQCMDEVNSYSCLCAEGYSGQLCEIPPHLPA-PKSPCEGTE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD CQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVA
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NP_003 CQNGANCVDQGNRPVCQCLPGFGGPECEKLLSVNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD TDKDNGILLYKGDNDPLALELYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLN
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NP_003 TAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPGSYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVAFD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD QTLNLVVDKGTPKSLGKLQKQPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIH
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NP_003 QMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVGGMPVDVNSAAFRLWQILNGTGFHGCIR
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KSD EVRINNELQDFKALPPQSLGVSPGCKSCT--VCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCD
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NP_003 NLYINNELQDFTKTQMKP-GVVPGCEPCRKLYCLHGICQPNATPGPMCHCEAGWVGLHCD
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD QEARDPCLGHRCHHGKCVATGT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHI
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NP_003 QPADGPCHGHKCVHGQCVPLDALSYSCQCQDGYSGALCNQAGALAEPCRGLQCLHGHCQA
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD SDQGEPYCLCQPGFSGEHCQQENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-G
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NP_003 SGTKGAHCVCDPGFSGELCEQESECRGDPVRDFHQVQRGYAICQTTRPLSWVECRGSCPG
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1490 1500 1510 1520
pF1KSD PQCCQPTRSKRRKYVFQCTDGSSFVEEVERHLECGCLACS
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NP_003 QGCCQGLRLKRRKFTFECSDGTSFAEEVEKPTKCGCALCA
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Smith-Waterman score: 5523; 64.3% identity (87.2% similar) in 1129 aa overlap (407-1522:30-1157)
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pF1KSD GLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQ
.::::.: ::::.:: :.::..:::.::::
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pF1KSD NPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCS--------GS
:::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::.:::::::::: :.
XP_011 NPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGT
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pF1KSD EDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLE
:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .:: :.:.:...::::.:: .:::
XP_011 EDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIPEHIPQYTAELRLNNNEFTVLE
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XP_011 ATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKGLESLK
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XP_011 TLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDTLHSLSTLNLLANPFNCN
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pF1KSD CHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQDFTCD-GNEESSCQLSPRCPE
:.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::: ::...::. :::
XP_011 CYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPT
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pF1KSD QCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTAVPRELSALRHLTLIDLSNNSI
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XP_011 ECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRI
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD SMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPEGSFNDLT
: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::.:.::::::: ::::.::::.
XP_011 STLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDISVVPEGAFNDLS
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pF1KSD SLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPTHRFQCKG
.:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..: :::.::::::...: :.:
XP_011 ALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAGPGEMADKLLLTTPSKKFTCQG
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pF1KSD PVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHG
:::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:::..::.:: :::..::.:::.::
XP_011 PVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYGFKGQDCDVPIHACISNPCKHG
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pF1KSD GTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCENNATCVDGINNYVCICPPNYT
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XP_011 GTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYT
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pF1KSD GELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECVPGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGA
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XP_011 GELCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYVGEHCDIDFDDCQDNKCKNGA
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pF1KSD QCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPCDQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPP
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XP_011 HCTDAVNGYTCICPEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIVRINEPICQCLP
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pF1KSD GFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANISLQVATDKDNGILLYKGDNDPLALE
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XP_011 GYQGEKCEKLVSVNFINKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVE
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pF1KSD LYQGHVRLVYDSLSSPPTTVYSVETVNDGQFHSVELVTLNQTLNLVVDKGTPKSLGKLQK
::.:.:: ::. : : ...:::::.:::.:: :::..:.:.:.: :: :.:: . .:.:
XP_011 LYRGRVRASYDTGSHPASAIYSVETINDGNFHIVELLALDQSLSLSVDGGNPKIITNLSK
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pF1KSD QPAVGINSPLYLGGIPTSTGLSALRQGTDRPLGGFHGCIHEVRINNELQDFKALPPQSLG
: .....::::.::.: ......:::. . .:::::... ::.:::::. .: :. :
XP_011 QSTLNFDSPLYVGGMPGKSNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFQKVPMQT-G
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pF1KSD VSPGCKSC--TVCKHGLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHHGKCVAT
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XP_011 ILPGCEPCHKKVCAHGTCQPSSQAGFTCECQEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPI
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pF1KSD GT-SYMCKCAEGYGGDLCDNKNDSANACSAFKCHHGQCHISDQGEPYCLCQPGFSGEHCQ
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XP_011 NAFSYSCKCLEGHGGVLCDEEEDLFNPCQAIKCKHGKCRLSGLGQPYCECSSGYTGDSCD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD QENPCLGQVVREVIRRQKGYASCATASKVPIMECRGGC-GPQCCQPTRSKRRKYVFQCTD
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XP_011 REISCRGERIRDYYQKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTD
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1510 1520
pF1KSD GSSFVEEVERHLECGCLACS
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XP_011 GSSFVDEVEKVVKCGCTRCVS
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>>XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolog 2 (1499 aa)
initn: 5022 init1: 3023 opt: 5082 Z-score: 2813.2 bits: 533.2 E(85289): 5.9e-150
Smith-Waterman score: 7273; 66.0% identity (86.7% similar) in 1512 aa overlap (29-1522:2-1497)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIP
: : : :: :.. :. :: .:
XP_011 MPGASETPL---CSPESIN--GVTLR-----LP
10 20
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pF1KSD RNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNK
: : ::. :::::::: :::::..::::.: .:..:.::::::::::.:::::::.:.
XP_011 --ASR-DLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRNH
30 40 50 60 70 80
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pF1KSD LQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRAL
::..::::: .: :: ::::::::::.:::::::: .:.:::::: :.::::::::::::
XP_011 LQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQLDYNQISCIEDGAFRAL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDLEILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFT
::::.::::::::.:. :.:::::::.::.:::::.::::::::::::::::: :: .:
XP_011 RDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYT
150 160 170 180 190 200
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pF1KSD LCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP---HSE--PPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRG
::.: :::: :::.:::.:.:: :. :::.. . ::. ::::::::::::
XP_011 QCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSV--LHCPAACTCSNNIVDCRG
210 220 230 240 250
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pF1KSD KGLMEIPANLPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLK
::: :::.:::: :.:::::::.::.:: :::. ::::.:::.:.::::..::::::::.
XP_011 KGLTEIPTNLPETITEIRLEQNTIKVIPPGAFSPYKKLRRIDLSNNQISELAPDAFQGLR
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pF1KSD SLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKL
::.:::::::::::. :.::.:: :::::::::::::::::..::::.::::::::::::
XP_011 SLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKL
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD QTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLKWLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRI
:::.:: :.::..:::.:::::::.::::::::::::. ::::::::::.::::::::::
XP_011 QTIAKGTFSPLRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRI
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD SQIKSKKFRCS--------GSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIP
.:::::::::: :.:::::..:..:: ::.:::::::::: :::::::: .::
XP_011 GQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYRSKLSGDCFADLACPEKCRCEGTTVDCSNQKLNKIP
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDGAASVQELM
:.:.:...::::.:: .::::::::::::.:::::.::::: ...::::.::..:.:..
XP_011 EHIPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEIL
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD LTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDNRITTITPG
::.:.::.:. ..:.:: .::::::::: : ::.::.: :::::::::::::.:::..::
XP_011 LTSNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRITCVGNDSFIGLSSVRLLSLYDNQITTVAPG
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AFTTLVSLSTINLLSNPFNCNCHLAWLGKWLRKRRIVSGNPRCQKPFFLKEIPIQDVAIQ
:: :: ::::.:::.:::::::.:::::.::::.:::.::::::::.:::::::::::::
XP_011 AFDTLHSLSTLNLLANPFNCNCYLAWLGEWLRKKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQ
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD DFTCD-GNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKDVTELYLEGNHLTA
::::: ::...::. ::: .:::..::::::::::..::.:.:.:::::::.::..:
XP_011 DFTCDDGNDDNSCSPLSRCPTECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPRDVTELYLDGNQFTL
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD VPRELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLRCIPVHAFNGLRSLR
::.::: .:::::::::: :: :.: .::::..: ::::::::::::: ..:.::.:::
XP_011 VPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLKSLR
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD VLTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWVKAGYKEPGIARCSS
.:.::::::: ::::.::::..:::::.:.:::.:::...:::.:::. :::::::::..
XP_011 LLSLHGNDISVVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWLSDWVKSEYKEPGIARCAG
800 810 820 830 840 850
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pF1KSD PEPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCACPYS
: :::.::::::...: :.::::.::.:::: :::.::::.:::..:::..:::.:::.
XP_011 PGEMADKLLLTTPSKKFTCQGPVDVNILAKCNPCLSNPCKNDGTCNSDPVDFYRCTCPYG
860 870 880 890 900 910
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pF1KSD YKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDNDCE
.::.:: :::..::.:::.:::::::.....::: : : ::::. ::.: :::::::::
XP_011 FKGQDCDVPIHACISNPCKHGGTCHLKEGEEDGFWCICADGFEGENCEVNVDDCEDNDCE
920 930 940 950 960 970
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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