FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0921, 1642 aa 1>>>pF1KSDA0921 1642 - 1642 aa - 1642 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4294+/-0.00134; mu= 1.4679+/- 0.080 mean_var=342.5743+/-68.682, 0's: 0 Z-trim(110.9): 66 B-trim: 111 in 1/50 Lambda= 0.069294 statistics sampled from 11930 (11984) to 11930 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16 Scan time: 5.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1642) 11111 1126.5 0 CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571) 4889 504.5 1.1e-141 CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061) 3976 413.1 2.5e-114 CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496) 3112 326.8 3.3e-88 CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499) 3112 326.8 3.3e-88 CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1712) 3090 324.7 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bits: 504.5 E(32554): 1.1e-141 Smith-Waterman score: 6647; 61.7% identity (79.5% similar) in 1667 aa overlap (17-1642:16-1571) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN .:: .: . :::: : :.::::: :: :.. ..:::...:: CCDS81 MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRW-DASTRSDLSFQFKTN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD .. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. . : :. ::.....:: CCDS81 VSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLS-NKQVNDSSWHFLMVSRD 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA ::.: .:::....:.. .: :.:.::::.::.: :.: :::::. :. : :.::. CCDS81 RLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF .:: :. : ::::.:.. . : :. . :: :::.: .: :. :::: ::.:::. CCDS81 DLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGP-CG--ERPCENGGICFLL-DGHPTCDCSTTGYGGKL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN :::. : .:: .. ...:: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.: ::: CCDS81 CSEDVSQDPGLSHLMMSEQAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRN 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KSD GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ ::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.::::::: CCDS81 GLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KSD HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL :::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::: CCDS81 --------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCL 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KSD KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA :.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::.:.. CCDS81 KEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNT 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KSD KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS :: ::::.::::::::::.::..:. . .. ..:.::.:::::.::::::::: CCDS81 KRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGS 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KSD GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL : ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...::::: CCDS81 GTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGL 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 pF1KSD PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL ::. :. : :: :.::: : :::::.:::::::::...: ::: :.:.:: ::: . CCDS81 PEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSA 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 pF1KSD KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: .::: CCDS81 KQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHT 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 pF1KSD EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GKGPET ::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::: .::::: CCDS81 EAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPET 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KSD LFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFI :.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:.: CCDS81 LYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYI 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KSD SVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLAL :::::.:::::..:.::: :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::.: CCDS81 SVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSL 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KSD ATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGN ::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...::: CCDS81 ATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGN 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD SDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSN ::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...::: :::.::::::.::..::...:.:: CCDS81 SDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSN 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KSD LPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVC :::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.:::::::: CCDS81 LPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVC 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KSD LQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFST .:::.::::::.::::.: :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: ::::::::: CCDS81 MQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFST 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KSD HQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFT ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: : . :.:::::::::: CCDS81 TVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1200 1210 1220 pF1KSD RSGGNATLQVDSWPVNERYPAG------------------------------RQLTIFNS :.:::::::::.:::::.::.: :::::::. CCDS81 RNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNT 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KSD QAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAE :: : :::.:.:: ::::.:::::.::::: .:::..::.. .: .::::: ::.: ... CCDS81 QAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQ 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KSD TTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLE :: .. .:.::.:::::::::::::..:: .. : :.: ::.:::: :::::. CCDS81 TT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS----TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFV 1310 1320 1330 1340 1350 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KSD ECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRP :::::: CCDS81 ECEPST------------------------------------------------------ 1360 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KSD PSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRK : : . .: : .: . . : ...:: . :.::: : CCDS81 ----------DKS-----LSTSIFEGG--YKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTS--- 1370 1380 1390 1400 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KSD PAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFE :.: :... :.. :.:::::::.:: : :: . :: ::..: CCDS81 --LSPELIRFTASSSSGMV-------PKLPAGKMNNRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYE 1410 1420 1430 1440 1450 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KSD PRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALC : .:: : : ..:::::: :: : ::: ::::::::::::::::::::::: CCDS81 LDSTKLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALC 1460 1470 1480 1490 1500 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KSD ILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKE ::::::::::::::::::::::..::::::::::::...::: .. :. : .::::.: CCDS81 ILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDRE 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1640 pF1KSD YYV ::: CCDS81 YYV 1570 >>CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061 aa) initn: 4259 init1: 2794 opt: 3976 Z-score: 2165.9 bits: 413.1 E(32554): 2.5e-114 Smith-Waterman score: 4923; 60.6% identity (75.9% similar) in 1263 aa overlap (389-1642:1-1061) 360 370 380 390 400 410 pF1KSD RQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMG :::::::::.::::.::::::::::::::: CCDS98 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG 10 20 30 420 430 440 450 460 470 pF1KSD CLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRW :::.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::.: CCDS98 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW 40 50 60 70 80 90 480 490 500 510 520 530 pF1KSD SAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDM ..:: ::::.::::::::::.::..:. . .. ..:.::.:::::.::::::: CCDS98 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM 100 110 120 130 140 150 540 550 560 570 580 590 pF1KSD GSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLG ::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...::: CCDS98 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG 160 170 180 190 200 210 600 610 620 630 640 650 pF1KSD GLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRE ::::. :. : :: :.::: : :::::.:::::::::...: ::: :.:.:: ::: CCDS98 GLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRM 220 230 240 250 260 660 670 680 690 700 710 pF1KSD TLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAM . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: .: CCDS98 SAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVM 270 280 290 300 310 320 720 730 740 750 760 pF1KSD HTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GKGP ::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::: .::: CCDS98 HTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGP 330 340 350 360 370 380 770 780 790 800 810 820 pF1KSD ETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERR :::.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.: CCDS98 ETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR 390 400 410 420 430 440 830 840 850 860 870 880 pF1KSD FISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYL .::::::.:::::..:.::: :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..:::: CCDS98 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL 450 460 470 480 490 500 890 900 910 920 930 940 pF1KSD ALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMK .:::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...: CCDS98 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK 510 520 530 540 550 560 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD GNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMF ::::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...::: :::.::::::.::..::...:. CCDS98 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY 570 580 590 600 610 620 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQG :::::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.:::::: CCDS98 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQG 630 640 650 660 670 680 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD VCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGF ::.:::.::::::.::::.: :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: ::::::: CCDS98 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF 690 700 710 720 730 740 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD STHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVR :: ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: : . :.:::::::: CCDS98 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR 750 760 770 780 790 800 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD FTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLK :::.:::::::::.:::::.::.::::::::.:: : :::.:.:: ::::.:::::.::: CCDS98 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK 810 820 830 840 850 860 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD VLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRR :: .:::..::.. .: .::::: ::.: ...:: .. .:.::.:::::::::::::. CCDS98 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRK 870 880 890 900 910 920 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KSD GRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATR .:: .. : :.: ::.:::: :::::. :::::: CCDS98 NRST----ASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST---------------------- 930 940 950 960 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD SPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGE CCDS98 ------------------------------------------------------------ 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KSD VFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPN CCDS98 ------------------------------------------------------------ 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KSD LPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGE :::: :: CCDS98 ----------------------------------------------------ANPTEPGI 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KSD RGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISN : ::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::: CCDS98 RRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISN 970 980 990 1000 1010 1020 1610 1620 1630 1640 pF1KSD SAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV ::::::...::: .. :. : .::::.:::: CCDS98 SAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV 1030 1040 1050 1060 >>CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496 aa) initn: 5897 init1: 2253 opt: 3112 Z-score: 1697.2 bits: 326.8 E(32554): 3.3e-88 Smith-Waterman score: 6324; 59.8% identity (75.2% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1496) 10 20 30 40 50 pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR : :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:. CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL : ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP :. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . : CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP :.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:. CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::::::. CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::::::::: CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG ::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::. CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . .. CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF :.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::. CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::::: CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..: CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG ::::: .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::: CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.:: CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . :: CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.: CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::: CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG----------------- :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: :::::: CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: : CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT . :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: .. . CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY :.:::.:::::::::::::.. ::::. CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS--------------------------------- 1370 1380 1390 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI :::: : : : ::..::: CCDS82 -----------------------------------------ANPTRAGGREPYPGSAEVI 1400 1410 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::: CCDS82 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVK 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1620 1630 1640 pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV :: :.. :. .: :::::::::: CCDS82 EKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV 1480 1490 >>CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499 aa) initn: 6028 init1: 2253 opt: 3112 Z-score: 1697.2 bits: 326.8 E(32554): 3.3e-88 Smith-Waterman score: 6345; 59.9% identity (75.3% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1499) 10 20 30 40 50 pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR : :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:. CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL : ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP :. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . : CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP :.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:. CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::::::. CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::::::::: CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG ::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::. CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . .. CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF :.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::. CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::::: CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..: CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG ::::: .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::: CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.:: CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . :: CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.: CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::: CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG----------------- :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: :::::: CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: : CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT . :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: .. . CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY :.:::.:::::::::::::.. ::::.:: CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG------------------------------- 1370 1380 1390 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI :::: : : : ::..::: CCDS82 ----------------------------------------LANPTRAGGREPYPGSAEVI 1400 1410 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::: CCDS82 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: CCDS80 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM ::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: 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CCDS54 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL : ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . CCDS54 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP :. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . : CCDS54 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP :.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:. CCDS54 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::::::. CCDS54 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::::::::: CCDS54 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS54 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::. CCDS54 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . .. CCDS54 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF :.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::. CCDS54 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: CCDS54 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::::: CCDS54 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..: CCDS54 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG ::::: .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: CCDS54 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::: CCDS54 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.:: CCDS54 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . :: CCDS54 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.: CCDS54 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: CCDS54 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::: CCDS54 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGR :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::. CCDS54 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGK 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KSD DQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLAD .::.:::::.::::::::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. .. CCDS54 EQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSE 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KSD MATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGE :.:.:::::::.::.:.:::. :: .. .:.:::.:::::::::::::.. ::::.:: CCDS54 MSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG- 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KSD LILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAE CCDS54 ------------------------------------------------------------ 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD RDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRT CCDS54 ------------------------------------------------------------ 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KSD DGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGV CCDS54 ------------------------------------------------------------ 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KSD TSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK :::: : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 ----------LANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK 1380 1390 1400 1410 1420 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KSD YRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV :::::::::.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: :::::::::: CCDS54 YRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV 1430 1440 1450 1460 1470 >>CCDS8078.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (666 aa) initn: 2889 init1: 2889 opt: 2898 Z-score: 1586.1 bits: 305.1 E(32554): 5e-82 Smith-Waterman score: 3605; 94.8% identity (94.8% similar) in 577 aa overlap (1096-1642:90-666) 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD ANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 THHVHHFHSKHGTVPIAINRMPFLTRGGHAGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRL 60 70 80 90 100 110 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD AVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 AVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKY 120 130 140 150 160 170 1190 1200 1210 pF1KSD HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG------------------------------RQ :::::::::::::::::::::::::::: :: CCDS80 HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQ 180 190 200 210 220 230 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD LTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 LTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPS 240 250 260 270 280 290 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD VLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 VLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPS 300 310 320 330 340 350 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD DDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 DDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPP 360 370 380 390 400 410 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KSD PAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 PAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTT 420 430 440 450 460 470 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KSD LLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 LLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAP 480 490 500 510 520 530 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KSD TSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 TSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAA 540 550 560 570 580 590 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KSD AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS80 AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKN 600 610 620 630 640 650 1640 pF1KSD KDKEYYV ::::::: CCDS80 KDKEYYV 660 >>CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1507 aa) initn: 6096 init1: 2253 opt: 2487 Z-score: 1359.5 bits: 264.4 E(32554): 2.1e-69 Smith-Waterman score: 6425; 60.3% identity (75.8% similar) in 1688 aa overlap (14-1642:16-1507) 10 20 30 40 50 pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR : :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:. CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL : ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . CCDS82 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP :. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . : CCDS82 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP :.: . ..... :. : : .. ..: : .. : :::.:.:. CCDS82 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::::::. CCDS82 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::::::::: CCDS82 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS82 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::. CCDS82 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..: . .. CCDS82 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF :.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::. ::. CCDS82 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: CCDS82 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::::: CCDS82 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..: CCDS82 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 pF1KSD LTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAG ::::: .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::. .. ::::: CCDS82 LTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAG 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KSD AHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARF : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::: CCDS82 DHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARF 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KSD GLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIEL :.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.:: CCDS82 GFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVEL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KSD VKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGA ::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . :: CCDS82 VKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGA 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD RNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVE ::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.::: ::.: CCDS82 RNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD RGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITY :::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: CCDS82 RGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITY 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD TWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDD :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::: CCDS82 KWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDD 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 pF1KSD ITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG----------------- :.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: :::::: CCDS82 IAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD -------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN ::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .:::.: : CCDS82 LGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDAN 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT . :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. :: .. . CCDS82 IAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPIS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY :.:::.:::::::::::::.. ::::.:: CCDS82 QTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG------------------------------- 1380 1390 1400 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP CCDS82 ------------------------------------------------------------ 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVI :::: : : : ::..::: CCDS82 ----------------------------------------LANPTRAGGREPYPGSAEVI 1410 1420 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::: CCDS82 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVK 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1620 1630 1640 pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV :: :.. :. .: :::::::::: CCDS82 EKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV 1490 1500 >>CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1547 aa) initn: 5438 init1: 2253 opt: 2487 Z-score: 1359.3 bits: 264.4 E(32554): 2.2e-69 Smith-Waterman score: 6277; 59.1% identity (74.2% similar) in 1706 aa overlap (36-1642:38-1547) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD RWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTNATRAL :::.:. .: .: .:.::.:.: ..:.: CCDS46 RGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLKTRSARGL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRDARRT .::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . :. : : CCDS46 VLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD ALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPPFRGLLAN .: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . ::.: . . 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