Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0899
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0899, 939 aa
1>>>pF1KSDA0899 939 - 939 aa - 939 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4923+/-0.00107; mu= 7.9281+/- 0.065
mean_var=158.3530+/-32.780, 0's: 0 Z-trim(109.3): 18 B-trim: 134 in 1/50
Lambda= 0.101920
statistics sampled from 10791 (10804) to 10791 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 4.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44512.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11 ( 939) 6089 907.8 0
CCDS73234.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11 ( 940) 6077 906.0 0
CCDS46149.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19 ( 955) 3966 595.6 1.5e-169
CCDS46148.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19 ( 977) 3966 595.6 1.5e-169
CCDS45522.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16 ( 825) 530 90.4 1.6e-17
CCDS32480.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16 ( 822) 524 89.5 2.9e-17
CCDS9602.1 AP1G2 gene_id:8906|Hs108|chr14 ( 785) 435 76.4 2.4e-13
>>CCDS44512.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11 (939 aa)
initn: 6089 init1: 6089 opt: 6089 Z-score: 4844.9 bits: 907.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6089; 100.0% identity (100.0% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSEF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSIR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRALL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSAD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFEN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD WKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KSD IGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
910 920 930
>>CCDS73234.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11 (940 aa)
initn: 4362 init1: 4362 opt: 6077 Z-score: 4835.3 bits: 906.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6077; 99.9% identity (99.9% similar) in 940 aa overlap (1-939:1-940)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFE
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVE
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD GGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQ
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTT
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930
pF1KSD QIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
910 920 930 940
>>CCDS46149.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19 (955 aa)
initn: 3452 init1: 2151 opt: 3966 Z-score: 3157.7 bits: 595.6 E(32554): 1.5e-169
Smith-Waterman score: 5113; 82.2% identity (92.2% similar) in 959 aa overlap (1-939:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
CCDS46 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
CCDS46 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.:::::.:::::::::::::
CCDS46 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
CCDS46 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
CCDS46 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
CCDS46 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
CCDS46 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
CCDS46 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP------LAPGSEDN-----
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..: :.:: ::
CCDS46 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIP
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD -----FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICS
. .::::::::::::::::::.:::::::::::..:::::::.:: ::.::..
CCDS46 EADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHP
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD DDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLP
::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:...:::::. : ....::
CCDS46 GDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLP
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD ITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEE
.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.::::::..:::::::..
CCDS46 VTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDN
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930
pF1KSD VDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::::::::: ::..:::::. ::
CCDS46 VDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
900 910 920 930 940 950
>>CCDS46148.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19 (977 aa)
initn: 3444 init1: 2151 opt: 3966 Z-score: 3157.5 bits: 595.6 E(32554): 1.5e-169
Smith-Waterman score: 5047; 80.4% identity (90.1% similar) in 976 aa overlap (1-934:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
CCDS46 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
CCDS46 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.:::::.:::::::::::::
CCDS46 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
CCDS46 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
CCDS46 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
CCDS46 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
CCDS46 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
CCDS46 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
610 620 630 640 650
660 670 680 690
pF1KSD ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVA--------------------PL
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. . :.
CCDS46 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSELEPPAPESPM
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730
pF1KSD A----------PGSEDN----------FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRM
: :: :: . .::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 ALLADPAPAADPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRM
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KSD FIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTE
..:::::::.:: ::.::.. ::: .: .::: : :.::::::::.::::. ::
CCDS46 YLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLT
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840 850
pF1KSD APVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAK
:.:...:::::. : ....::.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.
CCDS46 PPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKAN
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KSD HPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRL
::::.::::::..:::::::..::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::
CCDS46 HPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRL
900 910 920 930 940 950
920 930
pF1KSD TLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::: ::..::::
CCDS46 TLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
960 970
>>CCDS45522.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16 (825 aa)
initn: 730 init1: 260 opt: 530 Z-score: 428.2 bits: 90.4 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 951; 30.0% identity (61.5% similar) in 716 aa overlap (16-702:10-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
CCDS45 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:...:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
CCDS45 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
. .:::: .. .:: :: . .:::. :.: ..... ....:::: ... : :
CCDS45 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPE---EFKTSVSLAVSRLSRI-
.:. : . . .:::... ::. ... :.: . ...:. .:. . .: : .: ::
CCDS45 ELMEM--FLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKNEKL-VPQLVRIL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ---VTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEP
. :. . .: . . :.:.:..::::. : .: .. :: ..
CCDS45 KNLIMSGYSPEHDVSG--ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDS----SEAMNDILAQVATN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMC
...: :. ::.:.:.. :. :: .: : : : ::.:: . . :.::.:: :.
CCDS45 TETSK----NVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSL-
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLE
: . . .:.::. : :... :: . :::...::..: .:. . .: .. :.: .:.
CCDS45 -LKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLK-DLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLD
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDD
. . .. . . . . ::::: . :..:::. .. ::.:: ... .::.. : .
CCDS45 SCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD VQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNL-IAGDPRSSPLIQ------FHLLH
...:... ...:. . .. ::.:... .::.:.: ..:. . :: . .:.
CCDS45 MHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SKF--HLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLR
: . .. . ::. :.. .:. . : . :. :. .. . :::::::::::
CCDS45 SVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGS--SIDVELQQRAVEYNA
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEP
: . : . ..: : : :. .. .::. . :..:: ::
CCDS45 L--FKKYDHMRSALLERMPVMEKVTT--------NGPTEI-----------VQTNGETEP
580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KSD APASTSAV-STPSPSA------DLLG----LGAAPPAPAGPPPSSGGS--GLLVDVFSDS
:: :. : :.:.. :::: . : ::.. : :.:: :: :. .
CCDS45 APLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTG
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFL
: ..:: ::.:
CCDS45 APAAAP-APASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNT
680 690 700 710 720
>>CCDS32480.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16 (822 aa)
initn: 730 init1: 260 opt: 524 Z-score: 423.4 bits: 89.5 E(32554): 2.9e-17
Smith-Waterman score: 961; 29.9% identity (61.4% similar) in 712 aa overlap (16-702:10-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
CCDS32 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:...:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
CCDS32 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
. .:::: .. .:: :: . .:::. :.: ..... ....:::: ... : :
CCDS32 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPE---EFKTSVSLAVSRLSRIV
.:. : . . .:::... ::. ... :.: . ...:. .:. : : :. ..
CCDS32 ELMEM--FLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSK
:. . .: . . :.:.:..::::. : .: .. :: .. ...
CCDS32 MSGYSPEHDVSG--ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDS----SEAMNDILAQVATNTETS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLAS
: :. ::.:.:.. :. :: .: : : : ::.:: . . :.::.:: :. : .
CCDS32 K----NVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSL--LKT
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADY
. .:.::. : :... :: . :::...::..: .:. . .: .. :.: .:.. .
CCDS32 VQTDHNAVQRHRSTIVDCLK-DLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGY
.. . . . . ::::: . :..:::. .. ::.:: ... .::.. : ....:
CCDS32 EFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAY
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD AAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNL-IAGDPRSSPLIQ------FHLLHSKF-
... ...:. . .. ::.:... .::.:.: ..:. . :: . .:.: .
CCDS32 TVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLI
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD -HLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTV
.. . ::. :.. .:. . : . :. :. .. . ::::::::::: :
CCDS32 SNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGS--SIDVELQQRAVEYNAL--F
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPAS
. : . ..: : : :. .. .::. . :..:: ::::
CCDS32 KKYDHMRSALLERMPVMEKVTT--------NGPTEI-----------VQTNGETEPAPLE
580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KSD TSAV-STPSPSA------DLLG----LGAAPPAPAGPPPSSGGS--GLLVDVFSDSASVV
:. : :.:.. :::: . : ::.. : :.:: :: :. .: ..
CCDS32 TKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAA
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD APLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTP
:: ::.:
CCDS32 AP-APASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSV
680 690 700 710 720 730
>>CCDS9602.1 AP1G2 gene_id:8906|Hs108|chr14 (785 aa)
initn: 689 init1: 246 opt: 435 Z-score: 353.0 bits: 76.4 E(32554): 2.4e-13
Smith-Waterman score: 885; 29.1% identity (58.4% similar) in 838 aa overlap (16-831:11-782)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: .::. :.. : . :.:: :.::..:. : ... .
CCDS96 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDG---DPVHRHRQLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::.:: ..:..:.:.:.:..::: .:.. . ::.:.:::::
CCDS96 KLLYVHMLGYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
.. .:::: ....:: :: . .: :. :.:. . . :...: : ... : :
CCDS96 SQGIQPVQGLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPY--VRKKAILTAVHMIRKVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNP---EEFKTSVSLAVSRLSRIV
.: . . ..::...: :.. .. .::: : ...: ..:. : : : .:
CCDS96 ELSSV--FLPPCAQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSK
: . . ... : :.:.:..::::. . :: : .: ..
CCDS96 TMGYS--TEHSISGVSDPFLQVQILRLLR--------ILGRNHEESSETMNDLLAQVATN
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLAS
:: ::::::.. :. : .: : : : ::.:: . . :.::.:: :. :..
CCDS96 TDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADY
:. : ::. : ::.. :. : :.:. .::..: :. . ::. .. :. ..::.
CCDS96 SD--HSAVQRHRPTVVECLR-ETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGY
..: . . . . ::..: :..::::... :: .: ... . :.. . .....:
CCDS96 DLRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAY
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD AAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLI-AGDPRSSPLIQ------FHLLHS--K
... ...:: .. ::.:... .::.:.:. ::. . .: . ::.. .
CCDS96 SVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQ
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD FHLCSVP-TRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLST
:. :.: ::. :.. .:. . . . :..:. .. ::::::::::: :
CCDS96 SHM-SLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGS--CLDVELQQRAVEYDTLFR
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPA
. :..::.:: : .. ::.. : :..:... . . :.:.
CCDS96 -KYDHMRAAILEKMP------------LVERDGPQA--D-EEAKESKEAAQLSEAAPVPT
580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KSD STSAVSTPSPSADLLGL--GAAPPAPAGP--PPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSE
.: : ::: : ::. . : :: ::. :: .. : : : :: .
CCDS96 EPQA----SQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGA--LVHLL-DLPCVPPPPAPIPD
620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KSD DNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPT-LICSDD
. .:: . .:..: : .: . ... . :.:.: . : .::.
CCDS96 LK-----------VFEREGVQLNL-SFIRPPENPALLLI-TITATNFSEGDVTHFICQAA
670 680 690 700 710
770 780 790 800 810
pF1KSD LQPNLNLQTK-PVDPTV--EGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPV-LNIQFRYGGTFQNVSVQ
. .:.:: . : :: .:: . :. : . ..::. :.... : : :::
CCDS96 VPKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRIL---NPNKAPLRLKLRLTYDHFHQ--SVQ
720 730 740 750 760 770
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALL
. .:.. :.:
CCDS96 EIFEVNNL--PVESWQ
780
939 residues in 1 query sequences
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