Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1095
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1095, 1066 aa
1>>>pF1KSDA1095 1066 - 1066 aa - 1066 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3940+/-0.000541; mu= 3.2611+/- 0.034
mean_var=310.4168+/-63.558, 0's: 0 Z-trim(116.8): 252 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.072795
statistics sampled from 27950 (28230) to 27950 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 16.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055824 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein liga (1066) 7161 767.4 0
XP_016861431 (OMIM: 609729) PREDICTED: E3 ubiquiti (1037) 5348 577.0 2e-163
NP_001290068 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein l ( 764) 5044 544.9 6.5e-154
NP_001290071 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein l ( 783) 5044 544.9 6.6e-154
NP_001290070 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein l ( 788) 5040 544.5 8.8e-154
NP_001290069 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein l ( 723) 4807 520.0 1.9e-146
NP_001158067 (OMIM: 609730) PDZ domain-containing (1036) 2366 263.8 3.7e-69
NP_001290441 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing ( 775) 2108 236.6 4.3e-61
NP_037509 (OMIM: 609730) PDZ domain-containing RIN ( 778) 1969 222.0 1.1e-56
NP_001290444 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing ( 694) 1868 211.3 1.5e-53
NP_001290445 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing ( 688) 1812 205.4 9.1e-52
NP_115901 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing pro ( 769) 1812 205.5 9.8e-52
NP_001290442 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing ( 673) 1793 203.4 3.6e-51
NP_001290443 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing ( 660) 1711 194.8 1.4e-48
XP_016855490 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p ( 992) 352 52.3 1.7e-05
XP_011538770 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1515) 352 52.5 2.2e-05
XP_016855489 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1634) 352 52.5 2.4e-05
NP_795352 (OMIM: 603199) inaD-like protein [Homo s (1801) 352 52.5 2.5e-05
XP_016855488 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1854) 352 52.5 2.6e-05
XP_011538769 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1856) 352 52.5 2.6e-05
XP_016855487 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1879) 352 52.5 2.6e-05
XP_005270398 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1882) 352 52.6 2.6e-05
XP_011538768 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1907) 352 52.6 2.6e-05
XP_011538767 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1912) 352 52.6 2.6e-05
XP_011538766 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1921) 352 52.6 2.6e-05
XP_011538765 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1937) 352 52.6 2.6e-05
XP_011538764 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1937) 352 52.6 2.6e-05
XP_006710341 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1296) 335 50.6 6.9e-05
XP_005270404 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1300) 332 50.3 8.6e-05
XP_011538771 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1344) 331 50.2 9.5e-05
XP_011535418 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 516) 313 47.9 0.00018
XP_011535419 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 512) 310 47.5 0.00023
XP_005265842 (OMIM: 609732) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 728) 288 45.4 0.0014
XP_016864265 (OMIM: 609732) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 728) 288 45.4 0.0014
NP_001119800 (OMIM: 609732) E3 ubiquitin-protein l ( 728) 288 45.4 0.0014
XP_016877107 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 568) 281 44.5 0.002
XP_016877106 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 568) 281 44.5 0.002
NP_003291 (OMIM: 601896,614849) TNF receptor-assoc ( 568) 281 44.5 0.002
NP_663777 (OMIM: 601896,614849) TNF receptor-assoc ( 568) 281 44.5 0.002
NP_665702 (OMIM: 602356) TNF receptor-associated f ( 557) 275 43.9 0.0031
NP_001029082 (OMIM: 602356) TNF receptor-associate ( 557) 275 43.9 0.0031
NP_004610 (OMIM: 602356) TNF receptor-associated f ( 557) 275 43.9 0.0031
XP_016857710 (OMIM: 602356) PREDICTED: TNF recepto ( 557) 275 43.9 0.0031
XP_016877109 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 292) 268 42.9 0.0033
XP_016877108 (OMIM: 601896,614849) PREDICTED: TNF ( 543) 269 43.3 0.0047
NP_663778 (OMIM: 601896,614849) TNF receptor-assoc ( 543) 269 43.3 0.0047
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1630) 275 44.4 0.0064
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1655) 275 44.4 0.0065
>>NP_055824 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein ligase P (1066 aa)
initn: 7161 init1: 7161 opt: 7161 Z-score: 4084.0 bits: 767.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7161; 100.0% identity (100.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1066:1-1066)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KSD SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
1030 1040 1050 1060
>>XP_016861431 (OMIM: 609729) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1037 aa)
initn: 5276 init1: 5276 opt: 5348 Z-score: 3055.2 bits: 577.0 E(85289): 2e-163
Smith-Waterman score: 6908; 97.3% identity (97.3% similar) in 1066 aa overlap (1-1066:1-1037)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPARCRHAGCGQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLGAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 K-----------------------------DNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQI
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEV
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSAT
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWM
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLR
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKER
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQM
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTD
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILEL
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060
pF1KSD SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
1000 1010 1020 1030
>>NP_001290068 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein ligas (764 aa)
initn: 5044 init1: 5044 opt: 5044 Z-score: 2884.2 bits: 544.9 E(85289): 6.5e-154
Smith-Waterman score: 5044; 99.7% identity (99.9% similar) in 763 aa overlap (304-1066:2-764)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
: .:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MINQVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440 450
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KSD DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
340 350 360 370 380 390
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
400 410 420 430 440 450
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
460 470 480 490 500 510
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
520 530 540 550 560 570
880 890 900 910 920 930
pF1KSD PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
640 650 660 670 680 690
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
700 710 720 730 740 750
1060
pF1KSD TRVYNSFLSVTTV
:::::::::::::
NP_001 TRVYNSFLSVTTV
760
>>NP_001290071 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein ligas (783 aa)
initn: 5044 init1: 5044 opt: 5044 Z-score: 2884.1 bits: 544.9 E(85289): 6.6e-154
Smith-Waterman score: 5044; 99.6% identity (99.9% similar) in 763 aa overlap (304-1066:21-783)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
. .:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGCSLCSLQKQEEQYKLLYEVCQVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
10 20 30 40 50
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSA
60 70 80 90 100 110
400 410 420 430 440 450
pF1KSD HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEID
120 130 140 150 160 170
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMD
180 190 200 210 220 230
520 530 540 550 560 570
pF1KSD DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGR
240 250 260 270 280 290
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDA
300 310 320 330 340 350
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELR
360 370 380 390 400 410
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKD
420 430 440 450 460 470
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITE
480 490 500 510 520 530
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHI
540 550 560 570 580 590
880 890 900 910 920 930
pF1KSD PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYI
600 610 620 630 640 650
940 950 960 970 980 990
pF1KSD TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRRE
660 670 680 690 700 710
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDG
720 730 740 750 760 770
1060
pF1KSD TRVYNSFLSVTTV
:::::::::::::
NP_001 TRVYNSFLSVTTV
780
>>NP_001290070 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein ligas (788 aa)
initn: 5040 init1: 5040 opt: 5040 Z-score: 2881.8 bits: 544.5 E(85289): 8.8e-154
Smith-Waterman score: 5040; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (307-1066:29-788)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKMEHKRMILLFSKFTLIHKPHGGRWYLVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVL
10 20 30 40 50
340 350 360 370 380 390
pF1KSD RRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEY
60 70 80 90 100 110
400 410 420 430 440 450
pF1KSD YDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNS
120 130 140 150 160 170
460 470 480 490 500 510
pF1KSD IAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDR
180 190 200 210 220 230
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDE
240 250 260 270 280 290
580 590 600 610 620 630
pF1KSD STRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYL
300 310 320 330 340 350
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIE
360 370 380 390 400 410
700 710 720 730 740 750
pF1KSD LECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSS
420 430 440 450 460 470
760 770 780 790 800 810
pF1KSD AYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKNLLSITEDPE
480 490 500 510 520 530
820 830 840 850 860 870
pF1KSD VGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAH
540 550 560 570 580 590
880 890 900 910 920 930
pF1KSD AQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKR
600 610 620 630 640 650
940 950 960 970 980 990
pF1KSD PVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMM
660 670 680 690 700 710
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD QSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRV
720 730 740 750 760 770
1060
pF1KSD YNSFLSVTTV
::::::::::
NP_001 YNSFLSVTTV
780
>>NP_001290069 (OMIM: 609729) E3 ubiquitin-protein ligas (723 aa)
initn: 4807 init1: 4807 opt: 4807 Z-score: 2750.0 bits: 520.0 E(85289): 1.9e-146
Smith-Waterman score: 4807; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (344-1066:1-723)
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKM
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPSPPVLDPYLLPEEHPSAHEYYDPNDYIGDIHQEMDREELELEEVDLYRMNSQDKLGL
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEEN
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGG
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTL
220 230 240 250 260 270
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDA
280 290 300 310 320 330
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSI
340 350 360 370 380 390
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEG
400 410 420 430 440 450
800 810 820 830 840 850
pF1KSD AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVGTTEAYGPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
460 470 480 490 500 510
860 870 880 890 900 910
pF1KSD KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLGSAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPT
520 530 540 550 560 570
920 930 940 950 960 970
pF1KSD PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYW
580 590 600 610 620 630
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKI
640 650 660 670 680 690
1040 1050 1060
pF1KSD FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
700 710 720
>>NP_001158067 (OMIM: 609730) PDZ domain-containing RING (1036 aa)
initn: 2915 init1: 661 opt: 2366 Z-score: 1362.6 bits: 263.8 E(85289): 3.7e-69
Smith-Waterman score: 3877; 57.5% identity (79.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1066:1-1036)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGFELDRFDGDVDPDLKCALCHKVLEDPLTTPCGHVFCAGCVLPWVVQEGSCPARCRGRL
::: :.:: ::: :.: :: .:::.:: :::::::::.:.:::.:.. :: .:. :
NP_001 MGFALERFAEAVDPALECKLCGQVLEEPLCTPCGHVFCASCLLPWAVRRRRCPLQCQP-L
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD SAKELNHVLPLKRLILKLDIKCAYATRGCGRVVKLQQLPEHLERCDFAPAR-CR-HAGCG
. :: .::::. :: :: ..: : .::::. :.:..: :.:.:::.::: : ..::.
NP_001 APGELYRVLPLRSLIQKLRVQCDYRARGCGHSVRLHELEAHVEHCDFGPARRLRSRGGCA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QVLLRRDVEAHMRDACDARPVGRCQEGCGLPLTHGEQRAGGHCCARALRAHNGALQARLG
. : .: : : .: : . : :.:: :..: .: :
NP_001 SGLGGGEVPA--RGGCGPTP----RAG----------RGGG--------ARGGPPGGRWG
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ALHKALKKEALRAGKREKSLVAQLAAAQLELQMTALRYQKKFTEYSARLDSLSRCVAAPP
.. ..: .:::.:.::: : : :.:.:: :::.:::.: :.. .. :.
NP_001 R-GRGPGPRVLAWRRREKALLAQLWALQGEVQLTARRYQEKFTQYMAHVRNF---VGDLG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GG--KGEETKSLTLVLHRDSGSLGFNIIGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEG
:: . : : .:.::.:.. .::::::::::. .:..:.:.:::.::::...::: .
NP_001 GGHRRDGEHKPFTIVLERENDTLGFNIIGGRPNQNNQEGTSTEGIYVSKILENGPADRAD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVD
::.:::.:.::::.:::.:::..:::::..:::::::::::::: .. . :: ::..
NP_001 GLEIHDKIMEVNGKDLSKATHEEAVEAFRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KSD TGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD--PYLLPEE----HPSAHEYYDPNDYIGDIHQE
..:::::::::::::.:. :.::: : :.:: . :: ::.:. :.::... .
NP_001 ASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPDICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPAD
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD MDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGD
:: :..: :::.: :..::.:::::::::::::.: :::.::.::::::::::::::::
NP_001 ADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTVCYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGD
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pF1KSD RIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDML
::.:::: .:::::::::::...: : . ::.::::.::::::..:.::.::..:...::
NP_001 RILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKRIVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEML
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pF1KSD EEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQE
::.:..::: ::. : : ::..:. ::::::: ::.::::::::::::: :::::::::
NP_001 EEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGTTDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQE
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pF1KSD NNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFR
: ..: ...: : ..: : ::::::: .: . :::..:.. :.: .: : ..:::::
NP_001 NAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLGSVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFR
580 590 600 610 620
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pF1KSD ELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHK
.::::::.... : ::: :. .. .... :.:..::.:::::::.::::: .:..::.
NP_001 QLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECNQGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHR
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pF1KSD MQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRST
.:.. .:: . : ::..::::::::::..: .:.:: : ::::::::::::::.::::::
NP_001 LQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSIDMQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRST
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSL
:::.. :::.:: :. . . . ......:.. : .::. . : .
NP_001 PLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRSTMAATQSSSGQSSKE-------------STSTKA
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pF1KSD KELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQKLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYM
: . . ::::. . .::. : . .. :: :: : :..:.:::::.::::::
NP_001 KTTEQGCSAESKEK-VLEGSKLPDQEKAVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYM
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920 930 940
pF1KSD QLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSSPTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLR
:::::::::::::::.:::::::. : :::.:::::::::::::::::::::::.:.
NP_001 QLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--SQKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILK
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pF1KSD ERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLK
::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::::::::::::.:::.:::
NP_001 ERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGRYWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLK
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pF1KSD E--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLS
: :.... .::.::.:::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::
NP_001 ESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKRNKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLS
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pF1KSD VTTV
::::
NP_001 VTTV
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pF1KSD DGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEAFKTAKEPIVV
...:::..::. ...:...:....:::.:.
NP_001 MGCNMCVVQKPEEQYKVMLQVNGKELSKLSQEQTLQALRSSKEPLVI
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pF1KSD QVLRRTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPP--VLDPYLLPEEHP
:::::.:: . . . ::::.:::::::::::::: :. :.:: .:.::.: : :
NP_001 QVLRRSPRLRGDSSCHDLQLVDSGTQTDITFEHIMALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPP
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pF1KSD SAHEYYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYIS
.:::::: ... :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..
NP_001 ISHEYYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVG
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pF1KSD EIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEG
:..::::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: .
NP_001 EVNPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKR
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pF1KSD WMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSG
: :.::.:::::. . .: . .: .. . :: ..:. :. :.. :::..: :::
NP_001 WKDSDRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSG
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pF1KSD VGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--A
::::::::::.::::.. ::. .:.: .. ::. . :.: : :. :: .:... :
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pF1KSD DCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDK
.: :. .: ::.:::::.::...... :: .: :: ::.... ::. .
NP_001 GLGGGDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGH
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pF1KSD ELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDI
:. .:.:::: .:..: .:.::.:::::.:. ..:.:.. .. . .: . ..::::::
NP_001 EMAMLEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDI
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pF1KSD TELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGP
.::::::::::.:::::::::::::: .: :.. :::: : : .. : ::
NP_001 SELPEKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GP
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pF1KSD ASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLP
: . . . : :.:. ::.. :: :. .:. .. : :.: . : .
NP_001 AVATPAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPE
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pF1KSD SYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRM
: . .: ...::.: .:: .. : ... .::.. . ... . :::
NP_001 SSPYLSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRM
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pF1KSD EWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
:::::.:::::::..:::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EWKVKVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERK
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pF1KSD QHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKEQQAADDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMT
:::..:.:::.::::::::::.::.::: .:.. :.::. :::.: ::::::::.:::.:
NP_001 QHLIRAREQRKRREFMMQSRLECLREQQNGDSKPELNIIALSHRKTMKKRNKKILDNWIT
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pF1KSD IQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
:::.:.::..: :: :::: .::::::
NP_001 IQEMLAHGARSADGKRVYNPLLSVTTV
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pF1KSD IGGRPSVDNHDGSSSEGIFVSKIVDSGPAAKEGGLQIHDRIIEVNGRDLSRATHDQAVEA
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NP_037 MGCNLCTFQKREEHYKLLYEVSQVNGKDLSKATHEEAVEA
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pF1KSD FKTAKEPIVVQVLRRTPRTK-MFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPPVLD
:..:::::::::::::: .. . :: ::....:::::::::::::.:. :.::: :
NP_037 FRNAKEPIVVQVLRRTPLSRPAYGMASEVQLMNASTQTDITFEHIMALAKLRPPTPPVPD
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:.:: . :: ::.:. :.::... . :: :..: :::.: :..::.::::::
NP_037 ICPFLLSDSCHSLHPMEHEFYEDNEYISSLPADADRTEDFEYEEVELCRVSSQEKLGLTV
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pF1KSD CYRTDDEDDIGIYISEIDPNSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKN
:::::::.: :::.::.::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::...: :
NP_037 CYRTDDEEDTGIYVSEVDPNSIAAKDGRIREGDRILQINGEDVQNREEAVALLSNDECKR
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pF1KSD FSLLIARPELQLDEGWMDDDRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTAS-VLQQKKHDEDGGT
. ::.::::.::::::..:.::.::..:...::::.:..::: ::. : : ::..:. ::
NP_037 IVLLVARPEIQLDEGWLEDERNEFLEELNLEMLEEEHNEAMQPTANEVEQPKKQEEEEGT
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pF1KSD TDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLG
::::: ::.::::::::::::: :::::::::: ..: ...: : ..: : ::::::
NP_037 TDTATSSSNNHEKDSGVGRTDESLRNDESSEQENAAEDPNSTS--LKSKRDLGQSQDTLG
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pF1KSD SGDLPFSNESFISADCTDADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYPSGPLDAG
: .: . :::..:.. :.: .: : ..:::::.::::::.... : ::: :. .. .
NP_037 SVELQY-NESLVSGEYIDSDCIGNPDEDCERFRQLLELKCKIRNHGEYDLYYSSSTIECN
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pF1KSD KSDPESVDKELELLNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSID
... :.:..::.:::::::.::::: .:..::..:.. .:: . : ::..::::::::::
NP_037 QGEQEGVEHELQLLNEELRNIELECQNIMQAHRLQKVTDQYGDIWTLHDGGFRNYNTSID
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pF1KSD VRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGA
..: .:.:: : ::::::::::::::.:::::::::.. :::.:: :. . . . ...
NP_037 MQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTAESCRSTPLTVDRSPDSSLPRVINLTNKKNLRST
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pF1KSD VGTTEAY-GPASKNLLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASDGSRSPTPSQ
...:.. : .::. . : . : . . ::::. . .::. : .
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pF1KSD KLGS--AYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLSS
.. :: :: : :..:.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::. :
NP_037 AVSEHIPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--S
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pF1KSD PTPSEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGR
:::.:::::::::::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::..:::::::
NP_037 QKCSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRILKERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGR
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pF1KSD YWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDCLKE--QQAADDRKEMNILELSHKKMMKKR
::::::::::::.::::::::::::.:::.:::: :.... .::.::.:::::::::::
NP_037 YWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLECLKESPQSGSEGKKEINIIELSHKKMMKKR
690 700 710 720 730 740
1030 1040 1050 1060
pF1KSD NKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSFLSVTTV
::::.:::::::::.:::.::::::::.:.:::::::
NP_037 NKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAFLSVTTV
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>>NP_001290444 (OMIM: 300634) PDZ domain-containing prot (694 aa)
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pF1KSD RTPRTKMFTPPSESQLVDTGTQTDITFEHIMALTKMSSPSPP--VLDPYLLPEEHPSAHE
::: :. :.:: .:.::.: : : .::
NP_001 MALGKLRPPTPPMVILEPYVLSELPPISHE
10 20 30
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pF1KSD YYDPNDYIGDIHQEMDR-EELELEEVDLYRMNSQDKLGLTVCYRTDDEDDIGIYISEIDP
:::: ... :: :: .::: :::.::. . .::::: ::::::::.:.:::..:..:
NP_001 YYDPAEFMEGGPQEADRLDELEYEEVELYKSSHRDKLGLMVCYRTDDEEDLGIYVGEVNP
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD NSIAAKDGRIREGDRIIQINGIEVQNREEAVALLTSEENKNFSLLIARPELQLDEGWMDD
:::::::::::::::::::::..:::::::::.:..::: :.:::.:::: :: . : :.
NP_001 NSIAAKDGRIREGDRIIQINGVDVQNREEAVAILSQEENTNISLLVARPESQLAKRWKDS
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD DRNDFLDDLHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHDEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRT
::.:::::. . .: . .: .. . :: ..:. :. :.. :::..: :::::::
NP_001 DRDDFLDDFGSE--NEGELRARKLKSPPAQQPGNEEEKGAPDAGPGLSNSQELDSGVGRT
160 170 180 190 200
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pF1KSD DESTRNDESSEQENNGDDATASSNPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFIS--ADCTD
::::::.::::.. ::. .:.: .. ::. . :.: : :. :: .:... :
NP_001 DESTRNEESSEHDLLGDEPPSSTNTPGSLRKFGLQGDALQSRDFHFSMDSLLAEGAGLGG
210 220 230 240 250 260
640 650 660 670 680
pF1KSD ADYLGIPVDECERFRELLELKCQVKSATPYGLYYP--SG---PLDAGKSDPESVDKELEL
.: :. .: ::.:::::.::...... :: .: :: ::.... ::. .:. .
NP_001 GDVPGLTDEEYERYRELLEIKCHLENGNQLGLLFPRASGGNSALDVNRN--ESLGHEMAM
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD LNEELRSIELECLSIVRAHKMQQLKEQYRESWMLHNSGFRNYNTSIDVRRHELSDITELP
:.:::: .:..: .:.::.:::::.:. ..:.:.. .. . .: . ..::::::.:::
NP_001 LEEELRHLEFKCRNILRAQKMQQLRERCMKAWLLEEESLYDLAAS-EPKKHELSDISELP
330 340 350 360 370 380
750 760 770 780 790 800
pF1KSD EKSDKDSSSAYNTGESCRSTPLTLEISPDNSLRRAAEGISCPSSEGAVGTTEAYGPASKN
:::::::.:::::::::::::: .: :.. :::: : : .. : ::: .
NP_001 EKSDKDSTSAYNTGESCRSTPLLVEPLPESPLRRAMAGNS------NLNRTPP-GPAVAT
390 400 410 420 430
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pF1KSD LLSITEDPEVGTPTYSPSLKELDPNQPLESKERRASD--GSRSPTPSQKLGSAYLPSYHH
. . : :.:. ::.. :: :. .:. .. : :.: . : . : .
NP_001 PAKAAPPP--GSPAKFRSLSR-DP----EAGRRQHAEERGRRNPKTGLTLERVGPESSPY
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD SPYKHAHIPAHAQHYQSYMQLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCK--DLSSPTPSEPRMEWKV
.: ...::.: .:: .. : ... .::.. . ... . :::::::
NP_001 LSRRHRGQGQEGEHYHSCVQLAPTRGLEELGHGPLSLAGGPRVGGVAAAATEAPRMEWKV
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD KIRSDGTRYITKRPVRDRLLRERALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLV
:.:::::::..:::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_001 KVRSDGTRYVAKRPVRDRLLKARALKIREERSGMTTDDDAVSEMKMGRYWSKEERKQHLI
560 570 580 590 600 610
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