Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1246, 789 aa
1>>>pF1KSDA1246 789 - 789 aa - 789 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0599+/-0.000405; mu= -1.5569+/- 0.025
mean_var=310.6307+/-65.379, 0's: 0 Z-trim(121.5): 302 B-trim: 33 in 1/58
Lambda= 0.072770
statistics sampled from 37893 (38232) to 37893 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.448), width: 16
Scan time: 15.530
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016866599 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 5259 566.5 1.6e-160
XP_011513063 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 5259 566.5 1.6e-160
XP_011513064 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 5259 566.5 1.6e-160
NP_065788 (OMIM: 612808) leucine-rich repeat and f ( 789) 5259 566.5 1.6e-160
XP_016866600 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 467) 3123 342.0 3.5e-93
NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 719) 2368 262.9 3.4e-69
XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-ric ( 719) 2368 262.9 3.4e-69
NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and f ( 719) 2368 262.9 3.4e-69
XP_016882791 (OMIM: 612809) PREDICTED: leucine-ric ( 628) 2056 230.1 2.3e-59
NP_078785 (OMIM: 612809) leucine-rich repeat and f ( 628) 2056 230.1 2.3e-59
NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1843 207.6 9.8e-53
NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1843 207.6 9.8e-53
NP_076941 (OMIM: 612810) leucine-rich repeat and f ( 635) 1642 186.7 2.8e-46
XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-ric ( 635) 1642 186.7 2.8e-46
XP_005259159 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1585 180.7 2e-44
NP_065913 (OMIM: 612807) leucine-rich repeat and f ( 771) 1585 180.7 2e-44
XP_016882522 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1585 180.7 2e-44
NP_689783 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat and i ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_016869793 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
NP_001245211 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat an ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_011516026 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_016869795 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_016869796 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_016869794 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_016869792 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_011516030 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
XP_011516021 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 384 54.6 1.5e-06
NP_001004432 (OMIM: 609794) leucine-rich repeat an ( 593) 337 49.6 4.6e-05
XP_016868530 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 318 47.9 0.00033
XP_011515760 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 318 47.9 0.00033
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 307 46.4 0.00037
XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 301 45.7 0.00044
XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 306 46.5 0.00053
XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 306 46.5 0.00053
NP_075380 (OMIM: 181500,605566) reticulon-4 recept ( 473) 299 45.5 0.00062
XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 301 45.9 0.00074
XP_016864014 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 352) 293 44.8 0.00077
XP_016864012 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 385) 293 44.8 0.00082
XP_011530481 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 412) 293 44.9 0.00086
NP_001240659 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 626) 293 45.0 0.0012
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 297 45.6 0.0012
XP_016864011 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 675) 293 45.1 0.0012
XP_016864010 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 676) 293 45.1 0.0012
XP_016864009 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 293 45.1 0.0013
XP_016864008 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 293 45.1 0.0013
NP_001240657 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 724) 293 45.1 0.0013
NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leuc ( 811) 294 45.2 0.0013
XP_016864007 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 756) 293 45.1 0.0013
NP_067647 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 isofor ( 757) 293 45.1 0.0014
XP_011530476 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 783) 293 45.1 0.0014
>>XP_016866599 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-rich re (789 aa)
initn: 5259 init1: 5259 opt: 5259 Z-score: 3002.9 bits: 566.5 E(85289): 1.6e-160
Smith-Waterman score: 5259; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEWVMESTV
:::::::::
XP_016 SEWVMESTV
>>XP_011513063 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-rich re (789 aa)
initn: 5259 init1: 5259 opt: 5259 Z-score: 3002.9 bits: 566.5 E(85289): 1.6e-160
Smith-Waterman score: 5259; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEWVMESTV
:::::::::
XP_011 SEWVMESTV
>>XP_011513064 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-rich re (789 aa)
initn: 5259 init1: 5259 opt: 5259 Z-score: 3002.9 bits: 566.5 E(85289): 1.6e-160
Smith-Waterman score: 5259; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEWVMESTV
:::::::::
XP_011 SEWVMESTV
>>NP_065788 (OMIM: 612808) leucine-rich repeat and fibro (789 aa)
initn: 5259 init1: 5259 opt: 5259 Z-score: 3002.9 bits: 566.5 E(85289): 1.6e-160
Smith-Waterman score: 5259; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
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pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
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pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQPPPPSSAPAGAPPQGPP
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSGEAAGLGRAPWRIPPSAPRPKPSLDRLMGAF
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pF1KSD ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAGTSARGHHSDREPLLGPPAARARSLLPLPLEGKAKR
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pF1KSD SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEESDLVGARGTFGS
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEWVMESTV
:::::::::
NP_065 SEWVMESTV
>>XP_016866600 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-rich re (467 aa)
initn: 3123 init1: 3123 opt: 3123 Z-score: 1794.0 bits: 342.0 E(85289): 3.5e-93
Smith-Waterman score: 3123; 100.0% identity (100.0% similar) in 467 aa overlap (1-467:1-467)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYR
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
>>NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (719 aa)
initn: 1809 init1: 1182 opt: 2368 Z-score: 1363.2 bits: 262.9 E(85289): 3.4e-69
Smith-Waterman score: 2368; 51.7% identity (77.9% similar) in 702 aa overlap (1-691:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
:: .: :. .:.: . . ::: :::: :: .:.::: .::::::::.::::::::::.
NP_001 MEKILFYLFLIGIAVKA-QICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::. .:.:.::::::.:::::::::::: : : .: ::..::.:::.:::: .. .: .
NP_001 DNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
:: ::.:::.::::: :.. ::.: ...::.::::::::. .:::.:..::.:: :::
NP_001 SGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
:::..:.: .:::. :.:..:::.:::.::::::::.: :.:. : .. ...:::
NP_001 DHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
:::::::::::::::: :.::::::.:: : ::::: . ::::.:::::::.:::.. :
NP_001 GNPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
:::: :::.::: ::: : :::..:. .:..:..:. :::::::::.::: .:.::::::
NP_001 LEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
:.: ::::: .:.. :..:::: :::.. : :::. :.:.. . ..:.: :
NP_001 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGD--TKL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
.. ..:.:.:...::.:.. ... : ..:.:.::: . :..:.::::: ..:.:.:::
NP_001 SQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
:..:: :::::::..:: :.:::: .::: :: :. :: .:. :.::.::::::..:::
NP_001 LAAGTMYDLCVLAIYDDGITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQ--------PPPPSSAPA
::::..::::.:::.::::::... :.. :::::::::::: : :. .
NP_001 IIVASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTK-VSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GAPPQGPPKVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSG--EAAGLGRAPWRIPPSAPRPK
: .. .. ..... . . . ..:...:.: . ...... : . : .
NP_001 GHEENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD PSLDRLMGAFASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAG-TSARGHHSDREPLLGPPAARARSL
:. . . .. .. ... : :: : . : :: :.:
NP_001 PQNEAVTNVESQNTNRNNSTALQLASRPPDSVTEGPTSKRAHIKPNALLTNVDQIVQETQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD LPLPLEGKAKRSHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEES
NP_001 RLELI
>>XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-rich re (719 aa)
initn: 1809 init1: 1182 opt: 2368 Z-score: 1363.2 bits: 262.9 E(85289): 3.4e-69
Smith-Waterman score: 2368; 51.7% identity (77.9% similar) in 702 aa overlap (1-691:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
:: .: :. .:.: . . ::: :::: :: .:.::: .::::::::.::::::::::.
XP_016 MEKILFYLFLIGIAVKA-QICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTL
::. .:.:.::::::.:::::::::::: : : .: ::..::.:::.:::: .. .: .
XP_016 DNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLHQLSL
:: ::.:::.::::: :.. ::.: ...::.::::::::. .:::.:..::.:: :::
XP_016 SGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFG
:::..:.: .:::. :.:..:::.:::.::::::::.: :.:. : .. ...:::
XP_016 DHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPPLITQHTHKLLV
:::::::::::::::: :.::::::.:: : ::::: . ::::.:::::::.:::.. :
XP_016 GNPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFITTSQDSGAFTCI
:::: :::.::: ::: : :::..:. .:..:..:. :::::::::.::: .:.::::::
XP_016 LEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AANAAGEATAMVEVSIVQLPHLSNSTSRTAPPKSRLSDITGSSKTSRGGGGSGGGEPPKS
:.: ::::: .:.. :..:::: :::.. : :::. :.:.. . ..:.: :
XP_016 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGD--TKL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PPERAVLVSEVTTTSALVKWSVSKSAPRVKMYQLQYNCSDDEVLIYRMIPASNKAFVVNN
.. ..:.:.:...::.:.. ... : ..:.:.::: . :..:.::::: ..:.:.:::
XP_016 SQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSGTGYDLCVLAMWDDTATTLTATNIVGCAQFFTKADYPQCQSMHSQILGGTMILVIGG
:..:: :::::::..:: :.:::: .::: :: :. :: .:. :.::.::::::..:::
XP_016 LAAGTMYDLCVLAIYDDGITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KSD IIVATLLVFIVILMVRYKVCNHEAPSKMAAAVSNVYSQTNGAQ--------PPPPSSAPA
::::..::::.:::.::::::... :.. :::::::::::: : :. .
XP_016 IIVASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTK-VSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GAPPQGPPKVVVRNELLDFTASLARASDSSSSSSLGSG--EAAGLGRAPWRIPPSAPRPK
: .. .. ..... . . . ..:...:.: . ...... : . : .
XP_016 GHEENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD PSLDRLMGAFASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAG-TSARGHHSDREPLLGPPAARARSL
:. . . .. .. ... : :: : . : :: :.:
XP_016 PQNEAVTNVESQNTNRNNSTALQLASRPPDSVTEGPTSKRAHIKPNALLTNVDQIVQETQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD LPLPLEGKAKRSHSFDMGDFAAAAAGGVVPGGYSPPRKVSNIWTKRSLSVNGMLLPFEES
XP_016 RLELI
>>NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fibro (719 aa)
initn: 1809 init1: 1182 opt: 2368 Z-score: 1363.2 bits: 262.9 E(85289): 3.4e-69
Smith-Waterman score: 2368; 51.7% identity (77.9% similar) in 702 aa overlap (1-691:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLG
:: .: :. .:.: . . ::: :::: :: .:.::: .::::::::.::::::::::.
NP_689 MEKILFYLFLIGIAVKA-QICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLA
10 20 30 40 50
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NP_689 DNFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMF
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:: ::.:::.::::: :.. ::.: ...::.::::::::. .:::.:..::.:: :::
NP_689 SGLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDD-VFALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSL
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:::..:.: .:::. :.:..:::.:::.::::::::.: :.:. : .. ...:::
NP_689 DHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFG
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:::: :::.::: ::: : :::..:. .:..:..:. :::::::::.::: .:.::::::
NP_689 LEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCI
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:.: ::::: .:.. :..:::: :::.. : :::. :.:.. . ..:.: :
NP_689 ASNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGD--TKL
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.. ..:.:.:...::.:.. ... : ..:.:.::: . :..:.::::: ..:.:.:::
NP_689 SQDK-IVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNN
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:..:: :::::::..:: :.:::: .::: :: :. :: .:. :.::.::::::..:::
NP_689 LAAGTMYDLCVLAIYDDGITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGG
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NP_689 IIVASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTK-VSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAV
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: .. .. ..... . . . ..:...:.: . ...... : . : .
NP_689 GHEENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTE
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pF1KSD PSLDRLMGAFASLDLKSQRKEELLDSRTPAGRGAG-TSARGHHSDREPLLGPPAARARSL
:. . . .. .. ... : :: : . : :: :.:
NP_689 PQNEAVTNVESQNTNRNNSTALQLASRPPDSVTEGPTSKRAHIKPNALLTNVDQIVQETQ
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NP_689 RLELI
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:. . ::. : ::. : :..:::. :::::::..:::
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..::::. ::: . :.:.::::::. :.:::::: :. .: ::..::.::::.:::
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.. . : :: .:.: :.: .:.:::.: .. : ..:::.::: : :..:.::
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:. :: . :
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>>NP_078785 (OMIM: 612809) leucine-rich repeat and fibro (628 aa)
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10 20 30 40 50
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NP_078 MIPAESRSFLLTDLASGRTYDLCVLAVYEDSATGLTATRPVGCARFSTEPALRPCGAPHA
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NP_078 TPTPAPPAPEPAALRAHTVVQLDCEPWGPGHEPVGP
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789 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:32:23 2016 done: Thu Nov 3 05:32:25 2016
Total Scan time: 15.530 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]