Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1246, 789 aa
1>>>pF1KSDA1246 789 - 789 aa - 789 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1282+/-0.000989; mu= 4.4544+/- 0.060
mean_var=256.1571+/-52.196, 0's: 0 Z-trim(113.8): 132 B-trim: 5 in 2/52
Lambda= 0.080135
statistics sampled from 14234 (14373) to 14234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 5.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34443.1 LRFN2 gene_id:57497|Hs108|chr6 ( 789) 5259 621.7 1.4e-177
CCDS9678.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 ( 719) 2368 287.4 5.5e-77
CCDS12483.1 LRFN3 gene_id:79414|Hs108|chr19 ( 628) 2056 251.3 3.6e-66
CCDS81800.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 ( 466) 1843 226.6 7.5e-59
CCDS8153.1 LRFN4 gene_id:78999|Hs108|chr11 ( 635) 1642 203.5 9.3e-52
CCDS46071.1 LRFN1 gene_id:57622|Hs108|chr19 ( 771) 1585 196.9 1e-49
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 525 74.4 7.5e-13
>>CCDS34443.1 LRFN2 gene_id:57497|Hs108|chr6 (789 aa)
initn: 5259 init1: 5259 opt: 5259 Z-score: 3301.4 bits: 621.7 E(32554): 1.4e-177
Smith-Waterman score: 5259; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
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CCDS34 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEWVMESTV
:::::::::
CCDS34 SEWVMESTV
>>CCDS9678.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 (719 aa)
initn: 1809 init1: 1182 opt: 2368 Z-score: 1495.6 bits: 287.4 E(32554): 5.5e-77
Smith-Waterman score: 2368; 51.7% identity (77.9% similar) in 702 aa overlap (1-691:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
:: .: :. .:.: . . ::: :::: :: .:.::: .::::::::.::::::::::.
CCDS96 MEKILFYLFLIGIAVKA-QICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::. .:.:.::::::.:::::::::::: : : .: ::..::.:::.:::: .. .: .
CCDS96 DNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
:: ::.:::.::::: :.. ::.: ...::.::::::::. .:::.:..::.:: :::
CCDS96 SGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
:::..:.: .:::. :.:..:::.:::.::::::::.: :.:. : .. ...:::
CCDS96 DHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
:::::::::::::::: :.::::::.:: : ::::: . ::::.:::::::.:::.. :
CCDS96 GNPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
:::: :::.::: ::: : :::..:. .:..:..:. :::::::::.::: .:.::::::
CCDS96 LEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
:.: ::::: .:.. :..:::: :::.. : :::. :.:.. . ..:.: :
CCDS96 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGD--TKL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
.. ..:.:.:...::.:.. ... : ..:.:.::: . :..:.::::: ..:.:.:::
CCDS96 SQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
:..:: :::::::..:: :.:::: .::: :: :. :: .:. :.::.::::::..:::
CCDS96 LAAGTMYDLCVLAIYDDGITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQ--------PPPPSSAPA
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CCDS96 IIVASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTK-VSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GAPPQGPPKVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSG--EAAGLGRAPWRIPPSAPRPK
: .. .. ..... . . . ..:...:.: . ...... : . : .
CCDS96 GHEENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD PSLDRLMGAFASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAG-TSARGHHSDREPLLGPPAARARSL
:. . . .. .. ... : :: : . : :: :.:
CCDS96 PQNEAVTNVESQNTNRNNSTALQLASRPPDSVTEGPTSKRAHIKPNALLTNVDQIVQETQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD LPLPLEGKAKRSHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEES
CCDS96 RLELI
>>CCDS12483.1 LRFN3 gene_id:79414|Hs108|chr19 (628 aa)
initn: 1939 init1: 1459 opt: 2056 Z-score: 1301.5 bits: 251.3 E(32554): 3.6e-66
Smith-Waterman score: 2056; 53.5% identity (76.7% similar) in 589 aa overlap (16-596:23-603)
10 20 30 40 50
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRR
:. . ::. : ::. : :..:::. :::::::..:::
CCDS12 MAILPLLLCLLPLAPASSPPQSATPSPCPRRCRCQTQSLPLSVLCPGAGLLFVPPSLDRR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TVELRLGGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLP
..::::. ::: . :.:.::::::. :.:::::: :. .: ::..::.::::.:::
CCDS12 AAELRLADNFIASVRRRDLANMTGLLHLSLSRNTIRHVAAGAFADLRALRALHLDGNRLT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMV
:::: :::::::.:::..::::...: :..: ::::::::::::. :::... :.
CCDS12 SLGEGQLRGLVNLRHLILSNNQLAALAAGALDDCAETLEDLDLSYNNLEQLPWEALGRLG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAP
:.. :.:::::: . :.:. :.::::::.::::: .::::.:.: : : : .
CCDS12 NVNTLGLDHNLLASVPAGAFSRLHKLARLDMTSNRLTTIPPDPLFSR---LPLLARPRGS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PLS---FSFGGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPL
: : ..::::::::::::.::::: :.::::.:.:: .: ::::: : :::::::::.
CCDS12 PASALVLAFGGNPLHCNCELVWLRRLAREDDLEACASPPALGGRYFWAVGEEEFVCEPPV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ITQHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITT
.:... : : :. :.:.:.:.::: : ..::.:. ::.:::::. .. ::::....:
CCDS12 VTHRSPPLAVPAGRPAALRCRAVGDPEPRVRWVSPQGRLLGNSSRARAFPNGTLELLVTE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD SQDSGAFTCIAANAAGEATAMVEVSI--VQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSD-ITGSSKTSR
:.: :::::::::::::: ::... :.:.:::: ::.. : .: : .:
CCDS12 PGDGGIFTCIAANAAGEATAAVELTVGPPPPPQLANSTS-CDPPRDGDPDALTPPSAASA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GGGGSGGGEPPKSPPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYR
.. . : :: .:.: :.: .:.:::.: .. : ..:::.::: : :..:.::
CCDS12 SAKVADTG-PPT---DRGVQVTEHGATAALVQWPDQRPIPGIRMYQIQYNSSADDILVYR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MIPASNKAFVVNNLVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHS
:::: ...:....:.:: :::::::...:.:: :::: ::::.: :. : . :.
CCDS12 MIPAESRSFLLTDLASGRTYDLCVLAVYEDSATGLTATRPVGCARFSTEPALRPCGAPHA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD QILGGTMILVIGGIIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAP--SKMAAAVSNVYSQTNGAQPP
.::::::...::.:::..:::: .:..:::: . . : .:. : ::.: :::::: :
CCDS12 PFLGGTMIIALGGVIVASVLVFIFVLLMRYKVHGGQPPGKAKIPAPVSSVCSQTNGALGP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PPSSAPAGAPPQGPPKVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPS
:. :: . :
CCDS12 TPTPAPPAPEPAALRAHTVVQLDCEPWGPGHEPVGP
600 610 620
>>CCDS81800.1 LRFN5 gene_id:145581|Hs108|chr14 (466 aa)
initn: 1836 init1: 1173 opt: 1843 Z-score: 1170.1 bits: 226.6 E(32554): 7.5e-59
Smith-Waterman score: 1843; 57.6% identity (82.7% similar) in 467 aa overlap (1-467:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
:: .: :. .:.: . . ::: :::: :: .:.::: .::::::::.::::::::::.
CCDS81 MEKILFYLFLIGIAVKA-QICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::. .:.:.::::::.:::::::::::: : : .: ::..::.:::.:::: .. .: .
CCDS81 DNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
:: ::.:::.::::: :.. ::.: ...::.::::::::. .:::.:..::.:: :::
CCDS81 SGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
:::..:.: .:::. :.:..:::.:::.::::::::.: :.:. : .. ...:::
CCDS81 DHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
:::::::::::::::: :.::::::.:: : ::::: . ::::.:::::::.:::.. :
CCDS81 GNPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
:::: :::.::: ::: : :::..:. .:..:..:. :::::::::.::: .:.::::::
CCDS81 LEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
:.: ::::: .:.. :..:::: :::.. : :::. :.:.. . ..:.: :
CCDS81 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDT--KL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
.. ..:.:.:...::.:.. ... : ..:.:.::: . :..:.::
CCDS81 SQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRCFAD
420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
>>CCDS8153.1 LRFN4 gene_id:78999|Hs108|chr11 (635 aa)
initn: 1454 init1: 868 opt: 1642 Z-score: 1042.7 bits: 203.5 E(32554): 9.3e-52
Smith-Waterman score: 2133; 53.5% identity (74.2% similar) in 656 aa overlap (4-645:5-633)
10 20 30 40 50
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRL
:: ::: : : ::: ::::::::::.::: .:::::::..:::::::::
CCDS81 MAPPLLLLLLASGAA-----ACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDT
. ::: .. :: :::::::::::::.:..: .: :::::::::::.::: :: .
CCDS81 ADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGS
60 70 80 90 100 110
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CCDS81 LRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLN
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CCDS81 LDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDAE--ASP--APLVLSF
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CCDS81 SGNPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLW
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CCDS81 VLEGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTC
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CCDS81 IATNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASARTAAEGEGTLESEP--
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CCDS81 -----AVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLK
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CCDS81 HLVPGADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAV
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CCDS81 GGVLVAALLVFTVALLVRGRGAGNGRLPLKL----SHVQSQTNGG----PSPTPKAHPPR
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CCDS81 SPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAG-CRGVGGSAERLEES
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CCDS81 VV
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CCDS46 IPSTSQTFLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDDGATALPATRVVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAH
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CCDS46 TASAEPEVVLGRSLGGSAT-------SLCLLPSEETSGE-ESRAAVGPRRSRSGALEPPT
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CCDS46 HLDGAGGGAAGEDGDLGLGSARACLAFTSTEWMLESTV
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CCDS42 LRHLEILQLSKNLVRKIEVGAFNGLPSLNTLELFDNRLTTVPTQAFEYLSKLRELWLRNN
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CCDS42 PIESIPSYAFNRVPSLRRLDLGELKRLEYISEAAFEGLVNLRYLNLGMCNLKDIPNLTA-
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CCDS42 --LVRLEELELSGNRLDLIRPGSFQGLTSLRKLWLMHAQVATIERNAFDDLKSLEELNLS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]