Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0876, 1096 aa
1>>>pF1KSDA0876 1096 - 1096 aa - 1096 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2712+/-0.00114; mu= -4.7374+/- 0.068
mean_var=337.6207+/-67.803, 0's: 0 Z-trim(112.5): 43 B-trim: 57 in 1/52
Lambda= 0.069801
statistics sampled from 13248 (13288) to 13248 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 5.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 7580 778.2 0
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 2145 230.8 9.9e-60
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 2145 230.8 1e-59
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 2145 230.8 1.2e-59
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 2010 217.3 1.5e-55
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 1909 206.9 1e-52
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 1810 196.9 9.7e-50
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 151) 807 95.5 9.6e-20
>>CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096 aa)
initn: 7580 init1: 7580 opt: 7580 Z-score: 4141.9 bits: 778.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7580; 100.0% identity (100.0% similar) in 1096 aa overlap (1-1096:1-1096)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEALW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPSTF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPLLSLQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPLLSLQW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVDI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDDGSYSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDDGSYSDN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGSQLTVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGSQLTVKR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGRSQDYVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGRSQDYVA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KSD FVESLLQVQGRPGAPF
::::::::::::::::
CCDS12 FVESLLQVQGRPGAPF
1090
>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (813 aa)
initn: 2964 init1: 2109 opt: 2145 Z-score: 1185.8 bits: 230.8 E(32554): 9.9e-60
Smith-Waterman score: 2951; 54.0% identity (73.6% similar) in 844 aa overlap (10-850:11-808)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
:::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.::::::::::
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
:::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.::: :::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
::::: :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.:: ..::...:
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
: ... : : . :: :.:: .. .::.. :::
CCDS55 QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
: :.: . . .:. .. ::: :.:.::..... . : .. ..
CCDS55 ---EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
: . . . :. .:. . . .: ::. : :. .
CCDS55 L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
::... : ..: . : .: : .: . . . : . ..::
CCDS55 -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: :::: .: ::.: . .. .::.
CCDS55 -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
: :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: . ....: : ..
CCDS55 HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
:.. ::.:::::::: . :: : : :... .:::: ::.:.:::..::::::::
CCDS55 TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KSD ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
. . .:: :.:: .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: ::
CCDS55 HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
740 750 760 770 780 790
840 850 860 870 880 890
pF1KSD PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
.:.. :: :: ::
CCDS55 QIDVGRIPLQRLKLGRLGI
800 810
>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (835 aa)
initn: 2964 init1: 2109 opt: 2145 Z-score: 1185.7 bits: 230.8 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 2951; 54.0% identity (73.6% similar) in 844 aa overlap (10-850:33-830)
10 20 30
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQG
:::::::::::.::::..::::.::.::.:
CCDS55 HYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD AHRAGLAKIIPPKEWKPRQTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYR
::::::::.:::::::::: :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:
CCDS55 AHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RLANSEKYCTPRHQDFDDLERKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILD
.:::: ::::::. :..:::::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::
CCDS55 QLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD MVERECGTIIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKR
.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LERLAIGFFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAG
::::: ::::.:::::::::::::::::: .::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS55 LERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD FNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDL
:::::::::::::::.::::::::: :::::::::::::.::: .::.::.:::::::.
CCDS55 FNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDI
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TVLDHTRPTALTSPELSSWSASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAA
..:::.:: ..::...: : ... : : . :: :.:: ..
CCDS55 YTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE------------
370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LLEEAGGSVKEEAGPEVDPEEEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKS
.::.. ::: : :.: . . .:. .. ::: :.:.::.....
CCDS55 ---------EEEVSDEVDGA---EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSA
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FGLLPPQLPPPPAHFPSEEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEEL
. : .. .. : . . . :. .:. . . .:
CCDS55 SRMQVEQNLSDHIKLSGNSCL--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSG
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAA
::. : :. . ::... : ..: . : .: : .:
CCDS55 YEKPEKSDPSELSWPKSPE--------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLE
520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SSGAGRMETKARAGEGQAPSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEAS
. . . : . ..:: ... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: ::::
CCDS55 PGEIPAVPSGERNSF-KVPS-IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELP
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KSD P-FSGEEDVSDPDAL-RPLLSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQA
.: ::.: . .. .::. : :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: .
CCDS55 EVLSIEEEVEETESWAKPLIHL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKP
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD LQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSP
....: : .. :.. ::.:::::::: . :: : : :... .::::
CCDS55 DSSNEEND-ARWETKLDEVVTSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSL
680 690 700 710 720 730
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LIACGKCCLQVHASCYGIRPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWI
::.:.:::..:::::::: . . .:: :.:: .::::::::::::::::..: . .:
CCDS55 LISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWA
740 750 760 770 780 790
820 830 840 850 860 870
pF1KSD HVICAIAVPEARFLNVIERHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCST
::.::.::::.:: :: :: .:.. :: :: ::
CCDS55 HVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI
800 810 820 830
880 890 900 910 920 930
pF1KSD SFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVSITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYR
>>CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056 aa)
initn: 3852 init1: 2113 opt: 2145 Z-score: 1184.2 bits: 230.8 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 3857; 54.9% identity (75.8% similar) in 1058 aa overlap (10-1062:11-1022)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
:::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.::::::::::
CCDS64 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
:::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.::: :::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
::::: :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.:: ..::...:
CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
: ... : : . :: :.:: .. .::.. :::
CCDS64 QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
: :.: . . .:. .. ::: :.:.::..... . : .. ..
CCDS64 EV---PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
: . . . :. .:. . . .: ::. : :. .
CCDS64 L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
::... : ..: . : .: : .: . . . : . ..::
CCDS64 -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: :::: .: ::.: . .. .::.
CCDS64 -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
: :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: . ....: : ..
CCDS64 HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
:.. ::.:::::::: . :: : : :... .:::: ::.:.:::..::::::::
CCDS64 TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KSD ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
. . .:: :.:: .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: ::
CCDS64 HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
740 750 760 770 780 790
840 850 860 870 880 890
pF1KSD PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
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CCDS64 QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
800 810 820 830 840 850
900 910 920 930 940 950
pF1KSD YVVSITCLKHKSGGHAVQLL--RAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDD
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CCDS64 YVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDD
860 870 880 890 900 910
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD GSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGS
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CCDS64 GSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGS
920 930 940 950 960 970
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD QLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGR
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CCDS64 QIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGERKRQRVLSSRFKNEY
980 990 1000 1010 1020 1030
1080 1090
pF1KSD SQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF
CCDS64 VADPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ
1040 1050
>>CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064 aa)
initn: 3625 init1: 2006 opt: 2010 Z-score: 1110.7 bits: 217.3 E(32554): 1.5e-55
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
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CCDS49 MASESE-TLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASY
10 20 30 40 50
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pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
:::::.::::::::.:::::::::::::::::::: :.:..:::.::::::...:..:::
CCDS49 DDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELER
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
:::::::: ::::::..:.::. : .:::: ::::::.::.: : ::::::::::::
CCDS49 KYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFG
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
::::.:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::: ::::::.:.:.::::
CCDS49 MWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
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CCDS49 HKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEY
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
:: :. :.::::::::::::::: .:::::.::: ::: ::.::: :: :: :
CCDS49 GKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPT----PE-----A
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pF1KSD SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKP--EDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDP
.. ...: :. .. :.. :: . :: ..: .. :. .... :.
CCDS49 AEFLKESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGE---EGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQ
360 370 380 390 400
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pF1KSD EEEEEE--PQPLPHGREAEGAEEDGR-GKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPS
: . : :. ... : .: . . .:::.. : :. .. .: ..:
CCDS49 EVSQSELFPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHS-SVRQVEDGLTFPDYSDSTEVKFEE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRP
. . : : . ::.. : :: : .. . : .
CCDS49 LKNVKLEEEDEEEE--QAAAALDLSVNPAS---VGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSI
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD GKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQ
.. . ..: .::. . . .. . . . . : .:.: : .. . .:
CCDS49 SSDSETSEPLSCRAQGQTGVLTVHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAA-RSFSERELAEVA
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD APSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPL
:: . . .:.::.::.. : . :: :... .:.:: . .. ::.. . .:
CCDS49 DEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPL-VLQECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKP
590 600 610 620 630
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pF1KSD LSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCP-A
:: :.:: .:.::..:: . :. :.::.: .: :: ... .......: :
CCDS49 LSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIF-------QTYHQVEFGGFNQNCGNA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD TLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGI
. . ..:.:.:::::::::: : .:. .. :. .:::: :..: :: ..:::::::.
CCDS49 SDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGV
700 710 720 730 740 750
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pF1KSD RPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIE
: ..: : ::::.:.: .::::.::::::: ..: ::.:: ::.:. ::::.:. :
CCDS49 PPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAE
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD RHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDD
: :::.: :: :.::::..:.:: :...: :.:::. .: :.:::.::.::::.:.:::
CCDS49 RSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDD
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD WPYVVSITCLKHKSGG--HAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNF
::.:: :::..:: . .: :.... :: ::.:..:: .:.:.:. ...: :::::
CCDS49 WPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNF
880 890 900 910 920 930
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pF1KSD DDGSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFED
::::.:::::::.:.:.::.:.:::.:::.:..:::::..: :::..: ..:::::::
CCDS49 DDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFED
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pF1KSD GSQLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAK-RPRVGTPLATED
::::.::: :..::.:::::::.::::... . :. .:.: : : :: . ::
CCDS49 GSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYRED
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090
pF1KSD SGRSQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF
. : :..:
CCDS49 YIEPALYRAIME
1060
>>CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 (523 aa)
initn: 1962 init1: 1882 opt: 1909 Z-score: 1060.1 bits: 206.9 E(32554): 1e-52
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10 20 30 40 50
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPR
: :. . ::::.:.:: :.:: :::.::.::.::.:::::::::::::::::::: :
CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDD
.:::.:....: .:.:::..:..:.::::. .::::::::::.::::.:: :: ::.:.:
CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD LERKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYL
:::::::: . ::::::::::::.:... :::.: : :: :..:.:::..:::::::::
CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDA
:::::::::::::::::::::::::.::::.::..:::::.:::::: .:::::.:: :
CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRW
:::::..:::: .::. ::::.::::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::
CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD IDYGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSS
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CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD WSASRASLKAKL-LRR--SHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGP
. . .: : ::. :: : .: : :: .:. . . .:
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARHSPW------PMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSGT
370 380 390 400 410
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pF1KSD EVDPE----EEEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPP
..:. . ..:. : . . .:. ..:.... : . ::
CCDS83 ATQPRAAAVHSSKKPSSTPSSTPGPSAQ-----IIHPSNGRRGRGR------------PP
420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AHFPSEEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLY
.. ..: : : .: . :.:. : . .: : :: :: . : :: :. : :
CCDS83 QKLRAQE-LTLQTPAKRPLLA-GTTCTASGPEPEPL----PE--DGALMDKPVPLSPGLQ
460 470 480 490 500
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pF1KSD VVPRPGKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKAR
.: ::.
CCDS83 ---HPVKASGCSWAPVP
510 520
>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 (506 aa)
initn: 1799 init1: 1799 opt: 1810 Z-score: 1006.4 bits: 196.9 E(32554): 9.7e-50
Smith-Waterman score: 1810; 63.5% identity (82.7% similar) in 411 aa overlap (1-404:1-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
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CCDS44 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
:::.:..: .:.:::..::.:.::::. .:::: ::.:::::::.:: :: ::.: :::.
CCDS44 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLEQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
.:::. :::::::::::..... :::.: : ::::..:.:::..::::::::::::
CCDS44 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
:::::::::::::::::::::::::::.::..:::::..::::: .:: :.::.::::
CCDS44 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
::..:::: .::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: :::::
CCDS44 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
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CCDS44 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
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. ::.: .:: . . .:: .. . .:: : ... :.:. :
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