Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0964
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0964, 989 aa
1>>>pF1KSDA0964 989 - 989 aa - 989 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2761+/-0.000829; mu= 4.8254+/- 0.050
mean_var=213.8768+/-42.551, 0's: 0 Z-trim(115.1): 23 B-trim: 17 in 2/51
Lambda= 0.087699
statistics sampled from 15591 (15612) to 15591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 4.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13274.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 ( 989) 6659 855.6 0
CCDS13275.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 ( 453) 2712 356.0 9.9e-98
CCDS11836.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 977) 1847 246.8 1.6e-64
CCDS56053.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 929) 1543 208.3 5.9e-53
CCDS75689.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 ( 961) 1506 203.6 1.6e-51
CCDS47760.1 DLGAP2 gene_id:9228|Hs108|chr8 ( 975) 1425 193.4 1.9e-48
CCDS56050.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 685) 1163 160.1 1.4e-38
CCDS77146.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 693) 1163 160.1 1.4e-38
CCDS74191.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 699) 1163 160.1 1.4e-38
CCDS56052.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 661) 1085 150.3 1.2e-35
CCDS42406.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 675) 1084 150.1 1.4e-35
CCDS56051.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 683) 1084 150.1 1.4e-35
CCDS30670.1 DLGAP3 gene_id:58512|Hs108|chr1 ( 979) 1081 149.9 2.4e-35
CCDS56049.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 ( 627) 780 111.7 4.9e-24
>>CCDS13274.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 (989 aa)
initn: 6659 init1: 6659 opt: 6659 Z-score: 4562.0 bits: 855.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6659; 99.9% identity (99.9% similar) in 989 aa overlap (1-989:1-989)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAFAREARFPGQNTLPGDGLFPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNGSKKGGMEDGKGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMILGRQAERSQPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS13 RAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMTLGRQAERSQPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVKRGSWSTLTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVKRGSWSTLTLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAEGPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAEGPIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVSDSLNDSSCISQIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHAALKSEQGTLTSSESHPEAAP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSESSVPSHSMSSRRDTDSDTQDAND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSESSVPSHSMSSRRDTDSDTQDAND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD HLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAA
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KSD KRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
970 980
>>CCDS13275.1 DLGAP4 gene_id:22839|Hs108|chr20 (453 aa)
initn: 2731 init1: 1966 opt: 2712 Z-score: 1868.1 bits: 356.0 E(32554): 9.9e-98
Smith-Waterman score: 2712; 93.7% identity (96.2% similar) in 444 aa overlap (551-989:12-453)
530 540 550 560 570 580
pF1KSD CSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MALCLELLKQCSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQS
10 20 30 40
590 600 610 620 630 640
pF1KSD STESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVAPAPEAPEPPPKHA
50 60 70 80 90 100
650 660 670 680 690
pF1KSD ALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGP----KAIDVMAPSS
:::::::::::::::::::::::::::::: . . :. .: ..: :.. ..
CCDS13 ALKSEQGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQVDCIQPVPK--EEPSPATKFQSIGVQVEDD
110 120 130 140 150
700 710 720 730 740 750
pF1KSD -ESSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQI
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WRSSVPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQI
160 170 180 190 200 210
760 770 780 790 800 810
pF1KSD KRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERL
220 230 240 250 260 270
820 830 840 850 860 870
pF1KSD EGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTA
280 290 300 310 320 330
880 890 900 910 920 930
pF1KSD QDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKP
340 350 360 370 380 390
940 950 960 970 980
pF1KSD AVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
400 410 420 430 440 450
>>CCDS11836.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (977 aa)
initn: 2562 init1: 757 opt: 1847 Z-score: 1271.7 bits: 246.8 E(32554): 1.6e-64
Smith-Waterman score: 2747; 46.6% identity (71.8% similar) in 1015 aa overlap (1-989:1-977)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAF-AREARFPGQNTLPGDGLFP
::::. :: .: . . : . : .::.::::::.: : . . .:.. .. . :
CCDS11 MKGLSGSRSHHHGVTCDSACDSLSHHSDRKPYLLSPVEHHPADHPYYTQRNSFQAECVGP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGF
... : :::::: ::.:. :. .: . .. ::: ::.:::::::::.:::. :::.
CCDS11 FSD--PLASSTFPRRHYTSQQELKDECALVPRTLATKANRIPANLLDQFERQLPLSRDGY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD STLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEG-TAGKV-GGNGSKKGGMEDG
:::. : .. :..:::::::::::::.:: ::. :::: . :.: ::..: ..
CCDS11 HTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLF-TKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDEAQAAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMILGRQAERS
:.:.::::: .::: : .. :::::::::::. ... : ::.: .:: .::
CCDS11 YGKRSKSKERR--AEPKARPSTS-PGWWSSDDNLDGDMCIYHA--P-SGVMTMGRCPDRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVKRGSWS-T
.::..:::::: . .:....:. . .:: .: :. :: .:...:: :
CCDS11 ASQYFLEAYNTISEQAVKASRSNND---------VKCSTCANLPVSLDTPLLKKSAWSST
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAE
::.:.:.:: ::.:...:....::.::.: . .::::: :: : .:: :
CCDS11 LTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSESCQQERSCQYLQVPQD--EW--TGYTPRGKD----
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSL
:::::::::::::::::::: .: :::::::.::::.:::.::: :: : .. . :
CCDS11 DEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KSD DRLDSVDMLLPSKCPSWEEDYTPVS-----DSLNDSSCIS--QIFGQASLIPQLFGHEQQ
.. .... . :. . . :: :::. .. .. .. .. . .. .:
CCDS11 EHSPKLQI----RSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQ
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VREAELSDQYEAACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVS
: : :.. :.:..:::. :: :: :.:.::::.:. :: :::::.:::. ::::... ::
CCDS11 VSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVS
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTY
:.: ::: .: .. . .. :::...:::::::::::::.:::::.:.:::::::::.:
CCDS11 LRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAY
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVA----PAPEAPEPPPKHAALKSE
.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... : :: . .. .
CCDS11 MDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTT
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690
pF1KSD QGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSESS------
.:.:. . . . : . ::::: .. .. .:...:. .. .. . :
CCDS11 IATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRF
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KSD VPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCT-PHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRN
. :.:... ..: : .: ..: .: : . .: : ..: ::. . : . :
CCDS11 TRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDN--SCPGPMARQFSRDASTSTVS--IQGSGN
700 710 720 730 740
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LSYG----DNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETER
.. :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::.::::::::: .:
CCDS11 HYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDR
750 760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPT
.:::: ::..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: :::.::::.:.::::
CCDS11 MEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPT
810 820 830 840 850 860
880 890 900 910 920 930
pF1KSD AQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSK
.::::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.. ::::::::::.
CCDS11 SQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRAPPPVPKKPAKGP
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970 980
pF1KSD PAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
. :... ..: :::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS11 APLIRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
930 940 950 960 970
>>CCDS56053.1 DLGAP1 gene_id:9229|Hs108|chr18 (929 aa)
initn: 2293 init1: 709 opt: 1543 Z-score: 1064.2 bits: 208.3 E(32554): 5.9e-53
Smith-Waterman score: 2443; 44.8% identity (70.7% similar) in 945 aa overlap (1-919:1-911)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGTDRNPYLLSPTEAF-AREARFPGQNTLPGDGLFP
::::. :: .: . . : . : .::.::::::.: : . . .:.. .. . :
CCDS56 MKGLSGSRSHHHGVTCDSACDSLSHHSDRKPYLLSPVEHHPADHPYYTQRNSFQAECVGP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEKQLPIHRDGF
... : :::::: ::.:. :. .: . .. ::: ::.:::::::::.:::. :::.
CCDS56 FSD--PLASSTFPRRHYTSQQELKDECALVPRTLATKANRIPANLLDQFERQLPLSRDGY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD STLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEG-TAGKV-GGNGSKKGGMEDG
:::. : .. :..:::::::::::::.:: ::. :::: . :.: ::..: ..
CCDS56 HTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLF-TKSHSLEGPSKGSVNGGKASPDEAQAAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KGRRAKSKERAKAGEPKRRSRSNISGWWSSDDNLDGEAGAFRSSGPASGLMILGRQAERS
:.:.::::: .::: : .. :::::::::::. ... : ::.: .:: .::
CCDS56 YGKRSKSKERR--AEPKARPSTS-PGWWSSDDNLDGDMCIYHA--P-SGVMTMGRCPDRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNNTTELTAPPPPPAPPATCPSLGVGTDTNYVKRGSWS-T
.::..:::::: . .:....:. . .:: .: :. :: .:...:: :
CCDS56 ASQYFLEAYNTISEQAVKASRSNND---------VKCSTCANLPVSLDTPLLKKSAWSST
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAE
::.:.:.:: ::.:...:....::.::.: . .::::: :: : .:: :
CCDS56 LTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSESCQQERSCQYLQVPQ--DEW--TGYTPRGKD----
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSL
:::::::::::::::::::: .: :::::::.::::.:::.::: :: : .. . :
CCDS56 DEIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KSD DRLDSVDMLLPSKCPSWEEDYTPVS-----DSLNDSSCIS--QIFGQASLIPQLFGHEQQ
.. .... . :. . . :: :::. .. .. .. .. . .. .:
CCDS56 EHSPKLQI----RSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQ
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD VREAELSDQYEAACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVS
: : :.. :.:..:::. :: :: :.:.::::.:. :: :::::.:::. ::::... ::
CCDS56 VSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVS
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTY
:.: ::: .: .. . .. :::...:::::::::::::.:::::.:.:::::::::.:
CCDS56 LRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAY
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD LDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVA----PAPEAPEPPPKHAALKSE
.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... : :: . .. .
CCDS56 MDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTT
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690
pF1KSD QGTLTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSESS------
.:.:. . . . : . ::::: .. .. .:...:. .. .. . :
CCDS56 IATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRF
640 650 660 670 680 690
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pF1KSD VPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCT-PHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRN
. :.:... ..: : .: ..: .: : . .: : ..: ::. . : . :
CCDS56 TRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDN--SCPGPMARQFSRDASTSTVS--IQGSGN
700 710 720 730 740
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pF1KSD LSYG----DNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETER
.. :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::.::::::::: .:
CCDS56 HYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDR
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD LEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPT
.:::: ::..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: :::.::::.:.::::
CCDS56 MEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPT
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880 890 900 910 920 930
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.::::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.
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CCDS56 QSK
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10 20 30 40 50
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CCDS75 TKADGRADDHHHAHHAKHSKRSKSKERKPEGKP----RPGMSSWWSSDDNLDSDS-TYRT
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::. . .. . ::::::::::::::::::.: :: .::: :::.: .
CCDS75 -EWGGYPTGGKDEE------IPCRRMRSGSYIKAMGDEESGESDSSPKTSPKSAILPEPL
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: . : . ..... . .. :.. : : . :::::: .: ... .:. : .
CCDS75 AAAQRHLPESQSSSVRTSDKAILVSKA--EELLKSRCSSIGIQVETATDSD--TESRGLR
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pF1KSD AIDVMAPSSESSVPSHSMSSRRDTDSDTQDAN------DSSCKSSERSLPDCTPHPNSIS
.. . :. :. .: .. . . .:. . . ...: . :
CCDS75 EYHSVGVQVEDE-KRHGRFKRSNSVTAAVQADLELEGFPGHITTEDKGLQFGSSFQRH-S
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pF1KSD IDAGPRQAPKIAQIKRN--LSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRR
. : : . .. . .:: .. ...:.::::::::: . .. .: .. . :::
CCDS75 EPSTPTQYSAVRTVRTQGLFSYREDYRTQVDTSTLPPPDPWLEPAIDT-VETGRMSPCRR
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pF1KSD DGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRG
:: ::::::.:::.:.:::: .:..:..::.::::.:::. :::::::::::::::::
CCDS75 DGSWFLKLLHAETKRMEGWCKEMEREAEENDLSEEILGKIRSAVGSAQLLMSQKFQQFYW
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pF1KSD LCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEE
::.::..:.: ::::.:::::.::.:::::::.::::::: .:. :.:...:.:: ::::
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CCDS75 RKVPPPIPKKPPKGKFPITREKSLDLPDRQRQEARRRLMAAKRAASFRQNSASERADSIE
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980
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CCDS75 IYIPEAQTRL
960
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pF1KSD MKGLGDSR--PRHLSD---SLDPPH--EPLFAGTD-RNPYLLSPTEAF--AREARFPGQN
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CCDS47 MKGLSGSRTQPPLCSGHTCGLAPPEDCEHLHHGPDARPPYLLSPADSCPGGRHRCSPRSS
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pF1KSD TLPGDGLFPLNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPANLLDQFEK
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CCDS47 VHSECVMMPVVLGDHVSSSTFPRMHYSSHYDTRDDCAV-AHAGA-KINRIPANLLDQFEK
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pF1KSD QLPIHRDGFSTLQFPRGEAKA--RGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSLEGTAGKVGGNG
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CCDS47 QLPLHRDGFHTLQYQRTSAAAEQRSESPGRIRHLVHSVQKLF-TKSHSLEGSS-KSNANG
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CCDS47 TKADGRADDHHHAHHAKHSKRSKSKERKPEGKP----RPGMSSWWSSDDNLDSDS-TYRT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD SGPASGLMILGRQAERSQPRYFMHAYNTISGHM-LKTTK-NNTTELTAPPPPPAPPATCP
:. .:.:. . . : .. : . :::.: :: .. .: :
CCDS47 --PS----VLNRHHLGPVAHCYPDALQSPFGDLSLKTSKSNNDVKCSA----------CE
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pF1KSD SLGVGTDTNYVKRGSWSTLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGG
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CCDS47 GLALTPDAKYLKRSSWSTLTVSQAKEAYRKSSLNLDKPLLHQDAKPALRPCHYLQVPQD-
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CCDS47 -EWGGYPTGGKDEE------IPCRRMRSGSYIKAMGDEESGESDSSPKTSPKSAILPEPL
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CCDS47 LKSIGQRPLGEHQTQTYLQAASDVPVGHSLDPAANYNSPKFRSRNQSYMRAVSTLSQASC
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CCDS47 VSQ-----------------VSEAEINGQFESVCESVFSEVESQAMDALDLP--GCFRTR
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CCDS47 SKPLISVTAQSSTESTQDAYQDSRAQRMSPWPQDSRGLYNSTDSLDSNK---AMNLALET
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: . : . ..... . .. :.. : : . ::::::. :.. : .
CCDS47 AAAQRHLPESQSSSVRTSDKAILVSKA--EELLKSRCSSIGIQD------SEFPEHQPYP
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pF1KSD AIDVMAPSSESSVPSHSMSSRRDTDSDTQDAN-------DSSCKSSERSLPDCTPHPNSI
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CCDS47 RSDV-ETATDSDTESRGLREYHSVGVQVEDEKRHGRFKRSNSVTAAVQADLELEGFPGHI
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pF1KSD SI-DAG---------------PRQAPKIAQIKRN--LSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLE
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CCDS47 TTEDKGLQFGSSFQRHSEPSTPTQYSAVRTVRTQGLFSYREDYRTQVDTSTLPPPDPWLE
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CCDS47 PAIDT-VETGRMSPCRRDGSWFLKLLHAETKRMEGWCKEMEREAEENDLSEEILGKIRSA
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pF1KSD VGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHL
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CCDS47 VGSAQLLMSQKFQQFYWLCQQNMDPSAMPRPTSQDLAGYWDMLQLSIEDVSMKFDELQRL
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pF1KSD KANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDASDKQRQEARKRLLAAKR
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pF1KSD AASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL
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CCDS47 AASFRQNSASERADSIEIYIPEAQTRL
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CCDS56 MNLIFHKDILFGIPANKVPQDEW--TGYTPRGKD----DEIPCRRMRSGSY
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pF1KSD IKAMGDEDSDESGGSPKPSPKTAARRQSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLDSVDMLLPSK
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CCDS56 IKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQI----R
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD CPSWEEDYTPVS-----DSLNDSSCIS--QIFGQASLIPQLFGHEQQVREAELSDQYEAA
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CCDS56 SHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESV
110 120 130 140 150 160
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:::. :: :: :.:.::::.:. :: :::::.:::. ::::... :::.: :::
CCDS56 CESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTV
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD ----PSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKPFISVTVQSSTESAQDTYLDS
::: .. : .. :::...:::::::::::::.:::::.:.:::::::::.:.:.
CCDS56 RTIQSSTGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESAQDAYMDG
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD QDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGVA----PAPEAPEPPPKHAALKSEQGT
: ..... ::::::::..:::: .. ... : :: . .. . .:
CCDS56 QGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIAT
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD LTSSESHPEAAPKRKLSSIGIQERTRRNGSHLSEDNGPKAIDVMAPSSESS------VPS
.:. . . . : . ::::: .. .. .:...:. .. .. . : . :
CCDS56 VTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRS
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD HSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCT-PHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSY
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CCDS56 NSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDN--SCPGPMARQFSRDASTSTVS--IQGSGNHYH
410 420 430 440 450
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. :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::.::::::::: .:.::
CCDS56 ACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEG
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pF1KSD WCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQD
:: ::..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: :::.::::.:.::::.::
CCDS56 WCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQD
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::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.. ::::::::::. .
CCDS56 LAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRAPPPVPKKPAKGPAPL
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:... ..: :::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS56 IRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
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::: :: : .:: : ::::
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CCDS77 RMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSPKL
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.. . :. . . :: :::. .. .. .. .. . .. .:: : :.
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CCDS77 NGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSP
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: ::: .. : .. :::...:::::::::::::.:::::.:.:::::::
CCDS77 PRTTTTVRTIQSSTGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTESA
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::.:.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... : :: . ..
CCDS77 QDAYMDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVT
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. .:.:. . . . : . ::::: .. .. .:...:. .. .. . :
CCDS77 TTTTIATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKC
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pF1KSD ----VPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCT-PHPNSISIDAGPRQAPKIAQ
. :.:... ..: : .: ..: .: : . .: : ..: ::. . :
CCDS77 FRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDN--SCPGPMARQFSRDASTSTVS--IQ
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CCDS77 GSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQA
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pF1KSD ETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDAN
: .:.:::: ::..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: :::.::::.:.
CCDS77 ERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAH
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pF1KSD PRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKP
::::.::::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.. ::::::::
CCDS77 PRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRAPPPVPKKP
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::. . :... ..: :::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS77 AKGPAPLIRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
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.:.:: :: : .:: : ::
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:::::::::::::::::: .: :::::::.::::.:::.::: :: : .. . : ..
CCDS74 CRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSP
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.... . :. . . :: :::. .. .. .. .. . .. .:: :
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:.. :.:..:::. :: :: :.:.::::.:. :: :::::.:::. ::::... :::.:
CCDS74 EVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSS
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::: ::: .. : .. :::...:::::::::::::.:::::.:.:::::
CCDS74 SPPRTTTTVRTIQSSTGVIKLSSAVEVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKPFISITAQSSTE
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::::.:.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... : :: .
CCDS74 SAQDAYMDGQGQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTAT
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.. . .:.:. . . . : . ::::: .. .. .:...:. .. .. . :
CCDS74 VTTTTTIATVTTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEE
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD ------VPSHSMSSRRDTDSDTQDANDSSCKSSE-RSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKI
. :.:... ..: : .: ..: .: : : : : ..: ::. .
CCDS74 KCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPG--PMARQFSRDASTSTVS--
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pF1KSD AQIKRNLSYG----DNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLL
: . : .. :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::.::::::
CCDS74 IQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLL
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pF1KSD QAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPD
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CCDS74 QAERDRMEGWCQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPN
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pF1KSD ANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPK
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CCDS74 AHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRAPPPVPK
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::::. . :... ..: :::::::::.:::::::::::::::::.:::::.::::::
CCDS74 KPAKGPAPLIRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTR
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pF1KSD L
:
CCDS74 L
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pF1KSD HAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPGGGGEWSTTLLSPRETDAAAEGPIP
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CCDS56 MDLKTLKLFNSQLRCGWLLYIWNKAFMAHLRVPQD--EW--TGYTPRGKD----DEIP
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CCDS56 CRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDTSPKPSPKVAARRESYLKATQPSLTELTTLKISNEHSP
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD SVDMLLPSKCPSWEEDYTPVS-----DSLNDSSCIS--QIFGQASLIPQLFGHEQQVREA
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CCDS56 KLQI----RSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPKFRSRNESYMRAMSTISQVSEM
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pF1KSD ELSDQYEAACESACSEAESTAAETLDLPLPSYFRSRSHSYLRAIQAGCSQEEDSVSLQSL
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CCDS56 EVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPMPGCFRMRSHSYVRAIEKGCSQDDECVSLRSS
170 180 190 200 210 220
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CCDS56 SPPRTTTTV---RTIQSS-------------------------TAQSSTESAQDAYMDGQ
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CCDS56 GQRGDIISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGPASQHMGNNTATVTTTTTIATV
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CCDS56 TTEDRKKDHFKKNRCLSIGIQVDDAEEPDKTGENKAPSKFQSVGVQVEEEKCFRRFTRSN
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CCDS56 SVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPG--PMARQFSRDASTSTVS--IQGSGNHYHA
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CCDS56 CAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGHWFLKLLQAERDRMEGW
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD CCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDL
: ::..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: :::.::::.:.::::.:::
CCDS56 CQQMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCEENLNPNAHPRPTSQDL
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD AGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVS
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CCDS56 AGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRAPPPVPKKPAKGPAPLI
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CCDS56 RERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYIPEAQTRL
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989 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:26:59 2016 done: Thu Nov 3 04:26:59 2016
Total Scan time: 4.500 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]