Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1129
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1129, 587 aa
1>>>pF1KSDA1129 587 - 587 aa - 587 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2926+/-0.000456; mu= 18.9767+/- 0.028
mean_var=76.3797+/-16.835, 0's: 0 Z-trim(108.6): 393 B-trim: 1394 in 2/52
Lambda= 0.146752
statistics sampled from 16229 (16673) to 16229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 9.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 3878 831.5 0
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 3677 788.9 0
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 3343 718.1 1.7e-206
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 3078 662.1 1.5e-189
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 3078 662.1 1.5e-189
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 3030 651.9 1.6e-186
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 2967 638.6 1.8e-182
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 2758 594.3 3.2e-169
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 2758 594.3 3.2e-169
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 2587 558.1 2.5e-158
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 2587 558.1 2.5e-158
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 2346 507.0 5.1e-143
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 2188 473.6 5.8e-133
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 1513 330.7 7.8e-90
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 1513 330.8 9.2e-90
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 1513 330.8 9.7e-90
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1513 330.8 1e-89
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 1513 330.8 1e-89
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1505 329.0 2.5e-89
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1505 329.1 2.6e-89
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1505 329.1 2.7e-89
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1504 328.9 3.8e-89
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1504 328.9 3.8e-89
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1504 328.9 3.8e-89
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1503 328.7 4.4e-89
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1503 328.7 4.4e-89
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1503 328.7 4.4e-89
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 1467 321.1 8.2e-87
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 1461 319.7 1.6e-86
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 1416 310.3 1.4e-83
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 1406 308.2 6.2e-83
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 1391 305.0 5.4e-82
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 1387 304.1 1e-81
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 1382 303.0 1.6e-81
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 1317 289.2 2.1e-77
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 1317 289.2 2.3e-77
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1313 288.4 4.6e-77
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1313 288.4 4.6e-77
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1248 274.6 5.2e-73
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1248 274.6 5.7e-73
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1204 265.4 4.1e-70
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1204 265.4 4.1e-70
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1204 265.4 4.1e-70
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1204 265.4 4.1e-70
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1204 265.4 4.1e-70
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 1093 241.8 4.4e-63
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 1078 238.7 4.2e-62
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 1052 233.1 1.9e-60
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 1010 224.2 8.5e-58
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1006 223.4 1.7e-57
>>NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein 3 i (587 aa)
initn: 3878 init1: 3878 opt: 3878 Z-score: 4439.7 bits: 831.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3878; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 KVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KSD VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
550 560 570 580
>>NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein (555 aa)
initn: 3677 init1: 3677 opt: 3677 Z-score: 4210.1 bits: 788.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3677; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (33-587:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD GESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580
pF1KSD GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
520 530 540 550
>>NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein (505 aa)
initn: 3343 init1: 3343 opt: 3343 Z-score: 3828.5 bits: 718.1 E(85289): 1.7e-206
Smith-Waterman score: 3343; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (83-587:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580
pF1KSD CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
460 470 480 490 500
>>NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isoform (593 aa)
initn: 3459 init1: 3064 opt: 3078 Z-score: 3524.3 bits: 662.1 E(85289): 1.5e-189
Smith-Waterman score: 3078; 77.7% identity (93.0% similar) in 582 aa overlap (7-587:12-593)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMI
: . : ... ::. ... .:::: :: :::::::::::..::::: :
NP_009 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIE
::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.
NP_009 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAY
:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:
NP_009 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAK
::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.
NP_009 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPR
::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :
NP_009 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGG
::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::
NP_009 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAY
::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::
NP_009 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVA
. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:
NP_009 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCA
.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::
NP_009 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
NP_009 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isofo (597 aa)
initn: 3755 init1: 3064 opt: 3078 Z-score: 3524.2 bits: 662.1 E(85289): 1.5e-189
Smith-Waterman score: 3078; 77.7% identity (93.0% similar) in 582 aa overlap (7-587:16-597)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLC
: . : ... ::. ... .:::: :: :::::::::::..:::
NP_001 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYT
:: :::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.::
NP_001 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQ
:::.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..
NP_001 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLE
::.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: :
NP_001 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPR
::.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. :
NP_001 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVY
:. :::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.
NP_001 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLAS
::::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:
NP_001 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEW
::::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .::::
NP_001 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNA
:.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::
NP_001 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
NP_001 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like prot (555 aa)
initn: 3420 init1: 3025 opt: 3030 Z-score: 3469.7 bits: 651.9 E(85289): 1.6e-186
Smith-Waterman score: 3030; 79.8% identity (94.2% similar) in 555 aa overlap (33-587:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD GESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
: :::::::::::..::::: :::::.::
XP_016 MKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEIS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.::::::::
XP_016 AHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
:::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:::::: .:
XP_016 LLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::
XP_016 VLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.
XP_016 LLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::::::::::
XP_016 MVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.::::
XP_016 TVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWF
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
:::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::
XP_016 HVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580
pF1KSD GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
XP_016 GGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
520 530 540 550
>>XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like prot (633 aa)
initn: 3647 init1: 2956 opt: 2967 Z-score: 3396.9 bits: 638.6 E(85289): 1.8e-182
Smith-Waterman score: 2985; 73.0% identity (87.2% similar) in 618 aa overlap (11-587:16-633)
10 20 30 40
pF1KSD MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELR----------
: ... ::. ... .:::: :: ::::::::::
XP_011 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRRQSHSATQAG
10 20 30 40 50 60
50 60 70
pF1KSD ------------------------------SKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPY
:..::::: :::::.:: ::::::::::::
XP_011 MQWRDLSSLQPPTPGFKRLSHLSLPSSWDYSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPY
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KSD FCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMD
: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.:::::::::::::.::::.:
XP_011 FHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQD
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD VRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLD
:...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:::::: .:.:.::::.:...
XP_011 VKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIE
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KSD QVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVE
::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::::::.:::: ::
XP_011 QVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVE
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KSD EEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAI
::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.:.::::::::::
XP_011 EEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAI
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQW
::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::::::::::::::: :: :::::
XP_011 RSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQW
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KSD TSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSV
::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.:::: :::::::::::
XP_011 TSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSV
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD GVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYA
::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::::::::.. :::
XP_011 GVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYA
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASV
.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASV
550 560 570 580 590 600
560 570 580
pF1KSD EYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
XP_011 EYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
610 620 630
>>XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like prot (505 aa)
initn: 3449 init1: 2758 opt: 2758 Z-score: 3159.1 bits: 594.3 E(85289): 3.2e-169
Smith-Waterman score: 2758; 79.4% identity (94.5% similar) in 505 aa overlap (83-587:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
::::.::...::.::: :: ::::.::::
XP_016 MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
:.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::
XP_016 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : :
XP_016 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
:.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::.
XP_016 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
:::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::
XP_016 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::
XP_016 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :
XP_016 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::
XP_016 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580
pF1KSD CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
XP_016 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
460 470 480 490 500
>>NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isofo (505 aa)
initn: 3449 init1: 2758 opt: 2758 Z-score: 3159.1 bits: 594.3 E(85289): 3.2e-169
Smith-Waterman score: 2758; 79.4% identity (94.5% similar) in 505 aa overlap (83-587:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
::::.::...::.::: :: ::::.::::
NP_001 MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
:.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::
NP_001 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : :
NP_001 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
:.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::.
NP_001 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
:::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.:::::::::::.:.::: :.::
NP_001 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::
NP_001 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
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.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]