Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1259, 1556 aa
1>>>pF1KSDA1259 1556 - 1556 aa - 1556 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1275+/-0.00124; mu= 7.0489+/- 0.074
mean_var=218.7409+/-44.367, 0's: 0 Z-trim(108.8): 73 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.086718
statistics sampled from 10368 (10437) to 10368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 6.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 10246 1296.3 0
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 902 127.3 3.9e-28
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 902 127.3 4e-28
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 897 126.6 6.2e-28
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 897 126.6 6.2e-28
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 897 126.6 6.2e-28
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 897 126.6 6.2e-28
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 897 126.6 6.3e-28
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 692 101.2 5.6e-20
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 606 90.1 4e-17
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 600 89.2 4.9e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 600 89.2 5e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 600 89.2 5.1e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 600 89.3 5.6e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 600 89.3 5.9e-17
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 601 89.5 6.2e-17
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 591 88.4 2.2e-16
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 563 84.6 1.1e-15
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 563 84.6 1.2e-15
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 571 85.9 1.3e-15
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 563 84.6 1.3e-15
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 563 84.7 1.5e-15
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 545 82.7 1.3e-14
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 545 82.7 1.3e-14
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 545 82.7 1.3e-14
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 545 82.7 1.4e-14
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 539 81.8 1.8e-14
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 538 81.8 2.3e-14
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 538 81.8 2.3e-14
CCDS58914.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 ( 596) 521 79.3 4.1e-14
CCDS3639.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1026) 521 79.5 6.2e-14
CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1028) 521 79.5 6.3e-14
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 515 79.0 2.4e-13
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 515 79.0 2.4e-13
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 511 78.5 3.2e-13
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 508 78.1 3.7e-13
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 510 78.4 3.8e-13
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 508 78.1 4e-13
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 493 76.1 9.5e-13
CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10 (1849) 444 70.0 7.9e-11
>>CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556 aa)
initn: 10246 init1: 10246 opt: 10246 Z-score: 6936.4 bits: 1296.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10246; 100.0% identity (100.0% similar) in 1556 aa overlap (1-1556:1-1556)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD KHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD TVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGST
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD AKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD GLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR
1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572 aa)
initn: 1232 init1: 344 opt: 902 Z-score: 618.6 bits: 127.3 E(32554): 3.9e-28
Smith-Waterman score: 966; 25.1% identity (49.3% similar) in 1143 aa overlap (210-1319:413-1271)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . .. .: ...... .:
CCDS34 LRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIE-QE
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .: . ...: : ..
CCDS34 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERI
450 460 470 480 490
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. :: : :.. : . :. : :
CCDS34 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ--KKDRRLAYLLQQT-DEYVANLTNLVWEHKQAQAAKE
500 510 520 530 540 550
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALE--QRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTE----LYAHFMSRKR
: ....::. .: : . : : : . . :. : .:.:: :.. .
CCDS34 KKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKAS
560 570 580 590 600 610
410 420 430 440 450
pF1KSD DMG-----HDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENA
.. . : . :.:... . . .:. .: . . . :.
CCDS34 QLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEE---------DEEEESSRQETEEKILLDPNS
620 630 640 650 660
460 470 480 490 500 510
pF1KSD YHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL
.. . .... : ::.. . . . :. : ..:: . .: . . ..:: :
CCDS34 EEVSEKDAKQIIETAKQD-VDDEYSMQYSARG-SQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTL
670 680 690 700 710 720
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPAST
: :::.:..:...::....:::::::::::::.:.:::...: :.. . ::.::: : ::
CCDS34 KHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLST
730 740 750 760 770 780
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRK-VIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQD
:.:: :: ...:. . : :.: :. .. .. : : :.:..:.:. ...:
CCDS34 LSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGK--------FNVLLTTYEYIIKD
790 800 810 820 830
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLH
. . ...:.::..::.. .:. ..: .. :.::::::.:: . ::::::.
CCDS34 KHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLN
840 850 860 870 880 890
700 710 720 730 740 750
pF1KSD FIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQL---SRLHMILKPFMLRRIKKDVEN
:..::.: : :..::. . .: . .:. . ::: .:.::.:::.::.::.
CCDS34 FLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVES
900 910 920 930 940 950
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFR
.: .:.: .. :.... ::.::. .. : .: :: .. . ..... ...::: .::.:
CCDS34 QLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAK-GI--LLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLR
960 970 980 990 1000 1010
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQ
:.:::: .:. ::
CCDS34 KICNHPYMFQ--------HI----------------------------------------
1020
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWG
:::
CCDS34 ----------EES-----------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD APEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRS
:. : :::. :.
CCDS34 ---------------------------------------FAEHL----GYSNGVI-----
1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD ATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNG
::
CCDS34 ----------------------------------------------------------NG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD APELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRL
: : :::. :: .: .:
CCDS34 AE----------------------------------------LYRASGKFELLDRILPKL
1050 1060
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD KSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVF
.. .::::.. ::: .. ..:.:...:. :.::::..: .: .. :.. .. :.:
CCDS34 RATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD LLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEE
::::::::::.:: :::::...:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::
CCDS34 LLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD RILQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEE
.:: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... ..: ..:
CCDS34 KILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEE----EDEVPDDET
1190 1200 1210 1220 1230
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD TNRVKERKRKR----EKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSF
:.. :.... .. ...:: . ::.
CCDS34 LNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD ISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGS
CCDS34 EEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
>>CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590 aa)
initn: 1232 init1: 344 opt: 902 Z-score: 618.5 bits: 127.3 E(32554): 4e-28
Smith-Waterman score: 966; 25.1% identity (49.3% similar) in 1143 aa overlap (210-1319:413-1271)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . .. .: ...... .:
CCDS34 LRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIE-QE
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .: . ...: : ..
CCDS34 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERI
450 460 470 480 490
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. :: : :.. : . :. : :
CCDS34 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ--KKDRRLAYLLQQT-DEYVANLTNLVWEHKQAQAAKE
500 510 520 530 540 550
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALE--QRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTE----LYAHFMSRKR
: ....::. .: : . : : : . . :. : .:.:: :.. .
CCDS34 KKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKAS
560 570 580 590 600 610
410 420 430 440 450
pF1KSD DMG-----HDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENA
.. . : . :.:... . . .:. .: . . . :.
CCDS34 QLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEE---------DEEEESSRQETEEKILLDPNS
620 630 640 650 660
460 470 480 490 500 510
pF1KSD YHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL
.. . .... : ::.. . . . :. : ..:: . .: . . ..:: :
CCDS34 EEVSEKDAKQIIETAKQD-VDDEYSMQYSARG-SQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTL
670 680 690 700 710 720
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPAST
: :::.:..:...::....:::::::::::::.:.:::...: :.. . ::.::: : ::
CCDS34 KHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLST
730 740 750 760 770 780
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRK-VIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQD
:.:: :: ...:. . : :.: :. .. .. : : :.:..:.:. ...:
CCDS34 LSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGK--------FNVLLTTYEYIIKD
790 800 810 820 830
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLH
. . ...:.::..::.. .:. ..: .. :.::::::.:: . ::::::.
CCDS34 KHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLN
840 850 860 870 880 890
700 710 720 730 740 750
pF1KSD FIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQL---SRLHMILKPFMLRRIKKDVEN
:..::.: : :..::. . .: . .:. . ::: .:.::.:::.::.::.
CCDS34 FLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVES
900 910 920 930 940 950
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFR
.: .:.: .. :.... ::.::. .. : .: :: .. . ..... ...::: .::.:
CCDS34 QLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAK-GI--LLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLR
960 970 980 990 1000 1010
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQ
:.:::: .:. ::
CCDS34 KICNHPYMFQ--------HI----------------------------------------
1020
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWG
:::
CCDS34 ----------EES-----------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD APEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRS
:. : :::. :.
CCDS34 ---------------------------------------FAEHL----GYSNGVI-----
1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD ATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNG
::
CCDS34 ----------------------------------------------------------NG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD APELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRL
: : :::. :: .: .:
CCDS34 AE----------------------------------------LYRASGKFELLDRILPKL
1050 1060
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD KSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVF
.. .::::.. ::: .. ..:.:...:. :.::::..: .: .. :.. .. :.:
CCDS34 RATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD LLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEE
::::::::::.:: :::::...:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::
CCDS34 LLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD RILQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEE
.:: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... ..: ..:
CCDS34 KILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEE----EDEVPDDET
1190 1200 1210 1220 1230
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD TNRVKERKRKR----EKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSF
:.. :.... .. ...:: . ::.
CCDS34 LNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD ISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGS
CCDS34 EEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
>>CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613 aa)
initn: 1247 init1: 357 opt: 897 Z-score: 615.0 bits: 126.6 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 964; 25.7% identity (48.8% similar) in 1146 aa overlap (210-1314:437-1310)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . . .. .: ...... .:
CCDS54 LRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIE-QE
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
CCDS54 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERI
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
CCDS54 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ-KKDKRLAYLLQQTD--EYVANLTELVRQHKAAQVAKE
530 540 550 560 570
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALEQRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDG
: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
CCDS54 KKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVE--SGKILTGTDAPKAG
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IQEEILRKLEDSSTQRQIDI--GGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAE-------NAYH
: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
CCDS54 QLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDD
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG
. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
CCDS54 VSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAH-AVTERVDKQSALMVNGVLKQ
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570 580
pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
CCDS54 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
760 770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKY
:: :: ...:. . : :.: : : : : ... :.:..:.:. ...: .
CCDS54 NWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAAR---RAFVPQ----LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHI
820 830 840 850 860
650 660 670 680 690
pF1KSD FQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIM
. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
CCDS54 LAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQ----LSRLHMILKPFMLRRIKKDVENEL
::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
CCDS54 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKV
.:.: .. :.... :..::. .. : .. :: .. . ..... :..::: .::.::.
CCDS54 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAK-GV--LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRS
:::: .:. ::
CCDS54 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
1050
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAP
:::
CCDS54 --------EES-------------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSAT
:: : :.. .:.
CCDS54 -------------------------------------FSEHL----GFTGGIVQG-----
1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAP
:: : :.
CCDS54 --------------------------LDLY---RA-------------------------
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKS
:::. :: .: .:..
CCDS54 --------------------------------------------SGKFELLDRILPKLRA
1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVFLL
.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
CCDS54 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD STRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERI
::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
CCDS54 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD LQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKL-------RLRQEEK
: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... . :
CCDS54 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIA
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD RQQEETN---RVKERKRKREKYAEKKK----KEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNL
:..:: . :. .:..: :.: .::::
CCDS54 RHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMF
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD SADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATN
CCDS54 GRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTS
1340 1350 1360 1370 1380 1390
>>CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614 aa)
initn: 1247 init1: 357 opt: 897 Z-score: 615.0 bits: 126.6 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 964; 25.7% identity (48.8% similar) in 1146 aa overlap (210-1314:437-1310)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . . .. .: ...... .:
CCDS54 LRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIE-QE
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
CCDS54 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERI
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
CCDS54 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ-KKDKRLAYLLQQTD--EYVANLTELVRQHKAAQVAKE
530 540 550 560 570
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALEQRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDG
: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
CCDS54 KKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVE--SGKILTGTDAPKAG
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IQEEILRKLEDSSTQRQIDI--GGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAE-------NAYH
: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
CCDS54 QLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDD
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG
. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
CCDS54 VSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAH-AVTERVDKQSALMVNGVLKQ
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570 580
pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
CCDS54 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
760 770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKY
:: :: ...:. . : :.: : : : : ... :.:..:.:. ...: .
CCDS54 NWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAAR---RAFVPQ----LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHI
820 830 840 850 860
650 660 670 680 690
pF1KSD FQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIM
. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
CCDS54 LAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQ----LSRLHMILKPFMLRRIKKDVENEL
::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
CCDS54 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKV
.:.: .. :.... :..::. .. : .. :: .. . ..... :..::: .::.::.
CCDS54 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAK-GV--LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRS
:::: .:. ::
CCDS54 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
1050
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAP
:::
CCDS54 --------EES-------------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSAT
:: : :.. .:.
CCDS54 -------------------------------------FSEHL----GFTGGIVQG-----
1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAP
:: : :.
CCDS54 --------------------------LDLY---RA-------------------------
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKS
:::. :: .: .:..
CCDS54 --------------------------------------------SGKFELLDRILPKLRA
1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVFLL
.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
CCDS54 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD STRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERI
::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
CCDS54 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD LQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKL-------RLRQEEK
: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... . :
CCDS54 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIA
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD RQQEETN---RVKERKRKREKYAEKKK----KEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNL
:..:: . :. .:..: :.: .::::
CCDS54 RHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMF
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD SADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATN
CCDS54 GRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTS
1340 1350 1360 1370 1380 1390
>>CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616 aa)
initn: 1247 init1: 357 opt: 897 Z-score: 615.0 bits: 126.6 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 964; 25.7% identity (48.8% similar) in 1146 aa overlap (210-1314:437-1310)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . . .. .: ...... .:
CCDS45 LRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIE-QE
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
CCDS45 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERI
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
CCDS45 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ-KKDKRLAYLLQQTD--EYVANLTELVRQHKAAQVAKE
530 540 550 560 570
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALEQRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDG
: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
CCDS45 KKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVE--SGKILTGTDAPKAG
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IQEEILRKLEDSSTQRQIDI--GGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAE-------NAYH
: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
CCDS45 QLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDD
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG
. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
CCDS45 VSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAH-AVTERVDKQSALMVNGVLKQ
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570 580
pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
CCDS45 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
760 770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKY
:: :: ...:. . : :.: : : : : ... :.:..:.:. ...: .
CCDS45 NWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAAR---RAFVPQ----LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHI
820 830 840 850 860
650 660 670 680 690
pF1KSD FQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIM
. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
CCDS45 LAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQ----LSRLHMILKPFMLRRIKKDVENEL
::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
CCDS45 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKV
.:.: .. :.... :..::. .. : .. :: .. . ..... :..::: .::.::.
CCDS45 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAK-GV--LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRS
:::: .:. ::
CCDS45 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
1050
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAP
:::
CCDS45 --------EES-------------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSAT
:: : :.. .:.
CCDS45 -------------------------------------FSEHL----GFTGGIVQG-----
1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAP
:: : :.
CCDS45 --------------------------LDLY---RA-------------------------
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKS
:::. :: .: .:..
CCDS45 --------------------------------------------SGKFELLDRILPKLRA
1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVFLL
.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
CCDS45 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD STRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERI
::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
CCDS45 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD LQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKL-------RLRQEEK
: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... . :
CCDS45 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIA
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD RQQEETN---RVKERKRKREKYAEKKK----KEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNL
:..:: . :. .:..: :.: .::::
CCDS45 RHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMF
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD SADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATN
CCDS45 GRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTP
1340 1350 1360 1370 1380 1390
>>CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617 aa)
initn: 1247 init1: 357 opt: 897 Z-score: 615.0 bits: 126.6 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 964; 25.7% identity (48.8% similar) in 1146 aa overlap (210-1314:437-1310)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . . .. .: ...... .:
CCDS45 LRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIE-QE
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
CCDS45 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERI
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
CCDS45 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ-KKDKRLAYLLQQTD--EYVANLTELVRQHKAAQVAKE
530 540 550 560 570
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALEQRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDG
: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
CCDS45 KKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVE--SGKILTGTDAPKAG
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IQEEILRKLEDSSTQRQIDI--GGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAE-------NAYH
: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
CCDS45 QLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDD
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG
. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
CCDS45 VSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAH-AVTERVDKQSALMVNGVLKQ
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570 580
pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
CCDS45 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
760 770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKY
:: :: ...:. . : :.: : : : : ... :.:..:.:. ...: .
CCDS45 NWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAAR---RAFVPQ----LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHI
820 830 840 850 860
650 660 670 680 690
pF1KSD FQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIM
. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
CCDS45 LAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQ----LSRLHMILKPFMLRRIKKDVENEL
::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
CCDS45 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKV
.:.: .. :.... :..::. .. : .. :: .. . ..... :..::: .::.::.
CCDS45 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAK-GV--LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRS
:::: .:. ::
CCDS45 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
1050
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAP
:::
CCDS45 --------EES-------------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSAT
:: : :.. .:.
CCDS45 -------------------------------------FSEHL----GFTGGIVQG-----
1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAP
:: : :.
CCDS45 --------------------------LDLY---RA-------------------------
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKS
:::. :: .: .:..
CCDS45 --------------------------------------------SGKFELLDRILPKLRA
1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVFLL
.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
CCDS45 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD STRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERI
::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
CCDS45 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD LQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKL-------RLRQEEK
: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ... . :
CCDS45 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIA
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD RQQEETN---RVKERKRKREKYAEKKK----KEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNL
:..:: . :. .:..: :.: .::::
CCDS45 RHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMF
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD SADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATN
CCDS45 GRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTP
1340 1350 1360 1370 1380 1390
>>CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647 aa)
initn: 1247 init1: 357 opt: 897 Z-score: 614.9 bits: 126.6 E(32554): 6.3e-28
Smith-Waterman score: 945; 25.7% identity (48.7% similar) in 1094 aa overlap (210-1276:437-1258)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEE
: .:. :. . . .. .: ...... .:
CCDS12 LRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIE-QE
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIE---QLNARRRKVWLSIVKKELPKANK--
::..:: . . ..: :. : :. : .. .. . ...: : :.
CCDS12 RKRRQKHQEYLNSILQH---AKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERI
470 480 490 500 510 520
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QKASARNLFLTNS---RKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYE
.: : :. . ::: : :. : : : : . : . .:... :
CCDS12 EKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQ-KKDKRLAYLLQQTD--EYVANLTELVRQHKAAQVAKE
530 540 550 560 570
360 370 380 390 400
pF1KSD KVEKEHRKRAEKEALEQRKL--DEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDG
: .:...:.::. . . : : . :. : . ..: . . : . :
CCDS12 KKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVE--SGKILTGTDAPKAG
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KSD IQEEILRKLEDSSTQRQIDI--GGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAE-------NAYH
: :. . . : .:. . .:. . . . .: : ..
CCDS12 QLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDD
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG
. .. .: . :.::.. ... . :. :..:. .. : . . :: ::
CCDS12 VSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAH-AVTERVDKQSALMVNGVLKQ
700 710 720 730 740 750
530 540 550 560 570 580
pF1KSD YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN
::.::..::..::....:::::::::::::.:.:::...: :.. : :::::: : :::.
CCDS12 YQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLS
760 770 780 790 800 810
590 600 610 620 630 640
pF1KSD NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKY
:: :: ...:. . : :.: : : : : ... :.:..:.:. ...: .
CCDS12 NWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAAR---RAFVPQ----LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHI
820 830 840 850 860
650 660 670 680 690
pF1KSD FQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKIL-LQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIM
. ...:.::..::.. .:. ..: .. ::::::::.:: . ::::::.:..
CCDS12 LAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLL
870 880 890 900 910 920
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQ----LSRLHMILKPFMLRRIKKDVENEL
::.: : :..::. . .: : ..:.. . ::: .:.::.:::.::.:: .:
CCDS12 PTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGE-KVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQL
930 940 950 960 970 980
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKV
.:.: .. :.... :..::. .. : :: .. . ..... :..::: .::.::.
CCDS12 PEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGV---LLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKI
990 1000 1010 1020 1030 1040
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRS
:::: .:. ::
CCDS12 CNHPYMFQ--------HI------------------------------------------
1050
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAP
:::
CCDS12 --------EES-------------------------------------------------
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSAT
:: : :.. .:.
CCDS12 -------------------------------------FSEHL----GFTGGIVQG-----
1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAP
:: : :.
CCDS12 --------------------------LDLY---RA-------------------------
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD ELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKS
:::. :: .: .:..
CCDS12 --------------------------------------------SGKFELLDRILPKLRA
1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNR-NDIFVFLL
.:.::.. ::: .. ..:.:..:: :.::::..: .: .. :.. .. :.:::
CCDS12 TNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD STRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERI
::::::::.:: .:::::..:::::: : ::.:::::.:: ..: : :: ...::.:
CCDS12 STRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD LQRAKEKSEIQRMVISGGNF--KPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETN
: :: : .... ::..: : : .. . . .. .:. :: ..
CCDS12 LAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHT
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD RVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSA
CCDS12 APPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRK
1280 1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230 aa)
initn: 1311 init1: 635 opt: 692 Z-score: 472.1 bits: 101.2 E(32554): 5.6e-20
Smith-Waterman score: 1061; 45.1% identity (75.8% similar) in 339 aa overlap (493-831:597-916)
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQ
..:.::. .... : : .. :.:. ::
CCDS10 GSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKT----PIPLLLRGQLREYQ
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNW
:..::...::. .:::::::::::::.:.:.:::::: ... ::: ::: :.:.. ::
CCDS10 HIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNW
630 640 650 660 670 680
590 600 610 620 630 640
pF1KSD HQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQ
..:. :. :.::.: :.: ..::. :. : :. ::: ::::.::.:: . :.
CCDS10 EMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGW------TKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFR
690 700 710 720 730
650 660 670 680 690 700
pF1KSD RVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTL
: .:.:..::::: .:. .: ::. ::.:. . ::::::::.::.. :::.:.::.:: .
CCDS10 RKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHV
740 750 760 770 780 790
710 720 730 740 750 760
pF1KSD FDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEIL
:.::.::.::::. . . :... .:. ..::: .:.::.:::.: :::... : : .
CCDS10 FQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHV
800 810 820 830 840 850
770 780 790 800 810 820
pF1KSD MYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELF
. :.:..::. :: .:.. .. . : . :..:..::.:::::::.::
CCDS10 IRCRLSKRQRCLY---------DDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLF
860 870 880 890 900
830 840 850 860 870 880
pF1KSD ERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGI
. . . :::
CCDS10 DPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRH
910 920 930 940 950 960
>--
initn: 1311 init1: 635 opt: 692 Z-score: 472.1 bits: 101.2 E(32554): 5.6e-20
Smith-Waterman score: 692; 31.0% identity (57.5% similar) in 503 aa overlap (1061-1543:1998-2491)
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEP-AGGLWS-IRPQNGWSF-
:: :. : : :. :: :: .
CCDS10 QLSEIIERFIFVMPPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCN
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD --IRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYM
..: . . : ::: .: ::: .::..::::::..:::::.:.::....:. : :.
CCDS10 MRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYL
2030 2040 2050 2060 2070 2080
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD RLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQ
:::::... .:. .. :. . :: :.::::.::.:.:::.::::.:::::::::.: :
CCDS10 RLDGSTRVEQRQALMERFNADKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQ
2090 2100 2110 2120 2130 2140
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD AMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVV
:.:: ::.:::..: .:::: . :.:: ::..:..: . :.: :::: .: . .
CCDS10 AQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIR
2150 2160 2170 2180 2190 2200
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNL
:. : ::. ..:: . .... . :. . . :... . . .. .
CCDS10 ELF--DMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKA-EQ
2210 2220 2230 2240 2250 2260
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD VIPFVPSADNSNLSA-DGDDSFI--SVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLV
: .. .:... : .:... . : : .::. : : :... . .:
CCDS10 VAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLT---PIERYAMKFLE
2270 2280 2290 2300 2310 2320
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD IVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVS---DTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGS
. .: ..: .. . ... . : . .: . : : . : : :.
CCDS10 ASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGPGAGDES-SCGTGGGTHR
2330 2340 2350 2360 2370 2380
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD TAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAAS-AAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVR
.: : :. : .: : . ::.: . .:. . . .:. . :: . . :
CCDS10 RSKKA-KAPERPGTRVSER-LRGARAETQGANHTPVISAHQTRSTTTPPRCSPARERVPR
2390 2400 2410 2420 2430
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD PAGLADFGPSSASS--------PLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGT
:: :.:: . :.:.:. . : . .:. : : : .
CCDS10 PAPRPRPTPASAPAAIPALVPVPVSAPVPISAPNPITILPVHILPSPPPPSQIPPCSSPA
2440 2450 2460 2470 2480 2490
pF1KSD NPSGGR
CCDS10 CTPPPACTPPPAHTPPPAQTCLVTPSSPLLLGPPSVPISASVTNLPLGLRPEAELCAQAL
2500 2510 2520 2530 2540 2550
>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa)
initn: 1433 init1: 369 opt: 606 Z-score: 420.9 bits: 90.1 E(32554): 4e-17
Smith-Waterman score: 934; 27.6% identity (48.6% similar) in 949 aa overlap (404-1344:63-718)
380 390 400 410 420 430
pF1KSD EMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGV
: . : :.:: . . : : ..
CCDS37 NKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRF
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGE
. : . .. .. : :. . ... .: : . .: :.. .. .. : :
CCDS37 EYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPR-IKKDEKQNLLSVGDYRHRR-TEQEE
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540
pF1KSD SYSLANPSIRAG------EDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGL
. : . : .: :: :. . . :::. ::..:.::: .:::.::::::::::::
CCDS37 DEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKW-GKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGL
160 170 180 190 200
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKV
:::.:.:.::... . .:: :: ... : :::.:: .:: :.:: .. . :. ..: .
CCDS37 GKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAA
210 220 230 240 250 260
610 620 630 640 650 660
pF1KSD IRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKI
. : .: . . : .:::...... . :.. .:.:.:.:::. .:. .: .:
CCDS37 FVR----DVLLPGE--WDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEI
270 280 290 300 310 320
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAI
. .:. :::::::::.::.. :::.::.:..: .:.: ..:. ::. :.
CCDS37 VREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDT-------NNCLG
330 340 350 360 370
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDL
:.. . ::::.:.::.::::: :::. : : :. .: :.. :. : ..: ..:.
CCDS37 DQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWY----TRILMKDI
380 390 400 410 420 430
790 800 810 820 830 840
pF1KSD -LQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYR
. .: :. .. . :.:..::.:: :::: ::. : .:
CCDS37 DILNSAGKMDKMR-----LLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEP-GP----------------
440 450 460 470
850 860 870 880 890 900
pF1KSD HGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLML
:.. :
CCDS37 -------------------PYTTD------------------------------------
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCP
.:
CCDS37 -------------------MH---------------------------------------
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYC
CCDS37 ------------------------------------------------------------
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWS
CCDS37 ------------------------------------------------------------
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMR
:.:.:::. .:: :: .:: :: ::::.:::::..:.::.: ..:.. : :
CCDS37 ---------LVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCR
480 490 500 510 520
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LDGSSKISERRDMVADFQNRNDI-FVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQ
:::.. .::.: . ... :. :::.::::::::::::..::.::.::::::: :: :
CCDS37 LDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQ
530 540 550 560 570 580
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD AMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVV
:::::::.:::: : :.:.: .:.::::..::. : ... .::. : . ..:.
CCDS37 AMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKD
590 600 610 620 630 640
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNL
.: .. .. .: . .:. . . :: :: :.. : : : .
CCDS37 EMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERG---------AKKTAEMNEKLSKMGESS
650 660 670 680 690
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD VIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVD
. :. ....: . .:.:
CCDS37 LRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKA
700 710 720 730 740 750
1556 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:37:01 2016 done: Thu Nov 3 05:37:02 2016
Total Scan time: 6.540 Total Display time: 0.680
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]