FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1186, 403 aa 1>>>pF1KSDA1186 403 - 403 aa - 403 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5751+/-0.000833; mu= 15.2573+/- 0.050 mean_var=66.1864+/-13.215, 0's: 0 Z-trim(106.6): 26 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.157648 statistics sampled from 9045 (9071) to 9045 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16 Scan time: 2.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 403) 2761 636.9 1e-182 CCDS46685.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 392) 2485 574.1 7.8e-164 CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 2224 514.7 5.9e-146 CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 2063 478.1 6.3e-135 CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 ( 397) 1932 448.3 5.7e-126 CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 1870 434.2 9.3e-122 CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 341) 1858 431.5 5.9e-121 CCDS56228.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 320) 1801 418.5 4.4e-117 CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 323) 1756 408.3 5.4e-114 CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 ( 696) 684 164.6 2.6e-40 CCDS45789.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 681) 633 153.0 8e-37 CCDS11752.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 715) 633 153.0 8.3e-37 CCDS42385.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 719) 633 153.0 8.4e-37 >>CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 (403 aa) initn: 2761 init1: 2761 opt: 2761 Z-score: 3393.9 bits: 636.9 E(32554): 1e-182 Smith-Waterman score: 2761; 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CCDS54 YVLRFYNTYSLVHSKRISYTVEVLLPDQTFMEKMEKF 370 380 390 >>CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (360 aa) initn: 1891 init1: 1870 opt: 1870 Z-score: 2299.4 bits: 434.2 E(32554): 9.3e-122 Smith-Waterman score: 1870; 70.3% identity (89.7% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV ::.:::::::.:.::::.::::.::.:: ::: ::::::::::::.::::::: :::.:. CCDS54 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPNADDYFLLRWLRARNFDLQKSEDMLRRHM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL :::::.:.:::..:::::::: : :::.:::: .::::...::: :: ::::.::::::. CCDS54 EFRKQQDLDNIVTWQPPEVIQLYDSGGLCGYDYEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE .: ... :::::.:: :: :::::.: ...: :::.::::::::::.: .:. ..: CCDS54 IRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSLKHLWKPAVEVYQQFFSILEA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE ::::::: :.:..::::::::.::.: :.::.::.::..:: :::. : : :::::.::: CCDS54 NYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVILGDNWKQELTKFISPDQLPVE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG .::::::::::::: .::::::..:..::. .::. ::::. ...:::: ::: :::::: CCDS54 FGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEHTRSVGRGSSLQVENEILFPG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI ::::::: :::.:.:::.::::::::.: : :::::::.::::.:.:::::.::: . :. CCDS54 CVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGSLTCLQAGV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK >>CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (341 aa) initn: 1850 init1: 1850 opt: 1858 Z-score: 2285.1 bits: 431.5 E(32554): 5.9e-121 Smith-Waterman score: 1858; 75.1% identity (92.9% similar) in 338 aa overlap (60-397:1-338) 30 40 50 60 70 80 pF1KSD LPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMC .:::: :::.:..::::::::.:. ::.: CCDS58 MEFRKTMDIDHILDWQPPEVIQKYMPGGLC 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KSD GYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETI ::: :::::::::::::: ::::::..:::::.::::.:: .:.:: :: .::.:.::: CCDS58 GYDRDGCPVWYDIIGPLDPKGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETI 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KSD TIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFL ..:.:::::::::.::: ::.: ::. ..::::::::: ...::: :::::.:::.:::: CCDS58 VMIFDCEGLGLKHFWKPLVEVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KSD SEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYY :::::.::.::: :::: ::: :::...:...:::.::::::::: .::::::.::...: CCDS58 SEDTRRKIIVLGNNWKEGLLKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMY 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KSD VRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQR :::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.:::.::::::::::: CCDS58 VRDQVKTQYEHSVQINRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQR 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KSD AGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGIYVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKA :::::.:::.::::.:.:::::.::::. :.:::::::::::.:::::.:::::::::.. CCDS58 AGEMTDVLPSQRYNAHMVPEDGNLTCSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEG 280 290 300 310 320 330 390 400 pF1KSD SEEKMKQLGAGTPK .. :.: CCDS58 MQKYDKELTPV 340 >>CCDS56228.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 (320 aa) initn: 1798 init1: 1798 opt: 1801 Z-score: 2215.4 bits: 418.5 E(32554): 4.4e-117 Smith-Waterman score: 1997; 79.4% identity (79.4% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-320) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPDDYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRK-- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD EFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDL CCDS56 ------------------------------------------------------------ 130 140 150 160 170 180 pF1KSD LRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 ---------------------LGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEE 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KSD NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 NYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVLLKHISPDQVPVE 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KSD YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 YGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGSSHQVEYEILFPG 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KSD CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 CVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVPEDGTLTCSDPGI 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 pF1KSD YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 YVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK 280 290 300 310 320 >>CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (323 aa) initn: 1749 init1: 1749 opt: 1756 Z-score: 2160.1 bits: 408.3 E(32554): 5.4e-114 Smith-Waterman score: 1756; 75.5% identity (93.1% similar) in 319 aa overlap (79-397:2-320) 50 60 70 80 90 100 pF1KSD LQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNIISWQPPEVIQQYLSGGMCGYDLDGCPVWYDIIGPLDA :::.:. ::.:::: :::::::::::::: CCDS58 MVIQKYMPGGLCGYDRDGCPVWYDIIGPLDP 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KSD KGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIYDCEGLGLKHLWKPAV ::::::..:::::.::::.:: .:.:: :: .::.:.:::..:.:::::::::.::: : CCDS58 KGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGLKHFWKPLV 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KSD EAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDTRKKIMVLGANWKEVL :.: ::. ..::::::::: ...::: :::::.:::.:::::::::.::.::: :::: : CCDS58 EVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVLGNNWKEGL 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KSD LKHISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPKCKSKINYGGDIPRKYYVRDQVKQQYEHSVQISRGS :: :::...:...:::.::::::::: .::::::.::...::::::: ::::::::.::: CCDS58 LKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEHSVQINRGS 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KSD SHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFLKTKMGERQRAGEMTEVLPNQRYNSHLVP ::::::::::::::::::: :::::.:::.::::::::::::::::.:::.::::.:.:: CCDS58 SHQVEYEILFPGCVLRWQFSSDGADIGFGVFLKTKMGERQRAGEMTDVLPSQRYNAHMVP 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KSD EDGTLTCSDPGIYVLRFDNTYSFIHAKKVNFTVEVLLPDKASEEKMKQLGAGTPK :::.::::. :.:::::::::::.:::::.:::::::::.. .. :.: CCDS58 EDGNLTCSEAGVYVLRFDNTYSFVHAKKVSFTVEVLLPDEGMQKYDKELTPV 280 290 300 310 320 >>CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 (696 aa) initn: 615 init1: 435 opt: 684 Z-score: 837.1 bits: 164.6 E(32554): 2.6e-40 Smith-Waterman score: 684; 33.9% identity (65.3% similar) in 363 aa overlap (5-353:235-580) 10 20 30 pF1KSD MSGRVGDLSPRQKEALAKFRENVQDVLPALPNPD .: :.: :. : ..:. .:.. . : CCDS45 AHGPRSTLGPALEAVSMDGDKLDADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKG-KIPK 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 pF1KSD DYFLLRWLRARSFDLQKSEAMLRKHVEFRKQKDIDNII-SWQPPEVIQQYLSGGMCGYDL : .::.:::..: :.:.. :::. . .:::...: .. .:::: ..... .:: :. CCDS45 DEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDI 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 pF1KSD DGCPVWYDIIGPLDAKGLLFSASKQDLLRTKMRECELLLQECAHQTTKLGRKVETITIIY :: :.. .: .:.:::. ..... ::: . : ..: .: .::: . . : . CCDS45 DGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLL 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 pF1KSD DCEGLGLKHLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKRLFVVKAPKLFPVAYNLIKPFLSEDT : :::...:::.:.:.: ... . :.:::::: ::..:.::..::: ..::.::..:.: CCDS45 DLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENT 390 400 410 420 430 440 220 230 240 250 260 pF1KSD RKKIMVL-GANWKEVLLKHISPDQVPVEYGGTMTDPD---GNPKCKSKINYGGDIPRKYY :.:... :.:.. .: . :.: . :: :. : .. :: .:.. : CCDS45 RRKFLIYSGSNYQ-------GPGGL-VDYLDREVIPDFLGGESVC--NVPEGGLVPKSLY 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 pF1KSD VR-------DQVKQQYE--HSVQISRGSSHQVEYEILFPGCVLRWQFMSDGADVGFGIFL . ::. : : ::... ::. :.: ::: :. :.: .:: :... 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