Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1099
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1099, 804 aa
1>>>pF1KSDA1099 804 - 804 aa - 804 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6913+/-0.00119; mu= 5.1727+/- 0.073
mean_var=208.2809+/-42.451, 0's: 0 Z-trim(109.6): 135 B-trim: 621 in 2/49
Lambda= 0.088869
statistics sampled from 10833 (10978) to 10833 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 5290 691.8 1.2e-198
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 2877 382.5 1.6e-105
CCDS58756.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 405) 2269 304.3 2.7e-82
CCDS55185.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 396) 1759 238.9 1.3e-62
CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10 ( 686) 1658 226.1 1.5e-58
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 1648 224.8 3.7e-58
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 1639 223.7 8.4e-58
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 1602 219.0 2.8e-56
CCDS83243.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 343) 1515 207.5 3e-53
CCDS78287.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 576) 1504 206.3 1.2e-52
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 1429 196.7 9.4e-50
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 1381 190.7 8.8e-48
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 1371 189.3 1.8e-47
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 1304 180.9 1.1e-44
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 434 69.2 3.1e-11
CCDS75788.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1122) 433 69.2 4.3e-11
CCDS6362.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1129) 433 69.2 4.3e-11
>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (804 aa)
initn: 5290 init1: 5290 opt: 5290 Z-score: 3680.1 bits: 691.8 E(32554): 1.2e-198
Smith-Waterman score: 5290; 99.8% identity (99.9% similar) in 804 aa overlap (1-804:1-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS25 GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD STSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 STSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 CESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIR
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVL
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KSD MATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
790 800
>>CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (857 aa)
initn: 2901 init1: 2872 opt: 2877 Z-score: 2007.7 bits: 382.5 E(32554): 1.6e-105
Smith-Waterman score: 5036; 93.4% identity (93.5% similar) in 836 aa overlap (1-783:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS33 GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KSD SSPKTNGLSKDMSSLHISPNS---------------------------------------
:::::::::::::::::::::
CCDS33 SSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVSSADQ
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480
pF1KSD --------------DTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKA
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNK
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSR
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKL
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKL
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKG
730 740 750 760 770 780
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLS
790 800 810 820 830 840
790 800
pF1KSD RRNNNRNNSSGRVPTII
CCDS33 RRNNNRNNSSGRVPTII
850
>>CCDS58756.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (405 aa)
initn: 2269 init1: 2269 opt: 2269 Z-score: 1590.9 bits: 304.3 E(32554): 2.7e-82
Smith-Waterman score: 2269; 99.4% identity (99.7% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS58 GPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGLPFFVLALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
CCDS58 ASTYLRPAGARARQSSPWPGPRGGQTSPHCAEGPQSAQLSGAMMN
370 380 390 400
>>CCDS55185.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (396 aa)
initn: 1569 init1: 1543 opt: 1759 Z-score: 1237.7 bits: 238.9 E(32554): 1.3e-62
Smith-Waterman score: 1759; 83.3% identity (95.9% similar) in 317 aa overlap (4-319:60-376)
10 20 30
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYEL
: :.::::::::::::::::::::.::.:
CCDS55 LVCGGQFGGAGPGAGGGGGPSQQLAGGPPQQFALSNSAAIRAEIQRFESVHPNIYAIYDL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLT
.::.:. .::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 IERIEDLALQNQIREHVISIEDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLSSGKSALVHRYLT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::.::::::::::::
CCDS55 GTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVVFVFSLEDEISFQ
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCAT
:::.:. :. ..::.::.:.::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS55 TVYNYFLRLCSFRNASEVPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDLKRCTYYETCAT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGG
:::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::::::.: .:.. ::::.:..::::
CCDS55 YGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGG
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD S-LSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKG
: .:::::::::::::::.::::.. ...::::.:::::::::.::
CCDS55 SAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTICATVSNFSSTKR
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVH
CCDS55 PFQLLPN
390
>>CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10 (686 aa)
initn: 2187 init1: 1657 opt: 1658 Z-score: 1164.4 bits: 226.1 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 2667; 77.6% identity (88.0% similar) in 532 aa overlap (245-776:185-684)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGS
:.:. :: . ::.:::... :::::
CCDS44 ASQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQLHSFA----VSTVHITKNRNGGGS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLE
:..::::.::::: ::.. ...::::::::::: :.: : ::::::.::: ::::.:. :
CCDS44 LNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWSNLFTSEKGSHPDKERKAPE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGK
..::.:::::::::::::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: :
CCDS44 NHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKK
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPS
:::: .:.::::: : :::::::::: :.::::::: :::::::.: :::
CCDS44 EIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDM---------DTGLGDSICFSPS
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWH
:::::::::.::::::::.::: .::::.:: .::: ::::::
CCDS44 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNF------------------MIVSATGQTWH
390 400 410 420
520 530 540 550 560 570
pF1KSD FEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDC
::::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.:::::.::::
CCDS44 FEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNAHCVDY
430 440 450 460 470 480
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANS
:::::.:::::::.:::::::::::.:::.:::::::.:::::.:: ::::::::.::::
CCDS44 ETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANS
490 500 510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRT
.:: ::::.::::: :::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS44 IWEGSSQGQTKPSVKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLQT
550 560 570 580 590 600
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALA
::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.
CCDS44 AILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALT
610 620 630 640 650 660
760 770 780 790 800
pF1KSD YARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
:::::::::::.::::::::::
CCDS44 YARQASSQECINVLLQYGCPDECV
670 680
>>CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 (663 aa)
initn: 2365 init1: 1636 opt: 1648 Z-score: 1157.7 bits: 224.8 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 2653; 76.9% identity (87.8% similar) in 532 aa overlap (245-776:162-661)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGS
:.:. :: . ::.::: . :::::
CCDS72 AIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQLHSFA----VSTVHIMKKRNGGGS
140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLE
:..::::.::::: ::.. ...::::::::::: :.: : ::::::.::::::::.:. :
CCDS72 LNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWSNLFTSEKGSDPDKERKAPE
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGK
..::.:::::::::::::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: :
CCDS72 NHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKK
250 260 270 280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPS
:::: .:.::::: : :::::.:::. :.::::::: :::::::.: :::
CCDS72 EIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISTSKSNGLSKDM---------DTGLGDSICFSPS
310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWH
:::::::::.::::::::.::: .::::.:: .::: ::::::
CCDS72 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNF------------------MIVSATGQTWH
360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KSD FEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDC
::::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::.:::::::.:::::.:::::
CCDS72 FEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSKAMALQSIQNMRGNAHCVDC
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANS
:::::.:::::::.:::::::::::.:::.:::::::.:::::.:: ::::::::.::::
CCDS72 ETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANS
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRT
.:: ::::.:::: :::::::::::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS72 IWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELSLGQQLLRATADEDLQT
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALA
::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.
CCDS72 AILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALT
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800
pF1KSD YARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
:::::::::::.:::::::::.
CCDS72 YARQASSQECINVLLQYGCPDKCV
640 650 660
>>CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 (686 aa)
initn: 2171 init1: 1637 opt: 1639 Z-score: 1151.2 bits: 223.7 E(32554): 8.4e-58
Smith-Waterman score: 2643; 76.9% identity (87.2% similar) in 532 aa overlap (245-776:185-684)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGS
:.:. :: . ::.::: . :::::
CCDS44 AIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRTLSIPDEQLHSFA----VSTVHIMKKRNGGGS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLE
:..::::.::::: ::.. ...::::::::::: :.: : ::::::.::::::::.:. :
CCDS44 LNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWSNLFTSEKGSDPDKERKAPE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGK
..::.:::::::::::::::::::: : : :::::::::.::.:::. :: :::.:.: :
CCDS44 NHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGMLTYYSSLGDYMKNIHKK
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPS
:::: .:.::::: : :::::.:::: :.::::::: :::::::.: :::
CCDS44 EIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISSSKSNGLSKDM---------DTGLGDSICFSPS
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWH
:::::::::.::::::::.::: .::::.:: .::: ::::::
CCDS44 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNF------------------MIVSATGQTWH
390 400 410 420
520 530 540 550 560 570
pF1KSD FEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDC
::::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.:::::.:::::
CCDS44 FEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNAHCVDC
430 440 450 460 470 480
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANS
:::::.:::::::.:::::::::::.:: ::::::::.:::::.:: :::::: :.::::
CCDS44 ETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGPHLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIVNDLANS
490 500 510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRT
.:: ::::.:::: :::::::::::.:::.::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS44 IWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELSLGQQLLRATADEDLQT
550 560 570 580 590 600
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALA
::::::::: .::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.
CCDS44 AILLLAHGSCEEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALT
610 620 630 640 650 660
760 770 780 790 800
pF1KSD YARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
:::::::::::.::::::::::
CCDS44 YARQASSQECINVLLQYGCPDECV
670 680
>>CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (911 aa)
initn: 3964 init1: 1579 opt: 1602 Z-score: 1123.9 bits: 219.0 E(32554): 2.8e-56
Smith-Waterman score: 3827; 69.1% identity (85.2% similar) in 839 aa overlap (19-804:75-911)
10 20 30 40
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIRE
::::::::::.::.:.::.:. .:::::::
CCDS43 GGGGPSQQLAGGPPQQFALSNSAAIRAEIQRFESVHPNIYAIYDLIERIEDLALQNQIRE
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KSD HVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFK
:::.:::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HVISIEDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLSSGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFK
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KSD KEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNT
:::::::::::::::::::::: ::: :::::.:::::::::::::::.:. :. ..::.
CCDS43 KEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVVFVFSLEDEISFQTVYNYFLRLCSFRNA
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SEIPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQK
::.:.::::::::::.::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SEVPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQK
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KSD IVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGS-LSDYSSSVPSTPS
.:: ::::::.::::::::::::::.: .:.. ::::.:..::::: .::::::::::::
CCDS43 VVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPS
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIP
:::.::::.. ...::::.:::::::::.::::::.: :.:::. : ..::::::::::
CCDS43 ISQRELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KSD IKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPG
::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 IKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPG
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440
pF1KSD KRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHI-----SPNSDT-------------------
:: :::: : :: .::..:::: . :. .. .:.: .
CCDS43 KRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTGAPHSASSASLHSERPLSSSAWAGPR
470 480 490 500 510 520
450 460 470
pF1KSD --GLGDSVCS-----------------------SPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRR
:: . :: .:. ..:::::::::::.:::::::
CCDS43 PEGLHQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPASGPAEVLSSSPKLDPPPSPHSNRKKHRR
530 540 550 560 570 580
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASL
::::.. . :: :...:: ::.:::..::::::::::::.: :::. :::....::::::
CCDS43 KKSTGTPRPDGPSSATEEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASL
590 600 610 620 630 640
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIH
:.:.:.:.:.:: .:. :.:.:..:..:::: :.::.. ::.::::::::::::::::::
CCDS43 QGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIH
650 660 670 680 690 700
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERW
:.::.:::::::::::::: ::. ::...:: ::::::: . : .::. :. :::::::
CCDS43 RHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACREEKERW
710 720 730 740 750 760
660 670 680 690 700 710
pF1KSD IRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRT
::::::::::::::: ... :::.::::....::: ..::::::..::::: :.:::::
CCDS43 IRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRT
770 780 790 800 810 820
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERF
::::. .:::..:::::::::: .:::.: : :::::.:.:::: :.:.:.::: :
CCDS43 ALHLSSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGCPGEGC
830 840 850 860 870 880
780 790 800
pF1KSD VLMATPNLSRRNNNRNNSSG---RVPTII
: ::: :. : .: :. : :...
CCDS43 GLAPTPN--REPANGTNPSAELHRSPSLL
890 900 910
>>CCDS83243.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (343 aa)
initn: 1523 init1: 1499 opt: 1515 Z-score: 1069.5 bits: 207.5 E(32554): 3e-53
Smith-Waterman score: 1515; 82.0% identity (94.6% similar) in 278 aa overlap (4-281:60-334)
10 20 30
pF1KSD MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYEL
: :.::::::::::::::::::::.::.:
CCDS83 LVCGGQFGGAGPGAGGGGGPSQQLAGGPPQQFALSNSAAIRAEIQRFESVHPNIYAIYDL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLT
.::.:. .::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS83 IERIEDLALQNQIREHVISIEDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLSSGKSALVHRYLT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::.::::::::::::
CCDS83 GTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVVFVFSLEDEISFQ
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCAT
:::.:. :. ..::.::.:.::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS83 TVYNYFLRLCSFRNASEVPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTDLKRCTYYETCAT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGG
:::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::::::.: .:.. ::::.: .
CCDS83 YGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQIC---A
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SLSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGL
..:..::.
CCDS83 TVSNFSSTKRPFQLLPN
330 340
>>CCDS78287.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (576 aa)
initn: 1290 init1: 1290 opt: 1504 Z-score: 1058.7 bits: 206.3 E(32554): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 1504; 83.6% identity (95.5% similar) in 269 aa overlap (52-319:288-556)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD SVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLA
: :.::::::::::::::::::::::::.
CCDS78 LLTSRFRRREPAPAAPLWGRRAAAAPELLRAPSDSFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLS
260 270 280 290 300 310
90 100 110 120 130 140
pF1KSD SGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::.
CCDS78 SGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPELQFAAWVDAVV
320 330 340 350 360 370
150 160 170 180 190 200
pF1KSD FVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSEIPLVLVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSND
:::::::::::::::.:. :. ..::.::.:.::::::::::.::::::::.::::::.:
CCDS78 FVFSLEDEISFQTVYNYFLRLCSFRNASEVPMVLVGTQDAISAANPRVIDDSRARKLSTD
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVS
:::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::::::.: .:..
CCDS78 LKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKVVALRKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIP
440 450 460 470 480 490
270 280 290 300 310 320
pF1KSD AVHISQTSNGGGS-LSDYSSSVPSTPSISQKELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTS
::::.:..::::: .:::::::::::::::.::::.. ...::::.:::::::::.::
CCDS78 AVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQRELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTI
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370 380
pF1KSD RKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTY
CCDS78 CATVSNFSSTKRPFQLLPN
560 570
804 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:02:01 2016 done: Thu Nov 3 05:02:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]