Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0828
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0828, 610 aa
1>>>pF1KSDA0828 610 - 610 aa - 610 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1302+/-0.00102; mu= -1.0671+/- 0.062
mean_var=238.3547+/-48.373, 0's: 0 Z-trim(112.8): 13 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.083073
statistics sampled from 13522 (13530) to 13522 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 610) 4095 503.7 2.8e-142
CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 611) 4083 502.3 7.6e-142
CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 3296 407.9 1.6e-113
CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 3294 407.7 1.9e-113
CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 530) 3123 387.2 2.9e-107
CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 483) 3064 380.1 3.6e-105
CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 432) 1479 190.1 5e-48
CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 404) 1423 183.4 5e-46
>>CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (610 aa)
initn: 4095 init1: 4095 opt: 4095 Z-score: 2667.9 bits: 503.7 E(32554): 2.8e-142
Smith-Waterman score: 4095; 100.0% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVQVVSAAAAAKVPEVELKDLSPSEAESQLGLSTAAVGAMAPPAGGGDPEAPAPAAERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSVQVVSAAAAAKVPEVELKDLSPSEAESQLGLSTAAVGAMAPPAGGGDPEAPAPAAERP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVPGPGSGPAAALSPAAGKVPQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVPGPGSGPAAALSPAAGKVPQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD WQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVND
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKN
550 560 570 580 590 600
610
pF1KSD GPFKPNYYRY
::::::::::
CCDS47 GPFKPNYYRY
610
>>CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (611 aa)
initn: 3302 init1: 3302 opt: 4083 Z-score: 2660.1 bits: 502.3 E(32554): 7.6e-142
Smith-Waterman score: 4083; 99.8% identity (99.8% similar) in 611 aa overlap (1-610:1-611)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVQVVSAAAAAKVPEVELKDLSPSEAESQLGLSTAAVGAMAPPAGGGDPEAPAPAAERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSVQVVSAAAAAKVPEVELKDLSPSEAESQLGLSTAAVGAMAPPAGGGDPEAPAPAAERP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVPGPGSGPAAALSPAAGKVPQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PVPGPGSGPAAALSPAAGKVPQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KSD K-IQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNS
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KQIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNK
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KSD NGPFKPNYYRY
:::::::::::
CCDS58 NGPFKPNYYRY
610
>>CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 3296 init1: 3296 opt: 3296 Z-score: 2151.5 bits: 407.9 E(32554): 1.6e-113
Smith-Waterman score: 3296; 99.8% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (121-610:19-508)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD PHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVKKIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQS
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLGSKKKYIVNGNSGIKAQIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQS
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KSD STDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPAL
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAAL
110 120 130 140 150 160
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKG
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370 380 390
pF1KSD IVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFG
230 240 250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KSD GKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIV
290 300 310 320 330 340
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPD
350 360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDE
410 420 430 440 450 460
580 590 600 610
pF1KSD YVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
470 480 490 500
>>CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 3294 init1: 3294 opt: 3294 Z-score: 2150.2 bits: 407.7 E(32554): 1.9e-113
Smith-Waterman score: 3294; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (122-610:20-508)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVKKIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEKWDGNEGTSAFHMPEWMIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSS
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALM
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALA
110 120 130 140 150 160
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGI
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGG
230 240 250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVI
290 300 310 320 330 340
460 470 480 490 500 510
pF1KSD TCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDG
350 360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEY
410 420 430 440 450 460
580 590 600 610
pF1KSD VASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
470 480 490 500
>>CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 (530 aa)
initn: 3103 init1: 3103 opt: 3123 Z-score: 2039.2 bits: 387.2 E(32554): 2.9e-107
Smith-Waterman score: 3123; 91.8% identity (97.6% similar) in 500 aa overlap (111-610:33-530)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD PQASAMKRSDPHHQHQRHRDGGEALVSPDGTVTEAPRTVKKIQFADQKQEFNKRPTKIGR
:::.::. :.:::::. :::.: ::: ::
CCDS81 MPDAMPLPGVGEELKQAKEIEDAEKYSFMATVTKAPK--KQIQFADDMQEFTKFPTKTGR
10 20 30 40 50 60
150 160 170 180 190 200
pF1KSD RSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREI
::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: ::::::.::::::::::::::::
CCDS81 RSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREI
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KSD EIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIY
:::::.: ::..:::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::.:::::
CCDS81 EIAEQDMSALISLRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIY
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KSD STLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKK
:: :::::::::.: :::::::::::::::::::::..::: :::::::::::::.:::
CCDS81 STQNEVAAALAEAGVAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKK
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KSD YPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDG
:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YPNVFKKIRGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDG
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKL
::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.:::
CCDS81 LKRTTDVMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KSD NEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVR
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 NEVIRQVDVVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVR
370 380 390 400 410 420
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQD
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SQVDHVIWPDGKRVVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQD
430 440 450 460 470 480
570 580 590 600 610
pF1KSD VYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS81 VYLLPKKMDEYVASLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
490 500 510 520 530
>>CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 (483 aa)
initn: 3064 init1: 3064 opt: 3064 Z-score: 2001.6 bits: 380.1 E(32554): 3.6e-105
Smith-Waterman score: 3064; 92.9% identity (98.1% similar) in 482 aa overlap (129-610:2-483)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RDGGEALVSPDGTVTEAPRTVKKIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSA
:::.: ::: ::::::::::::::::::::
CCDS55 MQEFTKFPTKTGRRSLSRSISQSSTDSYSSA
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQ
::::::::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::::::::.: ::..::::::
CCDS55 ASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLRKRAQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVF
:::::::::::::::::::::::.::: ::::::::.::::::: :::::::::.: ::
CCDS55 GEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAGVAVF
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTG
:::::::::::::::::::..::: :::::::::::::.::::::.::::.:::::::::
CCDS55 AWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEESVTG
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KSD VHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 VHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQVVVCG
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KSD YGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKN
::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::
CCDS55 YGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCTGNKN
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLA
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 VVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRVVLLA
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLP
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610
pF1KSD TFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS55 SFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
460 470 480
>>CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 (432 aa)
initn: 1399 init1: 1399 opt: 1479 Z-score: 975.7 bits: 190.1 E(32554): 5e-48
Smith-Waterman score: 1479; 50.4% identity (80.1% similar) in 427 aa overlap (185-610:7-432)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD YSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALR
. : .: : .::. ..:::.:::.:: .:
CCDS13 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESG
.: .. ::: ::.:.:: :.:..::::.::: .:::. .:..:::.:: ...:::.:..:
CCDS13 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KSD FPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEE
.::.:::::..... :::.. . . :::::::::::. :. :::... :.:: ::
CCDS13 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQV
..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::.:..:: .
CCDS13 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCT
:: :::.::::: ::...:. : .:::::: :::: :.:.... ..:. .. .: .: :
CCDS13 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KSD GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRI
: ... .:...::.. ::::.:: ..:::: : . .. :::. .:.::
CCDS13 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
.:::::::.::.:. :.::.: . :.:..: :::.. :. .: :..::::.:: ::
CCDS13 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
340 350 360 370 380 390
580 590 600 610
pF1KSD SLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
:: ....::.::..::.:::.. .:::::..:::
CCDS13 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
400 410 420 430
>>CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 (404 aa)
initn: 1343 init1: 1343 opt: 1423 Z-score: 939.9 bits: 183.4 E(32554): 5e-46
Smith-Waterman score: 1423; 50.9% identity (80.5% similar) in 405 aa overlap (207-610:1-404)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITA
::.:: .:.: .. ::: ::.:.:: :.:.
CCDS54 MPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTV
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCV
.::::.::: .:::. .:..:::.:: ...:::.:..:.::.:::::..... :::.. .
CCDS54 ETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTL
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAM
. :::::::::::. :. :::... :.:: ::..:::: ::.. : : :::.
CCDS54 YFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAI
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSI
::::::::.:::::: ::::..::.::.::.:..:: .:: :::.::::: ::...:.
CCDS54 NVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGAR
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCN
: .:::::: :::: :.:.... ..:. .. .: .: :: ... .:...::.. ::::
CCDS54 VIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCN
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KSD MGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVL
.:: ..:::: : . .. :::. .:.::.:::::::.::.:. :.::.
CCDS54 IGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVM
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAKYL
: . :.:..: :::.. :. .: :..::::.:: :: :: ....::.::..::.::
CCDS54 SNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYL
340 350 360 370 380
600 610
pF1KSD GLNKNGPFKPNYYRY
:.. .:::::..:::
CCDS54 GMSCDGPFKPDHYRY
390 400
610 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:36:09 2016 done: Thu Nov 3 03:36:09 2016
Total Scan time: 3.380 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]