Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0846, 689 aa
1>>>pF1KSDA0846 689 - 689 aa - 689 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9618+/-0.000985; mu= 17.6402+/- 0.060
mean_var=100.0831+/-19.145, 0's: 0 Z-trim(108.2): 127 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.128202
statistics sampled from 9933 (10067) to 9933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 689) 4677 876.0 0
CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 ( 690) 4665 873.7 0
CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 797) 2315 439.1 1.1e-122
CCDS31598.1 RASGRP2 gene_id:10235|Hs108|chr11 ( 609) 2056 391.1 2.5e-108
CCDS46068.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 673) 1648 315.7 1.4e-85
CCDS59382.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 659) 1436 276.5 8.6e-74
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 597) 1421 273.7 5.5e-73
CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 762) 1421 273.8 6.6e-73
CCDS59383.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 639) 1203 233.4 7.9e-61
CCDS54263.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 576) 929 182.7 1.3e-45
CCDS59384.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 604) 728 145.5 2.1e-34
CCDS54264.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 581) 726 145.1 2.7e-34
CCDS54262.1 RASGRP4 gene_id:115727|Hs108|chr19 ( 484) 678 136.2 1.1e-31
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 436 91.8 6.6e-18
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 397 84.2 4.9e-16
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 397 84.5 1e-15
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 397 84.6 1e-15
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1077) 385 82.3 4.1e-15
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1094) 385 82.3 4.2e-15
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1095) 385 82.3 4.2e-15
>>CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 (689 aa)
initn: 4677 init1: 4677 opt: 4677 Z-score: 4677.6 bits: 876.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4677; 100.0% identity (100.0% similar) in 689 aa overlap (1-689:1-689)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
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CCDS54 MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVH
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD AGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
670 680
>>CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2 (690 aa)
initn: 2558 init1: 2558 opt: 4665 Z-score: 4665.6 bits: 873.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4665; 99.9% identity (99.9% similar) in 690 aa overlap (1-689:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKH
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSQPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKH
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLR
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLVTGSSRK
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRV
610 620 630 640 650 660
660 670 680
pF1KSD HAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
670 680 690
>>CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 (797 aa)
initn: 1992 init1: 1071 opt: 2315 Z-score: 2315.7 bits: 439.1 E(32554): 1.1e-122
Smith-Waterman score: 2320; 53.7% identity (76.9% similar) in 687 aa overlap (1-655:50-730)
10 20
pF1KSD MGSSG-LGKAATLDELLCTCIEMFDDNGEL
: : : :.:.:.::.:. .::. :: .:.:
CCDS45 AASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNL
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KSD DNS-YLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAE
: : ...: ::: .::.:: .:.. .:..: ... . ::::::.:::: .: .
CCDS45 CRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVRYWITEFWVM
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD FNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKK--VSKKGKACL
:..: .: :::.:... : : : ::: ..: . :: :..::: : .::: :. :
CCDS45 FKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSL
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQ
::::::: ::.::::.:: ::::::::.:::.:....:...:::.:::::: ::::.:::
CCDS45 LFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSE
:::::.:::: ::::. :::.::.:: ::.::::::::.::: :::::::::: ::. :
CCDS45 LMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHE
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVN
..: .:::::.::. :: :::.:...: ::::::::::::::... .::. :..:::
CCDS45 INKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVN
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
. :. : .::::.::... :: : ::..:::::::::.:::.::.:: . :::: .
CCDS45 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
.: : ::.:: : ..:: :: ::::: .:.::....:.:::.:::::.:::::::.::.
CCDS45 AP--PLTPSKPPVVVDWASGVSPKPDPKTISKHVQRMVDSVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KSD IAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTF
:::.::: ::::.:::..::::.::. :::.::.: .. :.: :: ::::: :::::::
CCDS45 IAASFPF--SFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASS-IYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTF
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KSD CEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSL--P----
:..:::::::.:::::.::::: :::::::::.:. :.. :. : . ... :
CCDS45 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610
pF1KSD ---GSPSLPPAQDE-VFEFPG---VTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQAT
:. .: : .: : ::. : :... : :.: :. ::.:::.::.::.. .::
CCDS45 CSLGAKDLLHAPEEGPFTFPNGEAVEHGEESKD-RTIMLMGVSSQKISLRLKRAVAHKAT
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650
pF1KSD QTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKA---------------AKDKGFAKWENEKPR
::: .. : :: .. . .. .: .. ..:.::::.
CCDS45 QTESQPWIGSEGPSGPFVLSSPRKTAQDTLYVLPSPTSPCPSPVLVRKRAFVKWENKDSL
680 690 700 710 720 730
660 670 680
pF1KSD VHAGVDVVDRGTEFELDQDEGEETRQDGEDG
CCDS45 IKSKEELRHLRLPTYQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQKKIESLQLEKSNHVLAQMEQ
740 750 760 770 780 790
>>CCDS31598.1 RASGRP2 gene_id:10235|Hs108|chr11 (609 aa)
initn: 1300 init1: 845 opt: 2056 Z-score: 2058.5 bits: 391.1 E(32554): 2.5e-108
Smith-Waterman score: 2056; 52.7% identity (77.7% similar) in 588 aa overlap (2-583:3-585)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSSGLGKAATLDELLCTCIEMFDDNGELDNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMY
:. : :. :..::: ::: :::.:.. . : :. :.:: ::. :..:: ::: .:
CCDS31 MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDSGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLID
... .. : ...: :...:::: :::::.:. : .. .:.. . .: : ..: ::::
CCDS31 QQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLID
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ISSIPSYDWMRRVTQRKKVS-KKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQS
:.:.:.: : :.::::. :. :: : ::::::::.:::::::.::..:: .: : ::.:
CCDS31 IDSVPTYKWKRQVTQRNPVGQKKRKMSLLFDHLEPMELAEHLTYLEYRSFCKILFQDYHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNF
.: ::: .::.::: :.:::..:.:::::.::::: ::: :::.:..::.:::::.::
CCDS31 FVTHGCTVDNPVLERFISLFNSVSQWVQLMILSKPTAPQRALVITHFVHVAEKLLQLQNF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFK
::::::::::::::::::::::::.: :. : :. .::::...::: :::. .: : ::.
CCDS31 NTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHVSPETIKLWEGLTELVTATGNYGNYRRRLAACVGFR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTE--ENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDL
.::::::::::.:... .::: . ....: .::.:: : ::. . . .. : ::
CCDS31 FPILGVHLKDLVALQLALPDWLDPARTRLNGAKMKQLFSILEELAMVTSLRPPVQANPDL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD INLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTT---PNKPVVPLEWALGVMPKPDP
..:::.::: :.:::..:.::: :::...::::::. : .: : ::. .. :: :
CCDS31 LSLLTVSLDQYQTEDELYQLSLQREPRSKSSPTSPTSCTPPPRPPVLEEWTSAAKPKLDQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEM
... .::.:.:::::::.: : ::.::::.:. : .:::.:..: ::..::: ::..::
CCDS31 ALVVEHIEKMVESVFRNFDVDGDGHISQEEFQIIRGNFPYLSAFGDLDQNQDGCISREEM
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480 490 500 510 520 530
pF1KSD MAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHK
..::::..: : .:: :.::::: . :.:. :.:: ... :: ::: ::. ::.::::
CCDS31 VSYFLRSSSVLGGRMG--FVHNFQESNSLRPVACRHCKALILGIYKQGLKCRACGVNCHK
490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPGSPSLPPAQDEVFEFPGVTAGHRDLDSRAITLV
:::: : . ::: :.. :: .:: :. . . ..: : :.:
CCDS31 QCKDRLSVECRRRAQSVSL---EGSAPSPSPMHSHHHRAFSFSLPRPGRRGSRPPEIREE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
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CCDS31 EVQTVEDGVFDIHL
600
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10 20
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30 40 50 60 70 80
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: : .... .:: :: : : :..:: .:: :..:::.. . ::.::...:::...
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
: .. : : .. .: .... : . : : :.. :. . ..:: :
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150 160 170 180 190 200
pF1KSD ACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISK
. ::::::: :::.:::.:: .::. :. : .:::..: ... :.:: :..: :..:.
CCDS46 VSLLFDHLETGELAQHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVLQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSR
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD WVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHL
:::.::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::
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270 280 290 300 310 320
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: . :: :.:::..:..:: ::...: : ::..:.::::::::...: :: ..
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330 340 350 360 370 380
pF1KSD KVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPR
.... :...: . :.:::.::. : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD NSKS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQE
:: : :: : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: . : ::::
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450 460 470 480 490 500
pF1KSD DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
::: ...:::: .. .. : .:..:. .:.::: : . :.: .:.:.:.:.:.
CCDS46 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
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:::::. :.:::::. ::::.:..:: :::.:.: . . :.. :. ..: .. ::
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570 580 590 600 610
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.: .: :: : .. : .. : ...: . . .:..: : :. . .: :
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pF1KSD SEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVHAGVDVVDRGTEFELDQDEG
CCDS46 ETDTVPCPVMDPPSTASSKLDS
660 670
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10 20
pF1KSD MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
:.: .:: . . :::: ::. ::.
CCDS59 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
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30 40 50 60 70 80
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
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CCDS59 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
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90 100 110 120 130 140
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: .. : : .. .: .... : . : : :..:. ..:: :.
CCDS59 PEVMHQDPQLEEVIGRFWATVAREGNSAQRRLGDSSDLPG------------LGKKRKVS
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150 160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD QLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSS
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CCDS59 QVMVLSRPGPLQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSP
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270 280 290 300 310 320
pF1KSD EVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKV
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CCDS59 DSTKALLELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRL
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330 340 350 360 370 380
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.. :...: . :.:::.::. : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
CCDS59 HLPKLNNLYLRLQELVALQGQHPPCSANEDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCP
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD KS-PTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDF
:: : :: : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: . : ::::::
CCDS59 KSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDF
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450 460 470 480 490 500
pF1KSD ESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLK
: ...:::: .. .. : .:..:. .:.::: : . :.: .:.:.:.:.:. :
CCDS59 ERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTFRK
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::::. :.:::::. ::::.:..:: :::.:.: . . :.. :. ..: .. ::.:
CCDS59 PTFCDSCSGFLWGVTKQGYRCRECGLCCHKHCRDQVKVECKK---RPG-AKGDAGPPGAP
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570 580 590 600 610 620
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.: :: : .. : .. : ...: . . .:..: : :. . .: :
CCDS59 -VPSTPA-------PHASCGSEENHSYTLSLEP----ETGCQLRHAWT-QTESPHPSWET
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CCDS59 DTVPCPVMDPPSTASSKLDS
640 650
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10 20
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:..: .: :::.:... : : : ::: ..: . :: :..::: : .::: :. :
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150 160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
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270 280 290 300 310 320
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..: .:::::.::. :: :::.:...: ::::::::::::::... .::. :..:::
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330 340 350 360 370 380
pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
. :. : .::::.::... :: : ::..:::::::::.:::.::.:: . :::: .
CCDS76 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
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CCDS76 AP-------------------------------------SVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
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:::.::: ::::.:::..::::.::. :::.:: :... :.: :: ::::: :::::::
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CCDS76 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
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CCDS76 CSLGAKDLLHGNKYSESR
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pF1KSD MGSSG-LGKAATLDELLCTCIEMFDDNGEL
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CCDS45 AASKARLEAKPANSPFPSHPSLAHITQFRMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNL
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30 40 50 60 70 80
pF1KSD DNS-YLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAE
: : ...: ::: .::.:: .:.. .:..: ... . ::::::.:::: .: .
CCDS45 CRSNQLLQVMLTMHRIVISSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVRYWITEFWVM
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD FNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSIPSYDWMRRVTQRKK--VSKKGKACL
:..: .: :::.:... : : : ::: ..: . :: :..::: : .::: :. :
CCDS45 FKMDASLTDTMEEFQELVKAKGEELHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSL
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQ
::::::: ::.::::.:: ::::::::.:::.:....:...:::.:::::: ::::.:::
CCDS45 LFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQ
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210 220 230 240 250 260
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CCDS45 LMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHE
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pF1KSD VTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWTEENKVN
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CCDS45 INKVLGEMTELLSSSRNYDNYRRAYGECTDFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVN
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pF1KSD IVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSK
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CCDS45 VHKLLALYNHISELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHR
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pF1KSD SPTSPTTPNKPVVPLEWALGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFES
.: :::.:::::.:::::::.::.
CCDS45 AP-------------------------------------SVFKNYDHDQDGYISQEEFEK
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pF1KSD IAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTF
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CCDS45 IAASFPF--SFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASS-IYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTF
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pF1KSD CEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSL--P----
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CCDS45 CDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKNPVAPTENNTSVGPVSNL
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pF1KSD ---GSPSLPPAQDE-VFEFPG---VTAGHRDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQAT
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CCDS45 CSLGAKDLLHAPEEGPFTFPNGEAVEHGEESKD-RTIMLMGVSSQKISLRLKRAVAHKAT
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pF1KSD QTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKA---------------AKDKGFAKWENEKPR
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CCDS45 QTESQPWIGSEGPSGPFVLSSPRKTAQDTLYVLPSPTSPCPSPVLVRKRAFVKWENKDSL
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pF1KSD MGSSGLG----KAATLDELLCTCIEMFDDN
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CCDS59 ECTGKIGGRGRPRQVRRHKTCPSPREISKVMASMNLGLLSEGGCSEDELLEKCIQSFDSA
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KSD GEL-DNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYRNATGESCNEFRLKICYFMRYWILKF
: : .... .:: :: : : :..:: .:: :..:::.. . ::.::...:::...
CCDS59 GSLCHEDHMLNMVLAMHSWVLPSADLAARLLTSYQKATGDTQELRRLQICHLVRYWLMRH
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD PAEFNLDLGLIRMTEEFREVASQLGYEKHVSLIDISSI--PSYDWMRRVTQRKKVSKKGK
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150 160 170 180 190 200
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. ::::::: :::.:::.:: .::. :.
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210 220 230 240 250 260
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.::::.: : :::.:. :::.::..: ::.::::::::.::: ::.:::::..:.::
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270 280 290 300 310 320
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: . :: :.:::..:..:: ::...: : ::..:.::::::::...: :: ..
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280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
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.... :...: . :.:::.::. : ::..::::::::..:::.::.:: . :::
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:: : :: : :.: .::: :: :::: .....:...::::::.::: . : ::::
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::: ...:::: .. .. : .:..:. .:.::: : . :.: .:.:.:.:.:.
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:::::. :.:::::. ::::.:..:: :::.:.: . . :.. :. ..: .. ::
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.: .: :: : .. : .. : ...: . . .:..: : :. . .: :
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10 20
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30 40 50 60 70 80
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90 100 110 120 130 140
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150 160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
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CCDS54 ---------ELTELLASHNNYARYRRTWAGCAGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDG
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CCDS54 CPKSLPPSPF--NAPLV-VEWAPGVTPKPDRVTLGRHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQE
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD DFESIAANFPFL-DSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTY
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CCDS54 DFERLSGNFPFACHGLHPPPRQGRGSFSREELTGYLLRA-SAICSKLGLAFLHTFHEVTF
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pF1KSD LKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARAPSLSSGHGSLPG
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]