Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0936
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0936, 632 aa
1>>>pF1KSDA0936 632 - 632 aa - 632 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8651+/-0.00112; mu= -11.1913+/- 0.067
mean_var=347.5310+/-74.131, 0's: 0 Z-trim(113.0): 621 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.068798
statistics sampled from 12993 (13727) to 12993 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 4.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 4318 442.8 6.6e-124
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 1916 204.4 3.7e-52
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 1916 204.4 3.9e-52
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 1916 204.4 4e-52
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 793 92.8 1e-18
CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 789 92.4 1.3e-18
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 748 88.3 1.7e-17
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 740 87.5 2.9e-17
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 740 87.5 2.9e-17
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 726 86.2 1.2e-16
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 726 86.2 1.2e-16
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 715 85.1 2.4e-16
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 715 85.1 2.5e-16
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 700 83.5 5.3e-16
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 696 83.1 6.8e-16
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 695 83.1 9.7e-16
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 695 83.1 9.8e-16
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 695 83.2 1.1e-15
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 679 81.7 5e-15
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 679 81.7 5.3e-15
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 659 79.5 8.6e-15
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 656 79.2 1.1e-14
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 643 77.9 2.8e-14
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 638 77.4 4.1e-14
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 638 77.4 4.4e-14
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 634 76.9 4.5e-14
CCDS61552.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 389) 634 77.0 5.3e-14
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 636 77.3 5.6e-14
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 629 76.4 5.6e-14
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 631 76.7 6.1e-14
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 636 77.3 6.3e-14
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 630 76.6 6.6e-14
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 624 76.0 9.8e-14
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 623 75.9 1.1e-13
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 622 75.8 1.1e-13
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 614 74.9 1.7e-13
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 623 76.1 2e-13
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 623 76.1 2e-13
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 623 76.1 2e-13
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 623 76.1 2e-13
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 621 75.9 2.2e-13
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 621 75.9 2.3e-13
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 621 75.9 2.3e-13
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 609 74.5 3.2e-13
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 609 74.6 3.3e-13
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 609 74.6 3.4e-13
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 601 73.8 5.8e-13
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 593 72.8 6.6e-13
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 596 73.2 6.8e-13
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 601 73.8 7.2e-13
>>CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 (632 aa)
initn: 4318 init1: 4318 opt: 4318 Z-score: 2337.9 bits: 442.8 E(32554): 6.6e-124
Smith-Waterman score: 4318; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSKPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 FFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSKPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 IDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNLQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 CVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNLQDS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKDSDDWAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKDSDDWAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDDLDFSPSLSRIDLKNKKRQSDDTLCRFESVLDLKPSEPVGTGNSAPTQTSYQRRDTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LDDLDFSPSLSRIDLKNKKRQSDDTLCRFESVLDLKPSEPVGTGNSAPTQTSYQRRDTPT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRSAAKQHYLKHSRYLPGISIRNGILSNPGKEFIPPNPWSSSGLSGKSSGTMSVISKVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LRSAAKQHYLKHSRYLPGISIRNGILSNPGKEFIPPNPWSSSGLSGKSSGTMSVISKVNS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VGSSSTSSSGLTGNYVPSFLKKEIGSAMQRVHLAPIPDPSPGYSSLKAMRPHPGRPFFHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VGSSSTSSSGLTGNYVPSFLKKEIGSAMQRVHLAPIPDPSPGYSSLKAMRPHPGRPFFHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD QPRSTPGLIPRPPAAQPVHGRTDWASKYASRR
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QPRSTPGLIPRPPAAQPVHGRTDWASKYASRR
610 620 630
>>CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 (583 aa)
initn: 2059 init1: 1821 opt: 1916 Z-score: 1050.0 bits: 204.4 E(32554): 3.7e-52
Smith-Waterman score: 2118; 54.6% identity (74.2% similar) in 635 aa overlap (1-632:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHA
::::::.::::::::::::.:.: :::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS75 MNRYTTMRQLGDGTYGSVLMGKSNESGELVAIKRMKRKFYSWDECMNLREVKSLKKLNHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHG
::.::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS75 NVIKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLMKDRNKLFPESVIRNIMYQILQGLAFIHKHG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSKPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSP
:::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::. ::::
CCDS75 FFHRDMKPENLLCMGPELVKIADFGLARELRSQPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSSVYSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQ
::::::: ::::.: :::::::.::.: :::::::::::::.::::::::.:.::::.::
CCDS75 IDVWAVGSIMAELYMLRPLFPGTSEVDEIFKICQVLGTPKKSDWPEGYQLASSMNFRFPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNLQDS
::: ::::::::::.::.::. .::.:::::::::::::..::::::. :: ....:...
CCDS75 CVPINLKTLIPNASNEAIQLMTEMLNWDPKKRPTASQALKHPYFQVGQVLGPSSNHLESK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDH
.. .: . . : .. : : : ... : ..:: ::. : . ..: .
CCDS75 QSLNKQLQPLESKPSLVE-VEPKPLPDIIDQVVGQPQPKTSQQPLQPIQPPQ-NLSVQQP
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKDSDDWAD
:.. ...:: ::::. .. : .: .. : ::.: ::::: . :..:.: .
CCDS75 PKQQSQEKPPQTLFPSIVKNMP-TKPNGTLSHKSG------RRRWG--QTIFKSGDSWEE
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KSD LDDLDFSPSLSR---IDLKNKKRQSDDTLCRFESVLDLKPSEPVGTGNSAPTQTSYQRRD
:.: ::. : :. . . ..::..:. . :. . .. .: ..: :. :: . .
CCDS75 LEDYDFGASHSKKPSMGVFKEKRKKDSPF-RLPEPVPSGSNHSTGENKSLPAVTSLKSDS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TPTLRSAAKQHYLKHSRYLPGISIRNGILSNPGKEFIPPNPWSSSGLSGKSSGTMSVISK
. ..::.:::.::::::.. .. : ::: : :. ::.. : :: :
CCDS75 ELSTAPTSKQYYLKQSRYLPGVNPKKVSLIASGKE-INPHTWSNQ-LFPKSLGP------
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VNSVGSSSTSSSGLTGNYVPSFLKKEIGSAMQRVHLAPIPDPSPGYSSLKAMRPHPGRPF
::. :. :..: . . . : ..... .:
CCDS75 ---VGA-------------------EL--AFKRSNAEYTWNTKTGRGQFSGRTYNPTAKN
530 540 550
600 610 620 630
pF1KSD FHTQPRSTPGLIPRPPAAQPVHGRTDWASKYASRR
.. :. : :: :::::::..::...:
CCDS75 LNIVNRAQP--IPS------VHGRTDWVAKYGGHR
560 570 580
>>CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 (623 aa)
initn: 2130 init1: 1821 opt: 1916 Z-score: 1049.6 bits: 204.4 E(32554): 3.9e-52
Smith-Waterman score: 2285; 56.5% identity (77.8% similar) in 639 aa overlap (1-632:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHA
::::::.::::::::::::.:.: :::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS45 MNRYTTMRQLGDGTYGSVLMGKSNESGELVAIKRMKRKFYSWDECMNLREVKSLKKLNHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHG
::.::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS45 NVIKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLMKDRNKLFPESVIRNIMYQILQGLAFIHKHG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSKPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSP
:::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::. ::::
CCDS45 FFHRDMKPENLLCMGPELVKIADFGLARELRSQPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSSVYSSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQ
::::::: ::::.: :::::::.::.: :::::::::::::.::::::::.:.::::.::
CCDS45 IDVWAVGSIMAELYMLRPLFPGTSEVDEIFKICQVLGTPKKSDWPEGYQLASSMNFRFPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNLQDS
::: ::::::::::.::.::. .::.:::::::::::::..::::::. :: ....:...
CCDS45 CVPINLKTLIPNASNEAIQLMTEMLNWDPKKRPTASQALKHPYFQVGQVLGPSSNHLESK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDH
.. .: . . : .. : : : ... : ..:: ::. : . ..: .
CCDS45 QSLNKQLQPLESKPSLVE-VEPKPLPDIIDQVVGQPQPKTSQQPLQPIQPPQ-NLSVQQP
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKDSDDWAD
:.. ...:: ::::. .. : .: .. : ::.: ::::: . :..:.: .
CCDS45 PKQQSQEKPPQTLFPSIVKNMP-TKPNGTLSHKSG------RRRWG--QTIFKSGDSWEE
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KSD LDDLDFSPSLSR---IDLKNKKRQSDDTLCRFESVLDLKPSEPVGTGNSAPTQTSYQRRD
:.: ::. : :. . . ..::..:. . :. . .. .: ..: :. :: . .
CCDS45 LEDYDFGASHSKKPSMGVFKEKRKKDSPF-RLPEPVPSGSNHSTGENKSLPAVTSLKSDS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TPTLRSAAKQHYLKHSRYLPGISIRNGILSNPGKEFIPPNPWSSSGLSGKSSGTMS--VI
. ..::.:::.::::::.. .. : ::: : :. ::.. : :: : .. .
CCDS45 ELSTAPTSKQYYLKQSRYLPGVNPKKVSLIASGKE-INPHTWSNQ-LFPKSLGPVGAELA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SKVNSVGSSSTSSSGLTGNYVPSFLKKEIGSAMQRVHLAPIPDPSPGYS-SLKAMRPH-P
: ...:. .. .. ..:.:::::::. :: ::.::::. . :. . :. : .
CCDS45 FKRSNAGNLGSYATYNQSGYIPSFLKKEVQSAGQRIHLAPLNATASEYTWNTKTGRGQFS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KSD GRPFFHTQPRSTPGLIPRPPAAQPVHGRTDWASKYASRR
:: . : .. ... : :::::::..::...:
CCDS45 GRTYNPTA--KNLNIVNRAQPIPSVHGRTDWVAKYGGHR
590 600 610 620
>>CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 (648 aa)
initn: 2133 init1: 1821 opt: 1916 Z-score: 1049.3 bits: 204.4 E(32554): 4e-52
Smith-Waterman score: 2251; 55.1% identity (75.0% similar) in 663 aa overlap (1-632:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHA
::::::.::::::::::::.:.: :::::.:::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS75 MNRYTTMRQLGDGTYGSVLMGKSNESGELVAIKRMKRKFYSWDECMNLREVKSLKKLNHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::.::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS75 NVIKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLMKDRNKLFPESVIRNIMYQILQGLAFIHKHG
70 80 90 100 110 120
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:::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::. ::::
CCDS75 FFHRDMKPENLLCMGPELVKIADFGLARELRSQPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSSVYSSP
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::::::: ::::.: :::::::.::.: :::::::::::::.::::::::.:.::::.::
CCDS75 IDVWAVGSIMAELYMLRPLFPGTSEVDEIFKICQVLGTPKKSDWPEGYQLASSMNFRFPQ
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::: ::::::::::.::.::. .::.:::::::::::::..::::::. :: ....:...
CCDS75 CVPINLKTLIPNASNEAIQLMTEMLNWDPKKRPTASQALKHPYFQVGQVLGPSSNHLESK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDH
.. .: . . : .. : : : ... : ..:: ::. : . ..: .
CCDS75 QSLNKQLQPLESKPSLVE-VEPKPLPDIIDQVVGQPQPKTSQQPLQPIQPPQ-NLSVQQP
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:.. ...:: ::::. .. : .: .. : ::.: ::::: . :..:.: .
CCDS75 PKQQSQEKPPQTLFPSIVKNMP-TKPNGTLSHKSG------RRRWG--QTIFKSGDSWEE
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:.: ::. : :. . . ..::..:. . :. . .. .: ..: :. :: . .
CCDS75 LEDYDFGASHSKKPSMGVFKEKRKKDSPF-RLPEPVPSGSNHSTGENKSLPAVTSLKSDS
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pF1KSD TPTLRSAAKQHYLKHSRYLPGISIRNGILSNPGKEFIPPNPWS------SSGLSG-----
. ..::.:::.::::::.. .. : ::: : :. :: : : :
CCDS75 ELSTAPTSKQYYLKQSRYLPGVNPKKVSLIASGKE-INPHTWSNQLFPKSLGPVGAELAF
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pF1KSD -KSSGTMSVISKVNSVGSSSTSSSGLT---GN-----------YVPSFLKKEIGSAMQRV
.:.. :.:. ..... . : : :: :.:::::::. :: ::.
CCDS75 KRSNAEESIIKPIEKLSCNETFPEKLEDPQGNLGSYATYNQSGYIPSFLKKEVQSAGQRI
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580 590 600 610 620
pF1KSD HLAPIPDPSPGYS-SLKAMRPH-PGRPFFHTQPRSTPGLIPRPPAAQPVHGRTDWASKYA
::::. . :. . :. : . :: . : .. ... : :::::::..::.
CCDS75 HLAPLNATASEYTWNTKTGRGQFSGRTYNPTA--KNLNIVNRAQPIPSVHGRTDWVAKYG
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630
pF1KSD SRR
..:
CCDS75 GHR
>>CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 (419 aa)
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Smith-Waterman score: 812; 39.4% identity (67.8% similar) in 345 aa overlap (1-342:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLN-H
:. : .: ..:.::.. :. .:...:. : :.::..: : :. ::::...:..:: :
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pF1KSD ANVVKLKEVI--RENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIH
:.. :.::. :.. : .: : : :.:.::. : . :. : . :::. ..: ::
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..:.::::.::::.: . ...:..::: : . :: :::.:.::::::::: :: . :
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. .:.:..::.. :. .:.:::::..:.: : :: .:.::: . . .. : ::::
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180 190 200 210 220 230
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pF1KSD WPQCVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNL
.: ... : : : . ..::. :. .:: .: .: :::..:::: .
CCDS99 FPFKKGSGIPLLTTNLSPQCLSLLHAMVAYDPDERIAAHQALQHPYFQ----------EQ
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. .:: : .::: : . :: : : . .::.. .. .:
CCDS99 RKTEKRALGSHRKAGFPEH--PVAPE--PLSNSCQISKEGRKQKQSLKQEEDRPKRRGPA
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CCDS99 YVMELPKLKLSGVVRLSSYSSPTLQSVLGSGTNGRVPVLRPLKCIPASKKTDPQKDLKPA
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>>CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 (418 aa)
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Smith-Waterman score: 808; 39.4% identity (67.5% similar) in 345 aa overlap (1-342:1-328)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLN-H
:. : .: ..:.::.. :. .:...:. : :.::..: : :. ::::...:..:: :
CCDS81 MKNYKAIGKIGEGTFSEVMKMQSLRDGNYYACKQMKQRFESIEQVNNLREIQALRRLNPH
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pF1KSD ANVVKLKEVI--RENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIH
:.. :.::. :.. : .: : : :.:.::. : . :. : . :::. ..: ::
CCDS81 PNILMLHEVVFDRKSGSLALICELMDMNIYELIRGRRYPLSEKKIMHYMYQLCKSLDHIH
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pF1KSD KHGFFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSKPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNY
..:.::::.::::.: ...:..::: : . :: :::.:.::::::::: :: . :
CCDS81 RNGIFHRDVKPENILI--KDVLKLGDFGSCRSVYSKQPYTEYISTRWYRAPECLLTDGFY
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pF1KSD SSPIDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFR
. .:.:..::.. :. .:.:::::..:.: : :: .:.::: . . .. : ::::
CCDS81 TYKMDLWSAGCVFYEIASLQPLFPGVNELDQISKIHDVIGTPAQKILTK-FKQSRAMNFD
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD WPQCVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNL
.: ... : : : . ..::. :. .:: .: .: :::..:::: .
CCDS81 FPFKKGSGIPLLTTNLSPQCLSLLHAMVAYDPDERIAAHQALQHPYFQ----------EQ
240 250 260 270 280
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pF1KSD QDSEKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSR
. .:: : .::: : . :: : : . .::.. .. .:
CCDS81 RKTEKRALGSHRKAGFPEH--PVAPE--PLSNSCQISKEGRKQKQSLKQEEDRPKRRGPA
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD TDHPSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKDSDD
CCDS81 YVMELPKLKLSGVVRLSSYSSPTLQSVLGSGTNGRVPVLRPLKCIPASKKTDPQKDLKPA
350 360 370 380 390 400
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10 20 30 40 50
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:. . ....:.:::: : ... :.:.:.:.::.. . . .::.. ::.:.:
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
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:.:.: .:.... .::..::.....: . . .. .: :.. ..:.:::..: :.
CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
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: .::::::.::: .:.::::::: . . : :: : : ::::::.:: :
CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAF-GVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKF
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:.. .:.:..:::.::. : . :::: :::: .:.: ..::::.. :: :: . ..
CCDS11 YTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPD-YKG
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pF1KSD RWPQCVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQN
.:. . ..:. ..:: :. .:: ..::.::..: ::. :: .:::. .: .. :
CCDS11 SFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQY
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pF1KSD LQDSEKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVS
CCDS11 VLQRFRH
300
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
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:. :: :...:.:::: : :: .:...:.::. .. : :: . .::.. ::.:
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKI--RLESEEEGVPSTAIREISLLKEL
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: :.:.:..:. ....::.:::... .: . . .. . : ... .::::::..:
CCDS44 RHPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVF
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:.. .::::::.::: .:.::::::: . . : :: : : :::.:::::
CCDS44 CHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAF-GIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLG
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:. ::.:.:.:..: :.::. : .::: : :::: .:.: ..::::.. ::: .:..
CCDS44 SARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDY
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: .:. :..: . . : . ....:: :: .:: :: ....:: .:::
CCDS44 KN-TFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKK
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pF1KSD TQNLQDSEKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKA
CCDS44 M
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
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CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
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:.::: .::. ...::..::.....: ... .: :.. ..:.:::::: :.
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
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CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAF-GVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKY
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CCDS88 YSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWP-G--VTSMPDY
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pF1KSD R--WPQCVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQ-VGHPLGST
. .:. . .... ..: . .. .:: .::..::.:: .:. :: .:.:: : .:.
CCDS88 KPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD TQNLQDSEKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAKPHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKA
CCDS88 RL
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 706 init1: 381 opt: 726 Z-score: 412.3 bits: 86.2 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 726; 38.1% identity (67.5% similar) in 302 aa overlap (1-300:189-486)
10 20 30
pF1KSD MNRYTTIRQLGDGTYGSVLLGRSIESGELI
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CCDS53 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD AIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHANVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLI
:.:... . : .:::. :: :.:::.: :..... . : ..:::. ..: : .
CCDS53 ALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYM
220 230 240 250 260 270
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. .... .. ..::::.:::. :.. .::::::.::: .:.:::::::
CCDS53 DDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARA-
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD RSKPP--YTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSPIDVWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDT
.: : :.. : : ::: :.::: :..::. ::.:.::::. :. . ::::::.. :
CCDS53 KSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDE
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KSD IFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQCVPNNLKTLIPNASSEAVQLLRDMLQWD
. : ..::::.. :: . :. .:. :. : . : .::...:. .::..
CCDS53 LHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYE
400 410 420 430 440 450
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pF1KSD PKKRPTASQALRYPYFQVGHPLGSTTQNLQDSEKPQKGILEKAGPPPYIKPVPPAQPPAK
::: .: .:... ::. :: . : .:
CCDS53 SKKRVSAEEAMKHVYFR---SLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVF
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pF1KSD PHTRISSRQHQASQPPLHLTYPYKAEVSRTDHPSHLQEDKPSPLLFPSLHNKHPQSKITA
CCDS53 VINHFTCRS
520
632 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:17:54 2016 done: Thu Nov 3 04:17:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]