Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0979, 1447 aa
  1>>>pF1KSDA0979 1447 - 1447 aa - 1447 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6792+/-0.0013; mu= -0.6624+/- 0.078
 mean_var=299.8323+/-60.436, 0's: 0 Z-trim(109.5): 36  B-trim: 31 in 1/53
 Lambda= 0.074069
 statistics sampled from 10906 (10925) to 10906 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.336), width:  16
 Scan time:  5.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41878.1 PDS5B gene_id:23047|Hs108|chr13        (1447) 9484 1028.6       0
CCDS47045.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4         (1337) 6089 665.8 2.3e-190
CCDS54759.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4         ( 600) 3186 355.4   3e-97


>>CCDS41878.1 PDS5B gene_id:23047|Hs108|chr13             (1447 aa)
 initn: 9484 init1: 9484 opt: 9484  Z-score: 5491.1  bits: 1028.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9484; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAHSKTRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSEEEKELYLNLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAHSKTRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSEEEKELYLNLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSPDKLKDIFMFITRQLKGLEDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSPDKLKDIFMFITRQLKGLEDT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KSPQFNRYFYLLENIAWVKSYNICFELEDSNEIFTQLYRTLFSVINNGHNQKVHMHMVDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KSPQFNRYFYLLENIAWVKSYNICFELEDSNEIFTQLYRTLFSVINNGHNQKVHMHMVDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MSSIICEGDTVSQELLDTVLVNLVPAHKNLNKQAYDLAKALLKRTAQAIEPYITNFFNQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSSIICEGDTVSQELLDTVLVNLVPAHKNLNKQAYDLAKALLKRTAQAIEPYITNFFNQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LMLGKTSISDLSEHVFDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSNDNEERLQVVKLLAKMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LMLGKTSISDLSEHVFDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSNDNEERLQVVKLLAKMF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHPDLAKDLTEYLKVRSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHPDLAKDLTEYLKVRSH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD DPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVRKEAMMGLAQIYKKYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVRKEAMMGLAQIYKKYA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LQSAAGKDAAKQIAWIKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVPHNLETTERMKCLYYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQSAAGKDAAKQIAWIKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVPHNLETTERMKCLYYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD YATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAIFSKVMVITRNLPDPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAIFSKVMVITRNLPDPG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEVLVSPTCSCKQAEGCVREITKKLGNPKQPTNPFLEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEVLVSPTCSCKQAEGCVREITKKLGNPKQPTNPFLEM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD IKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGLELLKVLSFTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGLELLKVLSFTH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPHIRSALLPVLHHKSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPHIRSALLPVLHHKSKK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD GPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLITPLVTIGHIALLAPDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLITPLVTIGHIALLAPDQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD FAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVKIQAIKMMVRWLLGMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVKIQAIKMMVRWLLGMK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD NNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSAIVKLAQEPCYHEIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSAIVKLAQEPCYHEIIT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD LEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICALCAKDPVKERRAHARQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICALCAKDPVKERRAHARQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD CLVKNINVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDYVKVQDIEQLKDVKEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CLVKNINVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDYVKVQDIEQLKDVKEC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD LWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDAKMNEKLYTVCDVAMNIIMSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDAKMNEKLYTVCDVAMNIIMSKS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD TTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKPKTTNVLGAVNKPLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKPKTTNVLGAVNKPLSS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD AGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENEDYTMSSPLPGKKSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENEDYTMSSPLPGKKSDK
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD RDDSDLVRSELEKPRGRKKTPVTEQEEKLGMDDLTKLVQEQKPKGSQRSRKRGHTASESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDDSDLVRSELEKPRGRKKTPVTEQEEKLGMDDLTKLVQEQKPKGSQRSRKRGHTASESD
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD EQQWPEEKRLKEDILENEDEQNSPPKKGKRGRPPKPLGGGTPKEEPTMKTSKKGSKKKSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EQQWPEEKRLKEDILENEDEQNSPPKKGKRGRPPKPLGGGTPKEEPTMKTSKKGSKKKSG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD PPAPEEEEEEERQSGNTEQKSKSKQHRVSRRAQQRAESPESSAIESTQSTPQKGRGRPSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPAPEEEEEEERQSGNTEQKSKSKQHRVSRRAQQRAESPESSAIESTQSTPQKGRGRPSK
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD TPSPSQPKKNVRVGRSKQAATKENDSSEEVDVFQGSSPVDDIPQEETEEEEVSTVNVRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TPSPSQPKKNVRVGRSKQAATKENDSSEEVDVFQGSSPVDDIPQEETEEEEVSTVNVRRR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

              
pF1KSD SAKRERR
       :::::::
CCDS41 SAKRERR
              

>>CCDS47045.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4              (1337 aa)
 initn: 6135 init1: 6057 opt: 6089  Z-score: 3531.0  bits: 665.8 E(32554): 2.3e-190
Smith-Waterman score: 6132; 69.4% identity (87.7% similar) in 1332 aa overlap (8-1326:18-1332)

                         10        20        30        40        50
pF1KSD           MAHSKTRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSE
                        . ::::.::::::::.:::. .::..:::::::::::::::::
CCDS47 MDFTAQPKPATALCGVVSADGKIAYPPGVKEITDKITTDEMIKRLKMVVKTFMDMDQDSE
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD EEKELYLNLALHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSPDKLKDIFMFI
       .::. :: :::::::.:::..:.:::::::::::::::::::::::::: :::::::.::
CCDS47 DEKQQYLPLALHLASEFFLRNPNKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSHDKLKDIFLFI
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KSD TRQLKGLEDTKSPQFNRYFYLLENIAWVKSYNICFELEDSNEIFTQLYRTLFSVINNGHN
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: :::: ::.:::::::::.::
CCDS47 TRQLKGLEDTKSPQFNRYFYLLENLAWVKSYNICFELEDCNEIFIQLFRTLFSVINNSHN
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KSD QKVHMHMVDLMSSIICEGDTVSQELLDTVLVNLVPAHKNLNKQAYDLAKALLKRTAQAIE
       .::.:::.::::::: ::: :.:::::..:.::.:::::::::..::::.:::::.:.::
CCDS47 KKVQMHMLDLMSSIIMEGDGVTQELLDSILINLIPAHKNLNKQSFDLAKVLLKRTVQTIE
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KSD PYITNFFNQVLMLGKTSISDLSEHVFDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSNDNEERL
         :.:::::::.::..:.::::::::::: ::. :: ::::::.:::::::::::.::::
CCDS47 ACIANFFNQVLVLGRSSVSDLSEHVFDLIQELFAIDPHLLLSVMPQLEFKLKSNDGEERL
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KSD QVVKLLAKMFGAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHPDLAKD
        ::.::::.::.:::.::.::.:::::.::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS47 AVVRLLAKLFGSKDSDLATQNRPLWQCFLGRFNDIHVPVRLESVKFASHCLMNHPDLAKD
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD LTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVRKEAMM
       ::::::::::::::::::::::.:.::::.:. ::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS47 LTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVTIITAAKRDLALVNDQLLGFVRERTLDKRWRVRKEAMM
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KSD GLAQIYKKYALQSAAGKDAAKQIAWIKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVPHNLET
       ::::.:::: :.. :::.::....:::::::::::::::::.::::.:::::.:::::::
CCDS47 GLAQLYKKYCLHGEAGKEAAEKVSWIKDKLLHIYYQNSIDDKLLVEKIFAQYLVPHNLET
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD TERMKCLYYLYATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAIFSKVM
        :::::::::::.:: ::::::::::::::.:: .:..:::: ::: ..:. .:.:.:.:
CCDS47 EERMKCLYYLYASLDPNAVKALNEMWKCQNMLRSHVRELLDLHKQPTSEANCSAMFGKLM
              490       500       510       520       530       540

              540       550       560       570       580       590
pF1KSD VITRNLPDPGKAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEVLVSPTCSCKQAEGCVREITKKLGNP
       .:..:::::::::::.:::.::: ::::.:.:::.:.:::::::::. :::::..::.::
CCDS47 TIAKNLPDPGKAQDFVKKFNQVLGDDEKLRSQLELLISPTCSCKQADICVREIARKLANP
              550       560       570       580       590       600

              600       610       620       630       640       650
pF1KSD KQPTNPFLEMIKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGL
       ::::::::::.:::::::::::::.:.::::.: .::::.::::::.:::  : :::.::
CCDS47 KQPTNPFLEMVKFLLERIAPVHIDSEAISALVKLMNKSIEGTADDEEEGVSPDTAIRSGL
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD ELLKVLSFTHPISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPHIRSAL
       ::::::::::: :::::::.:::: ::.:.:.::::::.:::.::: ::: :.:.:::.:
CCDS47 ELLKVLSFTHPTSFHSAETYESLLQCLRMEDDKVAEAAIQIFRNTGHKIETDLPQIRSTL
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD LPVLHHKSKKGPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLITPLVTI
       .:.::.:.:.: :.::: :.:::::::..::.:.::::::: .::. .  :.::::::..
CCDS47 IPILHQKAKRGTPHQAKQAVHCIHAIFTNKEVQLAQIFEPLSRSLNADVPEQLITPLVSL
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD GHIALLAPDQFAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVKIQAIK
       :::..:::::::.:.::.::.:::::::::::  :.:. ::: ::::::::...:.::::
CCDS47 GHISMLAPDQFASPMKSVVANFIVKDLLMNDRSTGEKNGKLWSPDEEVSPEVLAKVQAIK
              790       800       810       820       830       840

              840       850       860       870       880       890
pF1KSD MMVRWLLGMKNNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAGSAIVKLA
       ..::::::::::.:::..::::::...: :.:::::: .::: :::::::::::::.:::
CCDS47 LLVRWLLGMKNNQSKSANSTLRLLSAMLVSEGDLTEQKRISKSDMSRLRLAAGSAIMKLA
              850       860       870       880       890       900

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pF1KSD QEPCYHEIITLEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICALCAKDP
       :::::::::: ::.:::::.::::::::::.:::::::.: .: :::::::: :::::::
CCDS47 QEPCYHEIITPEQFQLCALVINDECYQVRQIFAQKLHKALVKLLLPLEYMAIFALCAKDP
              910       920       930       940       950       960

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pF1KSD VKERRAHARQCLVKNINVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDYVKVQD
       ::::::::::::.:::..::::.::.  ..:::::::::::::: :::::::::... ::
CCDS47 VKERRAHARQCLLKNISIRREYIKQNPMATEKLLSLLPEYVVPYMIHLLAHDPDFTRSQD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD IEQLKDVKECLWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDAKMNEKLYTVCD
       ..::.:.::::::.::.::.:::::::::..::.:::: :.:::.::..: :::::::::
CCDS47 VDQLRDIKECLWFMLEVLMTKNENNSHAFMKKMAENIKLTRDAQSPDESKTNEKLYTVCD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KSD VAMNIIMSKSTTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKPKTTNV
       ::. .: :::.  . .:::::::: .:::::.:.: : :.:.  : . ..  :::: ..:
CCDS47 VALCVINSKSALCNADSPKDPVLPMKFFTQPEKDFCNDKSYISEETRVLLLTGKPKPAGV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1140      1150      1160        1170      1180        
pF1KSD LGAVNKPLSSAGKQSQTKSSRMETVSNASSSS--NPSSPGRIKGRLDSSEMDH---SENE
       :::::::::..:..  ..:.  :: :: . .:  :::. .:  .: .:::  .   ::::
CCDS47 LGAVNKPLSATGRKPYVRSTGTETGSNINVNSELNPSTGNR--SREQSSEAAETGVSENE
             1150      1160      1170      1180        1190        

        1190            1200       1210      1220      1230        
pF1KSD DYTMS--SPLPGKKSD----KRDDSDLV-RSELEKPRGRKKTPVTEQEEKLGMDDLTKLV
       .  .   :  : :. :    :. .:: . .... . ::.:.: ..   :.. .    : :
CCDS47 ENPVRIISVTPVKNIDPVKNKEINSDQATQGNISSDRGKKRTVTAAGAENIQQKTDEK-V
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

     1240      1250      1260      1270      1280       1290       
pF1KSD QEQKPKGSQRSRKRGHTASESDEQQWPEEKRLKEDILENEDEQNSPPKKG-KRGRPPKPL
       .:. : . .. :.  .  :::           . .  .:.:  :.: .:: ::.   .  
CCDS47 DESGPPAPSKPRRGRRPKSES-----------QGNATKNDD-LNKPINKGRKRAAVGQES
      1260      1270                 1280       1290      1300     

      1300      1310      1320      1330      1340      1350       
pF1KSD GGGTPKEEPTMKTSKKGSKKKSGPPAPEEEEEEERQSGNTEQKSKSKQHRVSRRAQQRAE
        ::   :  . :. :  .  :.. :: ..                               
CCDS47 PGGL--EAGNAKAPKLQDLAKKAAPAERQIDLQR                          
          1310      1320      1330                                 

>>CCDS54759.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4              (600 aa)
 initn: 3186 init1: 3186 opt: 3186  Z-score: 1859.4  bits: 355.4 E(32554): 3e-97
Smith-Waterman score: 3186; 80.5% identity (95.3% similar) in 573 aa overlap (8-580:18-590)

                         10        20        30        40        50
pF1KSD           MAHSKTRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSE
                        . ::::.::::::::.:::. .::..:::::::::::::::::
CCDS54 MDFTAQPKPATALCGVVSADGKIAYPPGVKEITDKITTDEMIKRLKMVVKTFMDMDQDSE
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD EEKELYLNLALHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSPDKLKDIFMFI
       .::. :: :::::::.:::..:.:::::::::::::::::::::::::: :::::::.::
CCDS54 DEKQQYLPLALHLASEFFLRNPNKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSHDKLKDIFLFI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD TRQLKGLEDTKSPQFNRYFYLLENIAWVKSYNICFELEDSNEIFTQLYRTLFSVINNGHN
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: :::: ::.:::::::::.::
CCDS54 TRQLKGLEDTKSPQFNRYFYLLENLAWVKSYNICFELEDCNEIFIQLFRTLFSVINNSHN
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KSD QKVHMHMVDLMSSIICEGDTVSQELLDTVLVNLVPAHKNLNKQAYDLAKALLKRTAQAIE
       .::.:::.::::::: ::: :.:::::..:.::.:::::::::..::::.:::::.:.::
CCDS54 KKVQMHMLDLMSSIIMEGDGVTQELLDSILINLIPAHKNLNKQSFDLAKVLLKRTVQTIE
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KSD PYITNFFNQVLMLGKTSISDLSEHVFDLILELYNIDSHLLLSVLPQLEFKLKSNDNEERL
         :.:::::::.::..:.::::::::::: ::. :: ::::::.:::::::::::.::::
CCDS54 ACIANFFNQVLVLGRSSVSDLSEHVFDLIQELFAIDPHLLLSVMPQLEFKLKSNDGEERL
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD QVVKLLAKMFGAKDSELASQNKPLWQCYLGRFNDIHVPIRLECVKFASHCLMNHPDLAKD
        ::.::::.::.:::.::.::.:::::.::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS54 AVVRLLAKLFGSKDSDLATQNRPLWQCFLGRFNDIHVPVRLESVKFASHCLMNHPDLAKD
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD LTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVSIVTAAKKDILLVNDHLLNFVRERTLDKRWRVRKEAMM
       ::::::::::::::::::::::.:.::::.:. ::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS54 LTEYLKVRSHDPEEAIRHDVIVTIITAAKRDLALVNDQLLGFVRERTLDKRWRVRKEAMM
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KSD GLAQIYKKYALQSAAGKDAAKQIAWIKDKLLHIYYQNSIDDRLLVERIFAQYMVPHNLET
       ::::.:::: :.. :::.::....:::::::::::::::::.::::.:::::.:::::::
CCDS54 GLAQLYKKYCLHGEAGKEAAEKVSWIKDKLLHIYYQNSIDDKLLVEKIFAQYLVPHNLET
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD TERMKCLYYLYATLDLNAVKALNEMWKCQNLLRHQVKDLLDLIKQPKTDASVKAIFSKVM
        :::::::::::.:: ::::::::::::::.:: .:..:::: ::: ..:. .:.:.:.:
CCDS54 EERMKCLYYLYASLDPNAVKALNEMWKCQNMLRSHVRELLDLHKQPTSEANCSAMFGKLM
              490       500       510       520       530       540

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pF1KSD VITRNLPDPGKAQDFMKKFTQVLEDDEKIRKQLEVLVSPTCSCKQAEGCVREITKKLGNP
       .:..:::::::::::.:::.::: ::::.:.:::.:.:::::::::. ::          
CCDS54 TIAKNLPDPGKAQDFVKKFNQVLGDDEKLRSQLELLISPTCSCKQADICVVSKSYFTLFL
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD KQPTNPFLEMIKFLLERIAPVHIDTESISALIKQVNKSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGL




1447 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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