FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0880, 709 aa 1>>>pF1KSDA0880 709 - 709 aa - 709 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4625+/-0.000357; mu= 20.0114+/- 0.022 mean_var=82.0110+/-16.134, 0's: 0 Z-trim(115.0): 70 B-trim: 99 in 1/52 Lambda= 0.141624 statistics sampled from 25032 (25102) to 25032 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 9.670 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009187 (OMIM: 604988) solute carrier organic an ( 709) 4771 984.9 0 XP_016872646 (OMIM: 604988) PREDICTED: solute carr ( 711) 4737 978.0 0 NP_001138683 (OMIM: 604988) solute carrier organic ( 687) 4619 953.9 0 NP_001138684 (OMIM: 604988) solute carrier organic ( 565) 3792 784.8 0 NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier org ( 643) 941 202.4 4.7e-51 XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 712) 940 202.2 5.9e-51 NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic an ( 712) 940 202.2 5.9e-51 XP_016862565 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 597) 931 200.3 1.8e-50 XP_016862564 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 653) 931 200.3 2e-50 NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 730) 902 194.4 1.3e-48 XP_011519006 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 711) 826 178.9 6e-44 NP_001138516 (OMIM: 612435) solute carrier organic ( 692) 796 172.8 4.1e-42 XP_005254946 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 697) 796 172.8 4.2e-42 NP_037404 (OMIM: 612435) solute carrier organic an ( 710) 796 172.8 4.2e-42 XP_011519005 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 729) 788 171.1 1.3e-41 NP_112220 (OMIM: 613543) solute carrier organic an ( 848) 763 166.1 5.2e-40 XP_011519758 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 652) 728 158.8 6e-38 XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 706 154.3 1.3e-36 XP_016874976 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 706 154.3 1.3e-36 NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier org ( 702) 695 152.1 6.8e-36 NP_001139416 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 612) 668 146.6 2.8e-34 XP_011519011 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 668 146.6 2.8e-34 XP_005253453 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 668 146.6 2.8e-34 XP_016874973 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 668 146.6 2.8e-34 XP_016874974 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 668 146.6 2.8e-34 NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier org ( 691) 665 146.0 4.7e-34 XP_016875338 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 598) 625 137.8 1.2e-31 NP_066580 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 625 137.8 1.3e-31 XP_005253531 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 625 137.8 1.3e-31 XP_011519121 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 625 137.8 1.3e-31 NP_602307 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 625 137.8 1.3e-31 XP_011519120 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 625 137.8 1.3e-31 XP_011519122 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 668) 621 137.0 2.3e-31 XP_016875339 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 578) 615 135.7 4.9e-31 XP_005253534 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 650) 615 135.8 5.4e-31 XP_016874977 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 606 133.9 1.7e-30 XP_011519013 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 606 133.9 1.7e-30 XP_016874979 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 605 133.7 1.9e-30 XP_016874978 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 605 133.7 1.9e-30 XP_011519123 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 362) 600 132.5 2.9e-30 XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 586) 583 129.2 4.6e-29 XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 636) 583 129.2 4.9e-29 NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic an ( 724) 583 129.2 5.4e-29 XP_016869372 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 687) 547 121.9 8.5e-27 NP_001139480 (OMIM: 613543) solute carrier organic ( 687) 547 121.9 8.5e-27 XP_005254948 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 595) 524 117.1 2e-25 XP_016869375 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 423) 521 116.4 2.3e-25 XP_016869373 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 554) 521 116.5 2.9e-25 XP_005251370 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 793) 521 116.6 3.8e-25 NP_001139481 (OMIM: 613543) solute carrier organic ( 793) 521 116.6 3.8e-25 >>NP_009187 (OMIM: 604988) solute carrier organic anion (709 aa) initn: 4771 init1: 4771 opt: 4771 Z-score: 5266.2 bits: 984.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4771; 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100.0% identity (100.0% similar) in 560 aa overlap (150-709:6-565) 120 130 140 150 160 170 pF1KSD YGAILVALAGLLMTLPHFISEPYRYDNTSPEDMPQDFKASLCLPTTSAPASAPSNGNCSS :::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MGPRIEDMPQDFKASLCLPTTSAPASAPSNGNCSS 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KSD YTETQHLSVVGIMFVAQTLLGVGGVPIQPFGISYIDDFAHNSNSPLYLGILFAVTMMGPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YTETQHLSVVGIMFVAQTLLGVGGVPIQPFGISYIDDFAHNSNSPLYLGILFAVTMMGPG 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KSD LAFGLGSLMLRLYVDINQMPEGGISLTIKDPRWVGAWWLGFLIAAGAVALAAIPYFFFPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LAFGLGSLMLRLYVDINQMPEGGISLTIKDPRWVGAWWLGFLIAAGAVALAAIPYFFFPK 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KSD EMPKEKRELQFRRKVLAVTDSPARKGKDSPSKQSPGESTKKQDGLVQIAPNLTVIQFIKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EMPKEKRELQFRRKVLAVTDSPARKGKDSPSKQSPGESTKKQDGLVQIAPNLTVIQFIKV 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 pF1KSD FPRVLLQTLRHPIFLLVVLSQVCLSSMAAGMATFLPKFLERQFSITASYANLLIGCLSFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FPRVLLQTLRHPIFLLVVLSQVCLSSMAAGMATFLPKFLERQFSITASYANLLIGCLSFP 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 pF1KSD SVIVGIVVGGVLVKRLHLGPVGCGALCLLGMLLCLFFSLPLFFIGCSSHQIAGITHQTSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SVIVGIVVGGVLVKRLHLGPVGCGALCLLGMLLCLFFSLPLFFIGCSSHQIAGITHQTSA 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 pF1KSD HPGLELSPSCMEACSCPLDGFNPVCDPSTRVEYITPCHAGCSSWVVQDALDNSQVFYTNC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HPGLELSPSCMEACSCPLDGFNPVCDPSTRVEYITPCHAGCSSWVVQDALDNSQVFYTNC 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 pF1KSD SCVVEGNPVLAGSCDSTCSHLVVPFLLLVSLGSALACLTHTPSFMLILRGVKKEDKTLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SCVVEGNPVLAGSCDSTCSHLVVPFLLLVSLGSALACLTHTPSFMLILRGVKKEDKTLAV 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KSD GIQFMFLRILAWMPSPVIHGSAIDTTCVHWALSCGRRAVCRYYNNDLLRNRFIGLQFFFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GIQFMFLRILAWMPSPVIHGSAIDTTCVHWALSCGRRAVCRYYNNDLLRNRFIGLQFFFK 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 pF1KSD TGSVICFALVLAVLRQQDKEARTKESRSSPAVEQQLLVSGPGKKPEDSRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TGSVICFALVLAVLRQQDKEARTKESRSSPAVEQQLLVSGPGKKPEDSRV 520 530 540 550 560 >>NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier organic (643 aa) initn: 1728 init1: 484 opt: 941 Z-score: 1037.5 bits: 202.4 E(85289): 4.7e-51 Smith-Waterman score: 1865; 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NP_005 LTTIEKRFGLSSSSSGLISSLNEISNAILIIFVSYFGSRVHRPRLIGIGGLFLAAGAFIL 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KSD TLPHFISEPYRYDNTSPEDMPQDFKASLCLPT-TSAPASAPSNGNCSSYTETQHLSVVGI :::::.::::.: .: . . ..: :: . : : . . . ::. :. :. NP_005 TLPHFLSEPYQYTLASTGNNSR-LQAELCQKHWQDLPPSKCHSTTQNPQKETS--SMWGL 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KSD MFVAQTLLGVGGVPIQPFGISYIDDFAHNSNSPLYLGILFAVTMMGPGLAFGLGSLMLRL : ::: : :.: ::::::::::.:::.. ::::::..::::....::.... :::.::.. NP_005 MVVAQLLAGIGTVPIQPFGISYVDDFSEPSNSPLYISILFAISVFGPAFGYLLGSVMLQI 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KSD YVDINQMPEGGISLTIKDPRWVGAWWLGFLIAAGAVALAAIPYFFFPKEMPKEKRELQFR .:: ... ....:. ::::.::::::.::... ..:...:.::::. :: . NP_005 FVDYGRVNTAAVNLVPGDPRWIGAWWLGLLISSALLVLTSFPFFFFPRAMP-------IG 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KSD RKVLAVTDSPARKGKDSPSKQSPGESTKKQDGLVQIAPNLTVIQFIKVFPRVLLQTLRHP : .: . ::: ... :. : ...::: :: ..:. : . NP_005 AKRAPATADEARKLEEAKSRGS-------------------LVDFIKRFPCIFLRLLMNS 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KSD IFLLVVLSQVCLSSMAAGMATFLPKFLERQFSITASYANLLIGCLSFPSVIVGIVVGGVL .:.::::.: .::. ::..::: ::::.:.. .:.:::.::: ...:.. .:.. ::.: NP_005 LFVLVVLAQCTFSSVIAGLSTFLNKFLEKQYGTSAAYANFLIGAVNLPAAALGMLFGGIL 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 pF1KSD VKR----LHLGPVGCGALCLLGMLLCLFFSLPLFFIGCSSHQIAGI---THQTSAHPGLE .:: :. : .. ..:.::. ::::.:::. .: . . ..: :: NP_005 MKRFVFSLQAIPRIATTIITISMILCV----PLFFMGCSTPTVAEVYPPSTSSSIHPQ-- 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KSD LSPSCMEACSCPLDGFNPVCDPSTRVEYITPCHAGCSSWVVQDALDNSQVFYTNCSCVVE ::.: . :::: . :.::: . .::..:::::::. ...: ..:..: :::::. NP_005 -SPACRRDCSCPDSIFHPVCGDNG-IEYLSPCHAGCSNINMSSAT-SKQLIYLNCSCVTG 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 pF1KSD GNP-VLAGSCDSTCSHLVVPFLLLVSLGSALACLTHTPSFMLILRGVKKEDKTLAVGIQF :. . .::: :.:...: ..:.:. : .::..:.: .:..:: :..:.:..:.:.:: NP_005 GSASAKTGSCPVPCAHFLLPAIFLISFVSLIACISHNPLYMMVLRVVNQEEKSFAIGVQF 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 pF1KSD MFLRILAWMPSPVIHGSAIDTTCVHWALSC-GRRAVCRYYNNDLLRNRFIGLQFFFKTGS ...:.:::.:::...: .:: .:..: : :::..: ::.:: ::.:..:::. .:. . NP_005 LLMRLLAWLPSPALYGLTIDHSCIRWNSLCLGRRGACAYYDNDALRDRYLGLQMGYKALG 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 pF1KSD VI--CFALVLAVLRQQDKEARTKESRSSPAVEQQLLVSGPGKKPEDSRV .. :: NP_005 MLLLCFISWRVKKNKEYNVQKAAGLI 620 630 640 >>XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carrier (712 aa) initn: 1119 init1: 397 opt: 940 Z-score: 1035.8 bits: 202.2 E(85289): 5.9e-51 Smith-Waterman score: 1264; 32.7% identity (64.9% similar) in 673 aa overlap (29-675:19-666) 10 20 30 40 50 pF1KSD MGPRIGPAGEVPQVPDKETKATMGTENTPGGKAS-----PDPQDVRPSVFHNIKLFVLCH : :. : :. .. .: ..:.:. XP_005 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCC-GELKVFLCAL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KSD SLLQLAQLMISGYLKSSISTVEKRFGLSSQTSGLLASFNEVGNTALIVFVSYFGSRVHRP :.. .:. . :::::.:. .:.:: . :. :.. . :.:: .:.::::::...::: XP_005 SFVYFAKALAEGYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KSD RMIGYGAILVALAGLLMTLPHFISEPYRYDNTSPEDMPQDFKASLCLPTTSA--PASA-- ..:: : ...... ::...:.:. : :.:. :: . . .. : :: .:. :.:. XP_005 KIIGAGCVIMGVGTLLIAMPQFFMEQYKYERYSPSSN-STLSISPCLLESSSQLPVSVME 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KSD PSNGNCSSYTETQHLSVVGI-MFVAQTLLGVGGVPIQPFGISYIDDFAHNSNSPLYLGIL :... :. :.. : . : .:... : :.: .::::.::.:.:::: ..:. .:.: . 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XP_005 NFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSD 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KSD IAGIT--HQ----TSAHPGLELSPSCMEACSCPLDGFNPVCDPSTRVEYITPCHAGCSSW .::.: .: .: : .: .: :.: ..:.: . . :.. : :::.. XP_005 VAGLTVSYQGTKPVSYHERALFS-DCNSRCKCSETKWEPMCGENG-ITYVSACLAGCQT- 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 pF1KSD VVQDALDNSQVFYTNCSCV-----VEGNPV-LAGSC--DSTCSHLVVPFLLLVSLGSALA .. .. .:: ::.:: :: ..: : :. : .. . ::.. . : XP_005 --SNRSGKNIIFY-NCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTL 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KSD CLTHTPSFMLILRGVKKEDKTLAVGIQFMFLRILAWMPSPVIHGSAIDTTCVHWALS-CG : :...:.:: .: . :..:.:: . .:.:: .:.:: : :::.:..:... :: XP_005 SLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTLAIRVLAGIPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCG 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KSD RRAVCRYYNNDLLRNRFIGLQFFFKTGSVICFALVLAVLRQQDKEARTKESRSSPAVEQQ :. :: :.....:. ..:: .. : :.. :: .:.. XP_005 SRGSCRLYDSNVFRHIYLGLTVILGTVSILLSIAVLFILKKNYVSKHRSFITKRERTMVS 630 640 650 660 670 680 700 pF1KSD LLVSGPGKKPEDSRV XP_005 TRFQKENYTTSDHLLQPNYWPGKETQL 690 700 710 >>NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic anion (712 aa) initn: 1119 init1: 397 opt: 940 Z-score: 1035.8 bits: 202.2 E(85289): 5.9e-51 Smith-Waterman score: 1264; 32.7% identity (64.9% similar) in 673 aa overlap (29-675:19-666) 10 20 30 40 50 pF1KSD MGPRIGPAGEVPQVPDKETKATMGTENTPGGKAS-----PDPQDVRPSVFHNIKLFVLCH : :. : :. .. .: ..:.:. NP_059 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPCC-GELKVFLCAL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KSD SLLQLAQLMISGYLKSSISTVEKRFGLSSQTSGLLASFNEVGNTALIVFVSYFGSRVHRP :.. .:. . :::::.:. .:.:: . :. :.. . :.:: .:.::::::...::: NP_059 SFVYFAKALAEGYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KSD RMIGYGAILVALAGLLMTLPHFISEPYRYDNTSPEDMPQDFKASLCLPTTSA--PASA-- ..:: : ...... ::...:.:. : :.:. :: . . .. : :: .:. :.:. 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NP_059 KSKSKISNECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KSD FAVTMMGPGLAFGLGSLMLRLYVDINQMPEGGISLTIKDPRWVGAWWLGFLIAAGAVALA .:...:: ..: :::: .:::::. . :..: :::.::::::::.:::. :: NP_059 QTVAIIGPIFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLA 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KSD AIPYFFFPKEMPKEKRELQFRRKVLAVTDSPARKGKDSPSKQSPGESTKKQDGLVQIAPN :.:....:: .:. : .:. ..: :..: . : . . : NP_059 AVPFWYLPKSLPR----------------SQSREDSNSSSEKSKFIIDDHTDYQTPQGEN 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KSD LTVIQFIKVFPRVLLQTLRHPI-FLLVVLSQVCLSSMAAGMATFLPKFLERQFSITASYA .... . : : . . .:. :: . : : ..:. ::.:. ::..:.:.. ..: : NP_059 AKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFNSLF-GMVTYKPKYIEQQYGQSSSRA 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KSD NLLIGCLSFPSVIVGIVVGGVLVKRLHLGPVGCGALCLLGMLLCLFFSLPLFFIGCSSHQ :..:: ...:.: .:: ::...:..... : . : : . .. .. : :: .:: . . 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XP_016 YLNCSCVTGGSASAKTGSCPVPCAHFLLPAIFLISFVSLIACISHNPLYMMVLRVVNQEE 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KSD KTLAVGIQFMFLRILAWMPSPVIHGSAIDTTCVHWALSC-GRRAVCRYYNNDLLRNRFIG :..:.:.::...:.:::.:::...: .:: .:..: : :::..: ::.:: ::.:..: XP_016 KSFAIGVQFLLMRLLAWLPSPALYGLTIDHSCIRWNSLCLGRRGACAYYDNDALRDRYLG 560 570 580 590 600 610 660 670 680 690 700 pF1KSD LQFFFKTGSVI--CFALVLAVLRQQDKEARTKESRSSPAVEQQLLVSGPGKKPEDSRV ::. .:. ... :: XP_016 LQMGYKALGMLLLCFISWRVKKNKEYNVQKAAGLI 620 630 640 650 >>NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ani (730 aa) initn: 1081 init1: 397 opt: 902 Z-score: 993.7 bits: 194.4 E(85289): 1.3e-48 Smith-Waterman score: 1226; 33.0% identity (65.0% similar) in 646 aa overlap (29-648:19-639) 10 20 30 40 50 pF1KSD MGPRIGPAGEVPQVPDKETKATMGTENTPGGKAS-----PDPQDVRPSVFHNIKLFVLCH : :. : :. .. .: ..:.:. 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