Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0924
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0924, 606 aa
1>>>pF1KSDA0924 606 - 606 aa - 606 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6245+/-0.00106; mu= -2.1016+/- 0.064
mean_var=380.7787+/-78.927, 0's: 0 Z-trim(115.1): 881 B-trim: 247 in 1/54
Lambda= 0.065726
statistics sampled from 14681 (15640) to 14681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17 ( 606) 4206 412.9 5.9e-115
CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3 ( 747) 1916 195.9 1.6e-49
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 748 85.0 2.9e-16
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 732 83.4 7.5e-16
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 734 83.8 9.1e-16
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 733 83.7 9.2e-16
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 731 83.5 1e-15
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 727 83.1 1.2e-15
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 727 83.2 1.4e-15
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 721 82.4 1.6e-15
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 723 82.7 1.7e-15
CCDS46990.1 ZNF732 gene_id:654254|Hs108|chr4 ( 585) 717 82.1 2.2e-15
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 715 81.9 2.6e-15
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 714 81.9 3e-15
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 710 81.4 3.5e-15
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 709 81.3 3.5e-15
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 710 81.5 3.7e-15
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 713 81.9 4e-15
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 713 81.9 4e-15
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 706 81.1 4.8e-15
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 708 81.3 4.8e-15
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 706 81.1 4.9e-15
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 708 81.4 5e-15
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 703 80.7 5.2e-15
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 707 81.3 5.3e-15
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 703 80.8 5.8e-15
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 701 80.5 5.9e-15
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 700 80.4 6.3e-15
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 700 80.5 6.6e-15
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 697 80.2 7.9e-15
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 695 80.0 9.3e-15
CCDS58659.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 549) 694 79.9 9.7e-15
CCDS33004.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 550) 694 79.9 9.7e-15
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 692 79.7 1.1e-14
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 692 79.7 1.1e-14
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 697 80.4 1.1e-14
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 698 80.5 1.1e-14
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 692 79.7 1.1e-14
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 696 80.2 1.1e-14
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 697 80.4 1.1e-14
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 696 80.3 1.1e-14
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 692 79.7 1.2e-14
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 691 79.6 1.2e-14
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 686 79.1 1.5e-14
CCDS82335.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 458) 685 79.0 1.5e-14
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 688 79.4 1.6e-14
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 693 80.1 1.7e-14
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 686 79.2 1.8e-14
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 693 80.1 1.8e-14
CCDS54256.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 563) 685 79.0 1.8e-14
>>CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17 (606 aa)
initn: 4206 init1: 4206 opt: 4206 Z-score: 2177.3 bits: 412.9 E(32554): 5.9e-115
Smith-Waterman score: 4206; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (1-606:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSHTASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSHTASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRAVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRAVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VNLNNQTLNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VNLNNQTLNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVEKVSVTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCEKNIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCEKNIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHLAEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHLAEKN
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SSAQHH
::::::
CCDS32 SSAQHH
>>CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3 (747 aa)
initn: 2054 init1: 1776 opt: 1916 Z-score: 1002.7 bits: 195.9 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1932; 55.7% identity (69.6% similar) in 560 aa overlap (42-579:218-735)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD VENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSSFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYSVLVDTKMSKPH
.:: : .::... ..:......
CCDS46 FFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQ---IIVEVNLNNQT
190 200 210 220 230 240
80 90 100 110 120
pF1KSD LHETEEQPYFRETRAVSDVHAV--KED--RENSDDTEEEEEEVSYKREQIIVEVNLNNQT
:: . : . . : . .: .:: ...::. ::..:: ..:. : . ..
CCDS46 LH-VSTGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEE---EEGGGSGR
250 260 270 280 290 300
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEEEEEESEEEATDDSNDYGENEKQKKKE-KIVEKVS
. . : : ... .: : .::::: ::: . .: .:... .: . : .
CCDS46 EEEEEEEGGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQG
310 320 330 340 350 360
190 200 210 220 230
pF1KSD VTQRRTRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPV------------
:. :: . . : . :: . :: . .:. :.:: :
CCDS46 PRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPA
370 380 390 400 410 420
240 250 260 270 280
pF1KSD -----QKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSL
:.: :::. :.:::::::.:::::::::::: ::::::.:::.:.::::: :
CCDS46 TDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLL
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KSD HQQTDCEKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
:.:::::.:::::.:.:.:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HRQTDCERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
490 500 510 520 530 540
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIG
550 560 570 580 590 600
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
610 620 630 640 650 660
470 480 490 500 510 520
pF1KSD PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPP
:::::::::::::::::::::::::. : . ::.. : :
CCDS46 PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGDGVPAA------PGLP
670 680 690 700
530 540 550 560 570 580
pF1KSD INMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSE
: .: : . : : :. :: :: ::::::: :: .
CCDS46 ---------PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPPPLFPTTASPGGRMNA
710 720 730 740
590 600
pF1KSD DNFLRHLAEKNSSAQHH
CCDS46 NN
>>CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 1037 init1: 591 opt: 748 Z-score: 405.5 bits: 85.0 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 748; 40.2% identity (65.2% similar) in 256 aa overlap (235-488:194-447)
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHM
.:.. :. . :.:: . : .: .:
CCDS32 LNQCLTTTQSKIFPCDKYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHK
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KSD NVTHRRMQI-CDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVH
. :. . :..::: : : :. :.. :: ..: :.:.::. .: : ::.:
CCDS32 RIHIRENSYQCEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTH-KIIH
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGE
.:: . :: : : : .:. : . :: . :. :: :::.:..: .:..:.. :.::
CCDS32 T-GEKPYRCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGE
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFI
::..::.::. :. : .: :: :.:.. :. ::: :: .. . .: . ::::::.
CCDS32 KPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYK
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KSD CEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPP
::.:::.:. :. :. ::::::: :. ::. : : .: :::
CCDS32 CEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEEC
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KSD AVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHL
CCDS32 GKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAF
470 480 490 500 510 520
>>CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 (499 aa)
initn: 1600 init1: 579 opt: 732 Z-score: 398.1 bits: 83.4 E(32554): 7.5e-16
Smith-Waterman score: 732; 42.2% identity (64.8% similar) in 244 aa overlap (247-488:202-443)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-THRRMQICD
::.: ..:: : : . : .. :.
CCDS42 FKCIICGKAFKRSSTLTTHKKIHTGEKPYRCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYRCE
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KCGKKFVLESELSLHQQTDC-EKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEIC
.::: : :.:. :.. :: .: :.:.:.. .: : :::: .:: ..:: :
CCDS42 ECGKAFKQSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTDLTTH-KIVHT-GEKPYKCEEC
240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERF
: : .:: : ::. :..:: ::::::. .: .:. :.::::..::.: . :
CCDS42 GKAFKHPSHVTTHKKIHTRGKPYNCEECGKSFKHCSNLTIHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRP
. . .: .: .: :.: . :. ::: :: . . : : ::::::. :. :::.::
CCDS42 HLSSHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSTTLFSHEKIHTGEKPYKCDECGKTFTWPS
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KSD NMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPAT
...:.::::::::: :. ::. : :. : .::
CCDS42 ILSKHKRTHTGEKPYKCEECGKSFTASSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSDLNK
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPP
CCDS42 HKKIHIERKPYIVKNVTDLLNVPPLLISIR
470 480 490
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210 220 230 240 250 260
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:... :: ::.: . :. :. :.
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.: : .. :: ::: :.: :.:. ::.. :: .: :.:::.. . : ....:
CCDS46 GVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRR--NSHYQVHLVV
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pF1KSD GYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGE
.:: ..:::: : : .... :. ::. . :: :: ::..:..: :..:.: :.::
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::..::.: . :. . .:. : :: :.: . :. ::: : . . . :...:.:::::
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:: ::::: ... :...:::.::: :: ::. :..: : :.
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CCDS46 GKYFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSF
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....: ..:... . . ::: .::.. : .:: . : :. .. :
CCDS33 ----LTQRS-----IHTGQKTYQGNECEEAFNDSSSL-ELHKQVHLGKKSPACSTHEKDT
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.... :. ...: :... : . . :... :: ::..:
CCDS33 SYSSGI------PVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKP-YTCHECG
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. :: .: :. . : .. ::.::: : ..:..: .. :: .: :.:.:
CCDS33 KSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFT
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pF1KSD KLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRS
. :. : .: : :: ..: : :.: .... :. .::.. :. :. ::: :. :
CCDS33 QRSHLQAHERIHTG--EKPYKCGDCGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLS
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pF1KSD MSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFD
..:. :. :.::::..::.: . :. ...::. .: :.: : :. ::: :....::.
CCDS33 FNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQ
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pF1KSD EHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKE
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CCDS33 AHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWSLNLHNHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQS
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pF1KSD KCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSH
CCDS33 VHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQAHQRVHTGEKPYKCDTCGKAFSQRSNLQVHQIIHTG
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CCDS35 RTHTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRIHQRTHTGEKPFECHECGKSFN-----YKSILIVH
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CCDS35 QRTHTGEKPFECNECGKSFSHMSGLRNHRRTHTGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHRTH
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CCDS35 TGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTGEK
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CCDS35 PYQCEECGKTFRQKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFSEKSVLRKHQRTHTGEKPYNC
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CCDS35 NQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD
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.. : : . .. : . . . : : :... ::.: .... .: : . :
CCDS12 IHTGEKPYKCEECGKAFSIFSTLTKHKIIHTEEKSHRCEECGKAYKESSHLTTHKRIHTG
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CCDS12 EECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCEECG
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CCDS12 KAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGKAFS
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CCDS42 GHKIIHNGEKPYKCEECGKAFSIFSTPTKHKIIHTEEKSHRCEEYCKAYKESSHLTTHKR
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CCDS42 IHTGEKPYKCEECGKAFSIFSTLTKHKIIHTEEKSHRCEECGKAYKESSHLTTHKRIHTG
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CCDS42 EKPYKCEECGKTFSVFSILTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKRSSTLTKH-RIIHT-EEK
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CCDS42 PYKCEECGKAFNQSSTLSIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSTLTIHKMIHTGEKPYKC
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CCDS42 EECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCEECG
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CCDS42 KAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGKAFS
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CCDS54 HDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRH
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pF1KSD EEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNV-THRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDC-EK
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CCDS54 TGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEK
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD NIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPF
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CCDS54 RYKCEDCGKAFSRFSYLTAH-KIIHS-GEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPY
230 240 250 260 270 280
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CCDS54 KCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEE
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pF1KSD CGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQR
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CCDS54 CGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEA
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pF1KSD FRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVST
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CCDS54 FKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSS
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606 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:14:41 2016 done: Thu Nov 3 04:14:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]