Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1004
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1004, 1162 aa
1>>>pF1KSDA1004 1162 - 1162 aa - 1162 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2196+/-0.00101; mu= 9.8302+/- 0.061
mean_var=163.2118+/-32.686, 0's: 0 Z-trim(110.3): 44 B-trim: 6 in 1/52
Lambda= 0.100392
statistics sampled from 11442 (11482) to 11442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 5.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162) 8008 1172.7 0
CCDS58148.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 ( 723) 4609 680.3 4.4e-195
CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265) 1906 289.0 5e-77
CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336) 1888 286.4 3.2e-76
CCDS73873.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 ( 382) 1016 159.7 1.2e-38
CCDS45465.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 ( 694) 1016 159.9 1.9e-38
CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX ( 878) 643 105.9 4.3e-22
CCDS14355.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1024) 643 106.0 4.9e-22
CCDS55420.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1060) 643 106.0 5e-22
CCDS55418.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX ( 948) 640 105.5 6.2e-22
CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7 ( 941) 615 101.9 7.5e-21
CCDS35069.1 PHF2 gene_id:5253|Hs108|chr9 (1096) 522 88.5 9.7e-17
>>CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162 aa)
initn: 8008 init1: 8008 opt: 8008 Z-score: 6273.3 bits: 1172.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8008; 100.0% identity (100.0% similar) in 1162 aa overlap (1-1162:1-1162)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRYEDDGISDDEIEGKRTFDLEEKLHTNKYNANFVTFMEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRYEDDGISDDEIEGKRTFDLEEKLHTNKYNANFVTFMEGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVKMCVGSRRMVDVMDVNTQKGIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVKMCVGSRRMVDVMDVNTQKGIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD MTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQRPSTVDFIDWVDNMWPRHLKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQRPSTVDFIDWVDNMWPRHLKES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QTESTNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGTSVWYHIHQGGKVFWLIPPTAHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTESTNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGTSVWYHIHQGGKVFWLIPPTAHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LELYENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIPSGWIHAVYTPTDTLVFGGNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LELYENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIPSGWIHAVYTPTDTLVFGGNFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCITNRSHLTKEFQKESLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCITNRSHLTKEFQKESLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MDLELNGLESGNGDEEAVDREPRRLSSRRSVLTSPVANGVNLDYDGLGKTCRSLPSLKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDLELNGLESGNGDEEAVDREPRRLSSRRSVLTSPVANGVNLDYDGLGKTCRSLPSLKKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LAGDSSSDCSRGSHNGQVWDPQCAPRKDRQVHLTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAGDSSSDCSRGSHNGQVWDPQCAPRKDRQVHLTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMECCICNEIVHPGCLQMDGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMECCICNEIVHPGCLQMDGEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKRKMEESDEEAVQAKVLRPLRSCDEPLTPPPHSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKRKMEESDEEAVQAKVLRPLRSCDEPLTPPPHSPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAGPSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAGPSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SGKKELSEVEKAKIRGSYLTVTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRVLVQHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGKKELSEVEKAKIRGSYLTVTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRVLVQHC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PARTPQRGDEEGLGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQDGDESWMQREVWMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PARTPQRGDEEGLGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQDGDESWMQREVWMS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD WTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD DLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KSD ISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
1150 1160
>>CCDS58148.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (723 aa)
initn: 4609 init1: 4609 opt: 4609 Z-score: 3615.8 bits: 680.3 E(32554): 4.4e-195
Smith-Waterman score: 4609; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (493-1162:54-723)
470 480 490 500 510 520
pF1KSD CLVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FRRTSSTENKTKTLGKLHQEPRQLQSDGKRKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKL
30 40 50 60 70 80
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGEC
90 100 110 120 130 140
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMEC
150 160 170 180 190 200
650 660 670 680 690 700
pF1KSD CICNEIVHPGCLQMDGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKRKMEESDEEAVQAKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CICNEIVHPGCLQMDGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKRKMEESDEEAVQAKVL
210 220 230 240 250 260
710 720 730 740 750 760
pF1KSD RPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAGPSDHHSASRDERFKRRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAGPSDHHSASRDERFKRRQL
270 280 290 300 310 320
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LRLQATERTMVREKENNPSGKKELSEVEKAKIRGSYLTVTLQRPTKELHGTSIVPKLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRLQATERTMVREKENNPSGKKELSEVEKAKIRGSYLTVTLQRPTKELHGTSIVPKLQAI
330 340 350 360 370 380
830 840 850 860 870 880
pF1KSD TASSANLRHSPRVLVQHCPARTPQRGDEEGLGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TASSANLRHSPRVLVQHCPARTPQRGDEEGLGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRG
390 400 410 420 430 440
890 900 910 920 930 940
pF1KSD SWAQDGDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SWAQDGDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIV
450 460 470 480 490 500
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPL
510 520 530 540 550 560
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD LRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRH
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD MPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVT
630 640 650 660 670 680
1130 1140 1150 1160
pF1KSD LIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
690 700 710 720
>>CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265 aa)
initn: 4000 init1: 1847 opt: 1906 Z-score: 1496.4 bits: 289.0 E(32554): 5e-77
Smith-Waterman score: 3791; 51.3% identity (70.9% similar) in 1215 aa overlap (1-1088:1-1193)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRY-EDDGISD-DEIEGKRTFDLEEKLHTNKYNANFVTFME
:: :.. : ::: :.:: :.. .:: .:: . : :.:::::... :...:: ::
CCDS41 MEAEKDSGR---RLRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQLYQGDFVHAME
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GKDFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVKMCVGSRRMVDVMDVNTQKG
::::: ::.:: .:: ::::...:::::::::::::: :::. :::::.:::::::::::
CCDS41 GKDFNYEYVQREALRVPLIFREKDGLGIKMPDPDFTVRDVKLLVGSRRLVDVMDVNTQKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEMTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQRPSTVDFIDWVDNMWPRHLK
::.:.:..::::::: .:.:::::::::::::.::..:.::..::..::::::::.:::
CCDS41 TEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVKRPTVVDLVDWVDNMWPQHLK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ESQTESTNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGTSVWYHIHQGGKVFWLIPPTA
:.:::.:::: ::.::::.:::::::.::.::::.::::::::::. .:::.:::::::
CCDS41 EKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGTSVWYHVFRGGKIFWLIPPTL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HNLELYENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIPSGWIHAVYTPTDTLVFGGN
::: :::.:.:::::.:::::::: :::::::::::: ::::::::::::.:.::::::
CCDS41 HNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFFIPSGWIHAVYTPVDSLVFGGN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FLHSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCITNRSHLTKEFQKES
.:::::.::::.::.::::::: :::::::::::::::::::::.:.:::::.:.:.::
CCDS41 ILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCVTQRSHLTQEYQRES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD LSMDLE----LNGLESGNG---DEEAVDREPRRLSSR------RSVLTSPVANGV-----
. .: ..:. : . .::: :..:.. . :. .: ..:
CCDS41 MLIDAPRKPSIDGFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDEEGEGRDRAPKPPTDGSTSPTS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD --NLDYDGLGKTCRS--LPSLKKTLAGDSSSDCSRGSHNGQV-WDPQCAPRKD---RQVH
. : ..::: .. : ::.::...: . . . . : .: . . .:
CCDS41 TPSEDQEALGKKPKAPALRFLKRTLSNESEESVKSTTLAVDYPKTPTGSPATEVSAKWTH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVP
::.:::.::. ::.:::::: .::::: :::: .::. :: .:.: :..::.::.::::
CCDS41 LTEFELKGLKALVEKLESLPENKKCVPEGIEDPQALLEGVKNVLKEHADDDPSLAITGVP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD IVQWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCR
.: :::. :: :. : : . :: . :. ::. ..::::::.:::
CCDS41 VVTWPKKT-------PKNRAVGRPKGK---LGPA---SAVK-LAANRTTAGARRRRTRCR
540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEET
::.::.. ::: ::.:.:::::::::::::::..:::.:: :::...: .:::. ... .
CCDS41 KCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTV
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680
pF1KSD QDFEKK----LMECCICNEIVHPGCLQM-DGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKR
.. : : :::: :::::.:::::.. ..::..:.::::::::::: . .. : :::
CCDS41 EEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCLKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGK-QKR
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720
pF1KSD ------------------KMEESDEEAVQAKVLR------PLRSCDEPLTPPPHSPTSML
::.....:. . : : : :: : : ..:
CCDS41 GPGFKYASNLPGSLLKEQKMNRDNKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVP--PDGLL
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770
pF1KSD QLIHDPVSPRGMVTRSSPG--AGPSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREK-----
. : : : .: .: . . ...:. :.... .: .: . .:
CCDS41 RRKSDDVHLRKKRKYEKPQELSGRKRLKPGKEDKLFRKKRRSWKNAEDRMALANKPLRRF
770 780 790 800 810 820
780 790 800 810
pF1KSD ENNPSGKKELSEV-----EKAKIRGSYLT----------------VTLQR----PTKELH
...: . :: :. :. . :.: : : ..: :.:::
CCDS41 KQEP--EDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRKRRLPNKELS
830 840 850 860 870
820 830 840 850
pF1KSD ---GTSIVPKLQAITASSANLRHSPRVLVQHCPARTPQR--GDEE-------GLGGEEEE
. . ..: : :: ..: . .. :.: : : ::.: .:
CCDS41 RELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGICERPHRFSKGLNGTPRE
880 890 900 910 920 930
860 870 880 890
pF1KSD EEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQ------------------------DGDESWMQR
... . . .: : . :: :.:
CCDS41 LRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDDGAAHVMHR
940 950 960 970 980 990
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPV
::::.:: :::...:: :::::.:: .:::::::::.:::..::.:.: :::::.::::
CCDS41 EVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCKSITPLMLSGIIRRQPV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD SLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIK
::::::::::::::.::.::::::.::.:.:::: ::::: .::::::::::..:. :.:
CCDS41 SLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLDVQWVEGLK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DPQIRDLLTPPAD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSH
: :.::::.::.: .::: ::::::::....::::::::::.::::::::::::.: ::.
CCDS41 DAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPLLSKLHLSY
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD CSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQIT
:.:.:::: ::::::
CCDS41 CNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHIDLRYCKQVT
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336 aa)
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10 20 30
pF1KSD MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRY-EDDGISD-DEIEGKRTF
: : :.:: :.. .:: .:: . : :
CCDS41 SAEDHPPRKRHAAEKQKKKTVIYTKCFEFESATQRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DLEEKLHTNKYNANFVTFMEGKDFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDV
.:::::... :...:: ::::::: ::.:: .:: ::::...:::::::::::::: ::
CCDS41 SLEEKLRSQLYQGDFVHAMEGKDFNYEYVQREALRVPLIFREKDGLGIKMPDPDFTVRDV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KMCVGSRRMVDVMDVNTQKGIEMTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQ
:. :::::.::::::::::: ::.:.:..::::::: .:.:::::::::::::.::..:.
CCDS41 KLLVGSRRLVDVMDVNTQKGTEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RPSTVDFIDWVDNMWPRHLKESQTESTNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGT
::..::..::::::::.::::.:::.:::: ::.::::.:::::::.::.::::.:::::
CCDS41 RPTVVDLVDWVDNMWPQHLKEKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SVWYHIHQGGKVFWLIPPTAHNLELYENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVI
:::::. .:::.::::::: ::: :::.:.:::::.:::::::: :::::::::::: :
CCDS41 SVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFFI
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PSGWIHAVYTPTDTLVFGGNFLHSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLE
:::::::::::.:.::::::.:::::.::::.::.::::::: ::::::::::::::::
CCDS41 PSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVLE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KSD RYVYCITNRSHLTKEFQKESLSMDLE----LNGLESGNG---DEEAVDREPRRLSSR---
:::::.:.:::::.:.:.::. .: ..:. : . .::: :..:.. .
CCDS41 RYVYCVTQRSHLTQEYQRESMLIDAPRKPSIDGFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDEE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KSD ---RSVLTSPVANGV-------NLDYDGLGKTCRS--LPSLKKTLAGDSSSDCSRGSHNG
:. .: ..: . : ..::: .. : ::.::...: . . .
CCDS41 GEGRDRAPKPPTDGSTSPTSTPSEDQEALGKKPKAPALRFLKRTLSNESEESVKSTTLAV
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD QV-WDPQCAPRKD---RQVHLTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADV
. : .: . . .:::.:::.::. ::.:::::: .::::: :::: .::. :
CCDS41 DYPKTPTGSPATEVSAKWTHLTEFELKGLKALVEKLESLPENKKCVPEGIEDPQALLEGV
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPV
: .:.: :..::.::.::::.: :::. :: :. : : . :: . :
CCDS41 KNVLKEHADDDPSLAITGVPVVTWPKKT-------PKNRAVGRPKGK---LGPA---SAV
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD RPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAP
. ::. ..::::::.:::::.::.. ::: ::.:.:::::::::::::::..:::.::
CCDS41 K-LAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCIAP
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD RLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKK----LMECCICNEIVHPGCLQM-DGEGLLNEELP
:::...: .:::. ... ... : : :::: :::::.:::::.. ..::..:.:::
CCDS41 VLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCLKIKESEGVVNDELP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700
pF1KSD NCWECPKCYQEDSSEKAQKR------------------KMEESDEEAVQAKVLR------
:::::::: . .. : ::: ::.....:. . :
CCDS41 NCWECPKCNHAGKTGK-QKRGPGFKYASNLPGSLLKEQKMNRDNKEGQEPAKRRSECEEA
720 730 740 750 760 770
710 720 730 740
pF1KSD PLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPV---------SPRGMVTR-------SSPGAGPSD
: : :: : : ..:. : : .:. . : .:::. :.
CCDS41 PRRRSDEHSKKVP--PDGLLRRKSDDVHLRKKRKYEKPQELSGRKRASSLQTSPGS--SS
780 790 800 810 820
750 760 770 780
pF1KSD HHS-----ASRDERFKRRQLLRLQ-----ATERTMVREKE-------------NNP----
: : .: . : .: .: . : . :.:. :.:
CCDS41 HLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNAEDRMALANKPLRRF
830 840 850 860 870 880
790 800 810
pF1KSD --SGKKELSEV-----EKAKIRGSYLT----------------VTLQR----PTKELH--
. :: :. :. . :.: : : ..: :.:::
CCDS41 KQEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRKRRLPNKELSRE
890 900 910 920 930 940
820 830 840 850 860
pF1KSD -GTSIVPKLQAITASSANLRHSPRVLVQHCPARTPQR--GDEE-------GLGGEEEEEE
. . ..: : :: ..: . .. :.: : : ::.: .: .
CCDS41 LSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGICERPHRFSKGLNGTPRELR
950 960 970 980 990 1000
870 880 890
pF1KSD EEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQ------------------------DGDESWMQREV
.. . . .: : . :: :.:::
CCDS41 HQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDDGAAHVMHREV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
900 910 920 930 940 950
pF1KSD WMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSL
::.:: :::...:: :::::.:: .:::::::::.:::..::.:.: :::::.::::::
CCDS41 WMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCKSITPLMLSGIIRRQPVSL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDP
::::::::::::.::.::::::.::.:.:::: ::::: .::::::::::..:. :.::
CCDS41 DLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLDVQWVEGLKDA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD QIRDLLTPPAD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCS
:.::::.::.: .::: ::::::::....::::::
CCDS41 QMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPLLSKLHLSYCN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD HLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRK
CCDS41 HVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHIDLRYCKQVTKE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>--
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD DLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQ
::::.::::::::::::.: ::.:.:.:::
CCDS41 LSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHF
: :::::::..:: ::::.:.. :::.::: : ...: .:. :::: :::.:...::.:
CCDS41 SINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQF
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1150 1160
pF1KSD ISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
:...:.. . .:::.::.:
CCDS41 IAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
1320 1330
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pF1KSD EEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQDGDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVC
:.. . : .:. ::..:. :::: :::::
CCDS73 APPPRPPQLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVC
80 90 100 110 120 130
920 930 940 950 960 970
pF1KSD KTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLP
.:: .:: ::::: ..:::: :...: :::...::: .::::::..::::: ::.:::
CCDS73 RTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQ
140 150 160 170 180 190
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD GLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPAD-KPGQ-DNR
::..:.:.:::: .::::... : :: ::::: .:: :.:.:: :: : :::: ..:
CCDS73 GLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESR
200 210 220 230 240 250
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD SKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYS
..:......:::::..:::.:::..:: : :: ::::::.:. : : .:::: : : .
CCDS73 GRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRET
260 270 280 290 300 310
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD LTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDE
:..::.:::..:::. : .:: . .:::.:.:.. .:: .. . . . : .:
CCDS73 LVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRC-PEE
320 330 340 350 360 370
1160
pF1KSD KLIQKIS
::. : :
CCDS73 KLLLKDS
380
>>CCDS45465.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 (694 aa)
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Smith-Waterman score: 1615; 38.9% identity (63.5% similar) in 687 aa overlap (545-1162:13-694)
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKC
:. ::: ... .::::::.:::.:
CCDS45 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRC
10 20 30 40
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQD
.:::. ::: ::.:::::::::::::::::.:::: :: :::...: ::::. ... ..
CCDS45 RACVRTECGDCHFCRDMKKFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEG
50 60 70 80 90 100
640 650 660 670 680
pF1KSD FEKK----LMECCICNEIVHPGCLQMD-GEGLLNEELPNCWECPKCYQE-----DSSEKA
:.: :::: :::::::::::.: .::..: :.:::::::.: :: ::.:
CCDS45 EEEKFGLSLMECTICNEIVHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGP
110 120 130 140 150 160
690 700 710 720 730 740
pF1KSD QKRKMEESDEEAVQAKVLRPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAG
.:. ....: : .. . . . :: ::: . : : . : :. ::
CCDS45 GRRRADNGEEGASLGSGWK--LTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAG
170 180 190 200 210 220
750 760 770 780 790 800
pF1KSD PSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNPSG---KKELSEVEK-AKIRGSYLT
.. . . . :.. :. . . ..: .. . : . :. . .. . .
CCDS45 -NEPPTPRKKVKGGRERHLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPP
230 240 250 260 270
810 820 830 840 850
pF1KSD VTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRV--LVQHCPARTPQRGDEE------G
. ..: : ... : . . . . .:.. :. :... : . . .: . :
CCDS45 ENWEKPKPPL-ASAEGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSG
280 290 300 310 320 330
860 870 880
pF1KSD LGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRG--------------SWAQD-----------
. :.: : .. .:.... ..:: ::
CCDS45 TSLSEDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLE
340 350 360 370 380 390
890 900 910 920
pF1KSD --------------------GDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDK
:.. . : .:. ::..:. :::: :::::.:: .:: ::
CCDS45 RHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDK
400 410 420 430 440 450
930 940 950 960 970 980
pF1KSD RLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGC
::: ..:::: :...: :::...::: .::::::..::::: ::.::: ::..:.:.::
CCDS45 RLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGC
460 470 480 490 500 510
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD SWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPAD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFR
:: .::::... : :: ::::: .:: :.:.:: :: : :::: ..:..:......:
CCDS45 SWLSVSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELR
520 530 540 550 560 570
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD LAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCN
::::..:::.:::..:: : :: ::::::.:. : : .:::: : : .:..::.:::.
CCDS45 LAGLELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCH
580 590 600 610 620 630
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD KLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS
.:::. : .:: . .:::.:.:.. .:: .. . . . : .:::. : :
CCDS45 RLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRC-PEEKLLLKDS
640 650 660 670 680 690
>>CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (878 aa)
initn: 861 init1: 640 opt: 643 Z-score: 510.1 bits: 105.9 E(32554): 4.3e-22
Smith-Waterman score: 955; 39.4% identity (66.4% similar) in 414 aa overlap (34-438:83-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EEERIRYSQRLRGTMRRRYEDDGISDDEIEGKRTFDLEEKLHTNKYNANFVTFMEGKDFN
:. :: : . .: . . . :....
CCDS55 CEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLT
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVKMCVGSRRMVDVMDVNTQKGIEMTM
::....... :.. ..::::. .:.:.::: ::. ::: . .::.::. : .: .
CCDS55 VEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKL
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQRPSTVDFIDWVDNMWPRHLKESQTE
.....:: . . :::. :::::::: ::: :.:. :. : ..::.:.::..
CCDS55 GDFVKYYYSGK--REKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEE-------
180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KSD STNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGTSVWYHIHQGGKVFWLIPPTAHNLEL
..: :.:::::::::: :::::.::::::::::. .: :.:.:: :: :: :
CCDS55 ---CVFE--RPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIRPTNANLTL
230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIPSGWIHAVYTPTDTLVFGGNFLHSF
.: : :..:...:.::.:. : . .::: :. ::.:::::: ::.: :.::::::::.
CCDS55 FECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSL
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KSD NIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYV----LERYVYCITNRSHLTKEFQKESL
:: :::: :.:: : . . ::.: . .:::: :. . :: : .. . . .
CCDS55 NIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]