FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1074, 1709 aa
1>>>pF1KSDA1074 1709 - 1709 aa - 1709 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.9448+/-0.00183; mu= -26.3251+/- 0.108
mean_var=645.1018+/-136.383, 0's: 0 Z-trim(107.5): 229 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.050496
statistics sampled from 9440 (9599) to 9440 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 6.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41499.1 ANKRD26 gene_id:22852|Hs108|chr10 (1710) 10889 810.6 0
CCDS45621.1 CCDC144A gene_id:9720|Hs108|chr17 (1427) 2362 189.4 7.8e-47
CCDS74543.1 ANKRD36B gene_id:57730|Hs108|chr2 (1353) 899 82.8 9.1e-15
CCDS54379.1 ANKRD36 gene_id:375248|Hs108|chr2 (1941) 896 82.7 1.4e-14
CCDS67439.1 ANKRD62 gene_id:342850|Hs108|chr18 ( 917) 823 77.1 3.1e-13
CCDS54182.1 ANKRD30B gene_id:374860|Hs108|chr18 (1392) 824 77.3 4.1e-13
CCDS73609.1 POTEM gene_id:641455|Hs108|chr14 ( 508) 750 71.6 7.7e-12
CCDS43828.1 ANKRD20A4 gene_id:728747|Hs108|chr9 ( 823) 755 72.1 8.8e-12
CCDS35029.1 ANKRD20A3 gene_id:441425|Hs108|chr9 ( 823) 754 72.1 9.2e-12
CCDS35028.1 ANKRD20A2 gene_id:441430|Hs108|chr9 ( 823) 754 72.1 9.2e-12
CCDS73690.1 POTEB3 gene_id:102724631|Hs108|chr15 ( 581) 748 71.5 9.5e-12
CCDS74808.1 POTEH gene_id:23784|Hs108|chr22 ( 545) 746 71.4 9.9e-12
CCDS6620.1 ANKRD20A1 gene_id:84210|Hs108|chr9 ( 823) 752 71.9 1e-11
CCDS73610.1 POTEG gene_id:404785|Hs108|chr14 ( 508) 744 71.2 1e-11
CCDS59250.1 POTEB gene_id:100996331|Hs108|chr15 ( 544) 743 71.2 1.2e-11
CCDS59248.1 POTEB2 gene_id:100287399|Hs108|chr15 ( 544) 743 71.2 1.2e-11
CCDS45835.1 POTEC gene_id:388468|Hs108|chr18 ( 542) 741 71.0 1.3e-11
CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 750 71.9 1.4e-11
CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 748 71.7 1.6e-11
CCDS13562.1 POTED gene_id:317754|Hs108|chr21 ( 584) 737 70.7 1.7e-11
CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 746 71.6 1.7e-11
CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 746 71.6 1.7e-11
CCDS55311.1 ANKRD18A gene_id:253650|Hs108|chr9 ( 992) 720 69.6 6e-11
>>CCDS41499.1 ANKRD26 gene_id:22852|Hs108|chr10 (1710 aa)
initn: 6985 init1: 6985 opt: 10889 Z-score: 4310.4 bits: 810.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10889; 99.9% identity (99.9% similar) in 1710 aa overlap (1-1709:1-1710)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKKIFSKKGESPLGSFARRRRSSAGGGGEPGEGAYSQPGYHVRDRDLGKIHKAASAGNVA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKKIFSKKGESPLGSFARRQRSSAGGGGEPGEGAYSQPGYHVRDRDLGKIHKAASAGNVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KVQQILLLRKNGLNDRDKMNRTALHLACANGHPEVVTLLVDRKCQLNVCDNENRTALMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVQQILLLRKNGLNDRDKMNRTALHLACANGHPEVVTLLVDRKCQLNVCDNENRTALMKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQCQEEKCATILLEHGADPNLADVHGNTALHYAVYNEDISVATKLLLYDANIEAKNKDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VQCQEEKCATILLEHGADPNLADVHGNTALHYAVYNEDISVATKLLLYDANIEAKNKDDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TPLLLAVSGKKQQMVEFLIKKKANVNAVDKLESSHQLISEYKEERIPKHSSQNSNSVDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TPLLLAVSGKKQQMVEFLIKKKANVNAVDKLESSHQLISEYKEERIPKHSSQNSNSVDES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SEDSLSRLSGKPGVDDSWPTSDDEDLNFDTKNVPKPSLAKLMTASQQSRKNLEATYGTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SEDSLSRLSGKPGVDDSWPTSDDEDLNFDTKNVPKPSLAKLMTASQQSRKNLEATYGTVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TGNRTLFEDRDSDSQDEVVVESLPTTSIKVQCFSHPTYQSPDLLPKPSHKSLANPGLMKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TGNRTLFEDRDSDSQDEVVVESLPTTSIKVQCFSHPTYQSPDLLPKPSHKSLANPGLMKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EPTKPGIAKKENGIDIIESAPLEQTNNDNLTYVDEVHKNNRSDMMSALGLGQEEDIESPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EPTKPGIAKKENGIDIIESAPLEQTNNDNLTYVDEVHKNNRSDMMSALGLGQEEDIESPW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DSESISENFPQKYVDPLAGAADGKEKNIGNEQAEDVFYIPSCMSGSRNFKMAKLEDTRNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSESISENFPQKYVDPLAGAADGKEKNIGNEQAEDVFYIPSCMSGSRNFKMAKLEDTRNV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GMPVAHMESPERYLHLKPTIEMKDSVPNKAGGMKDVQTSKAAEHDLEVASEEEQEREGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GMPVAHMESPERYLHLKPTIEMKDSVPNKAGGMKDVQTSKAAEHDLEVASEEEQEREGSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NNQPQVEEERKKHRNNEMEVSANIHDGATDDAEDDDDDDGLIQKRKSGETDHQQFPRKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NNQPQVEEERKKHRNNEMEVSANIHDGATDDAEDDDDDDGLIQKRKSGETDHQQFPRKEN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD KEYAS-GPALQMKEVKSTEKEKRTSKESVNSPVFGKASLLTGGLLQVDDDSSLSEIDEDE
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KEYASSGPALQMKEVKSTEKEKRTSKESVNSPVFGKASLLTGGLLQVDDDSSLSEIDEDE
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD GRPTKKTSNEKNKVKNQIQSMDDVDDLTQSSETASEDCELPHSSYKNFMLLIEQLGMECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GRPTKKTSNEKNKVKNQIQSMDDVDDLTQSSETASEDCELPHSSYKNFMLLIEQLGMECK
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD DSVSLLKIQDAALSCERLLELKKNHCELLTVKIKKMEDKVNVLQRELSETKEIKSQLEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSVSLLKIQDAALSCERLLELKKNHCELLTVKIKKMEDKVNVLQRELSETKEIKSQLEHQ
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KVEWERELCSLRFSLNQEEEKRRNADTLYEKIREQLRRKEEQYRKEVEVKQQLELSLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVEWERELCSLRFSLNQEEEKRRNADTLYEKIREQLRRKEEQYRKEVEVKQQLELSLQTL
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD EMELRTVKSNLNQVVQERNDAQRQLSREQNARMLQDGILTNHLSKQKEIEMAQKKMNSEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EMELRTVKSNLNQVVQERNDAQRQLSREQNARMLQDGILTNHLSKQKEIEMAQKKMNSEN
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD SHSHEEEKDLSHKNSMLQEEIAMLRLEIDTIKNQNQEKEKKCFEDLKIVKEKNEDLQKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHSHEEEKDLSHKNSMLQEEIAMLRLEIDTIKNQNQEKEKKCFEDLKIVKEKNEDLQKTI
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD KQNEETLTQTISQYNGRLSVLTAENAMLNSKLENEKQSKERLEAEVESYHSRLAAAIHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KQNEETLTQTISQYNGRLSVLTAENAMLNSKLENEKQSKERLEAEVESYHSRLAAAIHDR
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DQSETSKRELELAFQRARDECSRLQDKMNFDVSNLKDNNEILSQQLFKTESKLNSLEIEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DQSETSKRELELAFQRARDECSRLQDKMNFDVSNLKDNNEILSQQLFKTESKLNSLEIEF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD HHTRDALREKTLGLERVQKDLSQTQCQMKEMEQKYQNEQVKVNKYIGKQESVEERLSQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HHTRDALREKTLGLERVQKDLSQTQCQMKEMEQKYQNEQVKVNKYIGKQESVEERLSQLQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD SENMLLRQQLDDAHNKADNKEKTVINIQDQFHAIVQKLQAESEKQSLLLEERNKELISEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SENMLLRQQLDDAHNKADNKEKTVINIQDQFHAIVQKLQAESEKQSLLLEERNKELISEC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD NHLKERQYQYENEKAEREVVVRQLQQELADTLKKQSMSEASLEVTSRYRINLEDETQDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NHLKERQYQYENEKAEREVVVRQLQQELADTLKKQSMSEASLEVTSRYRINLEDETQDLK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD KKLGQIRNQLQEAQDRHTEAVRCAEKMQDHKQKLEKDNAKLKVTVKKQMDKIEELQKNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KKLGQIRNQLQEAQDRHTEAVRCAEKMQDHKQKLEKDNAKLKVTVKKQMDKIEELQKNLL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD NANLSEDEKEQLKKLMELKQSLECNLDQEMKKNVELEREITGFKNLLKMTRKKLNEYENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NANLSEDEKEQLKKLMELKQSLECNLDQEMKKNVELEREITGFKNLLKMTRKKLNEYENG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD EFSFHGDLKTSQFEMDIQINKLKHKIDDLTAELETAGSKCLHLDTKNQILQEELLSMKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EFSFHGDLKTSQFEMDIQINKLKHKIDDLTAELETAGSKCLHLDTKNQILQEELLSMKTV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD QKKCEKLQKNKKKLEQEVINLRSHIERNMVELGQVKQYKQEIEERARQEIAEKLKEVNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QKKCEKLQKNKKKLEQEVINLRSHIERNMVELGQVKQYKQEIEERARQEIAEKLKEVNLF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD LQAQAASQENLEQFRENNFASMKSQMELRIKDLESELSKIKTSQEDFNKTELEKYKQLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQAQAASQENLEQFRENNFASMKSQMELRIKDLESELSKIKTSQEDFNKTELEKYKQLYL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KSD EELKVRKSLSSKLTKTNERLAEVNTKLLVEKQQSRSLFTTLTTRPVMEPPCVGNLNNSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EELKVRKSLSSKLTKTNERLAEVNTKLLVEKQQSRSLFTTLTTRPVMEPPCVGNLNNSLD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD LNRKLIPRENLVISTSNPRASNNSMENYLSKMQQELEKNITRELKEAAAELESGSIASPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNRKLIPRENLVISTSNPRASNNSMENYLSKMQQELEKNITRELKEAAAELESGSIASPL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700
pF1KSD GSTDESNLNQDLVWKASREYVQVLKKNYMI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSTDESNLNQDLVWKASREYVQVLKKNYMI
1690 1700 1710
>>CCDS45621.1 CCDC144A gene_id:9720|Hs108|chr17 (1427 aa)
initn: 2462 init1: 863 opt: 2362 Z-score: 954.3 bits: 189.4 E(32554): 7.8e-47
Smith-Waterman score: 2952; 40.2% identity (60.2% similar) in 1668 aa overlap (21-1663:55-1379)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKKIFSKKGESPLGSFARRRRSSAGGGGEPGEGAYSQPGYHVRDRDLGKI
..:.:. .. :::: .:: . :: .:::..
CCDS45 KTPSVGSQGDQWYLGYPGDQWSSGFPYSWWKNSVGSESKHGEGALDQPQHDVRLEDLGEL
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KSD HKAASAGNVAKVQQILLLRKNGLNDRDKMNRTALHLACANGHPEVVTLLVDRKCQLNVCD
:.:: .:.: :..:: .:.. ::. ... .:. :: . .. :
CCDS45 HRAARSGDVPGVEHILAPGDTGVDKRDR-KKSIQQLV-----PEYKEKQTPESLPQNNNP
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KSD NENRTAL-MKAVQCQEEKCATILLEHGADPNLADVHGNTALHYAVYNEDISVATKLLLYD
. . : : .. ::. : . : . .: . :. : ::: : .
CCDS45 DWHPTNLTLSDETCQRSKNLKV------DDKCPSVSPSMP-------ENQS-ATKEL-GQ
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ANIEAKNKDDLTPLLLAVSGKKQQMVEFLIKKKANVNAVDKLESSHQLISEYKEERIPKH
:. ..: : .:: ::. : :.. : :. :.. :.
CCDS45 MNLTEREKMDTGVVLL--SGN------------------DTLHDLCQ--SQLPENKESKE
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SSQNSNSVDESSEDSLSRLSGKPGVDDSWP--TSDDEDL--NFDTKNVP-KPSLAKLMTA
. :.: . .::. ::.: ... : ::.. .. . : ...: : : ..
CCDS45 AEQDS---ELTSEEEQERLKG---CENKQPQKTSQEPEMAKDCDREDIPIYPVLPHV---
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SQQSRKNLEATYGTVRTGNRT-LFEDRDSDSQDEVVVE-SLPTTSIKVQCFSHPTYQSPD
:. ... : .. :. : .. .. :. . ..:. . ... : .. :
CCDS45 --QKSEEMWIEQGKLEWKNQLKLVINELKQRFGEIYEKYKIPACPEEEPLLDNST-RGTD
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LLPKPSHKSLANPGLMKEEPTKPGIAKKENGIDIIESAPLEQTNNDNLTYVDEVHKNNRS
. : . . :: .:. .. ... ..:. : :: .. .: . . . . :
CCDS45 VKDIPFNLTNNIPGCEEEDASEISVSV------VFETFP-EQ-KEPSLKNIIHPYYHPYS
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DMMSALGLGQEEDIESPWDSESISENFPQKYVD--PLAGAADGKEKNIGNEQAEDVFYIP
:..: . . .. . :: . : : : . .::. :. . :
CCDS45 --------GSQEHVCQSSSKFHLHENKLDCDNDNKPGIGHIFSTDKNFHNDASTKKARNP
390 400 410 420 430
470 480 490 500 510
pF1KSD SC-MSGSRNFKMAKLEDTRNVGMPVAHMESPERYLHLKPTIEMKDSVPNKAGGMKDVQTS
: .. . :. :.:... . : . : ::: .: .:.: . ..:
CCDS45 EVVMVEMKEDQEFDLQMTKNMNQN-SDSGSTNNYKSLKPKLENLSSLPPDSDRTSEVYLH
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KAAEHDL-----EVASEEEQ----EREGSENNQPQVEEERKKHRNNEMEVSANIHDGATD
. ..:. :: . ::. ..: . .. .:::: .:::.: :.:... ::.:
CCDS45 EELQQDMQKFKNEVNTLEEEFLALKKEDVQLHK-DVEEEMEKHRSNSTELSGTLTDGTTV
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KSD DAEDDDDDDGLIQKRKSGETDHQQFPRKENKEYASGPALQMKEVKSTEKEKRTSKESVNS
.::::: .::.::::: :.
CCDS45 G----NDDDGL----------NQQIPRKENGEH---------------------------
560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KSD PVFGKASLLTGGLLQVDDDSSLSEIDEDEGRPTKKTSNEKNKVKNQIQSMDDVDDLTQSS
::. :::::::.::::: : : . :
CCDS45 -----------------------------DRPADKTSNEKNEVKNQIYPEADFADSMEPS
580 590 600
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ETASEDCELPHSSYKNFMLLIEQLGMECKDSVSLLKIQDAALSCERLLELKKNHCELLTV
: ::::::: :: :.::::::::: :: :::.:: .:::. ::.::.::.:::. :::
CCDS45 EIASEDCELSHSVYENFMLLIEQLRMEYKDSASLPRIQDTFCLCEHLLKLKNNHCDQLTV
610 620 630 640 650 660
760 770 780 790 800 810
pF1KSD KIKKMEDKVNVLQRELSETKEIKSQLEHQKVEWERELCSLRFSLNQEEEKRRNADTLYEK
:.:.::. :.::: ::::::. : ::: ::.:::.:: .::..:.::.:..:::: ::.:
CCDS45 KLKQMENMVSVLQNELSETKKTKLQLELQKIEWEKELYDLRLALKQENEEKRNADMLYNK
670 680 690 700 710 720
820 830 840 850 860 870
pF1KSD IREQLRRKEEQYRKEVEVKQQLELSLQTLEMELRTVKSNLNQVVQERNDAQRQLSREQNA
:::: :::. : ::.::::. .:. : :::::..::. :::::::::.:::.::.:
CCDS45 DSEQLRIKEEECGKVVETKQQLKWNLRRLVKELRTVRNNLDLVVQERNDAQKQLSEEQDA
730 740 750 760 770 780
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RMLQDGILTNHLSKQKEIEMAQKKMNSENSHSHEEEKDLSHKNSMLQEEIAMLRLEIDTI
:.::: ::: :::::.:::.:::::: :: :..:::: :.. :::::::.::::::::
CCDS45 RILQDQILT---SKQKELEMARKKMNSEISHRHQKEKDLFHEDCMLQEEIALLRLEIDTI
790 800 810 820 830
940 950 960 970 980 990
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::::..:::: :::.. :::::..::: :: ::::::.:: ::.:.:. ::::: .:::.
CCDS45 KNQNKQKEKKYFEDIEAVKEKNDNLQKIIKLNEETLTETILQYSGQLNNLTAENKILNSE
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::: ::..:::: :.:::. :::::..: :::.:. :.:.: :::.:.: ::.:::. :
CCDS45 LENGKQNQERLEIEMESYRCRLAAAVRDCDQSQTA-RDLKLDFQRTRQEWVRLHDKMKVD
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.:.:. .:::::..: ..:::.:::.:..:.::::: ...: :::::.:::::::: ::
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:: :: :: :..:::.:::::::::::::::::::::::::::.::...::: .:::::
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:. ...:::::::: : :.:.::::..: ::::::. : :.::: :..
CCDS45 HSAAKNLQAESEKQILSLQEKNKELMDEYNHLKERMDQCEKEKAGRKI------------
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:::
CCDS45 --------------------------------------------------------DLTE
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::. :.:::::..:..:: . :.:::..::.:: ::::::.:.:::.::.:..::::
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.: :... .: ::::::.:: :::.:. : :: ::: :.:.: :.::.: .:.:.::::
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:::::::.:.::::: ::::::::.::.:::::.:::.:::..:..::: .:::.:.:
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:::.: ::::::. .::::.: :::::::.: :::: :::.. :.. ..::
CCDS45 VEKEQTRSRSLFTAYATRPVLESPCVGNLNDSEGLNRKHIPRKK--------RSALKDME
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.:: ::::.:....: :.
CCDS45 SYLLKMQQKLQNDLTAEVAGSSQTGLHRIPQCSSFSSSSLHLLLCSICQPFFLILQLLLN
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:::: .: .:::::.::::::::.: : : ... :. . .:. . . .
CCDS74 LAVSRRKVKMVEFLLKKKANVNAIDYLGRSALILAVTLGEKDIVILLLQHNIDVFSRDVY
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. .:: :. .. : . . ::: .... : :. . :. :.... : .:.
CCDS74 GKLAEDYASEAENRVIFDLIYEYKRKRYEDLPINSNPVSPQKQRAEKATSDDKDSVSNIA
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: : . .... : :: .: : . . . : :: . . .
CCDS74 TEIKEGPISGTVSSQKQPAEKATSDEKDSVSNIATEIKEGQQSGTVSPQKQSAQKVIFKK
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. :: : : . :. .: . : ..... ..
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CCDS74 ALKATTDEEGSVSNIATEIKDGEKSGTVSSQKKPALKATSDEKDSFSNITREKKDGEISR
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. .. : :.. :: .. : :... : : : ....:. : . :. .:
CCDS74 TVSSQK-PPALKATSVKEDSVLNIAREKKDGEKSRTVSFEQPPGLKATRDEKDSLLNIAR
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..:. .:. : .:.:. :: .: :.:... .: : :. .:::
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. .:::::.: ::.::. :::.:.::: . . :: .:::.: :.::: : ::::..
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:.: ..:.::: :::: ::::::: :: : ..:..:::.:.:::::..:.: :::..:
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CCDS74 ELAFQGTVDKCRHLQENLNSHVL-------ILSLQLSKAESKSRVLKTELHYTGEALKEK
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
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CCDS74 ALVFEHVQSELKQKQSQMKDIEKMYKSGYNTMEKCIEKQE----RFCQLKKQNMLLQQQL
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CCDS74 S
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CCDS54 TFNVMFDQIEEKFTSLNKSAGVSPQKQSAQ--KVIFKKKVSLLNIATRITGGWKSGTEYP
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CCDS54 ENLPTLKATIENKNS-VLNTATKMKDVQTSTPAEQDLEMASEGEQKRLEEYENNQPQVKN
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CCDS54 QIHSRDDLDDIIQSSQTVSEDGDSLCCNCKNVILLIDQHEMKCKDCVHLLKIKNTFCLWK
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CCDS54 -----------------------------------------SET----DEKEDLLHENRL
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CCDS54 QLAALTDENTTLRSKLEKQRESRQRLETEMQSYHCRLNAARCDHDQSHSSKRDQELAFQG
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CCDS54 ADNQEKAILNIQARCDARVQNLQAECRKHRLLLEEDNKMLVNELNHSKEKECQYEKEKAE
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CCDS54 REVAVRQLQQKRDDVLNKGSATKALLDASSRHCTYLENGMQDSRKKLDQMRSQFQEIQDQ
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: ..::...:. :::: ... .. .::: :.::.:.: : ...:
CCDS54 LTATIRCTKEMEGDTQKLEVEHVMMRKIIKKQDDQIERLEKILQHSSLMLQVFES
1890 1900 1910 1920 1930 1940
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pF1KSD ELKQSLECNLDQEMKKNVELEREITGFKNLLKMTRKKLNEYENGEFSFHGDLKTSQFEMD
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CCDS67 MEVRGSFLAACRRRMATWRKNRDKDG-FSNPGYRVRQKDLGMIHKAAIAGD
10 20 30 40 50
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: ::.. .::: : :::::: ::::: ::::.:.: ::. :: ::::::. :.::::::.
CCDS67 VNKVMESILLRLNDLNDRDKKNRTALLLACAHGRPGVVADLVARKCQLNLTDSENRTALI
60 70 80 90 100 110
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CCDS67 KAVQCQEEVCASILLEHGANPNVRDMYGNTALHYAIDNENISMARKLLAYGADIEARSQD
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: :::::. ::.::: ::.::: ...:.:
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.::.. .:: :
CCDS67 --------------NIDVFC-----------------------------------QDI-S
230
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: ::: . . : :.. :
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:: ...... .: :..:.:.. :.:::..:: :::: :
CCDS67 --GM-ISEYKANKR--------------------CKSLQNSNS-EQDLEMTSEGEQERLE
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: :..::::::. :: ::..:::: :.: .::... .:: : ::.: :. . :..: :
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::: :.
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350
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: ..::::::.:::.:: ::..:.. ::: .::: :::.:. .:::::::: ::
CCDS67 ---DRLARKTSNEKSKVKSQIYFTDDLNDISGSSEKTSEDDELPYSDDENFMLLIEQSGM
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:::: ::: : ..:. .: : .: .: .:: : ::..::.....:::. :::: . :::
CCDS67 ECKDFVSLSKSKNATAACGRSIEDQKCYCERLKVKFQKMKNNISVLQKVLSETDKTKSQS
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:::... ...::.::: :.:.::.: .:. :::: :.:. ::::: ..:::.: .:.:
CCDS67 EHQNLQGKKKLCNLRFILQQQEEERIKAEELYEKDIEELKIMEEQYRTQTEVKKQSKLTL
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..::.::.::.:: ::
CCDS67 KSLEVELKTVRSNSNQ--------------------------------------------
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: :.::.:.:: ..: ....::: :::::::::.:::: :.: :.:..:.::.::::.
CCDS67 --NFHTHERERDLWQENHLMRDEIARLRLEIDTIKHQNQETENKYFKDIEIIKENNEDLE
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::.:.:::.::.::..:. .:.:: ::.::::.:..:::: :::.:.:::. :::::.
CCDS67 KTLKRNEEALTKTITRYSKELNVLMDENTMLNSELQKEKQSMSRLETEMESYRCRLAAAL
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pF1KSD HDRDQSETSKRELELAFQRARDECSRLQDKMNFDVSNLKDNNEILSQQLFKTESKLNSLE
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CCDS67 CDHDQRQSSKRDLQLAFQSTVNEWCHLQEDTNSHI-------QILSQQLSKAESTSSGLE
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:.:. :.::.:::: .:..: ::.:: .....:. :::.: ..::. ::.:::. :
CCDS67 TELHYEREALKEKTLHIEHMQGVLSRTQRRLEDIEHMYQNDQPILEKYVRKQQSVEDGLF
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::::.:.: .:: .::..::::.:::.:::: . . :.::::: .: ::: :: :.
CCDS67 QLQSQNLLYQQQCNDARKKADNQEKTIINIQVKCEDTVEKLQAECRK----LEENNKGLM
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pF1KSD SECNHLKERQYQYENEKAEREVVVRQLQQELADTLKKQSMSEASLEVTSRYRINLEDETQ
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CCDS67 KECTLLKERQCQYEKEKEEREVVRRQLQREVDDALNKQLLLEAMLEISSERRINLEDEAQ
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CCDS67 SLKKKLGQMRSQVCMKLSMSTVTL
900 910
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10 20 30 40 50
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CCDS54 MKRLLAAAGKGVRGPEPPNPFSERVYTEKDYGTIYFGDLGKIHT
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CCDS54 AASRGQVQKLEKMTVGKKPVNLNKRDMKKRTALHWACVNGHAEVVTFLVDRKCQLNVLDG
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CCDS54 EGRTPLMKALQCEREACANILIDAGADLNYVDVYGNTALHYAVYSENLLMVATLLSYGAV
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CCDS54 IEVQNKASLTPLLLAIQKRSKQTVEFLLTKNANANAFNESKCTALMLAICEGSSEIVGML
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.:: :: .:: . : .. ::. . : ... : . :
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. .: :. :. : . ... . .:.: . .. ... ::. .. ...
CCDS54 DEAAPLAERTPDTAESLLEKTPDEAARLVEGTSAKIQCLGKATSGKFEQSTEETPRKILR
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330 340 350
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. : ::.:..: . : .. ..: : . . .: : :
CCDS54 PTKETSEKFSWPAKERSRKITWEEKETSVKTECVAGVTPNKTEVLEKGTSNMIACP--TK
350 360 370 380 390
360 370 380 390
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: :: . ... : : ::.. ....: ::
CCDS54 ETSTKASTNVDVSSVEPIFSLFGTRTIENSQCTKVEEDFNLATKIISKSAAQNYTCLPDA
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400 410 420 430
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:: ... :.. :.: .::: : ::: : : :.. :: ..
CCDS54 TYQKDIKTINHKIEDQMFPSESKREEDEEYSWDSGSLFESSAKTQVCIPESMYQKVMEIN
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: .: .: .. ::: : ..:
CCDS54 REVEELPEKPSAFKPAVEMQKTVPNKAFELKNEQTLRAAQMFPSESKQKDDEENSWDSES
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:.:. . ...: .:::.. :.:..: .:
CCDS54 PCETVSQKDVYLPKA-THQKEFDTLSGKLEESPVKDGLLKPTCGRKVSLPNKALELKDRE
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CCDS54 TFKAESPDKDGLLKPTCGRKVSLPNKALELKDRETLKAESPDNDGLLKPTCGRKVSLPNK
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... . :.: . .: ::...:.. . ::. :.: :
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: .:. ..::..: ::::::
CCDS54 EQTLRIQDIELKSVTSNLNQV---------------------------------------
1050 1060 1070
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.:: :.: ...:.:. ::: .:.::::::.::.:::. :::.:: ::.:.::.: ::
CCDS54 AELQMTLKLKQKTVTKRASQYREQLKVLTAENTMLTSKLK-EKQDKEILETEIESHHPRL
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:.:..:.::: ::... ::::. : : . :: :: :::: :::.: : :.... :
CCDS54 ASALQDHDQSVTSRKNQELAFHSAGD--APLQGIMNVDVSNTIYNNEVLHQPLYEAQRKS
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CCDS54 KSPKINLNYAGDDLRENALVSEHAQRDRCETQCQMKKAEHMYQNEQDNVDKHTEQQESLE
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CCDS54 QKLFQLESKNRWLRQQLVYAHKKV-NKSKVTINI--QFPEM--KMQRH-------LNEKN
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pF1KSD KELISECNHLKERQYQYENEKAEREVVVRQLQQELADTLKKQSMSEASLEVTSRYRINLE
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CCDS54 EEVFNYGNHLKERIDQYEKEKAEREVSIKKYKY-FSNFLKESGLG
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pF1KSD DETQDLKKKLGQIRNQLQEAQDRHTEAVRCAEKMQDHKQKLEKDNAKLKVTVKKQMDKIE
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10 20
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CCDS73 MGKWCRHCFPWCRGSGKSNVGTSGDHDDSAMKTLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSKVGPW
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pF1KSD GEPGEGAYSQPGYHVRDRDLGKIHKAASAGNVAKVQQILLLRKNGLNDRDKMNRTALHLA
:. ..:. .: :::: .:: :.:.:: :.: . . :..:. . .: .::..:::::::
CCDS73 GDYDDSAFMEPRYHVRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLKDTDMNKKDKQKRTALHLA
130 140 150 160 170 180
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:::. ::: ::.::.::::. ::..:::: :::::::..:: .:::::.:::. : .::
CCDS73 SANGNSEVVKLLLDRRCQLNILDNKKRTALTKAVQCQEDECALMLLEHGTDPNIPDEYGN
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pF1KSD TALHYAVYNEDISVATKLLLYDANIEAKNKDDLTPLLLAVSGKKQQMVEFLIKKKANVNA
::::::.:::: .: :::: :.::.::: ::::::.: .:::.:.::::::::.::
CCDS73 TALHYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKHGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNA
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pF1KSD VDK---------------------LE---------------------SSH----QLISEY
.:. :: : : ::.:.:
CCDS73 LDRYGRTVLILAVCCGSASIVSLLLEQNIDVSSQDLSGQTAREYAVSSRHNVICQLLSDY
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::..: : ::.::: .. .::. .::.:. ..: : :.. ..: .
CCDS73 KEKQILKVSSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKGS---ENSQPEEMSQEPEINKGGDRKVEE
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. : .. . .:: .:. .:. :. : : . . ...: : . :
CCDS73 EMKKHGSTHMGFPENLPNG-ATADNGDDGLIPPRKSRTPES---QQFPDTENEQY---HS
420 430 440 450 460 470
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:. : . :... : :....: . ..:. :.. :.
CCDS73 DEQN-DTQKQLSEEQ--NTGILQDEI----LIHEEKQIEVAENEF
480 490 500
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pF1KSD HKNNRSDMMSALGLGQEEDIESPWDSESISENFPQKYVDPLAGAADGKEKNIGNEQAEDV
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10 20 30 40 50 60
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