Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1075
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1075, 1409 aa
1>>>pF1KSDA1075 1409 - 1409 aa - 1409 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8228+/-0.00113; mu= -8.3984+/- 0.068
mean_var=513.3656+/-106.966, 0's: 0 Z-trim(116.1): 86 B-trim: 437 in 1/52
Lambda= 0.056606
statistics sampled from 16579 (16659) to 16579 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.512), width: 16
Scan time: 5.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8843.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1409) 9880 822.7 0
CCDS8842.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1419) 9743 811.5 0
CCDS8844.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1285) 9048 754.7 3.9e-217
CCDS2407.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1735) 1595 146.2 8e-34
CCDS5506.2 TNS3 gene_id:64759|Hs108|chr7 (1445) 1589 145.6 9.9e-34
CCDS77528.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1714) 1590 145.7 1.1e-33
CCDS77529.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1721) 1589 145.7 1.1e-33
CCDS11368.1 TNS4 gene_id:84951|Hs108|chr17 ( 715) 1072 103.1 3e-21
>>CCDS8843.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1409 aa)
initn: 9880 init1: 9880 opt: 9880 Z-score: 4378.5 bits: 822.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9880; 99.9% identity (99.9% similar) in 1409 aa overlap (1-1409:1-1409)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSSGPVERLLRALGRRDSSRAASRPRKAEPHSFREKVFRKKPPVCAVCKVTIDGTGVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MKSSGPVERLLRALGRRDSSRAASRPRKAEPHSFREKVFRKKPPVCAVCKVTIDGTGVSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RVCKVATHRKCEAKVTSACQALPPVELRRNTAPVRRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RVCKVATHRKCEAKVTSACQALPPVELRRNTAPVRRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRHRGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRHRGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKAMETWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKAMETWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVATELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 IVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVATELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLVYTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLVYTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGPQLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGPQLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWDSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWDSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSGHSSTLTTEPAAESPGRPPPTAAERQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSGHSSTLTTEPAAESPGRPPPTAAERQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYRE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPEL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD YKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQPWKGDPVEQLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 YKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQPWKGDPVEQLVR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS88 HFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRIPSKDPLEETPEAPVP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD TNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400
pF1KSD CHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
1390 1400
>>CCDS8842.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1419 aa)
initn: 9739 init1: 9739 opt: 9743 Z-score: 4318.0 bits: 811.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9743; 99.1% identity (99.4% similar) in 1402 aa overlap (12-1409:18-1419)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKSSGPVERLLRALG---RRDSS-RAASRPRKAEPHSFREKVFRKKPPVCAVCK
.::: :..: : : .:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MDGGGVCVGRGDLLSSPQALGQLLRKESRPRRAMKPRKAEPHSFREKVFRKKPPVCAVCK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VTIDGTGVSCRVCKVATHRKCEAKVTSACQALPPVELRRNTAPVRRIEHLGSTKSLNHSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VTIDGTGVSCRVCKVATHRKCEAKVTSACQALPPVELRRNTAPVRRIEHLGSTKSLNHSK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRHRGHLRELAHVLQSKHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRHRGHLRELAHVLQSKHR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD DKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKAMETWLSADPQHVVVLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKAMETWLSADPQHVVVLY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVATELQPSQRRYISYFSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVATELQPSQRRYISYFSGL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLVYTSGVYHIAGPGPQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLVYTSGVYHIAGPGPQQL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD CISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGPQLTFPKDQLDEAWTDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGPQLTFPKDQLDEAWTDE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWDSYENFNQHHEDSVDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWDSYENFNQHHEDSVDGS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LTHTRGPLDGSPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSGHSSTLTTEPAAESPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LTHTRGPLDGSPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSGHSSTLTTEPAAESPGR
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PPPTAAERQELDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PPPTAAERQELDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HCSCRQGYREPCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 HCSCRQGYREPCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LYPYPPEMGKPATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYPYPPEMGKPATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLE
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD REAGEGWASEAGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 REAGEGWASEAGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSY
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TMCPEGRYGHPGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TMCPEGRYGHPGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGS
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD ISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVS
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QAGTGKAPELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QAGTGKAPELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLP
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD GLRHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GLRHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGLSQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD PPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD KFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQPW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD KGDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS88 KGDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRIPSKDP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD LEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD PAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400
pF1KSD KKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
1390 1400 1410
>>CCDS8844.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1285 aa)
initn: 9048 init1: 9048 opt: 9048 Z-score: 4011.8 bits: 754.7 E(32554): 3.9e-217
Smith-Waterman score: 9048; 99.9% identity (99.9% similar) in 1285 aa overlap (125-1409:1-1285)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRH
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKA
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KSD METWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 METWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVAT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLV
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KSD YTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 YTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGP
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTPRNDPSVSVDYNTTEPAVRWD
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPRQTPPAPSPEPPPPPMLSVSSDSG
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KSD HSSTLTTEPAAESPGRPPPTAAERQELDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 HSSTLTTEPAAESPGRPPPTAAERQELDRLLGGCGVASGGRGAGRETAILDDEEQPTVGG
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYREPCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYREPCGVPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYEGSPQGYA
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRAPGYREVVILEDPGLPALYPCPACE
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KSD EKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPGHPLPLLLPACGHHHAPMPDYSC
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGHPGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGHPGYPALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGE
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850 860 870
pF1KSD GRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAES
700 710 720 730 740 750
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTS
760 770 780 790 800 810
940 950 960 970 980 990
pF1KSD APTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 APTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGG
820 830 840 850 860 870
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD HSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 HSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPT
880 890 900 910 920 930
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD PAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDN
940 950 960 970 980 990
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD VPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAY
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD GLALKVATPPPSAQPWKGDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GLALKVATPPPSAQPWKGDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSI
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD SPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQA
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SPISLPCCLRIPSKDPLEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD VARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD WTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 WTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
1240 1250 1260 1270 1280
>>CCDS2407.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1735 aa)
initn: 2845 init1: 1285 opt: 1595 Z-score: 720.7 bits: 146.2 E(32554): 8e-34
Smith-Waterman score: 1781; 33.4% identity (54.4% similar) in 1283 aa overlap (120-1319:2-1169)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD NTAPVRRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARP
:.. :: .:::.::::::.:..::.
CCDS24 MSVSRTMEDSCELDLVYVTERIIAVSFPSTA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DEQRHRGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLC
.:. :..:::.:..:.::: .::::::::.: :.:.:. :: .::::.::.: :.:.:
CCDS24 NEENFRSNLREVAQMLKSKHGGNYLLFNLSERRPDITKLHAKVLEFGWPDLHTPALEKIC
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SICKAMETWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCE
::::::.:::.:::..::::. :::.:..::...::::::.:::.::::: ..:..: :
CCDS24 SICKAMDTWLNADPHNVVVLHNKGNRGRIGVVIAAYMHYSNISASADQALDRFAMKRFYE
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DKVATELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQ
::.. :::::::. ::::::::::.::..:::::.:.. .: :: : .:::.:::
CCDS24 DKIVPIGQPSQRRYVHYFSGLLSGSIKMNNKPLFLHHVIMHGIPNFESKGGCRPFLRIYQ
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SMQLVYTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTC
.:: :::::.:.: : . ..::..::.::::::... :::: :. : ..::::::::
CCDS24 AMQPVYTSGIYNIPGDSQTSVCITIEPGLLLKGDILLKCYHKKFRSPARDVIFRVQFHTC
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KSD TIHGPQLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTP-RNDPSVSVDYNTTE
.:: ..: :..::.:. :.::: ..:::::: .::::.: .: :::::::::..
CCDS24 AIHDLGVVFGKEDLDDAFKDDRFPEYGKVEFVFSYGPEKIQGMEHLENGPSVSVDYNTSD
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KSD PAVRWDSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPR---------QTPPAPSP
: .:::::.::. :..:... . ::.:::::: ::.:.. : :. :
CCDS24 PLIRWDSYDNFSGHRDDGMEEVVGHTQGPLDGSLYAKVKKKDSLHGSTGAVNATRPTLSA
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EPPP-PPMLSVSSDSGHS--STLTTEPAAESPGRPPPTAA----ERQELDRLLGGCGVAS
: ::::::::.: :: : . :: ::: :..::::::.: :.
CCDS24 TPNHVEHTLSVSSDSGNSTASTKTDKTDEPVPGASSATAALSPQEKRELDRLLSGFGLER
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KSD GGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYREPCGVPNGGYYRP
.:: .: : . .:. :: . :. .:: : . :::
CCDS24 EKQGAMYHTQHL--RSRPA--GGSAV-------PSSGRHVVPAQVHV------NGGALAS
460 470 480 490
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRAPG
: . . .: : . ... . . ::: :: : .: :.
CCDS24 ERETDILDDELPNQDGHSAG-SMGTLSSLDGVTNTSEGGYP---EALSPLTN--------
500 510 520 530 540
680 690 700 710 720 730
pF1KSD YREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPG
:: :: : .. .: : : :
CCDS24 ----------GLDKSYPM------------------------EPMVNGGGYPYESASRAG
550 560
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGHPGYPALVTYSYG
:: . : ::: .: ...:: : . :: ::..: :: :.
CCDS24 -------PAHAGHTAPM------RPSYSAQEGLAGYQR----EG--PHPAWPQPVTTSHY
570 580 590 600
800 810 820 830 840 850
pF1KSD GAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEI-PTE
. :: : . : .: . :.: . ... : . :... . . :
CCDS24 AHDPS-----GMFRSQSFSEAEPQLPPAPVRGGSSREAVQRGLNSWQQQQQQQQQPRPPP
610 620 630 640 650 660
860 870 880 890 900
pF1KSD EGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCSA----------
. .: .:: : .:: : .:.. :: ::. :: : .
CCDS24 RQQER----AHLESL--VASRPSPQPLAETPIPS----LPEFPRAASQQEIEQSIETLNM
670 680 690 700 710
910 920 930 940 950
pF1KSD ---SSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAP
. : .. ..::: :. : : . .: :. ..: : :..:. .: :
CCDS24 LMLDLEPASAAAPLHKSQSVPGAWPGASPLSSQPLSG-SSRQSH-----PLTQSRSGYIP
720 730 740 750 760
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD ELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPS---SPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGL---
: . ::: :: . ::. :: :. : : ..: : .::. ..::..
CCDS24 SGHSLGTPEP-APRASLESVPPGRSYSPYDY-QPCLAGPNQDFHS-KSPASSSLPAFLPT
770 780 790 800 810 820
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD RHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGL----
:.: ::. :: : : :. : . :. : :.: . . :.
CCDS24 THSP-PGPQQPPASLPGLTAQPLLSPKEATSDPSRTPEEEPLNLEGLVA-HRVAGVQARE
830 840 850 860 870 880
1070 1080 1090 1100
pF1KSD ---SQPPLPEKRHLPGPGQ------------QPGPWGPEQASSPARGIS-----------
..:: : .:. . :: .:: .: : :: ...
CCDS24 KQPAEPPAPLRRRAASDGQYENQSPEATSPRSPGVRSPVQCVSPELALTIALNPGGRPKE
890 900 910 920 930 940
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD -HHVTFAPLLSDNVPQTPE-PPTQESQSNVKFVQDT-SKFWYKPHLSRDQAIA-------
: .. . . .: :: . .: ... : . ::: : .
CCDS24 PHLHSYKEAFEEMEGTSPSSPPPSGVRSPPGLAKTPLSALGLKPHNPADILLHPTGVTRR
950 960 970 980 990 1000
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD -LLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQ---PWK-GDPVEQLVRHFL-IET
. ..: : ..: :. .. . ..:. : :: : . . :. : : . ...
CCDS24 RIQPEEDEGKVVVRLSEEPRSYVESVARTAVAGPRAQDSEPKSFSAPATQAYGHEIPLRN
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTA
: : .. . :: : ... : ..: : : :.: :.: .:: :. . .
CCDS24 GTLGGSFVS-PS-P-LSTSSPILSADSTSVGSFPSGE---SSDQGPRTPTQPLLESGFRS
1070 1080 1090 1100 1110
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLT
..: . . . . : .: .. . . : .: ::. . : ..:.:.
CCDS24 GSLGQPSPSAQRNYQSSSPLPTVGSSYSSPDYSLQHFSSSPE-SQARAQFSVAGVHTVPG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFAE
CCDS24 SPQARHRTVGTNTPPSPGFGWRAINPSMAAPSSPSLSHHQMMGPPGTGFHGSTVSSPQSS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>--
initn: 1322 init1: 696 opt: 1446 Z-score: 654.9 bits: 134.0 E(32554): 3.7e-30
Smith-Waterman score: 1450; 44.3% identity (66.4% similar) in 596 aa overlap (833-1409:1175-1735)
810 820 830 840 850 860
pF1KSD GRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEG-GDRYPLPG
:::: . : .. . : : : : :.
CCDS24 SSPDYSLQHFSSSPESQARAQFSVAGVHTVPGSPQ-ARHRTVGTNTPPSPGFGWRAINPS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
870 880 890 900 910
pF1KSD HLASAGPLASAESLEPVSWREGPSG---HSTLPRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPV
: ..: : ... :: : :.. ::.. ::.. ..:: : ..
CCDS24 MAAPSSPSLSHHQMM------GPPGTGFHGSTVSSPQS---SAATTPGSPSLCRHPAGVY
1210 1220 1230 1240 1250
920 930 940 950 960 970
pF1KSD QGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSGSGPEPLAPS-----P
: . . . . .: : :. :: .. :. : : :.. : .::
CCDS24 Q-VSGLHNKVATTPGS-PSLGRHPG------AHQGN-LASGLHSNAIASPGSPSLGRHLG
1260 1270 1280 1290 1300
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD VSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGPRGP--PDSPDGSP
: . :.:: .. . ::.: .:.. :: . .:.: : : :: :
CCDS24 GSGSVVPGSPC-LDRHVAYGGYS---TPEDRRPTLSRQSSASGYQAPSTPSFPVSPAYYP
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LTPVPSQMPWLVASPEPP---QSSPTPAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLPGPGQQPGP
:. : ::. :.:::::.: ... : ::. . : ..:
CCDS24 GLSSPATSP----SPDSAAFRQGSPTPALPEKRRMSV-GDRAGSLPNYATINGKVSSPVA
1370 1380 1390 1400 1410
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD WGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFWYKPHLSRD
: :::. : . :.:. : : . . :....:::::::::.::::..::.
CCDS24 SG---MSSPSGGST--VSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPEISRE
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSA--QPWKGDPVEQLVRHFLIET
::::::::..::::.:::::::.::::::.::..:::. : ::: ...:::::::::
CCDS24 QAIALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTIMQQNKKGDMTHELVRHFLIET
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTA
::.:::.::::.:: :::::::: :::: :..::: : : ..:: .:. .. :.: ..
CCDS24 GPRGVKLKGCPNEPNFGSLSALVYQHSIIPLALPCKLVIPNRDPTDESKDSSGPAN--ST
1540 1550 1560 1570 1580
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLT
::::.:::::.::...::. ::::::::...:.: .:. .: :. ..:::::::::::::
CCDS24 ADLLKQGAACNVLFVNSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATIVHFKVSAQGITLT
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDG-TTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFA
:::::::::::::.:..:: . :::.:.: . .: . .:.:::::.: :: .:.:::::
CCDS24 DNQRKLFFRRHYPLNTVTFCDLDPQERKWMKTEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACHLFA
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1390 1400
pF1KSD ELDPDQPAGAIVTFITKVLL--GQRK
::::.:::.:::.:..::.: ::..
CCDS24 ELDPNQPASAIVNFVSKVMLNAGQKR
1710 1720 1730
>>CCDS5506.2 TNS3 gene_id:64759|Hs108|chr7 (1445 aa)
initn: 2829 init1: 1272 opt: 1589 Z-score: 719.1 bits: 145.6 E(32554): 9.9e-34
Smith-Waterman score: 2350; 37.6% identity (58.8% similar) in 1341 aa overlap (125-1281:1-1316)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARPDEQRH
::. :::::.::::.:..::: .:. .
CCDS55 MEEGHGLDLTYITERIIAVSFPAGCSEESY
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLCSICKA
.:.:....:.::: :.::..::::::.:::.::::..: ::::::::::::.:.::::
CCDS55 LHNLQEVTRMLKSKHGDNYLVLNLSEKRYDLTKLNPKIMDVGWPELHAPPLDKMCTICKA
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KSD METWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCEDKVAT
.:.::... :::::..:.:.::..::..:.:::....::.::::: ..:.:: .:::..
CCDS55 QESWLNSNLQHVVVIHCRGGKGRIGVVISSYMHFTNVSASADQALDRFAMKKFYDDKVSA
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQSMQLV
.::::.::....:::::::..::.::::::.:.. : :. : .::::.::.:: :
CCDS55 LMQPSQKRYVQFLSGLLSGSVKMNASPLFLHFVILHGTPNFDTGGVCRPFLKLYQAMQPV
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KSD YTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTCTIHGP
::::.:... .:...:: .::: :::::::: :::: :.. : ..::.:::: ...:
CCDS55 YTSGIYNVGPENPSRICIVIEPAQLLKGDVMVKCYHKKYRSATRDVIFRLQFHTGAVQGY
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTP-RNDPSVSVDYNTTEPAVRW
:.: :..::.: :.::: ..::.:::..::::.:: :: .: ::::::.: .::
CCDS55 GLVFGKEDLDNASKDDRFPDYGKVELVFSATPEKIQGSEHLYNDHGVIVDYNTTDPLIRW
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500
pF1KSD DSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPRQTPPAPS-PEPPPP---P----
:::::. :.:: . ::.::.::: ::.:.. . : :. :. : :
CCDS55 DSYENL------SADGEVLHTQGPVDGSLYAKVRKKSSSDPGIPGGPQAIPATNSPDHSD
340 350 360 370 380
510 520 530 540 550
pF1KSD -MLSVSSDSGHSS-TLTTEPAAE--SPG-RPPPTAAERQELDRLLGGCGVASGG------
::::::::::. . :. . : .:: : .: :. :::.::.: :. . :
CCDS55 HTLSVSSDSGHSTASARTDKTEERLAPGTRRGLSAQEKAELDQLLSGFGLEDPGSSLKEM
390 400 410 420 430 440
560 570
pF1KSD -----RGAG-------------------RETAILDDEEQP--------TVGG-----GP-
. .: ::: ::::: .: ..: ::
CCDS55 TDARSKYSGTRHVVPAQVHVNGDAALKDRETDILDDE-MPHHDLHSVDSLGTLSSSEGPQ
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620
pF1KSD --HLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGY-----REPCG--VPNGGYYRPEGTLERRRLAYGGYE
::: . :. :.. .:. ..: : ::. : .: ::.: ..:. :
CCDS55 SAHLGPFTCHKS--SQNSLLSDGFGSNVGEDPQGTLVPDLGLGM-DGPYERER-TFGSRE
510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KSD GS-PQ-------------GYAEASMEKRRLCRS---LSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRA
. :: .:...:. . :. . : . :. :. . . :
CCDS55 PKQPQPLLRKPSVSAQMQAYGQSSYSTQTWVRQQQMVVAHQYSFAPD-GE---ARLVSRC
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710
pF1KSD PGYREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLR-------------LEREAGEGW
:. .. .: .: : : . ..:. .. : . : :.
CCDS55 PADNPGLVQAQPRVP-LTPTRGTSSRVAVQRGVGSGPHPPDTQQPSPSKAFKPRFPGDQV
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760
pF1KSD ASEAGKPLLHPVRPGHP----------LPLLLPACGHHHAPMPDY-SCLKPPKAGEEGHE
.. :: : :: : : :. :.: . . : : . .
CCDS55 VNGAGPELSTGPSPGSPTLDIDQSIEQLNRLILELDPTFEPIPTHMNALGSQANGSVSPD
680 690 700 710 720 730
770 780 790 800 810 820
pF1KSD GCSYTMCPEGRYGHPGY-PALVTYSYGGAVPSYCPAYGRVPH-SCGSPGEGRGYPSPGAH
. . . .: : :. .: :... . : ::. . : :. . : : ..
CCDS55 SVGGGLRASSRLPDTGEGPSRATGRQGSSAEQ--PLGGRLRKLSLGQYDNDAGGQLPFSK
740 750 760 770 780 790
830 840 850 860 870 880
pF1KSD SP--RAG-SISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWR
.:: . .:. ::.:. .. . : . :.. :. . :::
CCDS55 CAWGKAGVDYAPNLPPFPSPADVKETMTPGYPQDLDIIDGRILSSKESMCSTPAFPVS-P
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920
pF1KSD EGPSGHSTL---PRSPRDAPCS--ASSELSG------PSTPLH----TSSPVQGKESTRR
: : ...: : :: . : : ::.. .: : : : . ::. : . :
CCDS55 ETPYVKTALRHPPFSPPEPPLSSPASQHKGGREPRSCPETLTHAVGMSESPIGPKSTMLR
860 870 880 890 900 910
930 940 950 960
pF1KSD QDTRSPTS-----APTQRLS---PGEALPPVSQAGTGKAPELPS------GSG-PE--PL
:. : : : . .: ::. :.: . :. ::: : ::
CCDS55 ADASSTPSFQQAFASSCTISSNGPGQRRESSSSAERQWVESSPKPMVSLLGSGRPTGSPL
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010
pF1KSD AP--------SPVSPTFPPS---SPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQ
. ::: :::: .: .: : . :. .: : .. :. ::
CCDS55 SAEFSGTRKDSPVLSCFPPSELQAPFH-SHELSLAEPPDSLAP--PSSQAFLGFGTAPV-
980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD GPRGPPDSPDGSPL------TPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAF----PLAASYDTNGL
: ::. :. : .:.:: .: :.:. .. . : : .:. . ::
CCDS55 GSGLPPEEDLGALLANSHGASPTPS-IP-LTATGAADNGFLSHNFLTVAPGHSSHHSPGL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD S--------QPPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQA--SSPARGISHHVTFAPLLSD----N
. :::::::.. .. : .: .. ::: : . . : .: : .
CCDS55 QGQGVTLPGQPPLPEKKRASEGDRSLGSVSPSSSGFSSPHSGSTISIPFPNVLPDFSKAS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD VPQTPEPPTQ-ESQSNVKFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGA
.: : . .. ::::::::::::: .::.::::.::::.::.:..::::::.::
CCDS55 EAASPLPDSPGDKLVIVKFVQDTSKFWYKADISREQAIAMLKDKEPGSFIVRDSHSFRGA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD YGLALKVATPPPSAQPWK---GDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVS
::::.::::::::. . :: ...:::::::: ::::..::: .:::::::.:::
CCDS55 YGLAMKVATPPPSVLQLNKKAGDLANELVRHFLIECTPKGVRLKGCSNEPYFGSLTALVC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD QHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLT
::::.:..::: : : .::::: :. : ..::.::.:::::.: ::
CCDS55 QHSITPLALPCKLLIPERDPLEEIAESSPQTAANSAAELLKQGAACNVWYLNSVEMESLT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD GPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDP
CCDS55 GHQAIQKALSITLVQEPPPVSTVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSVIFCALDP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
>>CCDS77528.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1714 aa)
initn: 2845 init1: 1285 opt: 1590 Z-score: 718.5 bits: 145.7 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1807; 33.9% identity (55.3% similar) in 1263 aa overlap (120-1319:2-1148)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD NTAPVRRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARP
:.. :: .:::.::::::.:..::.
CCDS77 MSVSRTMEDSCELDLVYVTERIIAVSFPSTA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DEQRHRGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLC
.:. :..:::.:..:.::: .::::::::.: :.:.:. :: .::::.::.: :.:.:
CCDS77 NEENFRSNLREVAQMLKSKHGGNYLLFNLSERRPDITKLHAKVLEFGWPDLHTPALEKIC
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SICKAMETWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCE
::::::.:::.:::..::::. :::.:..::...::::::.:::.::::: ..:..: :
CCDS77 SICKAMDTWLNADPHNVVVLHNKGNRGRIGVVIAAYMHYSNISASADQALDRFAMKRFYE
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DKVATELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQ
::.. :::::::. ::::::::::.::..:::::.:.. .: :: : .:::.:::
CCDS77 DKIVPIGQPSQRRYVHYFSGLLSGSIKMNNKPLFLHHVIMHGIPNFESKGGCRPFLRIYQ
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SMQLVYTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTC
.:: :::::.:.: : . ..::..::.::::::... :::: :. : ..::::::::
CCDS77 AMQPVYTSGIYNIPGDSQTSVCITIEPGLLLKGDILLKCYHKKFRSPARDVIFRVQFHTC
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KSD TIHGPQLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTP-RNDPSVSVDYNTTE
.:: ..: :..::.:. :.::: ..:::::: .::::.: .: :::::::::..
CCDS77 AIHDLGVVFGKEDLDDAFKDDRFPEYGKVEFVFSYGPEKIQGMEHLENGPSVSVDYNTSD
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KSD PAVRWDSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPR---------QTPPAPSP
: .:::::.::. :..:... . ::.:::::: ::.:.. : :. :
CCDS77 PLIRWDSYDNFSGHRDDGMEEVVGHTQGPLDGSLYAKVKKKDSLHGSTGAVNATRPTLSA
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EPPP-PPMLSVSSDSGHS--STLTTEPAAESPGRPPPTAA----ERQELDRLLGGCGVAS
: ::::::::.: :: : . :: ::: :..::::::.: :.
CCDS77 TPNHVEHTLSVSSDSGNSTASTKTDKTDEPVPGASSATAALSPQEKRELDRLLSGFGLER
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KSD GGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYREPCGVPNGGYYRP
.:: .: : . .:. :: . :. .:: : . :::
CCDS77 EKQGAMYHTQHL--RSRPA--GGSAV-------PSSGRHVVPAQVHV------NGGALAS
460 470 480 490
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRAPG
: . . .: : . ... . . ::: :: : .: :.
CCDS77 ERETDILDDELPNQDGHSAG-SMGTLSSLDGVTNTSEGGYP---EALSPLTN--------
500 510 520 530 540
680 690 700 710 720 730
pF1KSD YREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPG
:: :: : .. .: : : :
CCDS77 ----------GLDKSYPM------------------------EPMVNGGGYPYESASRAG
550 560
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGHPGYPALVTYSYG
:: . : ::: .: ...:: : . :: ::..: :: :.
CCDS77 -------PAHAGHTAPM------RPSYSAQEGLAGYQR----EG--PHPAWPQPVTTSHY
570 580 590 600
800 810 820 830 840 850
pF1KSD GAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEI-PTE
. :: : . : .: . :.: . ... : . :... . . :
CCDS77 AHDPS-----GMFRSQSFSEAEPQLPPAPVRGGSSREAVQRGLNSWQQQQQQQQQPRPPP
610 620 630 640 650 660
860 870 880 890 900
pF1KSD EGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCSA----------
. .: .:: : .:: : .:.. :: ::. :: : .
CCDS77 RQQER----AHLESL--VASRPSPQPLAETPIPS----LPEFPRAASQQEIEQSIETLNM
670 680 690 700 710
910 920 930 940 950
pF1KSD ---SSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAP
. : .. ..::: :. : : . .: :. ..: : :..:. .: :
CCDS77 LMLDLEPASAAAPLHKSQSVPGAWPGASPLSSQPLSG-SSRQSH-----PLTQSRSGYIP
720 730 740 750 760
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD ELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPS---SPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGL---
: . ::: :: . ::. :: :. : : ..: : .::. ..::..
CCDS77 SGHSLGTPEP-APRASLESVPPGRSYSPYDY-QPCLAGPNQDFHS-KSPASSSLPAFLPT
770 780 790 800 810 820
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD RHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGL----
:.: ::. :: : : :. : . :. : :.: . . :.
CCDS77 THSP-PGPQQPPASLPGLTAQPLLSPKEATSDPSRTPEEEPLNLEGLVA-HRVAGVQARE
830 840 850 860 870 880
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ---SQPPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVT-FAPLLSDNVPQTP-----
..:: : .:. . :: . .:: .: . :. : .: :. .. .:
CCDS77 KQPAEPPAPLRRRAASDGQYENQ-SPEATSPRSPGVRSPVQCVSPELALTIALNPGGRPK
890 900 910 920 930 940
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD EPPTQESQSNVKFVQDTSK-------FWYKPHLSRDQAIAL-LKDKDPGAFLIRDSHSFQ
:: . . . .. :: : :.. :: :: ..:. .:.. . .
CCDS77 EPHLHSYKEAFEEMEGTSPSSPPPSGVRSPPGLAKTPLSALGLKPHNPADILLHPTGEPR
950 960 970 980 990 1000
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD GAYGLALKVATPPPSAQ---PWK-GDPVEQLVRHFL-IETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLS
. . ..:. : :: : . . :. : : . ...: : .. . :: : ... :
CCDS77 SYVESVARTAVAGPRAQDSEPKSFSAPATQAYGHEIPLRNGTLGGSFVS-PS-P-LSTSS
1010 1020 1030 1040 1050
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD ALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTSVET
..: : : :.: :.: .:: :. . ...: . . . . : .:
CCDS77 PILSADSTSVGSFPSGE---SSDQGPRTPTQPLLESGFRSGSLGQPSPSAQRNYQSSSPL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD ESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFS
.. . . : .: ::. . : ..:.:.
CCDS77 PTVGSSYSSPDYSLQHFSSSPE-SQARAQFSVAGVHTVPGSPQARHRTVGTNTPPSPGFG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD STDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLG
CCDS77 WRAINPSMAAPSSPSLSHHQMMGPPGTGFHGSTVSSPQSSAATTPGSPSLCRHPAGVYQV
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>--
initn: 1322 init1: 696 opt: 1446 Z-score: 655.0 bits: 134.0 E(32554): 3.7e-30
Smith-Waterman score: 1450; 44.3% identity (66.4% similar) in 596 aa overlap (833-1409:1154-1714)
810 820 830 840 850 860
pF1KSD GRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEG-GDRYPLPG
:::: . : .. . : : : : :.
CCDS77 SSPDYSLQHFSSSPESQARAQFSVAGVHTVPGSPQ-ARHRTVGTNTPPSPGFGWRAINPS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
870 880 890 900 910
pF1KSD HLASAGPLASAESLEPVSWREGPSG---HSTLPRSPRDAPCSASSELSGPSTPLHTSSPV
: ..: : ... :: : :.. ::.. ::.. ..:: : ..
CCDS77 MAAPSSPSLSHHQMM------GPPGTGFHGSTVSSPQS---SAATTPGSPSLCRHPAGVY
1190 1200 1210 1220 1230
920 930 940 950 960 970
pF1KSD QGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSGSGPEPLAPS-----P
: . . . . .: : :. :: .. :. : : :.. : .::
CCDS77 Q-VSGLHNKVATTPGS-PSLGRHPG------AHQGN-LASGLHSNAIASPGSPSLGRHLG
1240 1250 1260 1270 1280
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD VSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGPRGP--PDSPDGSP
: . :.:: .. . ::.: .:.. :: . .:.: : : :: :
CCDS77 GSGSVVPGSPC-LDRHVAYGGYS---TPEDRRPTLSRQSSASGYQAPSTPSFPVSPAYYP
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LTPVPSQMPWLVASPEPP---QSSPTPAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLPGPGQQPGP
:. : ::. :.:::::.: ... : ::. . : ..:
CCDS77 GLSSPATSP----SPDSAAFRQGSPTPALPEKRRMSV-GDRAGSLPNYATINGKVSSPVA
1350 1360 1370 1380 1390
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD WGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFWYKPHLSRD
: :::. : . :.:. : : . . :....:::::::::.::::..::.
CCDS77 SG---MSSPSGGST--VSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPEISRE
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSA--QPWKGDPVEQLVRHFLIET
::::::::..::::.:::::::.::::::.::..:::. : ::: ...:::::::::
CCDS77 QAIALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTIMQQNKKGDMTHELVRHFLIET
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTA
::.:::.::::.:: :::::::: :::: :..::: : : ..:: .:. .. :.: ..
CCDS77 GPRGVKLKGCPNEPNFGSLSALVYQHSIIPLALPCKLVIPNRDPTDESKDSSGPAN--ST
1520 1530 1540 1550 1560
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGITLT
::::.:::::.::...::. ::::::::...:.: .:. .: :. ..:::::::::::::
CCDS77 ADLLKQGAACNVLFVNSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATIVHFKVSAQGITLT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDG-TTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFA
:::::::::::::.:..:: . :::.:.: . .: . .:.:::::.: :: .:.:::::
CCDS77 DNQRKLFFRRHYPLNTVTFCDLDPQERKWMKTEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACHLFA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1390 1400
pF1KSD ELDPDQPAGAIVTFITKVLL--GQRK
::::.:::.:::.:..::.: ::..
CCDS77 ELDPNQPASAIVNFVSKVMLNAGQKR
1690 1700 1710
>>CCDS77529.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1721 aa)
initn: 2803 init1: 1285 opt: 1589 Z-score: 718.1 bits: 145.7 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1795; 33.3% identity (53.7% similar) in 1323 aa overlap (120-1373:2-1189)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD NTAPVRRIEHLGSTKSLNHSKQRSTLPRSFSLDPLMERRWDLDLTYVTERILAAAFPARP
:.. :: .:::.::::::.:..::.
CCDS77 MSVSRTMEDSCELDLVYVTERIIAVSFPSTA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DEQRHRGHLRELAHVLQSKHRDKYLLFNLSEKRHDLTRLNPKVQDFGWPELHAPPLDKLC
.:. :..:::.:..:.::: .::::::::.: :.:.:. :: .::::.::.: :.:.:
CCDS77 NEENFRSNLREVAQMLKSKHGGNYLLFNLSERRPDITKLHAKVLEFGWPDLHTPALEKIC
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SICKAMETWLSADPQHVVVLYCKGNKGKLGVIVSAYMHYSKISAGADQALATLTMRKFCE
::::::.:::.:::..::::. :::.:..::...::::::.:::.::::: ..:..: :
CCDS77 SICKAMDTWLNADPHNVVVLHNKGNRGRIGVVIAAYMHYSNISASADQALDRFAMKRFYE
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DKVATELQPSQRRYISYFSGLLSGSIRMNSSPLFLHYVLIPMLPAFEPGTGFQPFLKIYQ
::.. :::::::. ::::::::::.::..:::::.:.. .: :: : .:::.:::
CCDS77 DKIVPIGQPSQRRYVHYFSGLLSGSIKMNNKPLFLHHVIMHGIPNFESKGGCRPFLRIYQ
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SMQLVYTSGVYHIAGPGPQQLCISLEPALLLKGDVMVTCYHKGGRGTDRTLVFRVQFHTC
.:: :::::.:.: : . ..::..::.::::::... :::: :. : ..::::::::
CCDS77 AMQPVYTSGIYNIPGDSQTSVCITIEPGLLLKGDILLKCYHKKFRSPARDVIFRVQFHTC
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KSD TIHGPQLTFPKDQLDEAWTDERFPFQASVEFVFSSSPEKIKGSTP-RNDPSVSVDYNTTE
.:: ..: :..::.:. :.::: ..:::::: .::::.: .: :::::::::..
CCDS77 AIHDLGVVFGKEDLDDAFKDDRFPEYGKVEFVFSYGPEKIQGMEHLENGPSVSVDYNTSD
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KSD PAVRWDSYENFNQHHEDSVDGSLTHTRGPLDGSPYAQVQRPPR---------QTPPAPSP
: .:::::.::. :..:... . ::.:::::: ::.:.. : :. :
CCDS77 PLIRWDSYDNFSGHRDDGMEEVVGHTQGPLDGSLYAKVKKKDSLHGSTGAVNATRPTLSA
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EPPP-PPMLSVSSDSGHS--STLTTEPAAESPGRPPPTAA----ERQELDRLLGGCGVAS
: ::::::::.: :: : . :: ::: :..::::::.: :.
CCDS77 TPNHVEHTLSVSSDSGNSTASTKTDKTDEPVPGASSATAALSPQEKRELDRLLSGFGLER
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KSD GGRGAGRETAILDDEEQPTVGGGPHLGVYPGHRPGLSRHCSCRQGYREPCGVPNGGYYRP
.:: .: : . .:. :: . :. .:: : . :::
CCDS77 EKQGAMYHTQHL--RSRPA--GGSAV-------PSSGRHVVPAQVHV------NGGALAS
460 470 480 490
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EGTLERRRLAYGGYEGSPQGYAEASMEKRRLCRSLSEGLYPYPPEMGKPATGDFGYRAPG
: . . .: : . ... . . ::: :: : .: :.
CCDS77 ERETDILDDELPNQDGHSAG-SMGTLSSLDGVTNTSEGGYP---EALSPLTN--------
500 510 520 530 540
680 690 700 710 720 730
pF1KSD YREVVILEDPGLPALYPCPACEEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPG
:: :: : .. .: : : :
CCDS77 ----------GLDKSYPM------------------------EPMVNGGGYPYESASRAG
550 560
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HPLPLLLPACGHHHAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMCPEGRYGHPGYPALVTYSYG
:: . : ::: .: ...:: : . :: ::..: :: :.
CCDS77 -------PAHAGHTAPM------RPSYSAQEGLAGYQR----EG--PHPAWPQPVTTSHY
570 580 590 600
800 810 820 830 840 850
pF1KSD GAVPSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEI-PTE
. :: : . : .: . :.: . ... : . :... . . :
CCDS77 AHDPS-----GMFRSQSFSEAEPQLPPAPVRGGSSREAVQRGLNSWQQQQQQQQQPRPPP
610 620 630 640 650 660
860 870 880 890 900
pF1KSD EGGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRSPRDAPCSA----------
. .: .:: : .:: : .:.. :: ::. :: : .
CCDS77 RQQER----AHLESL--VASRPSPQPLAETPIPS----LPEFPRAASQQEIEQSIETLNM
670 680 690 700 710
910 920 930 940 950
pF1KSD ---SSELSGPSTPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAP
. : .. ..::: :. : : . .: :. ..: : :..:. .: :
CCDS77 LMLDLEPASAAAPLHKSQSVPGAWPGASPLSSQPLSG-SSRQSH-----PLTQSRSGYIP
720 730 740 750 760
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD ELPSGSGPEPLAPSPVSPTFPPS---SPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGL---
: . ::: :: . ::. :: :. : : ..: : .::. ..::..
CCDS77 SGHSLGTPEP-APRASLESVPPGRSYSPYDY-QPCLAGPNQDFHS-KSPASSSLPAFLPT
770 780 790 800 810 820
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD RHAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPAFPLAASYDTNGL----
:.: ::. :: : : :. : . :. : :.: . . :.
CCDS77 THSP-PGPQQPPASLPGLTAQPLLSPKEATSDPSRTPEEEPLNLEGLVA-HRVAGVQARE
830 840 850 860 870 880
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ---SQPPLPEKRHLPGPGQQPGPWGPEQASSPARGISHHVT-FAPLLSDNVPQTP-----
..:: : .:. . :: . .:: .: . :. : .: :. .. .:
CCDS77 KQPAEPPAPLRRRAASDGQYENQ-SPEATSPRSPGVRSPVQCVSPELALTIALNPGGRPK
890 900 910 920 930 940
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD EPPTQESQSNVKFVQDTSK-------FWYKPHLSRDQAIAL-LKDKDPGAFLIRDSHSFQ
:: . . . .. :: : :.. :: :: ..:. .:.. .
CCDS77 EPHLHSYKEAFEEMEGTSPSSPPPSGVRSPPGLAKTPLSALGLKPHNPADILLHPT----
950 960 970 980 990
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD GAYGLALKVATPPPSAQPWKGDPVEQLVRHFLIETGPKGV----KIKGCPSEPYFGSLSA
:.. . : : . ::...: . .::.. : . :. .:
CCDS77 ---GVTRRRIQPEPRSY------VESVARTAV--AGPRAQDSEPKSFSAPATQAYGHEIP
1000 1010 1020 1030 1040
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD L----VSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNMSTAADLLRQGAACSVLYLTS
: .. .:: : ::: : : . :.. :. :: . :
CCDS77 LRNGTLGGSFVSPSPLSTSSPILSADS---TSVGSFPSGESSD-----QGPRTPTQPLLE
1050 1060 1070 1080 1090
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD VETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFK--VSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVN
.: . : :. : :: :: . . . : : .. . ... : .. :
CCDS77 SGFRSGSLGQPSPSAQRNYQSSSPLPTVGSSYSSPDYSLQHFSSSPESQA---RAQFSVA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD SITFSSTDPQDR-RWTNPDGTTSKIFGFVAKKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFI
.. .:: : : .. . : ::. : .:
CCDS77 GVHTVPGSPQARHRTVGTNTPPSPGFGWRAINPSMAAPSSPSLSHHQMMGPPGTGFHGST
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD TKVLLGQRK
CCDS77 VSSPQSSAATTPGSPSLCRHPAGVYQVSGLHNKVATTPGSPSLGRHPGAHQGNLASGLHS
1220 1230 1240 1250 1260 1270
>--
initn: 1280 init1: 450 opt: 1413 Z-score: 640.4 bits: 131.3 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 1416; 46.0% identity (68.6% similar) in 539 aa overlap (883-1409:1206-1721)
860 870 880 890 900
pF1KSD GGDRYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSG---HSTLPRSPRDAPCSASSELSGPS
:: : :.. ::.. ::.. ..::
CCDS77 TPPSPGFGWRAINPSMAAPSSPSLSHHQMMGPPGTGFHGSTVSSPQS---SAATTPGSPS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
910 920 930 940 950 960
pF1KSD TPLHTSSPVQGKESTRRQDTRSPTSAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSGSGPEPL
: .. : . . . . .: : :. :: .... ..: : :: :
CCDS77 LCRHPAGVYQ-VSGLHNKVATTPGS-PSLGRHPGAHQGNLASGLHSNAIASP-GS-PSLG
1240 1250 1260 1270 1280
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APSPVSPTFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPVPTTLPGLRHAPWQGPRGP--PDSP
: . :.:: .. . ::.: .:.. :: . .:.: : : ::
CCDS77 RHLGGSGSVVPGSPC-LDRHVAYGGYS---TPEDRRPTLSRQSSASGYQAPSTPSFPVSP
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD DGSPLTPVPSQMPWLVASPEPP---QSSPTPAFPLAASYDTNGLSQPPLPEKRHLPGPGQ
: :. : ::. :.:::::.: ... : ::. . : .
CCDS77 AYYPGLSSPATSP----SPDSAAFRQGSPTPALPEKRRMSV-GDRAGSLPNYATINGKVS
1350 1360 1370 1380 1390
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNVKFVQDTSKFWYKPH
.: : :::. : . :.:. : : . . :....:::::::::.::::.
CCDS77 SPVASG---MSSPSGGST--VSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPE
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSA-QPWKGDPVEQLVRHFL
.::.::::::::..::::.:::::::.::::::.::..:::. : : : ...::::::
CCDS77 ISREQAIALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTIMQQNKKDMTHELVRHFL
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD IETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDPLEETPEAPVPTNM
:::::.:::.::::.:: :::::::: :::: :..::: : : ..:: .:. .. :.:
CCDS77 IETGPRGVKLKGCPNEPNFGSLSALVYQHSIIPLALPCKLVIPNRDPTDESKDSSGPAN-
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD STAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRPTPAVVHFKVSAQGI
..::::.:::::.::...::. ::::::::...:.: .:. .: :. ..::::::::::
CCDS77 -STADLLKQGAACNVLFVNSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATIVHFKVSAQGI
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDG-TTSKIFGFVAKKPGSPWENVCH
::::::::::::::::.:..:: . :::.:.: . .: . .:.:::::.: :: .:.::
CCDS77 TLTDNQRKLFFRRHYPLNTVTFCDLDPQERKWMKTEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACH
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1390 1400
pF1KSD LFAELDPDQPAGAIVTFITKVLL--GQRK
:::::::.:::.:::.:..::.: ::..
CCDS77 LFAELDPNQPASAIVNFVSKVMLNAGQKR
1700 1710 1720
>>CCDS11368.1 TNS4 gene_id:84951|Hs108|chr17 (715 aa)
initn: 1086 init1: 505 opt: 1072 Z-score: 494.9 bits: 103.1 E(32554): 3e-21
Smith-Waterman score: 1098; 34.2% identity (56.6% similar) in 725 aa overlap (724-1404:20-709)
700 710 720 730 740
pF1KSD EEKLALPTAALYGLRLEREAGEGWASEAGKPLLHPVRPGHPLPL--LLPACGHH------
: .: : :: : : : :...
CCDS11 MSQVMSSPLLAGGHAVSLAPCDEPRRTLHPAPSPSLPPQCSYYTTEGWG
10 20 30 40
750 760 770 780 790
pF1KSD -HAPMPDYSCLKPPKAGEEGHEGCSYTMC--P---EGRYGHP----GYPALVTYSYGGAV
.: : :. :: ... . . . : : : : : .: . : . .
CCDS11 AQALMAPVPCMGPPGRLQQAPQVEAKATCFLPSPGEKALGTPEDLDSYIDFSLESLNQMI
50 60 70 80 90 100
800 810 820 830 840 850
pF1KSD PSYCPAYGRVPHSCGSPGEGRGYPSPGAHSPRAGSISPGSPPYPQSRKLSYEIPTEEGGD
:.. .: :: : : . :.: ..: . .. ..: : .
CCDS11 LELDPTFQLLP-----PGTG-GSQAELAQS----TMSMRKKEESEALDIKYIEVTSARSR
110 120 130 140 150
860 870 880 890 900 910
pF1KSD RYPLPGHLASAGPLASAESLEPVSWREGPSGHSTLPRS-PRDAPCSASSEL-SGPSTPLH
. : : .: . ::. :: : :. ::.. :. : . :: . :
CCDS11 CHDGPQHCSSPSVTPPFGSLR--------SGGLLLSRDVPRETRSSSESLIFSGNQGRGH
160 170 180 190 200 210
920 930 940 950 960
pF1KSD TSSPVQGKESTRRQDTRSPT----------SAPTQRLSPGEALPPVSQAGTGKAPELPSG
. :. .:. . ::. :.: :: : : . . : ::. :
CCDS11 -QRPLPPSEGLSPRPPNSPSISIPCMGSKASSPHGLGSPLVASPRLEKRLGGLAPQ--RG
220 230 240 250 260
970 980 990 1000 1010
pF1KSD SGPEPLAPSPVSP-TFPPSSPSDWPQERSPGGHSDGASPRSPV--PTTLPGL-------R
: :. :::: .. .: .. . . . .:.. : .::. ..: .: :
CCDS11 SRISVLSASPVSDVSYMFGSSQSLLHSSNSSHQSSSRSLESPANSSSSLHSLGSVSLCTR
270 280 290 300 310 320
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD HAPWQGPRGPPDSPDGSPLTPVPSQMPWLVASPEPPQSSPTPA-FPLAASYDTNGLSQPP
. .:.::.: . :.: :: . :: ::. . . . .:.. :: .:
CCDS11 PSDFQAPRNPTLTM-GQPRTPHSPPLAKEHASSCPPSITNSMVDIPIVL---INGCPEPG
330 340 350 360 370 380
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD LPEKRHLPGPGQ--QPGPWGPEQASSPARGISHHVTFAPLLSDNVPQTPEPPTQESQSNV
.. :: . ::: .: . .:. :. .. ::. . :: :... : ..
CCDS11 SSPPQRTPGHQNSVQPGAASPSNPCPATRSNSQTLSDAPFTT-----CPEGPARDMQPTM
390 400 410 420 430
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD KFVQDTSKFWYKPHLSRDQAIALLKDKDPGAFLIRDSHSFQGAYGLALKVATPPPSAQPW
:::.::::.:.::...:.::: ::. ..::::.:::: :..:..:::::: : :::
CCDS11 KFVMDTSKYWFKPNITREQAIELLRKEEPGAFVIRDSSSYRGSFGLALKVQEVPASAQSR
440 450 460 470 480 490
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD KGDPVEQLVRHFLIETGPKGVKIKGCPSEPYFGSLSALVSQHSISPISLPCCLRILSKDP
:. ..:.::::::.. :::..:: :::::::::.: :::: ..::: : : :
CCDS11 PGEDSNDLIRHFLIESSAKGVHLKGADEEPYFGSLSAFVCQHSIMALALPCKLTI----P
500 510 520 530 540 550
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD LEETPEAPVPTNMS-TAADLLRQGAACSVLYLTSVETESLTGPQAVARASSAALSCSPRP
.: : .. . . :. ...:.: .:::.:: .:.::: :: .: :... . :
CCDS11 QRELGGADGASDSTDSPASCQKKSAGCHTLYLSSVSVETLTGALAVQKAISTTFERDILP
560 570 580 590 600 610
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD TPAVVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPVNSITFSSTDPQDRRWTNPDGTTSKIFGFV
::.::::::. ::::::: :::.:::::::.... : . ::..:.: . : :::::
CCDS11 TPTVVHFKVTEQGITLTDVQRKVFFRRHYPLTTLRFCGMDPEQRKWQKY-CKPSWIFGFV
620 630 640 650 660 670
1370 1380 1390 1400
pF1KSD AKKPGSPWENVCHLFAELDPDQPAGAIVTFITKVLLGQRK
::. : ::::::::: : :::. .. ..: .:
CCDS11 AKSQTEPQENVCHLFAEYDMVQPASQVIGLVTALLQDAERM
680 690 700 710
1409 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:53:50 2016 done: Thu Nov 3 04:53:51 2016
Total Scan time: 5.640 Total Display time: 0.630
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]