Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0899
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0899, 939 aa
1>>>pF1KSDA0899 939 - 939 aa - 939 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7096+/-0.000431; mu= 6.6164+/- 0.027
mean_var=172.9745+/-35.549, 0's: 0 Z-trim(116.8): 47 B-trim: 1230 in 1/53
Lambda= 0.097518
statistics sampled from 28133 (28180) to 28133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 15.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alph ( 939) 6089 869.5 0
NP_001229766 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit a ( 940) 6077 867.8 0
XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 864) 5573 796.9 0
XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 666) 4174 600.0 1.3e-170
NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 955) 3966 570.8 1.1e-161
NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 977) 3966 570.8 1.1e-161
XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 972) 3815 549.6 2.8e-155
XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 994) 3815 549.6 2.8e-155
NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit g ( 825) 530 87.4 3.2e-16
NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamm ( 822) 524 86.6 5.8e-16
XP_005268229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 435 74.0 3.3e-12
NP_003908 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit gamm ( 785) 435 74.0 3.3e-12
XP_005268230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 435 74.0 3.3e-12
XP_005268239 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 575) 431 73.4 3.7e-12
XP_005268237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 640) 431 73.4 4.1e-12
XP_005268236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 431 73.4 4.2e-12
XP_005268234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 431 73.4 4.2e-12
XP_005268235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 431 73.4 4.2e-12
XP_005268231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 431 73.4 4.5e-12
XP_016877231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 431 73.4 4.5e-12
XP_005268232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 431 73.4 4.5e-12
NP_001269404 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 713) 431 73.4 4.5e-12
XP_016877230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 795) 431 73.5 4.9e-12
XP_016877234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 494) 408 70.1 3.1e-11
XP_016877233 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 495) 408 70.1 3.1e-11
NP_031373 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 comple (1137) 342 61.0 3.9e-08
XP_016877232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 552) 330 59.2 6.8e-08
XP_016877229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 804) 330 59.3 9.4e-08
XP_011535585 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 807) 330 59.3 9.4e-08
XP_005268227 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 330 59.3 9.7e-08
XP_006720364 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 330 59.3 9.7e-08
XP_005268226 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 330 59.3 9.7e-08
XP_005268225 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 330 59.3 9.7e-08
XP_005268224 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 330 59.3 9.7e-08
NP_003929 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex subun (1153) 307 56.1 1.2e-06
XP_006722995 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 (1203) 307 56.1 1.2e-06
NP_001248755 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex su (1215) 307 56.1 1.3e-06
XP_005254321 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 303 55.5 1.6e-06
XP_006720510 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 303 55.5 1.6e-06
NP_001239056 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 com (1062) 303 55.5 1.6e-06
XP_016882911 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 ( 987) 260 49.5 0.0001
XP_016877531 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE ( 843) 231 45.3 0.0015
XP_011535588 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 222 43.9 0.002
XP_016877237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 222 43.9 0.002
XP_016877236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 222 43.9 0.002
NP_001269403 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 404) 222 43.9 0.002
XP_016877235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 222 43.9 0.002
>>NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alpha-2 (939 aa)
initn: 6089 init1: 6089 opt: 6089 Z-score: 4638.0 bits: 869.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6089; 100.0% identity (100.0% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 HSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSEF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSIR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 EEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 TVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRALL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSAD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFEN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 QLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 GAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD WKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 WKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KSD IGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 IGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
910 920 930
>>NP_001229766 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alpha (940 aa)
initn: 4362 init1: 4362 opt: 6077 Z-score: 4628.9 bits: 867.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6077; 99.9% identity (99.9% similar) in 940 aa overlap (1-939:1-940)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFE
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVE
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD GGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQ
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTT
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930
pF1KSD QIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
910 920 930 940
>>XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 complex su (864 aa)
initn: 4362 init1: 4362 opt: 5573 Z-score: 4246.2 bits: 796.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5573; 99.9% identity (99.9% similar) in 864 aa overlap (77-939:1-864)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD DKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQ
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SAALCLLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAALCLLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSV
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SLAVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_011 SLAVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLET
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ILNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLR
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KSD YLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KSD AEMLSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEMLSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVI
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLL
400 410 420 430 440 450
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pF1KSD HSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRL
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KSD STVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPA
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD PASTSAVSTPSPSADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PASTSAVSTPSPSADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDN
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQP
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pF1KSD NLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNK
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pF1KSD FFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNP
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890 900 910 920 930
pF1KSD ANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
820 830 840 850 860
>>XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 complex su (666 aa)
initn: 2459 init1: 2459 opt: 4174 Z-score: 3184.2 bits: 600.0 E(85289): 1.3e-170
Smith-Waterman score: 4174; 99.8% identity (99.8% similar) in 653 aa overlap (1-652:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEPAPASTSAVVSGGRNL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFE
XP_011 LVEICL
>>NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alpha-1 (955 aa)
initn: 3452 init1: 2151 opt: 3966 Z-score: 3023.7 bits: 570.8 E(85289): 1.1e-161
Smith-Waterman score: 5113; 82.2% identity (92.2% similar) in 959 aa overlap (1-939:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
NP_570 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
NP_570 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.:::::.:::::::::::::
NP_570 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
NP_570 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
NP_570 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
NP_570 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
NP_570 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
NP_570 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP------LAPGSEDN-----
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..: :.:: ::
NP_570 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIP
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD -----FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICS
. .::::::::::::::::::.:::::::::::..:::::::.:: ::.::..
NP_570 EADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHP
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD DDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLP
::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:...:::::. : ....::
NP_570 GDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLP
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD ITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEE
.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.::::::..:::::::..
NP_570 VTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDN
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930
pF1KSD VDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::::::::: ::..:::::. ::
NP_570 VDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
900 910 920 930 940 950
>>NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alpha-1 (977 aa)
initn: 3444 init1: 2151 opt: 3966 Z-score: 3023.5 bits: 570.8 E(85289): 1.1e-161
Smith-Waterman score: 5047; 80.4% identity (90.1% similar) in 976 aa overlap (1-934:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
:::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.::::::::::::::::..::
NP_055 ASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDSVKQSAALCLLRLYKASP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSA
::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::: ::::::::::::.::
NP_055 DLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFKTCVSLAVSRLSRIVSSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKV
::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.:::::.:::::::::::::
NP_055 STDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVLNKAQEPPKSKKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
::::::::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADYSI
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::: :::.::: :::::::.:
NP_055 FSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSEMLRYLETADYAI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD REEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::
NP_055 REEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQIVTNRDDVQGYAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFHLLHSKFHLCSVPTRAL
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .:: ::::::::::: ::::
NP_055 KTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQFSLLHSKFHLCSVATRAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLRLSTVASTDILATVLE
::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::: ::.:::::.::::::
NP_055 LLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEYLTLSSVASTDVLATVLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGGPEPAPASTSAVSTPSPS
:::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.::: ::.: :.:::::::
NP_055 EMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGGMEPTP---STVSTPSPS
610 620 630 640 650
660 670 680 690
pF1KSD ADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVA--------------------PL
:::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. . :.
NP_055 ADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTPEEAFLSELEPPAPESPM
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730
pF1KSD A----------PGSEDN----------FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRM
: :: :: . .::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_055 ALLADPAPAADPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRM
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KSD FIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTE
..:::::::.:: ::.::.. ::: .: .::: : :.::::::::.::::. ::
NP_055 YLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLT
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840 850
pF1KSD APVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAK
:.:...:::::. : ....::.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.
NP_055 PPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKAN
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KSD HPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRL
::::.::::::..:::::::..::::: ::::::::.::. :.::::::::: :::::::
NP_055 HPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRL
900 910 920 930 940 950
920 930
pF1KSD TLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::: ::..::::
NP_055 TLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
960 970
>>XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 complex su (972 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNC---KSKEAEIKRINKELANIRSK
:.. ...: ::::::::::::::::::::
XP_011 METRGRQEGWRGGCFTDLSERAWDLDEVVIVEVLKTCSEGKSKEAEIKRINKELANIRSK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
XP_011 FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDS
::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.:::
XP_011 SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDS
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170 180 190 200 210 220
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:::::::::::::..::::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::
XP_011 VKQSAALCLLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFK
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230 240 250 260 270 280
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: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.::
XP_011 TCVSLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVEC
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
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:::.:::::::::::::::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_011 LETVLNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRET
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350 360 370 380 390 400
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:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_011 NLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAK
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410 420 430 440 450 460
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:::.::: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_011 QIVSEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD RVIQIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQF
::.::: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .::
XP_011 RVLQIVTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQF
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD HLLHSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEY
::::::::::: ::::::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::
XP_011 SLLHSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEY
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LRLSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGG
: ::.:::::.:::::::::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.:::
XP_011 LTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGG
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650 660 670 680 690
pF1KSD PEPAPASTSAVSTPSPSADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSAS--VVAP--
::.: :.::::::::::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. ..:
XP_011 MEPTP---STVSTPSPSADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTP
670 680 690 700 710
700 710 720 730 740
pF1KSD ----LAPGSEDN----------FARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYG
:.:: :: . .::::::::::::::::::.:::::::::::..:::
XP_011 EEAFLSPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYG
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD NKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPVLN
::::.:: ::.::.. ::: .: .::: : :.::::::::.::::. :: :.:.
XP_011 NKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGGAQVQQVLNIECLRDFLTPPLLS
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KSD IQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDT
..:::::. : ....::.:.::::::::::.::::::::::: ::::.:.::::.::::.
XP_011 VRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRWKQLSLPQQEAQKIFKANHPMDA
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KSD EVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTS
::::::..:::::::..::::: ::::::::.::. :.::::::::: ::::::::::::
XP_011 EVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQVGCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTS
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930
pF1KSD KEAVSQRLCELLSAQF
:: ::..:::::. ::
XP_011 KEPVSRHLCELLAQQF
960 970
>>XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 complex su (994 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNC---KSKEAEIKRINKELANIRSK
:.. ...: ::::::::::::::::::::
XP_011 METRGRQEGWRGGCFTDLSERAWDLDEVVIVEVLKTCSEGKSKEAEIKRINKELANIRSK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
XP_011 FKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNKYTEKQIGYLFISVLVN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDS
::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::.::::..::..:::::.:::
XP_011 SNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMCLALHCIANVGSREMGEAFAADIPRILVAGDSMDS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VKQSAALCLLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFK
:::::::::::::..::::::::.::.::::::::::.::::::.:::: : .:::..::
XP_011 VKQSAALCLLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPDDFK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD TSVSLAVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPP-DPAVRGRLTEC
: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::.::
XP_011 TCVSLAVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVEC
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LETILNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRET
:::.:::::::::::::::::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_011 LETVLNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRET
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAP
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_011 NLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QIVAEMLSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
:::.::: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_011 QIVSEMLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWY
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RVIQIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQF
::.::: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .::
XP_011 RVLQIVTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPPVQF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD HLLHSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEY
::::::::::: ::::::::::::.:::::.: ::: :::. :::::::::::::::::
XP_011 SLLHSKFHLCSVATRALLLSTYIKFINLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQRAVEY
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LRLSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRD-RSVDVNGG
: ::.:::::.:::::::::::::::::::::::.::::.. . :.: .:: : :.:::
XP_011 LTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSNDINGG
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690
pF1KSD PEPAPASTSAVSTPSPSADLLGLGAAPPAPAGPPPSSGGSGLLVDVFSDSASVVA-----
::.: :.::::::::::::: :::: ::.:: :.:...::::::. :. .
XP_011 MEPTP---STVSTPSPSADLLGLRAAPP-PAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQPSLGPTP
670 680 690 700 710
700 710 720
pF1KSD ---------------PLA----------PGSEDN----------FARFVCKNNGVLFENQ
:.: :: :: . .:::::::::::::
XP_011 EEAFLSELEPPAPESPMALLADPAPAADPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQ
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDDLQPNLNLQTKPVDPTVEGG
:::::.:::::::::::..:::::::.:: ::.::.. ::: .: .::: : :.::
XP_011 LLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQTQLAVQTKRVAAQVDGG
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AQVQQVVNIECVSDFTEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRW
::::::.::::. :: :.:...:::::. : ....::.:.::::::::::.:::::::
XP_011 AQVQQVLNIECLRDFLTPPLLSVRFRYGGAPQALTLKLPVTINKFFQPTEMAAQDFFQRW
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KSD KQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQI
:::: ::::.:.::::.::::.::::::..:::::::..::::: ::::::::.::. :.
XP_011 KQLSLPQQEAQKIFKANHPMDAEVTKAKLLGFGSALLDNVDPNPENFVGAGIIQTKALQV
900 910 920 930 940 950
910 920 930
pF1KSD GCLLRLEPNLQAQMYRLTLRTSKEAVSQRLCELLSAQF
::::::::: :::::::::::::: ::..::::
XP_011 GCLLRLEPNAQAQMYRLTLRTSKEPVSRHLCELLAQQF
960 970 980 990
>>NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma (825 aa)
initn: 730 init1: 260 opt: 530 Z-score: 412.1 bits: 87.4 E(85289): 3.2e-16
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:...:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
NP_001 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
. .:::: .. .:: :: . .:::. :.: ..... ....:::: ... : :
NP_001 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPE---EFKTSVSLAVSRLSRI-
.:. : . . .:::... ::. ... :.: . ...:. .:. . .: : .: ::
NP_001 ELMEM--FLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKNEKL-VPQLVRIL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ---VTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEP
. :. . .: . . :.:.:..::::. : .: .. :: ..
NP_001 KNLIMSGYSPEHDVSG--ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDS----SEAMNDILAQVATN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMC
...: :. ::.:.:.. :. :: .: : : : ::.:: . . :.::.:: :.
NP_001 TETSK----NVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSL-
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLE
: . . .:.::. : :... :: . :::...::..: .:. . .: .. :.: .:.
NP_001 -LKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLK-DLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLD
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDD
. . .. . . . . ::::: . :..:::. .. ::.:: ... .::.. : .
NP_001 SCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD VQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNL-IAGDPRSSPLIQ------FHLLH
...:... ...:. . .. ::.:... .::.:.: ..:. . :: . .:.
NP_001 MHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SKF--HLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLRSDSQLRNADVELQQRAVEYLR
: . .. . ::. :.. .:. . : . :. :. .. . :::::::::::
NP_001 SVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGS--SIDVELQQRAVEYNA
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDVNGGPEP
: . : . ..: : : :. .. .::. . :..:: ::
NP_001 L--FKKYDHMRSALLERMPVMEKVTT--------NGPTEI-----------VQTNGETEP
580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KSD APASTSAV-STPSPSA------DLLG----LGAAPPAPAGPPPSSGGS--GLLVDVFSDS
:: :. : :.:.. :::: . : ::.. : :.:: :: :. .
NP_001 APLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTG
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ASVVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFL
: ..:: ::.:
NP_001 APAAAP-APASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNT
680 690 700 710 720
>>NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma-1 (822 aa)
initn: 730 init1: 260 opt: 524 Z-score: 407.6 bits: 86.6 E(85289): 5.8e-16
Smith-Waterman score: 961; 29.9% identity (61.4% similar) in 712 aa overlap (16-702:10-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVC
.: ::. ... : . :.:: : :::.:. . :. . . :
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREE---DNTYRCRNVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDL
:::.. .::. ::..: ..:..:...:.:.:::: .:.. ... :..: :::::
NP_001 KLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASRNPTFMGLALHCIASVGSREMAEAFAGEIPKVLVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSP
. .:::: .. .:: :: . .:::. :.: ..... ....:::: ... : :
NP_001 NHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSY--LRKKAALCAVHVIRKVP
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD DLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPE---EFKTSVSLAVSRLSRIV
.:. : . . .:::... ::. ... :.: . ...:. .:. : : :. ..
NP_001 ELMEM--FLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSK
:. . .: . . :.:.:..::::. : .: .. :: .. ...
NP_001 MSGYSPEHDVSG--ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDS----SEAMNDILAQVATNTETS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLAS
: :. ::.:.:.. :. :: .: : : : ::.:: . . :.::.:: :. : .
NP_001 K----NVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSL--LKT
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEMLSYLETADY
. .:.::. : :... :: . :::...::..: .:. . .: .. :.: .:.. .
NP_001 VQTDHNAVQRHRSTIVDCLK-DLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
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