FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0961, 519 aa
1>>>pF1KSDA0961 519 - 519 aa - 519 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4938+/-0.00218; mu= 8.9865+/- 0.129
mean_var=296.1824+/-57.507, 0's: 0 Z-trim(102.7): 972 B-trim: 24 in 1/49
Lambda= 0.074524
statistics sampled from 6002 (7064) to 6002 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 2386 271.6 1.5e-72
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 2126 243.7 4e-64
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1805 209.3 1.1e-53
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1786 207.1 4.1e-53
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1786 207.1 4.1e-53
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1786 207.2 4.3e-53
CCDS59394.1 ZNF404 gene_id:342908|Hs108|chr19 ( 552) 1775 206.0 9.4e-53
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1758 204.0 3.1e-52
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1738 202.4 2.1e-51
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1738 202.4 2.2e-51
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1729 201.1 3.1e-51
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1729 201.1 3.1e-51
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1713 199.5 1.2e-50
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1713 199.5 1.2e-50
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1701 198.1 2.5e-50
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1701 198.1 2.6e-50
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1701 198.1 2.6e-50
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1701 198.1 2.6e-50
CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 628) 1700 198.0 2.7e-50
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CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1682 196.0 9.9e-50
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1683 196.2 1e-49
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CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1667 194.4 3e-49
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CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1660 193.9 6.3e-49
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1650 192.6 1.1e-48
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1650 192.6 1.1e-48
CCDS54260.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 577) 1643 191.8 1.8e-48
CCDS12508.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 607) 1643 191.8 1.9e-48
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 1643 191.9 1.9e-48
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1643 191.9 2e-48
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1641 191.7 2.4e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1641 191.8 2.5e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1641 191.8 2.5e-48
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1638 191.2 2.6e-48
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 1633 190.8 4.2e-48
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 1633 190.8 4.2e-48
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1631 190.6 4.8e-48
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1628 190.2 5.8e-48
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1626 190.2 8e-48
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1621 189.3 8.6e-48
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1619 189.4 1.2e-47
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1602 187.4 3.8e-47
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1600 187.1 4.3e-47
CCDS31939.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 533) 1597 186.8 5.3e-47
>>CCDS33005.1 ZFP30 gene_id:22835|Hs108|chr19 (519 aa)
initn: 3705 init1: 3705 opt: 3705 Z-score: 2182.3 bits: 413.4 E(32554): 3.1e-115
Smith-Waterman score: 3705; 100.0% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (1-519:1-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKSCGLEEQESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKSCGLEEQESP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQRIH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHIGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHIGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKCYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKCYEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCKECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCKECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKECGKAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKECGKAFR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KSD LIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
490 500 510
>>CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 (532 aa)
initn: 2358 init1: 2358 opt: 2386 Z-score: 1415.8 bits: 271.6 E(32554): 1.5e-72
Smith-Waterman score: 2827; 75.2% identity (87.1% similar) in 533 aa overlap (1-518:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLE
:: ::: ::..::: :::: :. :..:::::.:::::::::: :: :::::::. ::
CCDS12 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSL-GCFISKPDVISSLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD QGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKSCGL------
:::::: ::: .:.. :::..:.:::: .::::.::::::.::::.. ::
CCDS12 QGKEPWKVVRKGRRQYP-DLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD ---------EEQESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGK
: :: :.: : .: : :::. .:.: ::. .:. : .::::: ::::
CCDS12 NDWESTGKIEGQERPQEGYFSSV-KMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD AFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTC
:::::::::::.::::::::::::::: :::: :::.::::.:...::::::.::. : :
CCDS12 AFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFIC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHL
:.::::::..::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::::
CCDS12 GADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD TRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQ
::::.:: :.. :::::::.::::..:::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHI
:::::::::.:::::::::::::: ::.:::::::::::::: : : :::.:::::.:::
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKP
: :::.::::::::::.::::::::::.::::.::::: :.::: ..:: ::::::::::
CCDS12 GVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KSD YDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
..:::: :::::.:::::: :::::::::.:::::::::::::::.: .::::
CCDS12 FECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 (533 aa)
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Smith-Waterman score: 2518; 69.4% identity (81.1% similar) in 533 aa overlap (1-517:1-531)
10 20 30 40 50
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLL-
::. : :::::.:::::::: :. ::.:::::. :::::..:: : :::::::::::
CCDS33 MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISL-GPSISKPDVITLLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EQGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKS--------
:. ::: ::::. ::. :::::: :. : :::::. :: .::::::
CCDS33 EERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD -----CG--LEEQESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECG
: .: .. .: : :: : ::::: ::.. . : :: :: :: ::: ::
CCDS33 RNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQV-KITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KAFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFT
:.: :. :. : :::::::::.:::::.:::: ::: ::...::..: ::::.::: ::
CCDS33 KTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD CGSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAH
..: :::.: ::::::::::::::::. :: ::::::::::::::.:::.::: .:
CCDS33 VLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LTRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLH
:::::::. ::: :::::::.::.:. ::.:.:.: :::::::::::::::. ::::.:
CCDS33 LTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD QRIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIH
: ::::::::.:::::::: .:. :::::: :::::: :: : : ::.:::::.::
CCDS33 QSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IGEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEK
:::.::::.::::::::.:::::::::: ::::..::::.: ::::::::::::::::::
CCDS33 IGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KSD PYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
::.::::::::::.: : ::::::.::::::::::::::::::::: ::.:::
CCDS33 PYECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
480 490 500 510 520 530
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 1805 init1: 1805 opt: 1805 Z-score: 1077.1 bits: 209.3 E(32554): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1877; 59.4% identity (75.7% similar) in 456 aa overlap (77-516:44-497)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GCSISKPDVITLLEQGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVM
.::: :: .: : :. :: .::::..
CCDS12 DFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSLDLPSRCASKDLSPEKNTYETELSQWEMS
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150
pF1KSD ERIKSCGLEE----------------QESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQK
.:...: ::: ::. .: ::: .:: . . : : ...
CCDS12 DRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQENQKEY-FRQ-GMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSR
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SHNREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTS
:. ::::.: ::::::: ..:: :: :::::::::::.::::: . ..:: :::.::.
CCDS12 CHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTG
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KSD DKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPY
.: : ::.::: :: .:.: .:.::: :::::.:.:::::: .::. ::..:::::::
CCDS12 EKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPY
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKE
::::::::: : ..:: ::::. .:: :::::: ..: . : ::...:::::::::::
CCDS12 ECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKE
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKF
::::: .::. ::.::.:::::.:::::..: :: : :::::::::::.:.:: :
CCDS12 CGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKA
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KSD FRRYSELISHQGIHIGEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLL
: : :.: .:: :: .::::::::::: : ::::::: :: ::::..:::: :.:
CCDS12 FIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRG
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLT
: ::.:: ::::::::.::::::.: : : ::.:::.:::::.:::: :.: . :.::
CCDS12 SLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLT
440 450 460 470 480 490
pF1KSD YHQRIHNVT
:::::
CCDS12 QHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQR
500 510 520 530 540 550
>--
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Smith-Waterman score: 887; 66.7% identity (80.4% similar) in 189 aa overlap (265-453:498-686)
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIA
::::::::::: :: : .::..::::. .
CCDS12 IHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTG
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPY
:: : :.:::.:: . : :...:::::::.:::::::: .::: :::::::::::
CCDS12 EKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPY
530 540 550 560 570 580
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKE
.::::::.::.: .::::::::::::::::.::.: : . :.: :: :: :::::.:::
CCDS12 ECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKE
590 600 610 620 630 640
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKA
::::: ::::::: ::..:: :. ::: : ::.
CCDS12 CGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
650 660 670 680
480 490 500 510
pF1KSD FRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
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Smith-Waterman score: 1786; 51.9% identity (72.1% similar) in 520 aa overlap (1-516:9-520)
10 20 30 40 50
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISK
: ..:: :::::::::::::.::.: ::.:: .:.:::: ::::. : .::
CCDS12 MAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLC-FSK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PDVITLLEQGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKSC
:.:: :::::: :::: :. . : .:..: .:.:: . :: :..: . :
CCDS12 PSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQ-KIIETLTSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD GLEEQESPHEV-CFRQVTKTTSEKMPTYRK--LTSL-PLYQKSHNREKPYECGECGKAFR
.:: . .: : . ... ... .: ::... ::. :. : .:.
CCDS12 NLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDE---REQEYKSW--G-SFH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTCGSD
: .. : :: .. ..:.. . . . . :: .:. : :.:. .:.
CCDS12 QNPLLCTQKIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRH
: .::::: :::::.: :::::: :..: :::::::::::::::: ::: : :::..:
CCDS12 LTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIH
:.. .:: :::: : .:: . : :...::::::::: :::::: :.... :::.:
CCDS12 LRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD TGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEK
::::::.:. :::.:: .::.::::::::.::::::: : : . :.: .:: :: :::
CCDS12 TGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD PYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDC
::.:.:: ::: .. :.::: .: ::::..: :: :.: :.::::: .:::::::.:
CCDS12 PYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYEC
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KSD KECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
::::: .:: ::::::.::.::.::::::.::::.::..:::::
CCDS12 TVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGESLSPPNPVN
480 490 500 510 520 530
CCDS12 HQVL
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Smith-Waterman score: 2026; 57.5% identity (74.2% similar) in 532 aa overlap (1-516:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLE
::..::::::::.: ::::::::: :::::..:.:::::::::: : :.::: ::. ::
CCDS74 MAHELVMFRDVAIDVSQEEWECLNPAQRNLYKEVMLENYSNLVSL-GLSVSKPAVISSLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD QGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLFQGKDIYEMNLSQWKVMERIKS---------
::::::::::.: :: :: :: . .:: .:::: .:::: ::..::
CCDS74 QGKEPWMVVREETGRWCPDLASRDEPQKLSPKRDIYETELSQWVNMEEFKSHSPERSIFS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD ------CGLEEQESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGK
: .:.... .: :::. . :.:: . . : : :. ..::: :: .: :
CCDS74 AIWEGNCHFEQHQGQEEGYFRQLM-INHENMPIFSQHTLLT--QEFYDREKISECKKCRK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD AFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQ-CAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFT
: . .. :.: :. : ::::: . : : ..: :...:: :::.: : :.
CCDS74 IFSYHLFFSHHKRTHSKELS-ECKECTEIVNTPC--LFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD CGSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAH
:.:. : ::: ::: :::.:::::: ..:.::::::::::::::::::::::: ..
CCDS74 HCSQLK-HLRIHNGEKRYECNECGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LTRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLH
::.::::. .:: ::::.::.::. . : : .:::::::::::::::.:: :..::.:
CCDS74 LTQHQRLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIH
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD QRIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIH
::::::::::.:.::::.:: .. ::.::.:.:::::.:: : : .: :: ::
CCDS74 QRIHTGEKPYECRECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IGEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEK
::::::::::::.:: :.: .:: :: :::: .: : :.::: :.: ::: ::::::
CCDS74 TGEKPYECKECGKTFRQCSHLKRHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KSD PYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
::.:::::::: :::. .:::::::.:::.: ::: .. .:. :: .:
CCDS74 PYECKECGKAFSYHSSFSHHQRIHSGKKPYQC---GKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRF
480 490 500 510 520
CCDS74 PLLPPHPSLAS
530 540
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10 20 30
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNL
: ..:: :::::::::::::.::.: ::.:
CCDS74 PVRVESSEATAISQEKSQEEERMAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD YRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLEQGKEPWMVVRDEKRRWTLDLESRYDTKKLF
: .:.:::: ::::. : .:::.:: :::::: :::: :. . : .:..:
CCDS74 YSNVMLENYRILVSLGLC-FSKPSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELT
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140
pF1KSD QGKDIYEMNLSQWKVMERIKSCGLEEQESPHEV-CFRQVTKTTSEKMPTYRK--LTSL-P
.:.:: . :: :..: . : .:: . .: : . ... ... .: :
CCDS74 PKQDFYEEHQSQ-KIIETLTSYNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEP
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LYQKSHNREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQR
:... ::. :. : .:. : .. : :: .. ..:.. . .
CCDS74 LFDE---REQEYKSW--G-SFHQNPLLCTQKIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKS
220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD IHTSDKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTG
. . :: .:. : :.:. .:.: .::::: :::::.: :::::: :..: :::::::
CCDS74 VCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTG
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KSD EKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPY
::::::::: ::: : :::..: :.. .:: :::: : .:: . : :...:::::::
CCDS74 EKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPY
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKE
:: :::::: :.... :::.:::::::.:. :::.:: .::.::::::::.::::::
CCDS74 ECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKE
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KSD CQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKT
: : : . :.: .:: :: :::::.:.:: ::: .. :.::: .: ::::..: :: :.
CCDS74 CGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKA
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KSD FRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQH
: :.::::: .:::::::.: ::::: .:: ::::::.::.::.::::::.::::
CCDS74 FSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFRQH
510 520 530 540 550 560
510
pF1KSD SHLTYHQRIHNVT
.::..:::::
CCDS74 AHLAHHQRIHIGESLSPPNPVNHQVL
570 580 590
>>CCDS59394.1 ZNF404 gene_id:342908|Hs108|chr19 (552 aa)
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Smith-Waterman score: 1775; 51.5% identity (72.0% similar) in 522 aa overlap (1-516:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MARDLVMFRDVAVDFSQEEWECLNSYQRNLYRDVILENYSNLVSLAGCSISKPDVITLLE
::: . : :::.:::::::: ::: ::.:::::.::::.::::: .. . .. .
CCDS59 MARVPLTFSDVAIDFSQEEWEYLNSDQRDLYRDVMLENYTNLVSLDFNFTTESNKLSSEK
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD QGKEPWMVVRDE-KRRWTLDLES---RYDTKKLFQ-GKDIY-EMNLSQWKVMERIKSCGL
.. : .. :: :..: : : . .. :.. ... . .... :: :
CCDS59 RNYEVNAYHQETWKRNKTFNLMRFIFRTDPQYTIEFGRQQRPKVGCFSQMIFKKHKSLPL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EEQESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGKAFRVRQQLT
..... .: .. .: .:: : . ..:. ::::.:::::: : :..
CCDS59 HKRNNTREKSYE-----CKEYKKGFRKYLHLTEHLRDHTGVIPYECNECGKAFVVFQHFI
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQR
:..::: :::::. : :::: ..: .:: :::. : ::::.::: : : : ::.
CCDS59 RHRKIHTDLKPYECNGCEKAFRFYSQLIQHQIIHTGMKPYECKQCGKAFRRHSHLTEHQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIA
::.: ::.::::::..::. .. :::.:: : :::.:::::::: . . : .:.... .
CCDS59 IHVGLKPFECKECGETFRLYRHMCLHQKIHHGVKPYKCKECGKAFGHRSSLYQHKKIHSG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EKCYECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPY
:: :.:..: .::. : : :.. ::::::.:: :::::: ..: :.:::..:: :
CCDS59 EKPYKCEQCEKAFVRSYLLVEHQRSHTGEKPHECMECGKAFGKGSSLLKHKRIHSSEKLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKE
:::.:::.: :: .:: ::::::::::.::::: : :. .: ::.:: :: ::::::.
CCDS59 DCKDCGKAFCRGSQLTQHQRIHTGEKPHECKECGKTFKLHSYLIQHQIIHTDLKPYECKQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPFKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKA
::::: ..: ::::: ::::..:::: ::::: ::: ::.:::: ::: :::: ::
CCDS59 CGKAFSRVGDLKTHQSIHAGEKPYECKECGKTFRLNSQLIYHQTIHTGLKPYVCKECKKA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KSD FRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVT
:: :.: ::.:::.:::::.:::: ::: . ..:: :. ::
CCDS59 FRSISGLSQHKRIHTGEKPYECKECDKAFNRSDRLTQHETIHTGVKPQKCKECGKAFSHC
480 490 500 510 520 530
CCDS59 YQLSQHQRFHHGERLLM
540 550
>>CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 (488 aa)
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Smith-Waterman score: 1758; 65.6% identity (81.6% similar) in 369 aa overlap (148-516:80-448)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ESPHEVCFRQVTKTTSEKMPTYRKLTSLPLYQKSHNREKPYECGECGKAFRVRQQLTFHQ
.:. :. :::::: :::::: .:..::
CCDS12 IQHQRIHTDEKLLECKECGKDFSFVSVLVRHQRIHTGEKPYECKECGKAFGSGANLAYHQ
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCGKIFTCGSDLRVHQRIHI
::::::::.::::::::: . ..:..::::::..: ::::.::: :. :: : :: ::
CCDS12 RIHTGEKPFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHS
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIAEKC
::::::::::::.: .. : :.::::::::::: .::::: . ..::.:.:.. .::
CCDS12 GEKPYECKECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKP
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YECKECGQAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYDCK
:::: ::.:: ...: :...::::::: :.:::::: . :: ::::::::::: ::
CCDS12 YECKACGMAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCK
230 240 250 260 270 280
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