FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0827, 1531 aa 1>>>pF1KSDA0827 1531 - 1531 aa - 1531 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3038+/-0.00132; mu= -4.0209+/- 0.078 mean_var=327.7029+/-70.299, 0's: 0 Z-trim(110.1): 138 B-trim: 342 in 1/52 Lambda= 0.070849 statistics sampled from 11207 (11334) to 11207 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16 Scan time: 4.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10881.1 NFAT5 gene_id:10725|Hs108|chr16 (1531) 10007 1038.3 0 CCDS45518.1 NFAT5 gene_id:10725|Hs108|chr16 (1549) 9858 1023.1 0 CCDS45519.1 NFAT5 gene_id:10725|Hs108|chr16 (1548) 9841 1021.3 0 CCDS10882.1 NFAT5 gene_id:10725|Hs108|chr16 (1455) 9530 989.5 0 CCDS68156.1 NFATC2 gene_id:4773|Hs108|chr20 ( 702) 785 95.5 6.4e-19 CCDS46614.1 NFATC2 gene_id:4773|Hs108|chr20 ( 901) 785 95.5 7.8e-19 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SQEQQQQQQQQQQQQQQQQQSILFSNQNTMATMASPKQPPPNMIFNPNQNPMANQEQQNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SQEQQQQQQQQQQQQQQQQQSILFSNQNTMATMASPKQPPPNMIFNPNQNPMANQEQQNQ 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KSD SIFHQQSNMAPMNQEQQPMQFQSQSTVSSLQNPGPTQSESSQTPLFHSSPQIQLVQGSPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SIFHQQSNMAPMNQEQQPMQFQSQSTVSSLQNPGPTQSESSQTPLFHSSPQIQLVQGSPS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD SQEQQVTLFLSPASMSALQTSINQQDMQQSPLYSPQNNMPGIQGATSSPQPQATLFHNTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SQEQQVTLFLSPASMSALQTSINQQDMQQSPLYSPQNNMPGIQGATSSPQPQATLFHNTA 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KSD GGTMNQLQNSPGSSQQTSGMFLFGIQNNCSQLLTSGPATLPDQLMAISQPGQPQNEGQPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GGTMNQLQNSPGSSQQTSGMFLFGIQNNCSQLLTSGPATLPDQLMAISQPGQPQNEGQPP 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1490 1500 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.:.::.:::: CCDS68 TSYEKIVGNTKVLEIPLEPKNNMRATIDCAGILKLRNADIELRKGETDIGRKNTRVRLVF 270 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KSD RVNIMRKDGSTLTLQTPSSPILCTQPAG--VPEILKKSLHSCSVKGEEEVFLIGKNFLKG ::.: ...: ..::: :.:: :.: .. .: . ... :: : : ....: :.:: . CCDS68 RVHIPESSGRIVSLQTASNPIECSQRSAHELPMVERQDTDSCLVYGGQQMILTGQNFTSE 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KSD TKVIFQENVSD-ENSWKSEAEIDMELFHQNHLIVKVPPYHDQHITLPVSVGIYVVTNAGR .::.: :...: .. :. :: .: . . : :.:..: :...:: ::.:..::... . CCDS68 SKVVFTEKTTDGQQIWEMEATVDKDKSQPNMLFVEIPEYRNKHIRTPVKVNFYVINGKRK 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 pF1KSD SHDVQPFTYTPDPAAAGALNVNVKKEISSPARP---CSFEEAMKAMKTTGCNLDKVNIIP . : ::: : :: .: : .. : :: .. . . . : : CCDS68 RSQPQHFTYHPVPA--------IKTEPTDEYDPTLICSPTHGGLGSQPYYPQHPMVAESP 450 460 470 480 490 590 600 610 620 630 640 pF1KSD NALMTPLIPSSMIKSEDVTP-MEVTAEKRSSTIFKTTKSVGSTQQTLENISNIAGNGSFS . :.. . : ..... .: . .. ...... .::.. . .. . .:. :.. CCDS68 SCLVATMAPCQQFRTGLSSPDARYQQQNPAAVLYQRSKSLSPSLLGYQQPALMAAPLSLA 500 510 520 530 540 550 650 660 670 680 690 700 pF1KSD SPSSS---HLPSENEKQQQIQPKAYNPETLTTIQTQDISQPGTFPAVSASSQLPNSDALL . : : :..... ..:. : .. .:. . .: . .:. . . CCDS68 DAHRSVLVHAGSQGQSSALLHPSPTNQQASPVIHYSPTNQQ-----LRCGSHQEFQHIMY 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 760 pF1KSD QQATQFQTRETQSREILQSDGTVVNLSQLTEASQQQQQSPLQEQAQTLQQQISSN--IFP . .: :. :.: :: . . :::. ...: .:.. ..: CCDS68 CE--NFAPGTTRPGPPPVSQGQ--RLSPGSYPTVIQQQNATSQRAAKNGPPVSDQKEVLP 620 630 640 650 660 670 770 780 790 800 810 820 pF1KSD SPNSVSQLQNTIQQLQAGSFTGSTASGSSGSVDLVQQVLEAQQQLSSVLFSAPDGNENVQ . ...: :: : CCDS68 AGVTIKQEQNLDQTYLDDELIDTHLSWIQNIL 680 690 700 >>CCDS46614.1 NFATC2 gene_id:4773|Hs108|chr20 (901 aa) initn: 596 init1: 278 opt: 785 Z-score: 451.6 bits: 95.5 E(32554): 7.8e-19 Smith-Waterman score: 789; 27.9% identity (56.2% similar) in 754 aa overlap (57-776:176-882) 30 40 50 60 70 80 pF1KSD VYDLLPKELQLPPSRETSVASMSQTSGGEAGSPP---PAVVAADASSAPSSSSMGGACSS :.: : : .: .: . . .: CCDS46 CLSPASSGSSASFISDTFSPYTSPCVSPNNGGPDDLCPQFQNIPAHYSPRTSPIMSPRTS 150 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 pF1KSD FTTSS-----SPTIYSTSVTDSK-AMQVESCSSAVGVSNRGVSEKQLTSNTVQQHPST-- .. .: ::. .: ..: : . .::. :. . :.: .. : . : ::. CCDS46 LAEDSCLGRHSPVPRPASRSSSPGAKRRHSCAEALVALPPGASPQRSRSPSPQ--PSSHV 210 220 230 240 250 260 140 150 160 170 180 190 pF1KSD -PKRHTVLYISPPPED---LLDNSRMSCQDEGCGLESEQSCSMWMEDSPSNFSNMSTSSY :. : :: ..: : ::. . :: . ::. .:. CCDS46 APQDHGSPAGYPPVAGSAVIMDALNSLATDSPCGIPPK----MW-KTSPDP---SPVSAA 270 280 290 300 310 200 210 220 230 240 250 pF1KSD NDNTEVPRKSRKRNPKQRPGVKRRD-CEESNMDIFDADSAKAPHYVLSQLTTDNKGNSKA ... .::. :.:. ::... .::. .: : : : CCDS46 PSKAGLPRHIY-------PAVEFLGPCEQGER------RNSAPESILLVPPTWPKPLVPA 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 pF1KSD GNGTLENQKGTGVKKSPMLCGQYPVKSEGK--ELKIVVQPETQHRARYLTEGSRGSVKDR . . . . : : ..:..:.. ::.: :::. .:::.: ::::::.:: CCDS46 ----IPICSIPVTASLPPL--EWPLSSQSGSYELRIEVQPKPHHRAHYETEGSRGAVKAP 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TQQGFPTVKLEGH--NEPVVLQVFVGNDSGRV-KPHGFYQACRVTGRNTTPCKEVDIEGT : : :.:.:.:. :.:. ::.:.:. . :. :::.:::. :.::...: . : :. 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CCDS46 RIVSLQTASNPIECSQRSAHELPMVERQDTDSCLVYGGQQMILTGQNFTSESKVVFTEKT 540 550 560 570 580 590 490 500 510 520 530 540 pF1KSD SD-ENSWKSEAEIDMELFHQNHLIVKVPPYHDQHITLPVSVGIYVVTNAGRSHDVQPFTY .: .. :. :: .: . . : :.:..: :...:: ::.:..::... . . : ::: CCDS46 TDGQQIWEMEATVDKDKSQPNMLFVEIPEYRNKHIRTPVKVNFYVINGKRKRSQPQHFTY 600 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 pF1KSD TPDPAAAGALNVNVKKEISSPARP---CSFEEAMKAMKTTGCNLDKVNIIPNALMTPLIP : :: .: : .. : :: .. . . . : :. :.. . : CCDS46 HPVPA--------IKTEPTDEYDPTLICSPTHGGLGSQPYYPQHPMVAESPSCLVATMAP 660 670 680 690 700 600 610 620 630 640 650 pF1KSD SSMIKSEDVTP-MEVTAEKRSSTIFKTTKSVGSTQQTLENISNIAGNGSFSSPSSS---H ..... .: . .. ...... .::.. . .. . .:. :... : : CCDS46 CQQFRTGLSSPDARYQQQNPAAVLYQRSKSLSPSLLGYQQPALMAAPLSLADAHRSVLVH 710 720 730 740 750 760 660 670 680 690 700 710 pF1KSD LPSENEKQQQIQPKAYNPETLTTIQTQDISQPGTFPAVSASSQLPNSDALLQQATQFQTR :..... ..:. : .. .:. . .: . .:. . . . .: CCDS46 AGSQGQSSALLHPSPTNQQASPVIHYSPTNQQ-----LRCGSHQEFQHIMYCE--NFAPG 770 780 790 800 810 820 720 730 740 750 760 770 pF1KSD ETQSREILQSDGTVVNLSQLTEASQQQQQSPLQEQAQTLQQQISSN--IFPSPNSVSQLQ :. :.: :: . . :::. ...: .:.. ..:. ...: : CCDS46 TTRPGPPPVSQGQ--RLSPGSYPTVIQQQNATSQRAAKNGPPVSDQKEVLPAGVTIKQEQ 830 840 850 860 870 780 790 800 810 820 830 pF1KSD NTIQQLQAGSFTGSTASGSSGSVDLVQQVLEAQQQLSSVLFSAPDGNENVQEQLSADIFQ : : CCDS46 NLDQTYLDDELIDTHLSWIQNIL 880 890 900 >>CCDS68157.1 NFATC2 gene_id:4773|Hs108|chr20 (905 aa) initn: 596 init1: 278 opt: 785 Z-score: 451.6 bits: 95.5 E(32554): 7.8e-19 Smith-Waterman score: 789; 27.9% identity (56.2% similar) in 754 aa overlap (57-776:176-882) 30 40 50 60 70 80 pF1KSD VYDLLPKELQLPPSRETSVASMSQTSGGEAGSPP---PAVVAADASSAPSSSSMGGACSS :.: : : .: .: . . .: CCDS68 CLSPASSGSSASFISDTFSPYTSPCVSPNNGGPDDLCPQFQNIPAHYSPRTSPIMSPRTS 150 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 pF1KSD FTTSS-----SPTIYSTSVTDSK-AMQVESCSSAVGVSNRGVSEKQLTSNTVQQHPST-- .. .: ::. .: ..: : . .::. :. . :.: .. : . : ::. CCDS68 LAEDSCLGRHSPVPRPASRSSSPGAKRRHSCAEALVALPPGASPQRSRSPSPQ--PSSHV 210 220 230 240 250 260 140 150 160 170 180 190 pF1KSD -PKRHTVLYISPPPED---LLDNSRMSCQDEGCGLESEQSCSMWMEDSPSNFSNMSTSSY :. : :: ..: : ::. . :: . ::. .:. CCDS68 APQDHGSPAGYPPVAGSAVIMDALNSLATDSPCGIPPK----MW-KTSPDP---SPVSAA 270 280 290 300 310 200 210 220 230 240 250 pF1KSD NDNTEVPRKSRKRNPKQRPGVKRRD-CEESNMDIFDADSAKAPHYVLSQLTTDNKGNSKA ... .::. :.:. ::... .::. .: : : : CCDS68 PSKAGLPRHIY-------PAVEFLGPCEQGER------RNSAPESILLVPPTWPKPLVPA 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 pF1KSD GNGTLENQKGTGVKKSPMLCGQYPVKSEGK--ELKIVVQPETQHRARYLTEGSRGSVKDR . . . . : : ..:..:.. ::.: :::. .:::.: ::::::.:: CCDS68 ----IPICSIPVTASLPPL--EWPLSSQSGSYELRIEVQPKPHHRAHYETEGSRGAVKAP 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TQQGFPTVKLEGH--NEPVVLQVFVGNDSGRV-KPHGFYQACRVTGRNTTPCKEVDIEGT : : :.:.:.:. :.:. ::.:.:. . :. :::.:::. :.::...: . : :. 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CCDS33 LAEDSCLGRHSPVPRPASRSSSPGAKRRHSCAEALVALPPGASPQRSRSPSPQ--PSSHV 230 240 250 260 270 280 140 150 160 170 180 190 pF1KSD -PKRHTVLYISPPPED---LLDNSRMSCQDEGCGLESEQSCSMWMEDSPSNFSNMSTSSY :. : :: ..: : ::. . :: . ::. .:. CCDS33 APQDHGSPAGYPPVAGSAVIMDALNSLATDSPCGIPPK----MW-KTSPDP---SPVSAA 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 pF1KSD NDNTEVPRKSRKRNPKQRPGVKRRD-CEESNMDIFDADSAKAPHYVLSQLTTDNKGNSKA ... .::. :.:. ::... .::. .: : : : CCDS33 PSKAGLPRHIY-------PAVEFLGPCEQGER------RNSAPESILLVPPTWPKPLVPA 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 pF1KSD GNGTLENQKGTGVKKSPMLCGQYPVKSEGK--ELKIVVQPETQHRARYLTEGSRGSVKDR . . . . : : ..:..:.. ::.: :::. .:::.: ::::::.:: CCDS33 ----IPICSIPVTASLPPL--EWPLSSQSGSYELRIEVQPKPHHRAHYETEGSRGAVKAP 390 400 410 420 430 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TQQGFPTVKLEGH--NEPVVLQVFVGNDSGRV-KPHGFYQACRVTGRNTTPCKEVDIEGT : : :.:.:.:. :.:. ::.:.:. . :. :::.:::. :.::...: . : :. 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