FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0979, 1447 aa 1>>>pF1KSDA0979 1447 - 1447 aa - 1447 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6792+/-0.0013; mu= -0.6624+/- 0.078 mean_var=299.8323+/-60.436, 0's: 0 Z-trim(109.5): 36 B-trim: 31 in 1/53 Lambda= 0.074069 statistics sampled from 10906 (10925) to 10906 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16 Scan time: 5.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41878.1 PDS5B gene_id:23047|Hs108|chr13 (1447) 9484 1028.6 0 CCDS47045.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4 (1337) 6089 665.8 2.3e-190 CCDS54759.1 PDS5A gene_id:23244|Hs108|chr4 ( 600) 3186 355.4 3e-97 >>CCDS41878.1 PDS5B gene_id:23047|Hs108|chr13 (1447 aa) initn: 9484 init1: 9484 opt: 9484 Z-score: 5491.1 bits: 1028.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9484; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 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