Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0854
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0854, 837 aa
1>>>pF1KSDA0854 837 - 837 aa - 837 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1738+/-0.0004; mu= 9.3828+/- 0.025
mean_var=202.5952+/-40.525, 0's: 0 Z-trim(118.7): 35 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.090107
statistics sampled from 31966 (32001) to 31966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 14.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055758 (OMIM: 609185) zinc fingers and homeobox ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_011515234 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_011515233 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_005250893 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_005250894 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
NP_001017926 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeo ( 873) 600 91.3 2e-17
NP_009153 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeobox ( 873) 600 91.3 2e-17
XP_011527022 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956) 521 81.1 2.7e-14
XP_016883226 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956) 521 81.1 2.7e-14
NP_055850 (OMIM: 609598) zinc fingers and homeobox ( 956) 521 81.1 2.7e-14
XP_016883227 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527015 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527016 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527013 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527007 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527020 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_006723812 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_005260398 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527010 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_005260400 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_006723811 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527003 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527006 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527008 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527011 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527005 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527009 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527019 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_016883225 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
XP_011527004 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969) 521 81.1 2.7e-14
>>NP_055758 (OMIM: 609185) zinc fingers and homeoboxes p (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3905.3 bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>XP_011515234 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3905.3 bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>XP_011515233 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3905.3 bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>XP_005250893 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3905.3 bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>XP_005250894 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an (837 aa)
initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541 Z-score: 3905.3 bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
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pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
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pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
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pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
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pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
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pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
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pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
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pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
790 800 810 820 830
>>NP_001017926 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeoboxe (873 aa)
initn: 1730 init1: 464 opt: 600 Z-score: 433.7 bits: 91.3 E(85289): 2e-17
Smith-Waterman score: 1887; 39.8% identity (66.5% similar) in 890 aa overlap (1-811:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
:::.::::::::: .: ::: :. ..: : : .. :. :...::
NP_001 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
10 20 30 40 50
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pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
: . ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.:: :::.:::: ::
NP_001 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
.::.::.:: :.:::: :::: ..::::::..::.:. . :.. .. .: :
NP_001 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
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pF1KSD DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEGTARLVTDT
.::::.::::::: : :.. :. ::.. : :: : :. ::. . ....
NP_001 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD ---AEILSRLGGVEL--------LQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
. :..:. . :..:. .:. : ::.::: .:.:. ::.:
NP_001 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
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280 290 300 310 320 330
pF1KSD LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
::.: ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
NP_001 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
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340 350 360 370 380
pF1KSD KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
.:.::::...:: ::::.:.... . : :::: :::.:: .::::::.. .:
NP_001 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
.::.:.:::: .... . .: : : . .: : :: : . ..: :
NP_001 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
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450 460 470 480 490
pF1KSD KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: :: ::. .
NP_001 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KSD HITSESL------AKDQLA----IAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
:....: ..:. . ..... .... .:::.:::::::: :...:. :::
NP_001 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
.:: :. ::.:::..:::.:::::.::.:..: . :. . .: ..:.. ...: .
NP_001 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
: :. ::: ..: . :. ::.:.:.:.:.:::::.:.:::.:: ..::.
NP_001 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
::.:: :: ..: :.:..::. :: .. .: ... ... .: ... :
NP_001 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760
pF1KSD ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
:.: .. .:: : : :.::..::.. ..: : ..
NP_001 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
770 780 790 800 810
770 780 790 800 810 820
pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEESS-VVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
: ..:.. : . .:::: . :.: : :.. .: ::.:
NP_001 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
820 830 840 850 860
830
pF1KSD LAESDSDCVPAEAGQA
NP_001 SKSDD
870
>>NP_009153 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeoboxes p (873 aa)
initn: 1730 init1: 464 opt: 600 Z-score: 433.7 bits: 91.3 E(85289): 2e-17
Smith-Waterman score: 1887; 39.8% identity (66.5% similar) in 890 aa overlap (1-811:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
:::.::::::::: .: ::: :. ..: : : .. :. :...::
NP_009 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
: . ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.:: :::.:::: ::
NP_009 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
.::.::.:: :.:::: :::: ..::::::..::.:. . :.. .. .: :
NP_009 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEGTARLVTDT
.::::.::::::: : :.. :. ::.. : :: : :. ::. . ....
NP_009 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD ---AEILSRLGGVEL--------LQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
. :..:. . :..:. .:. : ::.::: .:.:. ::.:
NP_009 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
::.: ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
NP_009 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KSD KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
.:.::::...:: ::::.:.... . : :::: :::.:: .::::::.. .:
NP_009 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
.::.:.:::: .... . .: : : . .: : :: : . ..: :
NP_009 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: :: ::. .
NP_009 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KSD HITSESL------AKDQLA----IAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
:....: ..:. . ..... .... .:::.:::::::: :...:. :::
NP_009 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
.:: :. ::.:::..:::.:::::.::.:..: . :. . .: ..:.. ...: .
NP_009 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
: :. ::: ..: . :. ::.:.:.:.:.:::::.:.:::.:: ..::.
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730 740 750 760
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770 780 790 800 810 820
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NP_055 -GLLVIA----------PGNR-ELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAE
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pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRD-GQGSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
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NP_055 KMGEETRAVADTGSEDQGPGTGELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTS
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837 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:46:03 2016 done: Thu Nov 3 03:46:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]