Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1083
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1083, 584 aa
1>>>pF1KSDA1083 584 - 584 aa - 584 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6857+/-0.000951; mu= 6.9480+/- 0.058
mean_var=244.2416+/-48.140, 0's: 0 Z-trim(114.6): 52 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.082066
statistics sampled from 15153 (15203) to 15153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 4.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 3811 464.1 2.1e-130
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 2489 307.6 2.9e-83
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 1108 144.2 5.1e-34
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 869 115.9 1.8e-25
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 792 106.6 6.9e-23
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 759 102.7 1e-21
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 740 100.5 5.3e-21
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 726 98.8 1.7e-20
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 703 96.1 1.1e-19
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 652 89.9 5.8e-18
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 613 85.7 2.7e-16
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 522 74.8 3.9e-13
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 522 74.8 4.2e-13
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 522 74.9 4.3e-13
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 522 74.9 4.6e-13
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 515 73.8 4.8e-13
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 503 72.3 1.3e-12
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 503 72.3 1.3e-12
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 499 72.2 2.9e-12
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 492 71.0 3e-12
CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 489 70.6 3.4e-12
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 492 71.1 3.4e-12
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 490 70.8 4e-12
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 488 71.1 1.1e-11
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 475 69.0 1.2e-11
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 486 70.8 1.3e-11
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 475 69.0 1.3e-11
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 473 69.2 2.8e-11
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 463 67.9 5.6e-11
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 465 68.3 6.4e-11
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 465 68.3 6.6e-11
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 453 66.4 8.2e-11
>>CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (584 aa)
initn: 3811 init1: 3811 opt: 3811 Z-score: 2454.6 bits: 464.1 E(32554): 2.1e-130
Smith-Waterman score: 3811; 100.0% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNSPGGRGKKKGSGGASNPVPPRPPPPCLAPAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MNSPGGRGKKKGSGGASNPVPPRPPPPCLAPAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAKRSSGAAPAPASASAPAPVPGGEAERVRVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAKRSSGAAPAPASASAPAPVPGGEAERVRVFH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERARRLQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERARRLQAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KSD SASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
550 560 570 580
>>CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (616 aa)
initn: 2480 init1: 2480 opt: 2489 Z-score: 1608.4 bits: 307.6 E(32554): 2.9e-83
Smith-Waterman score: 3737; 94.8% identity (94.8% similar) in 616 aa overlap (1-584:1-616)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNSPGGRGKKKGSGGASNPVPPRPPPPCLAPAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MNSPGGRGKKKGSGGASNPVPPRPPPPCLAPAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAKRSSGAAPAPASASAPAPVPGGEAERVRVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAKRSSGAAPAPASASAPAPVPGGEAERVRVFH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERARRLQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERARRLQAK
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KSD MMTNLVMAKDRLQLLE--------------------------------SGAVPKRKDPLT
:::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS17 MMTNLVMAKDRLQLLEKMQPVLPFSKSQTDVYNDSTNLACRNGHLQSESGAVPKRKDPLT
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD HTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 HTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVIL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD PSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARM
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KSD TDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQT
550 560 570 580 590 600
570 580
pF1KSD LEAYIRWNKDFGDTTV
::::::::::::::::
CCDS17 LEAYIRWNKDFGDTTV
610
>>CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 (674 aa)
initn: 1125 init1: 1092 opt: 1108 Z-score: 724.3 bits: 144.2 E(32554): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 1122; 43.8% identity (74.1% similar) in 397 aa overlap (199-580:277-671)
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EQCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGL
: : .: . ..::: ::. . .
CCDS55 CFPAACENPQRKSFYGSGTIDALSNPILNKACSKTEDNGPKEDSSLPTFKTAKEQLWVDQ
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270
pF1KSD SGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSG-------------PAPTTHKGTPKTNRTNKP--STPT
. ... :. .. : .:::.. : : : : . . :: . ::
CCDS55 QKKYHQPQRASGSSYGGVKKSLGASRSRGILGKFVPPIPKQDGGEQNGGMQCKPYGAGPT
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRP
.. . ..:.. .. .::::::.:.: :...:::: ..:: ...:::. : :::
CCDS55 EPAHPVDE--RLKNLEPKMIELIMNEIMDHGPPVNWEDIAGVEFAKATIKEIVVWPMLRP
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KSD ELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRA
..:::::.: .:.:::::::.:::...: .:..:.::::.:::.:::::.::::::.:::
CCDS55 DIFTGLRGPPKGILLFGPPGTGKTLIGKCIASQSGATFFSISASSLTSKWVGEGEKMVRA
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGA
:::::: ::..:::::.:::: .: .:::..:::.:::::...::. ....::.::.::
CCDS55 LFAVARCQQPAVIFIDEIDSLLSQRGDGEHESSRRIKTEFLVQLDGATTSSEDRILVVGA
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KSD TNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYS
::::::.:::. ::..::.:. ::. .: .. ::. :. :...:. :.....:..:
CCDS55 TNRPQEIDEAARRRLVKRLYIPLPEASARKQIVINLMSKEQCCLSEEEIEQIVQQSDAFS
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYI
:.:.: : ..:.::::: :. .. ... ...: : :: .... .. ::::. :: :
CCDS55 GADMTQLCREASLGPIRSLQTADIATITPDQVRPIAYIDFENAFRTVRPSVSPKDLELYE
610 620 630 640 650 660
580
pF1KSD RWNKDFGDTTV
::: ::
CCDS55 NWNKTFGCGK
670
>>CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 (759 aa)
initn: 907 init1: 805 opt: 869 Z-score: 570.7 bits: 115.9 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 870; 29.2% identity (62.4% similar) in 590 aa overlap (3-580:186-756)
10 20 30
pF1KSD MNSPGGRGKKKGSGGASNPVP--PRPPPPCLA
.:: :. : .:.:.: : : : :
CCDS22 SNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAGLPSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLH
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVGFALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAK
. : ::: : : . : . : .. . . .. ...
CCDS22 SSGLLQPPPPPPPPPAL-------VPGYNGTSNLSSYSYPSA-------SYPPQTAVGSG
220 230 240 250 260
100 110 120 130 140
pF1KSD RSSGAAPAPASASAPAPVPGGEA---ERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQ-KEQAV
: :.:: : :: :. .:. : . :. :: . .:.. :..:
CCDS22 YSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHGLTPIAPSALTNSSASSLKRKA-
270 280 290 300 310 320
150 160 170 180 190 200
pF1KSD EWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERA-RRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKD
.: : ..... . :: .. . :. . ..: .. . :.... .
CCDS22 -FYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSPMYRMPDNSISNTNRGNGFDRSAETSSLAFK--
330 340 350 360 370
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPT-THKGTPKTN
: . .: . : ... : :. . . ..:. :. . :. .:. ...: . .
CCDS22 PTKQLMSSEQQRKFSSQSSRA-LTPPSYSTAKNSLGSRSSESFGKYTSPVMSEHGDEHRQ
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KSD RTNKP-STP--TTATRKKKDL-KNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQ
..: . : .:: ..... ....:.:..: .:. :::. .: : ..:::: ::.:
CCDS22 LLSHPMQGPGLRAATSSNHSVDEQLKNTDTHLIDLVTNEIITQGPPVDWNDIAGLDLVKA
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLT
...: :. : :: . :.:: : :..::::: :.:::.:.. .:.. .::::.:....:.
CCDS22 VIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGTGKTLLGRCIASQLGATFFKIAGSGLV
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KSD SKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGV
.:..::.::...: : ::: :::.::....: :: . . ::. :..::::...: :
CCDS22 AKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDMLLSSQVNEEHSPVSRMRTEFLMQLDTV
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQK
....:...:. ::..:.:.::.. : :.::. . ::. .: .. .:: ... :..:
CCDS22 LTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLIPLPDSTARHQIIVQLLSQHNYCLNDK
620 630 640 650 660 670
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKI
:.: :.. :.:.:: :.. : ..:..::.. . ... . :..: . .:: ... ::
CCDS22 EFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPATDLSAIMPSQLRPVTYQDFENAFCKI
680 690 700 710 720 730
570 580
pF1KSD KRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
. :.: . :. :..::: ::
CCDS22 QPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
740 750
>>CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 (444 aa)
initn: 775 init1: 453 opt: 792 Z-score: 524.4 bits: 106.6 E(32554): 6.9e-23
Smith-Waterman score: 792; 45.7% identity (75.1% similar) in 293 aa overlap (262-549:82-366)
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDS-
:... : . :. : .: .: . . :.
CCDS11 DKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKNKEKKAQKPVKEGQPSPADEKGNDSDGEGESDDP
60 70 80 90 100 110
300 310 320 330 340
pF1KSD ---NLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLL
.: : ... :: . ::..:.:: . ::.::.: :::: :.:::: :.: ::.:
CCDS11 EKKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFPHLFTGKRTPWRGIL
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LFGPPGNGKTMLAKAVAAESN-ATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSII
::::::.::..::::::.:.: .:::.::...:.::..::.::::. :: .::: .::::
CCDS11 LFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSISSSDLVSKWLGESEKLVKNLFQLARENKPSII
180 190 200 210 220 230
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLR
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CCDS11 FIDEIDSLCGSRSENESEAARRIKTEFLVQMQGV-GVDNDGILVLGATNIPWVLDSAIRR
240 250 260 270 280 290
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAAL
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CCDS11 RFEKRIYIPLPEPHARAAMFKLHLGTTQNSLTEADFRELGRKTDGYSGADISIIVRDALM
300 310 320 330 340 350
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
:.:... ::......:
CCDS11 QPVRKVQ-------SATHFKKVRGPSRADPNHLVDDLLTPCSPGDPGAIEMTWMDVPGDK
360 370 380 390 400
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270 280 290 300 310 320
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330 340 350 360 370 380
pF1KSD LQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESN-ATFFNISAASLT
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CCDS45 LKEAVILPIKFPHLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSVSSSDLM
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pF1KSD SKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGV
::..::.::::. :: .::. .:::::::::::: : :.: .:.::.:::::....::
CCDS45 SKWLGESEKLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTEFLVQMQGV
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pF1KSD QSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQK
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CCDS45 GN-NNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDA
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pF1KSD ELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKI
.. .::: :.::::.:.. ...:. . :.:...
CCDS45 NIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVCGPSRTNPSMMIDDLLTPC
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570 580
pF1KSD KRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
CCDS45 SPGDPGAMEMTWMDVPGDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEDFGQES
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CCDS52 MSLLMISENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTYLQ
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170 180 190 200 210 220
pF1KSD QCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSK--------TVM
: . ... .. .. .:: .. ::: . . :: ....:: :. :
CCDS52 Q--KWQQVWQEINVEAKHVKDIMKTLESFKLDST--PLKAAQHDLPASEGEVWSMPVPVE
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230 240 250 260
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. : : :... :. : . :. . : ..:. :. .:
CCDS52 RRPSPGPRKRQSSQYSDPKSHGNRPSTTVRVHRSSAQNVHNDRGKAVRCREKKEQNKGRE
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KSD NKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIV
.: ..:...:. . . . . :..:.. . .:.... :..:::: ::. :.: :
CCDS52 EKNKSPAAVTEPETNKFDSTGYDKDLVEALERDIISQNPNVRWDDIADLVEAKKLLKEAV
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGE
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CCDS52 VLPMWMPEFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNVSSSTLTSKYRGE
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KSD GEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKTEFLIEFDGV--QS
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CCDS52 SEKLVRLLFEMARFYSPATIFIDEIDSI-CSRRGTSEEHEASRRVKAELLVQMDGVGGTS
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450 460 470 480 490
pF1KSD AGDD---RVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQ
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CCDS52 ENDDPSKMVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPSAKGREELLRISL-RELELADD
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500 510 520 530 540 550
pF1KSD KELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMSASEMRN-IRLSDFT
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CCDS52 VDLASIAENMEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRIEGLTPEEIRNLSKEEMHMPTTMEDFE
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560 570 580
pF1KSD ESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
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CCDS52 MALKKVSKSVSAADIERYEKWIFEFGSC
470 480 490
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CCDS31 GVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGY--
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330 340
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CCDS31 -DKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVL
190 200 210 220 230 240
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CCDS31 MVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIF
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pF1KSD IDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSA--GDD---RVLVMGATNRPQEL
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CCDS31 IDEIDSI-CSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDI
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pF1KSD DEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLK-NLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTA
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CCDS31 DEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQ--LEDIAEKIEGYSGADITN
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pF1KSD LAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMSASEMRN-IRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIR
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CCDS31 VCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKYEK
430 440 450 460 470 480
580
pF1KSD WNKDFGDTTV
: .::
CCDS31 WMVEFGSA
490
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CCDS32 RGQIIDFQGLLTDAIKGATSELALNTFDHNPDPSERLLKPLSAFIGMNSEMRELAAVVSR
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CCDS32 DIYLHNPNIKWNDIIGLDAAKQLVKEAVVYPIRYPQLFTGILSPWKGLLLYGPPGTGKTL
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CCDS32 LAKAVATECKTTFFNISASTIVSKWRGDSEKLVRVLFELARYHAPSTIFLDELESVMSQR
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CCDS32 GTASGGEHEGSLRMKTELLVQMDGL-ARSEDLVFVLAASNLPWELDCAMLRRLEKRILVD
300 310 320 330 340
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pF1KSD LPNEETRLLLLKNLL--CKQGSPL---TQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIR
::..:.: .. . : ... : :. : . :.. :.::::::. . ..::. :.:
CCDS32 LPSREARQAMIYHWLPPVSKSRALELHTELEYSVLSQETEGYSGSDIKLVCREAAMRPVR
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD ELKPEQVKNMS-ASEMRNIRL-----SDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
.. ...: .:.. :.: .:: . : . : : . . . : :...:
CCDS32 KIFDALENHQSESSDLPRIQLDIVTTADFLDVLTHTKPS-AKNLAQRYSDWQREFESV
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CCDS73 TYFTIKWMVDAIDPTRKQKVEAQKQAEKLMKQIGVKNVKLSEYEMS--IAAHLVDPLNMH
30 40 50 60 70 80
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CCDS73 VTWSDIAGLDDVITDLKDTVILPIKKKHLFENSRLLQPPKGVLLYGPPGCGKTLIAKATA
90 100 110 120 130 140
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:.. :.:.. ..::.:. ::..::. :.:..: .::::::::::.::.: .: ..:.
CCDS73 KEAGCRFINLQPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHE
150 160 170 180 190 200
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pF1KSD ASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLL
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CCDS73 ATAMMKAQFMSLWDGLDTDHSCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREA
210 220 230 240 250 260
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CCDS73 ILK-LILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDED
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CCDS73 EIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD
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584 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]