FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0865, 1858 aa 1>>>pF1KSDA0865 1858 - 1858 aa - 1858 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8773+/-0.00147; mu= -21.8022+/- 0.089 mean_var=733.4486+/-148.540, 0's: 0 Z-trim(113.6): 108 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.047358 statistics sampled from 14091 (14176) to 14091 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16 Scan time: 8.200 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 12436 866.7 0 CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 12436 866.7 0 CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1040 88.0 2.6e-16 CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1040 88.0 2.6e-16 CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1042 88.2 2.7e-16 CCDS46529.1 NYAP2 gene_id:57624|Hs108|chr2 ( 653) 1013 85.9 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CCDS42 AIELGDGDPPLFDMHPVKTLFKIPRNPPPTLLHPE-KWCEEFNHFISQCLIKDFERRPSV 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KSD IHDLPVLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTK-P : : :.. . . .:.:.. .: : :. :. . .. :. : CCDS42 THLLD------HPFIKGVHGKVLFLQKQL-----AKVLQDQKHQNPVAKTRHERMHTRRP 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KSD EQVKLMPP-APNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYS .:. .:::..: :.. ......:::... :::..::::. .::...: ::: CCDS42 YHVEDAEKYCLEDDLVNLEVLDEDTIIHQLQKRYADLLIYTYVGDILIALNPFQNLSIYS 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KSD SMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQII . :.:: : .: :::.:. .. :.. . .. ::...::: ::::.:... :. CCDS42 PQFSRLYH---GVKRASNPPHIFASADAAYQCMVTLSKDQCIVISGESGSGKTESAHLIV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KSD RHLTCRAGASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGA .::: . :. :: .. .: ..::::.. :..:: :: : ::.:..: . :: CCDS42 QHLTFLGKANNQTLREKILQVNSLVEAFGNSCTAINDNSSRFGKYLEMMFTPTGV-VMGA 460 470 480 490 500 580 590 600 610 620 pF1KSD RIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYG-LHLNNLCAHRYL-NQT--IQ :: :::::::...: ..:: ::: .. :: ..: . ..: . ::. ..: .. CCDS42 RISEYLLEKSRVIKQAAREKNFHIFYYIYAGLHHQKKLSDFRLPEEKPPRYIADETGRVM 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 pF1KSD DDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVILAAILHLGDIRFTALN---EGN : .. : :... .... . ..::.. ::.... :::.::..:.:.:.:.. . . CCDS42 HDITSKES--YRRQFEAIQHCFRIIGFTDKEVHSVYRILAGILNIGNIEFAAISSQHQTD 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 pF1KSD SAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSL .. : . . :...:..: .: .:: :::. .:. ::: .:.. : :: ..:.: CCDS42 KSEVPNAEALQNAASVLCISPEELQEALTSHCVVTRGETIIRANTVDRAADVRDAMSKAL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 pF1KSD YSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQT-LDIGILDIFGFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMH :.::::..:: .:. :. ... : ...:::::::::.::.: :::::.:..::... CCDS42 YGRLFSWIVNRINTLLQPDENICSAGGGMNVGILDIFGFENFQRNSFEQLCINIANEQIQ 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 860 pF1KSD HYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVE .:.:. .: ::.: .::. . :. .::.:.::: :.:.::::::. 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CCDS42 KPNDDREALQFSRERVLAQLRSTGILETVSIRRQGYSHRILFEEFVKRYYYLA--FTAHQ 960 970 980 990 1000 1010 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD KEQSAAERCRLVLQQCKLQGWQMGVRKVFLKYWHADQLNDLCLQLQRKIITCQKVIRGFL .. : : .:.. .:. : .: ::::::.:..::: : .. .... : .:.: CCDS42 TPLASKESCVAILEKSRLDHWVLGKTKVFLKYYHVEQLNLLLREVIGRVVVLQAYTKGWL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD -ARQHLLQRIS-IRQQEVTSINSFLQNTE------DMGLKTYDALVIQNASDIARENDRL ::.. .:. :.. . .:.: .. . .. . .. . ..:.: . ... CCDS42 GARRY--KRVREKREKGAIAIQSAWRGYDARRKFKKISNRRNESAAHNQAGDTSNQSSGP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD RSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSGPRHFHPSSMSVCAAVDGLGQCLVG-PSIW .: . : . . ::.. .: :.... : :. : .. : .: : . :.. CCDS42 HSPVAAGT-RGSAEVQDCSEPGDHKVLRGSVHRRSHSQAES----NNGRTQTSSNSPAVT 1140 1150 1160 1170 1180 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD SPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAAREAANEALARP . : :.. ::. . . .. ... . : : . . . : CCDS42 EKNGH-------SQAQSSPKGCDIFAGHANKHSVSGTDLLSSRICHPAPDQQGLSLWGAP 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD -RPHSDDYSTMKKIPPRK----PKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAPGAAARVLT .: :.. ..:. ::. :: . . . :....:. CCDS42 QKPGSENGLAQKHRTPRRRCQQPKMLSSPEDTMYYNQLNGTLEYQGSKRKPRKLGQIKVL 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KSD PGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAARPDSPDPGESVYEEMKCCLPDDGGPGAG CCDS42 DGEDEYYKSLSPVDCIPEENNSAHPSFFSSSSKGDSFAQH 1310 1320 1330 1340 >>CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616 aa) initn: 1244 init1: 233 opt: 1042 Z-score: 406.0 bits: 88.2 E(32554): 2.7e-16 Smith-Waterman score: 1527; 30.8% identity (62.4% similar) in 1061 aa overlap (404-1414:341-1354) 380 390 400 410 420 430 pF1KSD QQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMPPAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTF :::::: :..... ...: .. .:::.. CCDS71 MGGTEKARRERIHTKKGNFNRPLISNLKDVDDLATLEILDENTVSEQLEKCYSRDQIYVY 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 pF1KSD IGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCF .::::. .::.. : .::. :.::..: : .: :::.:. .. ...... . ::. CCDS71 VGDILIALNPFQSLGLYSTKHSKLYIGS--KRTAS-PPHIFAMADLGYQSMITYNSDQCI 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 550 pF1KSD ILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRATLDSRFKHVVCILEAFGHAKTTLNDLSSCF ..::: :.::.: .. ....:: . :. ::. .. .: ..::::.: : .:: :: : CCDS71 VISGESGAGKTENAHLLVQQLTVLGKANNRTLQEKILQVNNLVEAFGNACTIINDNSSRF 430 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 pF1KSD IKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEK---YG ::.:..: . ..::.: :::::::.. : .:..:: ::: .. ::. ..: : CCDS71 GKYLEMKFTS-SGAVVGAQISEYLLEKSRVIHQAIGEKNFHIFYYIYAGLAEKKKLAHYK 490 500 510 520 530 540 620 630 640 650 660 pF1KSD LHLNNLCAHRYLN----QTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVIL : :. :::. .:.:: .. :. . . .... ..:.::. .. ... :: CCDS71 LPENK--PPRYLQNDHLRTVQDIMNN---SFYKSQYELIEQCFKVIGFTMEQLGSIYSIL 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 pF1KSD AAILHLGDIRFTAL---NEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDM ::::..:.:.:... .. ... .:. ::. :..: . .::: :::. .:. CCDS71 AAILNVGNIEFSSVATEHQIDKSHISNHTALENCASLLCIRADELQEALTSHCVVTRGET 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KSD IIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCL-HSQDEQKSMQTLDIGILDIFGF ::: .:.. : :: .::.::.::::..:: .:: : :... . . . :.::::::::: CCDS71 IIRPNTVEKATDVRDAMAKTLYGRLFSWIVNCINSLLKHDSSPSGNGDELSIGILDIFGF 670 680 690 700 710 720 790 800 810 820 830 840 pF1KSD EEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFF :.:.:: :::::.:..::....: :. .: :: : ..: : .. : .::.:. CCDS71 ENFKKNSFEQLCINIANEQIQYYYNQHVFAWEQNEYLNEDVDARVIEYEDNWP-LLDMFL 730 740 750 760 770 780 850 860 870 880 890 900 pF1KSD QKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAF ::: :.:.::::::.. ...... .:... :.: . . : : .: CCDS71 QKPMGLLSLLDEESRFPKATDQTLVEKFEGNLKS---QYFWRP----------KRMELSF 790 800 810 820 910 920 930 940 950 960 pF1KSD TIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPS : ::::.:.:.. : . ::.:.: ........:.: :: .: . :..::.: : CCDS71 GIHHYAGKVLYNASGFLAKNRDTLPTDIVLLLRSSDNSVIRQLVNHPLTKTGNL----PH 830 840 850 860 870 880 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD FKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPV-TIASQLR : .. ... .: .: .. ..:.: : .: : . . :.:: .: CCDS71 SKTKN----VINYQMRTS------EKLINLAK--GDTGEATRHARETTNMKTQTVASYFR 890 900 910 920 930 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KSD KSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVR ::::...:. :::..::.::. . .:. : ::.: :.:: ..: : :. : CCDS71 YSLMDLLSKMVVGQPHFVRCIKPNSERQARKYDKEKVLLQLRYTGILETARIRRLGFSHR 940 950 960 970 980 990 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KSD LSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQGWQMGVRKVFLKYWHADQLN . :..:..:: : . .. . . . : .:.. :..: .: ::::::.:..::: CCDS71 ILFANFIKRYYLLC--YKSSEEPRMSPDTCATILEKAGLDNWALGKTKVFLKYYHVEQLN 1000 1010 1020 1030 1040 1150 1160 1170 pF1KSD DLCLQLQRKIITCQKVIRGFL----------------------ARQHLL--QRISIRQQE . . :.: : .:.:: :: ::. :: : ... CCDS71 LMRKEAIDKLILIQACVRAFLCSRRYQKIQEKRKESAIIIQSAARGHLVRKQRKEIVDMK 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KSD VTSINSFLQNTEDMGLK-----TYDALVIQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEV--- :..... . ... : : ...: ..: . :.:. ..:: .: .. : CCDS71 NTAVTTIQTSDQEFDYKKNFENTRESFVKKQAENAISANERF---ISAPNNKGSVSVVKT 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KSD RNMQEEGSKRTDDKSGPRHFH-PSSMSVCAAVDGLGQC-LVGPSIWSPSLHSVFSMDDSS ... : . .:. : .. :..:. . . :::: . ::. .:: .....: CCDS71 STFKPEEETTNAVESNNRVYQTPKKMNNVYEEEVKQEFYLVGPEV-SPKQKSVKDLEENS 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KSD SLPSPRKQPPP-KPKRDPNTRLSASYEAVSACLSAAREAANEALARPRPH-SDDYSTMKK .: . .:. . . :. :. .: : :.: .: . : : ... ...:: CCDS71 NLRKVEKEEAMIQSYYQRYTEERNCEESKAAYLE--RKAISERPSYPVPWLAENETSFKK 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KSD -IPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDARPAGAPGAA-ARVLTPGTPQCALPPAAPPG . : .:: . .. .: . : . : . . .:. . . . :.. CCDS71 TLEPTLSQRSIYQNANSMEKEKKTSVVTQRAPICSQEEGRGRLRHETVKERQVEPVTQAQ 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KSD DEDDSEPVYIEMLGHAARPDSPDPGESVYEEMKCCLPDDGGPGAGSFLLHGASPPLLHRA .:.:. :.:. CCDS71 EEEDKAAVFIQSKYRGYKRRQQLRKDKMSSFKHQRIVTTPTEVARNTHNLYSYPTKHEEI 1350 1360 1370 1380 1390 1400 >>CCDS46529.1 NYAP2 gene_id:57624|Hs108|chr2 (653 aa) initn: 812 init1: 450 opt: 1013 Z-score: 400.6 bits: 85.9 E(32554): 5.4e-16 Smith-Waterman score: 1271; 43.1% identity (61.5% similar) in 589 aa overlap (1177-1735:12-571) 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASD : ...::: ::::.:.::.:::::::: CCDS46 MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASD 10 20 30 40 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KSD IARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSG--------PRHFHPSSMSVCA :::::::::.: : : ::: : : :::. :: . : .::. . :.. : CCDS46 IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA 50 60 70 80 90 100 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KSD AVDGLGQ-CLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVS- : : . : : :. : ::::: . ::.:: : :.::::::::::.:.::.: :.:: CCDS46 PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS 110 120 130 140 150 160 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KSD --ACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDA : :. .:: :.::::::.:: ::::: ::::.:::.:: :..: .. : CCDS46 TAASKSGKTPERTEASAKPRPHSDEYS--KKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPR 170 180 190 200 210 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KSD RPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAARP---DSPDPGESV : . .. . ..: :: .. :::::::.:. : .. : .:.: CCDS46 RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV 220 230 240 250 260 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KSD YEEMKCCLPDDGGPGAG-SFLLHG-----ASP--PLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFP ::::: . :: : : .: :. :.: : : : . : : :::::::: CCDS46 YEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFP 270 280 290 300 310 320 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KSD NLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLS-PQY ::: ::::::::::.:: ::: ::::::::::: :::::: :..: :: :.:: . :.. 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CCDS46 AAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSH----ST 500 510 520 530 540 550 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KSD EITSETQDRNANNHGIQLSNSLSSAITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQRH : . .... ..:: . : CCDS46 EPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSPTLLAGNHSSEPK 560 570 580 590 600 610 >>CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (961 aa) initn: 541 init1: 182 opt: 984 Z-score: 387.6 bits: 84.1 E(32554): 2.9e-15 Smith-Waterman score: 1153; 30.5% identity (62.4% similar) in 771 aa overlap (405-1164:13-715) 380 390 400 410 420 430 pF1KSD QSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMPPAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFI :.. .. .. .. ... :: ...::::: CCDS76 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFI 10 20 30 40 440 450 460 470 480 490 pF1KSD GDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFI :.... ::::: : ::. . . : .:. :::::. .. :.. . :... :.. 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CCDS76 EQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDN 340 350 360 370 380 390 790 800 810 820 830 840 pF1KSD NEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSG : :::.:.:. :::... . .... .:: : .::. . .:: ..:. :. .: CCDS76 NSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQI-IVDLVEQQHKG 400 410 420 430 440 450 850 860 870 880 890 900 pF1KSD FLTLLDEESQMIWSVESN-FPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMH ....::. . . .: .. : . :.: : . .: .: : .. : . : : : CCDS76 IIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKL---GKHAHFSSRKLCASDKIL-EFDRDFRIRH 460 470 480 490 500 910 920 930 940 950 960 pF1KSD YAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFR ::: :.:.:.: :.::::.: :.. .: .: : :.... .: CCDS76 YAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNM--------------WP----- 510 520 530 540 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD GHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMD :.: : .... :. :.: :. ...:.. CCDS76 ------------------EGK--LSITEVTKR--------------PLTAATLFKNSMIA 550 560 570 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KSD IIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSD .. .: . :....::.::..: :. ::. :..:.:.:: :.. : :. : .. CCDS76 LVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEK 580 590 600 610 620 630 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KSD FLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQG-WQMGVRKVFLKYWHAD-QLNDLC :: ::: ... .. : : . ....: .: .: :.:.. .. :..: CCDS76 FLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELR 640 650 660 670 680 690 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD LQ-LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQN : : : .. ::: :: ::: CCDS76 AQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMR 700 710 720 730 740 750 >>CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006 aa) initn: 541 init1: 182 opt: 984 Z-score: 387.3 bits: 84.1 E(32554): 3e-15 Smith-Waterman score: 1153; 30.5% identity (62.4% similar) in 771 aa overlap (405-1164:13-715) 380 390 400 410 420 430 pF1KSD QSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMPPAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQIYTFI :.. .. .. .. ... :: ...::::: CCDS32 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFI 10 20 30 40 440 450 460 470 480 490 pF1KSD GDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQRPQCFI :.... ::::: : ::. . . : .:. :::::. .. :.. . :... :.. CCDS32 GEVVVSVNPYKLLNIYGRDTIEQY---KGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIV 50 60 70 80 90 500 510 520 530 540 550 pF1KSD LSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRATLDSRFKHVV----CILEAFGHAKTTLNDLS .::: :.::.:::: :..... .. :. . : :... :.:::::.:::. :: : CCDS32 ISGESGAGKTEASKYIMQYIAAITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNS 100 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 610 pF1KSD SCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLSAEEKYG : : ::....: . : . :..: .:::::::.. : :. .: :: :..: : . . CCDS32 SRFGKYMDINF-DFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRS 160 170 180 190 200 210 620 630 640 650 660 pF1KSD LHLN-NLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFVILAAI :::. .: .. :.. : .: .. . .. :. :..:.::. :..... ::::: CCDS32 LHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSSINDAA----EFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAI 220 230 240 250 260 270 670 680 690 700 710 720 pF1KSD LHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQYFKGDMIIRRHT ::::...:.. .:.. .. . ... .: .:...:: . .:: :.: ..:: CCDS32 LHLGNLKFVV--DGDTPLIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHT 280 290 300 310 320 330 730 740 750 760 770 780 pF1KSD IQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLD--IGILDIFGFEEFQK : : . :: .::..: ::: ..:. .:. .. .. . ... . ::.:::.::: :.. CCDS32 EQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDN 340 350 360 370 380 390 790 800 810 820 830 840 pF1KSD NEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQKPSG : :::.:.:. :::... . .... .:: : .::. . .:: ..:. :. .: CCDS32 NSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQI-IVDLVEQQHKG 400 410 420 430 440 450 850 860 870 880 890 900 pF1KSD FLTLLDEESQMIWSVESN-FPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTAFTIMH ....::. . . .: .. : . :.: : . .: .: : .. : . : : : CCDS32 IIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKL---GKHAHFSSRKLCASDKIL-EFDRDFRIRH 460 470 480 490 500 910 920 930 940 950 960 pF1KSD YAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYPSFKFR ::: :.:.:.: :.::::.: :.. .: .: : :.... .: CCDS32 YAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNM--------------WP----- 510 520 530 540 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD GHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMD :.: : .... :. :.: :. ...:.. CCDS32 ------------------EGK--LSITEVTKR--------------PLTAATLFKNSMIA 550 560 570 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KSD IIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSD .. .: . :....::.::..: :. ::. :..:.:.:: :.. : :. : .. CCDS32 LVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEK 580 590 600 610 620 630 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KSD FLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQG-WQMGVRKVFLKYWHAD-QLNDLC :: ::: ... .. : : . ....: .: .: :.:.. .. :..: CCDS32 FLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELR 640 650 660 670 680 690 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD LQ-LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQN : : : .. ::: :: ::: CCDS32 AQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMR 700 710 720 730 740 750 >>CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022 aa) initn: 925 init1: 338 opt: 901 Z-score: 352.6 bits: 78.7 E(32554): 2.6e-13 Smith-Waterman score: 1166; 27.8% identity (53.8% similar) in 1316 aa overlap (397-1559:140-1405) 370 380 390 400 410 420 pF1KSD ATKGLCKQQSQDSIPENPMMSGSTKPEQVKLMP--PAPNDDLATLSELNDGSLLYEIQKR :.: : ::: .: ::..:.:: ....: CCDS46 QERNADGTIKYVHMQLVAQATATRRLVERGLLPRQQADFDDLCNLPELTEGNLLKNLKHR 110 120 130 140 150 160 430 440 450 460 470 480 pF1KSD FGNNQIYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSS-GKLCSSLPPHLFSCVERAFHQ : ...:::. :.::. .::.: ::::. ..: ... :: : ::.:. .. :.. CCDS46 FLQQKIYTYAGSILVAINPFKFLPIYNPKYVKMYENQQLGK----LEPHVFALADVAYYT 170 180 190 200 210 220 490 500 510 520 530 540 pF1KSD LFREQRPQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRAT-LDSRFKHVVCILEAFGHA ..:.. ::...::: ::::..... .:. :: . . :. .. . . .:::::.: CCDS46 MLRKRVNQCIVISGESGSGKTQSTNFLIHCLTALSQKGYASGVERTILGAGPVLEAFGNA 230 240 250 260 270 280 550 560 570 580 590 600 pF1KSD KTTLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDG ::. :. :: : :...... : . . :: . ::::::::::: . :. .:: :. : CCDS46 KTAHNNNSSRFGKFIQVSYLE-SGIVRGAVVEKYLLEKSRLVSQEKDERNYHVFYYLLLG 290 300 310 320 330 340 610 620 630 640 650 pF1KSD LSAEEKYGLHLNNLCAHRYLNQ---TIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEV .: ::. ..:.. . :::: :.: :: .:... . ::.:...::: CCDS46 VSEEERQEFQLKQPEDYFYLNQHNLKIED----GE-DLKHD-FERLKQAMEMVGFLPATK 350 360 370 380 390 660 670 680 690 700 710 pF1KSD ENLFVILAAILHLGDIRFTALNEG--NSAFVSDLQLLEQVAGMLQVSTDELASALTTDIQ ...:..:.:::.::.. . : .. :. ..:. .. .:.:. . :. .:: CCDS46 KQIFAVLSAILYLGNVTYKKRATGREEGLEVGPPEVLDTLSQLLKVKREILVEVLTKRKT 400 410 420 430 440 450 720 730 740 750 760 770 pF1KSD YFKGDMIIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMN-SCLHSQDEQKSMQTLDIGI .: .: .... : :: .:::::: ::...: .: . :...: ..... :.::. CCDS46 VTVNDKLILPYSLSEAITARDSMAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDVEEAVSCLSIGV 460 470 480 490 500 510 780 790 800 810 820 830 pF1KSD LDIFGFEEFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNG :::::::.:..: :::.:.:..::....:.:. .: :: : ::.: .. . : : CCDS46 LDIFGFEDFERNSFEQFCINYANEQLQYYFNQHIFKLEQEEYQGEGITWHNIGYTDNV-G 520 530 540 550 560 570 840 850 860 870 880 890 pF1KSD VLDFFFQKPSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKL-QSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVAL . .. .::.:.. :::::: :::. :.:: . . . .:.. .. CCDS46 CIHLISKKPTGLFYLLDEES--------NFPHATSQTLLAKFKQQ-----HEDNKYFLGT 580 590 600 610 620 900 910 920 930 940 pF1KSD KDHGTAFTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLF--------- :: :.:.::.: :.. ::: : . ... ... :.. . .:. CCDS46 PVMEPAFIIQHFAGKVKYQIKDFREKNMDYMRPDIVALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFR 630 640 650 660 670 680 950 960 970 pF1KSD ----------QSKLSQTGSL---------------VSAYPSFKFRGHKSAL------LSK .. : ..: : ....: :: .. : . CCDS46 WAVLRAAIRAMAVLREAGRLRAERAEKAAGMSSPGAQSHPEELPRGASTPSEKLYRDLHN 690 700 710 720 730 740 980 990 1000 pF1KSD KMTAS----SIIGENKNYL--ELSKL-------LKKKG---------------------- .: : ::. : ::.: ::.:: CCDS46 QMIKSIKGLPWQGEDPRSLLQSLSRLQKPRAFILKSKGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIIS 750 760 770 780 790 800 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD -------TSTFLQRLERGDPVTIASQLRKSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTF :...:. .. : .:..:.. :: .. : : : ::.::: : : : CCDS46 MTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLEALGKAEPFFIRCIRSNAEKKELCF 810 820 830 840 850 860 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD DNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVRLSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRL :. : ::.: :.:: :.: : :: .. .:.:: ... : : : : CCDS46 DDELVLQQLRYTGMLETVRIRRSGYSAKYTFQDFTEQFQ-----VLLPKDAQPCREVIST 870 880 890 900 910 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD VLQQCKL--QGWQMGVRKVFLKYWHADQLND-LCLQLQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQ- .:.. :. ...:.: ::::: . . :.. : .. :::. :. .: : :.:.:: CCDS46 LLEKMKIDKRNYQIGKTKVFLKETERQALQETLHREVVRKILLLQSWFRMVLERRHFLQM 920 930 940 950 960 970 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD -RISI------------RQQEVTSINSFLQNTE----DMGLKTYDALVIQNASDIAREND : .. : : :. .:: . . : .. : ... : . CCDS46 KRAAVTIQACWRSYRVRRALERTQAAVYLQASWRGYWQRKLYRHQKQSIIRLQSLCRGHL 980 990 1000 1010 1020 1030 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD RLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSGPRHFHPSSMSVCA-----AVDG---LG . .: . .:.: : .. . . :. . : . ....: : :: . CCDS46 QRKSFSQMISEKQKAEEKEREALEAARAGAEEGGQGQAAGGQQVAEQGPEPAEDGGHLAS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KSD QCLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKP-------KRDPNTRLSA------S . : :: :: :: . . :::.: ::. .. :..: . . CCDS46 EPEVQPSDRSPLEHS----SPEKEAPSPEKTLPPQKTVAAESHEKVPSSREKRESRRQRG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KSD YEAVSACLSAAREAANE-ALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSR : :. . . .: :: .: . . . .. . .: .: .: : : . CCDS46 LEHVKFQNKHIQSCKEESALREPSRRVTQEQGVSLLEDKKESREDETLL---VVETEAEN 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD PGDARPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAP-PGDEDDSEPVYIEMLGHAARPDSPDPG- .. .:. : : : . . .:: ..: ::. . .:. . . .: . : :: CCDS46 TSQKQPTEQPQAMAVGKVSEETEKTLPSGSPRPGQLE--RPTSLAL---DSRVSPPAPGS 1220 1230 1240 1250 1260 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD --ESVYEEMKCC-------LPDD-GGPGAGSFLLHG---ASPPLLHRAPEDEAAGPPGDA :. .. : : ::. :: . : . :: : :. . ::. :. CCDS46 APETPEDKSKPCGSPRVQEKPDSPGGSTQIQRYLDAERLASAVELWRGKKLVAAASPSAM 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KSD CDIPPPFPNLLPHRPPLLVFPPTPV--TCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPE . . . :: .. :: : .:: : : : .: :. ::. . : CCDS46 LSQSLDLSD--RHRATGAALTPTEERRTSFSTSDVSKLLPSLAKAQPAAETT-----DGE 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KSD GSSPLSPQYSKSQKGDGDRPASPGLALFNGSGRASPPSTPPPPPPPPGPPPAPYRPCAHL :. .: .:.. ::.. . ::. CCDS46 RSAK-KPAVQKKKPGDASSLPDAGLSPGSQVDSKSTFKRLFLHKTKDKKYSLEGAEELEN 1390 1400 1410 1420 1430 >>CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960 aa) initn: 751 init1: 186 opt: 894 Z-score: 350.2 bits: 78.2 E(32554): 3.5e-13 Smith-Waterman score: 1074; 27.5% identity (60.1% similar) in 914 aa overlap (350-1239:20-867) 320 330 340 350 360 370 pF1KSD SASTLAQEEPYEEIIHDLPVLSSKLSPLVLPIAKQDSLLEKDIMFKDATKGLCKQQSQDS :.:. : .: . . .:. . .. CCDS13 MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEE 10 20 30 40 380 390 400 410 420 pF1KSD IPENPMM----SGS----TKPEQVKLMPP--APNDDLATLSELNDGSLLYEIQKRFGNNQ . :. .. .:. .: . :. :: . .:.: :. ::..:.:.....:. .. CCDS13 VGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGL 50 60 70 80 90 100 430 440 450 460 470 480 pF1KSD IYTFIGDILLLVNPYKELPIYSSMVSQLYFSSSGKLCSSLPPHLFSCVERAFHQLFREQR :::. : . ...::::.::::: . ..: .:: .:::... .. :......... CCDS13 IYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEEIVEMY---KGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDRE 110 120 130 140 150 160 490 500 510 520 530 540 pF1KSD PQCFILSGERGSGKSEASKQIIRHLTCRAGASRAT-----LDSRFKHVVCILEAFGHAKT : .. .:: :.::.: .:..:..:. :.. .. :. .. .. ::::::.::: CCDS13 DQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAYVASSHKSKKDQGELERQLLQANPILEAFGNAKT 170 180 190 200 210 220 550 560 570 580 590 600 pF1KSD TLNDLSSCFIKYFELQFCERKQQLTGARIYTYLLEKSRLVSQPLGQSNFLIFYLLMDGLS . :: :: : :.....: . . ..:: : :::::::: . : . .: ::: :..: . CCDS13 VKNDNSSRFGKFIRINF-DVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAG 230 240 250 260 270 280 610 620 630 640 650 660 pF1KSD AEEKYGLHLNNLCAHRYLNQTIQDDASTGERSLNREKLAVLKRALNVVGFSSLEVENLFV . : : :. .:.:.. . .... .: . .:. ..:. : .:. CCDS13 EHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETM----EAMRIMGIPEEEQMGLLR 290 300 310 320 330 340 670 680 690 700 710 720 pF1KSD ILAAILHLGDIRFTALNEGNSAFVSDLQLLEQVAGMLQVS-TDELASALTTDIQYFKGDM .....:.::.: : . ..: . : ..:. .: .. :: . :: :. . :. CCDS13 VISGVLQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGR-DY 350 360 370 380 390 400 730 740 750 760 770 780 pF1KSD IIRRHTIQIAEFFRDLLAKSLYSRLFSFLVNTMNSCLHSQDEQKSMQTLDIGILDIFGFE . . .: . :.: . :::. : :.: .:: .:. : :. : . . :::::: ::: CCDS13 VQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKAL---DKTKRQGASFIGILDIAGFE 410 420 430 440 450 790 800 810 820 830 840 pF1KSD EFQKNEFEQLCVNMTNEKMHHYINEVLFLHEQVECVQEGVTMETAYSAGNQNGVLDFFFQ :. : :::::.:.::::... .:...:. :: : .::. . . . . .:.. . CCDS13 IFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEK 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 900 pF1KSD K--PSGFLTLLDEESQMIWSVESNFPKKLQSLLESSNTNAVYSPMKDGNGNVALKDHGTA : :.:.::::: . .....: .:. .. ..:. .. :. :::.. CCDS13 PAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKV---MQEQGTHPKFQKPKQ------LKDKAD- 520 530 540 550 560 910 920 930 940 950 960 pF1KSD FTIMHYAGRVMYDVVGAIEKNKDSLSQNLLFVMKTSENVVINHLFQSKLSQTGSLVSAYP : :.::::.: : . . :: : :..:. ... : . ...:... CCDS13 FCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSSDKFVSELWKD------------- 570 580 590 600 610 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD SFKFRGHKSALLSKKMTASSIIGENKNYLELSKLLKKKGTSTFLQRLERGDPVTIASQLR ... . ... : ... : ..: : .: :... . CCDS13 -----------VDRIIGLDQVAGMSETALP----------GAFKTR--KGMFRTVGQLYK 620 630 640 650 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KSD KSLMDIIGKLQKCTPHFIHCIRPNNSKLPDTFDNFYVSAQLQYIGVLEMVKIFRYGYPVR ..: ... :.. .:.:..:: ::. : .: : ::. :::: ..: : :.: : CCDS13 EQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNR 660 670 680 690 700 710 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KSD LSFSDFLSRYKPLADTFLREKKEQSAAERCRLVLQQCKLQG--WQMGVRKVFLK---YWH . :..: .::. :. . . : ... . : :... .:.. ...: :::.. : CCDS13 VVFQEFRQRYEILTPNSI-PKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAGVLAH 720 730 740 750 760 770 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KSD ADQLNDLCLQLQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTED-MGLKT .. : :.. :: : ::.:::. . .: ::..:... . .: . :.. CCDS13 LEEERD--LKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKR----QQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRN 780 790 800 810 820 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KSD YDALVIQNASDIARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSGPRHFHPSSMS .. . . . .: . :: : ..: ..::. : . .: CCDS13 WQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAK-EEELVKVREKQLAAENRLTEMETLQSQLMAEKL 830 840 850 860 870 880 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KSD VCAAVDGLGQCLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAV CCDS13 QLQEQLQAETELCAEAEELRARLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQAEKKKMQQ 890 900 910 920 930 940 1858 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 18:49:12 2016 done: Thu Nov 3 18:49:13 2016 Total Scan time: 8.200 Total Display time: 0.910 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]