Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0989
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0989, 780 aa
1>>>pF1KSDA0989 780 - 780 aa - 780 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5411+/-0.000975; mu= -6.3533+/- 0.058
mean_var=376.5434+/-80.309, 0's: 0 Z-trim(115.5): 33 B-trim: 113 in 1/53
Lambda= 0.066095
statistics sampled from 16068 (16096) to 16068 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.494), width: 16
Scan time: 5.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 ( 780) 5070 497.8 2.8e-140
CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 ( 837) 5053 496.2 9.1e-140
CCDS63783.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 ( 777) 5025 493.5 5.5e-139
CCDS48154.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX (1084) 1325 140.8 1.1e-32
CCDS73368.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11 ( 906) 1306 138.9 3.5e-32
CCDS44712.1 AMOTL1 gene_id:154810|Hs108|chr11 ( 956) 1306 138.9 3.6e-32
CCDS14563.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX ( 675) 1261 134.5 5.4e-31
>>CCDS33860.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 (780 aa)
initn: 5070 init1: 5070 opt: 5070 Z-score: 2631.9 bits: 497.8 E(32554): 2.8e-140
Smith-Waterman score: 5070; 99.9% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSERQTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSERQTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KHGSRDGSTQTDGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KHGSRDGSTQTEGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
730 740 750 760 770 780
>>CCDS63784.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 (837 aa)
initn: 4678 init1: 4573 opt: 5053 Z-score: 2622.7 bits: 496.2 E(32554): 9.1e-140
Smith-Waterman score: 5053; 99.7% identity (99.9% similar) in 780 aa overlap (1-780:59-837)
10 20 30
pF1KSD MRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ERLAAGDSVGCSGARCHRPLSRQLCASQRSMRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRT
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQQAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQQAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALREL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSSSHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSSSHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPP
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQHAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQHAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQE
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNER
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDF
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIED
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRL
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWE
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KSD QKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIRHSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIRHSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLK
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQGSLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQGSLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSER
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHAKHGSRDGSTQTDGPPDSTSTCLPPEPDSLL
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS63 QTADAPARLTT-DRAPTEEPVVTAPPAAHAKHGSRDGSTQTEGPPDSTSTCLPPEPDSLL
750 760 770 780 790 800
760 770 780
pF1KSD GCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
810 820 830
>>CCDS63783.1 AMOTL2 gene_id:51421|Hs108|chr3 (777 aa)
initn: 4574 init1: 3434 opt: 5025 Z-score: 2608.8 bits: 493.5 E(32554): 5.5e-139
Smith-Waterman score: 5025; 99.5% identity (99.6% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-777)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MRTLEDSSGTVLHRLIQEQLRYGNLTETRTLLAIQQQALRGGAGTGGTGSPQASLEILAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 EDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QAGTRPHAGDRDPRGAPGGSRRQDEALRELRHGHVRSLSERLLQLSLERNGARAPSHMSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SHSFPQLARNQQGPPLRGPPAEGPESRGPPPQYPHVVLAHETTTAVTDPRYRARGSPHFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HAEVRILQAQVPPVFLQQQQQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ASSATSGSAHLAQMEAVLRENARLQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLSEAHE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGSQDMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEELRKKQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSGSGGS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS63 AYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQ--QAGAPGGSSGSGGS
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HSPQPSPSSSFNEGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRRDPGKAIQG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSERQTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS63 SLRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSSERQTADAPARLTT-DRAPTEEPVVTAPPAAHA
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KHGSRDGSTQTDGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KHGSRDGSTQTEGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
720 730 740 750 760 770
>>CCDS48154.1 AMOT gene_id:154796|Hs108|chrX (1084 aa)
initn: 1775 init1: 795 opt: 1325 Z-score: 700.0 bits: 140.8 E(32554): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1483; 41.2% identity (62.0% similar) in 797 aa overlap (83-740:88-875)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ASLEILAPEDSQVLQQATRQEPQGQEHQGGENHLAENTLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKA
:: . :. .: :. ...::::::::::.
CCDS48 QSDVLSPQDHHQQLVAHAARQEPQGQEIQSENLIMEK---QLSPRMQNNEELPTYEEAKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KSD HSQYYAAQQAGTRPHA----GDRDPR----GAPG------GSRRQDEALRELRHGHVRSL
.:::. .:: .. : : . . : :. :. .:::.::.:..::::::
CCDS48 QSQYFRGQQHASVGAAFYVTGVTNQKMRTEGRPSVQRLNPGKMHQDEGLRDLKQGHVRSL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KSD SERLLQLSLERNGARA-PSHMSSSHSFPQ---LARNQ---------QGPPLRGPPAEGPE
::::.:.:: .:..: : :. : :: : .: ::: .: :
CCDS48 SERLMQMSLATSGVKAHPPVTSAPLSPPQPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGME
180 190 200 210 220 230
210 220 230
pF1KSD SRGPPPQYP-----------------HVVLAHETTT-AVTD---------PRY-------
:::::.:: : :. . . :. :.:
CCDS48 HRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHFYSEHRLNQPGRTEGQLMRYQHPPEYGAARPAQ
240 250 260 270 280 290
240 250
pF1KSD ------RARGS-PHFQHAEV---------------RILQAQVPPV---------------
::.: :: . . :. :. : :
CCDS48 DISLPLSARNSQPHSPTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQ
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290
pF1KSD -FLQQQ--------------QQYQYLQQSQEHPPPPHPAALGHGPLSSLSPPAVEGPVSA
:: .: .: : ::.:.: : . : .. . : :
CCDS48 HFLPNQAHQGDHYRLSQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMP-RA
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QASSATSGSAHLAQMEAVLRENAR---LQRDNERLQRELESSAEKAGRIEKLESEIQRLS
: :::. . . : : . :. .:. :..:::. ::..:..:.:.::::.:
CCDS48 QPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVS
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQAGS
::.:.:...:::::::::.::::...:.::..:::::::::::.::..:: : :.. .
CCDS48 EAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDT
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QDMVAKLLAQSYEQQQEQEKLEREMALLRGAIEDQRRRAELLEQALGNAQGRAARAEEEL
. ...:.:.. :.:.:.:::: :.: :.. :::::. :. .:::.:::..... ::::
CCDS48 RKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEEL
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KSD RKKQAYVEKVERLQQALGQLQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQAGAPGGSSG
.:::.::.:::..:::: ::::::::::::: :::::::.::..:: :::: :.
CCDS48 KKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEKREQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQ-----GNCQ
600 610 620 630 640
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SGGSPELSALRLSEQLREKEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDT
. : .: : : ::::::.:::::::::::::::::: .::.::.:::::.::::::
CCDS48 PTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMTKWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDT
650 660 670 680 690 700
600 610 620 630 640
pF1KSD TLIRHSPQPSPSSSFN-------EGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQR
:.: :::. : ..... : .: ...: .::.:.:.:::::.::::.:::::::
CCDS48 TVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQR
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD SRRDPGKAIQGS-LRPAKSVPSVFAAAAAGTQGWQGLSSS---ERQTADAPARLTT----
::..:.:. : : .:::::. :. :... . . :..: :.. : . .
CCDS48 SRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILL
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710 720 730 740 750
pF1KSD -----ADRAP-TEEPVVTAPP--AAHAKHGSRDGSTQTDGPPDSTSTCLPPEPDSLLGCS
:. .: : :: . : .::.: :::: ::::. .:..:
CCDS48 GGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGSRDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVA
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760 770 780
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40 50 60 70 80 90
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140 150 160 170 180 190
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200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290
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300 310 320 330 340 350
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: :.: .. : .: .: . . : ..:. :..::.. ..: ...:.:.:.:
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360 370 380 390 400 410
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:.. .. :: .: : : .:::::.:::::::::::::::::: ..:.:::.::::::
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pF1KSD AQRDTTLIRHSPQPSPS-SSFN-------EGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVI
:.::::.: :: . : . ::.. : .. ...: :.:: .: :::.:.::::.:
CCDS73 AERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIWQEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNLHAKIIEKDAMI
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650 660 670 680
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::::::::.: ::. ..:::::.::::. :::.::.. :.:
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690 700 710 720 730
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:.. ... :.:: : . .:: .:::: ::.:.:::::
CCDS73 SIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPPTSALSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTDKSAELFW
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10 20 30
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CCDS44 QAT-GSAGPAHPTNNFSSTENLTQEDPQMVYQSARQEPQGQEHQV-DNTVMEKQVRSTQP
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CCDS44 Q-QNNEELPTYEEAKAQSQFFRGQQQQQQQQGAVGHGYYMAGGTSQKSRTEGRPTVNRAN
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CCDS44 SGQAHKDEALKELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAK--QHLPGSGNGKGF-KVGGGPSPA
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CCDS44 QPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLFYGDQHPGMLHEMVKPYPAPQPVRT
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CCDS44 DVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQLPFPSTMQQHSPMSSQTSSASGPLHSVSLPLPLPMALGA
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CCDS44 PQPPPAASPSQQLGPDAFAIVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQ
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pF1KSD RLSEAHESLTRASSKREALEKTMRNKMDSEMRRLQDFNRDLRERLESANRRLASKTQEAQ
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CCDS44 RISEAYESLVKSTTKRESLDKAMRNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYE--
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CCDS44 -GHEDKAAEGHYASQNKEFLKEKEKLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIK
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CCDS44 -GNGQPANMPEYNAPALLELVREKEERILALEADMTKWEQKYLEESTIRHFAMNAAATAA
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pF1KSD AQRDTTLIRHSPQPSPS-SSFN-------EGLLTGGHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVI
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CCDS44 AERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIWQEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNLHAKIIEKDAMI
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CCDS44 KVLQQRSRKDAGKTDSSSLRPARSVPSI--AAATGTHSRQTSLTSSQLAEEKKEEKTWKG
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pF1KSD -----LSSSERQTADAPARLTTADRAPTEEPVVTAPPAAHAKHGSRDGSTQTDGPPDSTS
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pF1KSD TCLPPEPDSLLGCSSSQRAASLDSVATSRVQDLSDMVEILI
CCDS44 PSMASLPSRGRLSTTPAHSPVLKHPAAKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSLLHKPEFP
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CCDS14 DENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEGEIR
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CCDS14 RMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELATAR
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CCDS14 STNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEKREQ
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CCDS14 LEHRLRTRLERELESLRIQQRQ-----GNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEAD
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CCDS14 NKRCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSG
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CCDS14 LLSHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKT
390 400 410 420 430 440
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 04:33:25 2016 done: Thu Nov 3 04:33:26 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]