FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1264, 719 aa 1>>>pF1KSDA1264 719 - 719 aa - 719 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5596+/-0.00114; mu= -0.8715+/- 0.067 mean_var=256.1064+/-58.315, 0's: 0 Z-trim(110.4): 686 B-trim: 303 in 1/49 Lambda= 0.080143 statistics sampled from 10821 (11610) to 10821 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16 Scan time: 3.540 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 4871 577.3 2.7e-164 CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 1730 214.0 3.9e-55 CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 1726 213.6 6.8e-55 CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 1542 192.4 1.9e-48 CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 636) 1082 139.2 1.9e-32 CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 1065 137.2 6.5e-32 CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 1064 137.1 7e-32 CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 1064 137.1 7.2e-32 CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 1064 137.1 7.2e-32 CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 1064 137.1 7.4e-32 CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 1031 133.2 9.6e-31 CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 1005 130.2 8e-30 CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 674 91.9 2.4e-18 CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 679 92.7 2.5e-18 CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 674 91.9 2.5e-18 CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 679 92.7 2.6e-18 CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 671 91.6 3.1e-18 CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 670 91.4 3.1e-18 CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 662 90.5 5.8e-18 CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 664 90.9 8e-18 CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 664 90.9 8e-18 CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 645 88.5 2.2e-17 CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 632 87.0 6.3e-17 CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 632 87.2 1e-16 CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 632 87.3 1.1e-16 CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 618 85.7 3.6e-16 CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 617 85.6 4.7e-16 CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 617 85.7 4.8e-16 CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 600 83.6 1.5e-15 CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 575 80.7 1e-14 CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 575 80.7 1.2e-14 CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 568 79.9 2.1e-14 CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 568 80.0 2.2e-14 CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 568 80.0 2.4e-14 CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 551 78.0 9.6e-14 CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 551 78.0 9.7e-14 CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 551 78.0 9.8e-14 CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 551 78.0 9.8e-14 CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 551 78.0 9.9e-14 CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 551 78.0 1e-13 CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 551 78.1 1e-13 CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 551 78.1 1e-13 CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 533 75.5 1.5e-13 CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 520 74.0 4.3e-13 CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 528 75.4 6.2e-13 CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 528 75.4 6.2e-13 CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 528 75.4 6.3e-13 CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 522 74.6 9.2e-13 CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 522 74.7 9.7e-13 CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 522 74.7 9.9e-13 >>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 (719 aa) initn: 4871 init1: 4871 opt: 4871 Z-score: 3063.0 bits: 577.3 E(32554): 2.7e-164 Smith-Waterman score: 4871; 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CCDS33 GDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQ 170 180 190 200 210 220 510 520 530 540 550 560 pF1KSD HDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQ :.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::: :: : CCDS33 HENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQ 230 240 250 260 270 280 570 580 590 600 610 620 pF1KSD GVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGT ::::::::::::::: :::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::: CCDS33 GVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGP 290 300 310 320 330 340 630 640 650 660 670 680 pF1KSD EVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLV ::::::::::::::.::::::::::::.::. :::.::::.:.::::: :.:::: .:: CCDS33 EVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLV 350 360 370 380 390 400 690 700 710 pF1KSD REPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH :.:.::::: ::: :::: ::::. ::::::: : CCDS33 RDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 410 420 430 >>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (591 aa) initn: 2262 init1: 1681 opt: 1726 Z-score: 1099.0 bits: 213.6 E(32554): 6.8e-55 Smith-Waterman score: 2115; 52.8% identity (67.1% similar) in 724 aa overlap (1-717:1-589) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MFGKKKKKIEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCIT ::::.::..:::.::::::::::::: .::::::::.::.::. ..: ::::.:::.::: CCDS12 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACIT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD PIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGHA :: . ::::::.: :. ... ::..:.:.:::::::::..::: : .. CCDS12 SIQPGAPKTIVRGSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPPPPARAR-------- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD EENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPYYRGSHAAKQNGHVMKMKHGEA .:::. : ::: ::. :.: CCDS12 QENGM------PEEPATTA---------------------RGGP-------------GKA 120 130 190 200 210 220 230 240 pF1KSD YYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSRTA .. .::.. ::. .. CCDS12 ---------GSRGRFAG--HSE------------------------------------AG 140 250 260 270 280 290 pF1KSD GTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMR-QRSRSGSGLQEPMMPF : :: ... :: ..::::: .. .:: . : .: :: . :. : CCDS12 GGSGDRRRA--------GP-----EKRPKSSREGSGGPQESSRDKRPLSGPDVGTPQ-PA 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 pF1KSD GASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDR-AQMVLSPPLSGSDTYPRGPAK-- : .. :. .:.: :..: :. .. . . : :. : ::. CCDS12 GLASGAKLAAGRPFNTY------------PRADTDHPSRGAQGEP---HDVAPNGPSAGG 200 210 220 230 360 370 380 390 400 410 pF1KSD --LPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLS-SLSLSSSTYPP .::: :::: . :. . : :: . . : . . . .. . : CCDS12 LAIPQS------SSSSSRPPTRARGA-----PSPGVLGPHASEPQLAPPACTPAAPAVPG 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 pF1KSD PSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGK : : ...:.:::::::::::::::.::::: :: ::::::::::::::::: . .:: CCDS12 PPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGK 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KSD QVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTD :::::::::::::::::::::::::::.:.:::.::.:::::::::::::::::::::: CCDS12 LVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTD 350 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 pF1KSD IVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQV :::::::::::::.:::.::.::: :: :::::::::::::::: :::.::::::::::: CCDS12 IVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQV 410 420 430 440 450 460 600 610 620 630 640 650 pF1KSD SKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMR :::::.::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::.::::::::::::.::. CCDS12 SKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMK 470 480 490 500 510 520 660 670 680 690 700 710 pF1KSD RIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLM :::.::::.:.::::: :.:::: .:::.:.::::: ::: :::: ::::. ::::: CCDS12 MIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLM 530 540 550 560 570 580 pF1KSD RQYRHH :: : CCDS12 RQNRTR 590 >>CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (681 aa) initn: 1716 init1: 1518 opt: 1542 Z-score: 983.2 bits: 192.4 E(32554): 1.9e-48 Smith-Waterman score: 1922; 46.8% identity (68.3% similar) in 739 aa overlap (1-719:1-677) 10 20 30 40 50 pF1KSD MFGKKKKK-IEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI :: ::::: :::.:.::.:::::.:::.: ::.::: ::...: :: ::::.:::: : CCDS10 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNIL-DTLRRPKPVVDPSRI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH : .:: ::::.:::. . :.:::.:....:: ::.:: .:: . . CCDS10 TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRR--------- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH :. :.. ..... : : :.. ::. : . ... :: .: CCDS10 AQSLGLLGDEHWATDPDM---YLQSPQSERT------DPHGLYLSCNGGTPAGH-KQMPW 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KSD GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS : .: : . .: .. .::. :.:.. . :: . : .: .: CCDS10 PEPQSPRVLP--NGLA-------AKAQSLG-PAEFQGAS---QRCLQ---LGACLQSSPP 170 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KSD RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS--- .. .: ..... .. . . ::.: .... ::.: :. : CCDS10 GASPPTGTNRHGMKAAKH------GSEEARPQSCLVGSATGRPGGEGSPSPKTRESSLKR 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL :: : ..: ::.. .:. :. ..: . :.. :. .. CCDS10 RLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTF 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KSD SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY :: :. ::: .: : .. .: . ... :.: .. : ....:. :. CCDS10 SP-LTTSDT--SSPQKSLRTAPATG-QLPGRSSPAGSPRTW---HAQISTSNLYLPQD-- 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KSD LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST : . :. . .. . :.::::.:::..::. :::: : ...::::::: CCDS10 -----------PTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGST 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KSD GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW ::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.::: CCDS10 GIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELW 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG :.::::.::::::::...:.::::::::: .::.::.::: :::::::::::::::: :: CCDS10 VLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDG 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 640 pF1KSD RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE :.::::::::::.::.::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::.::: CCDS10 RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEVDIWSLGIMVIEMVDGE 540 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 pF1KSD PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL ::::.. :.:::.:.::: ::..:. :::: ::: ::. ::::.:..:::::::: :::: CCDS10 PPYFSDSPVQAMKRLRDSPPPKLKNSHKVSPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFL 600 610 620 630 640 650 710 pF1KSD KLAGPPSCIVPLMRQYRHH .: : :.:::.. ::.. CCDS10 LQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC 660 670 680 >>CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 (636 aa) initn: 1461 init1: 1065 opt: 1082 Z-score: 696.1 bits: 139.2 E(32554): 1.9e-32 Smith-Waterman score: 1569; 42.4% identity (62.7% similar) in 739 aa overlap (1-719:1-632) 10 20 30 40 50 pF1KSD MFGKKKKK-IEISGPSNFEHRVHTGFDPQEQKFTGLPQQWHSLLADTANRPKPMVDPSCI :: ::::: :::.:.::.:::::.:::.: ::.::: ::...: :: ::::.:::: : CCDS61 MFRKKKKKRPEISAPQNFQHRVHTSFDPKEGKFVGLPPQWQNIL-DTLRRPKPVVDPSRI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD TPIQLAPMKTIVRGNKPCKETSINGLLEDFDNISVTRSNSLRKESPPTPDQGASSHGPGH : .:: ::::.:::. . :.:::.:....:: ::.:: .:: . . CCDS61 TRVQLQPMKTVVRGSAMPVDGYISGLLNDIQKLSVISSNTLRGRSPTSRRR--------- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD AEENGFITFSQYSSESDTTADYTTEKYREKSLYGDDLDPY--YRGSHAAKQNGHVMKMKH :. :.. ..... : : :.. ::. : . ... :: .: CCDS61 AQSLGLLGDEHWATDPDM---YLQSPQSERT------DPHGLYLSCNGGTPAGH-KQMPW 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KSD GEAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPS : .: : . .: .. .::. :.:.. . :: . : .: .: CCDS61 PEPQSPRVLP--NGLA-------AKAQSLG-PAEFQGAS---QRCLQ---LGACLQSSPP 170 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KSD RTAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQT--------SPQPTMRQRS--- .. .: ..... .. . . ::.: .... ::.: :. : CCDS61 GASPPTGTNRHGMKAAKH------GSEEARPQSCLVGSATGRPGGEGSPSPKTRESSLKR 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KSD ---RSGSGLQEPMMPFGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDY---DRAQMVL :: : ..: ::.. .:. :. ..: . :.. :. .. CCDS61 RLFRSMFLSTAATAPPSSSKPGPPPQSKPNSSFRPPQKDNPPSLVAKAQSLPSDQPVGTF 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KSD SPPLSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASY :: :. ::: .: : .. .: . ... :.: .. : ....:. :. CCDS61 SP-LTTSDT--SSPQKSLRTAPATG-QLPGRSSPAGSPRTW---HAQISTSNLYLPQD-- 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KSD LSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGST : . :. . .. . :.::::.:::..::. :::: : ...::::::: CCDS61 -----------PTVAKGALAGEDTGVVTHEQFKAALRMVVDQGDPRLLLDSYVKIGEGST 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KSD GIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELW ::::.: :::.:.::::: ::::::::::::::::::::::.: :::.::.:::::.::: CCDS61 GIVCLAREKHSGRQVAVKMMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHFNVVEMYKSYLVGEELW 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KSD VVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDG :.::::.::::::::...:.::::::::: .::.::.::: :::::::::::::::: :: CCDS61 VLMEFLQGGALTDIVSQVRLNEEQIATVCEAVLQALAYLHAQGVIHRDIKSDSILLTLDG 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 640 pF1KSD RIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGE :.::::::::::.::.::::::::::::::::::::: :.::: CCDS61 RVKLSDFGFCAQISKDVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRSLYATEV---------------- 540 550 560 570 580 650 660 670 680 690 700 pF1KSD PPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFL : ::: ::. ::::.:..:::::::: :::: CCDS61 -----------------------------SPVLRDFLERMLVRDPQERATAQELLDHPFL 590 600 610 710 pF1KSD KLAGPPSCIVPLMRQYRHH .: : :.:::.. ::.. CCDS61 LQTGLPECLVPLIQLYRKQTSTC 620 630 >>CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 (545 aa) initn: 1201 init1: 1024 opt: 1065 Z-score: 686.4 bits: 137.2 E(32554): 6.5e-32 Smith-Waterman score: 1067; 38.0% identity (65.9% similar) in 508 aa overlap (209-713:60-534) 180 190 200 210 220 230 pF1KSD EAYYSEVKPLKSDFARFSADYHSHLDSLSKPSEYSDLKWEYQRASSSSPLDYSFQFTPSR :.. .. : : .: : : : : . CCDS82 DAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILPGDKTNKKKEKERPEISLPSD----FEHTI 30 40 50 60 70 80 240 250 260 270 280 290 pF1KSD TAGTSGCSKESLAYSESEWGPSLDDYDRRPKSSYLNQTSPQPTMRQRSRSGSGLQEPMMP .: .. . : .. : .:. :. . . . : . ... . . .. .. .: CCDS82 HVGFDAVTGEFTGMPE-QWARLLQTSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMS 90 100 110 120 130 140 300 310 320 330 340 350 pF1KSD FGASAFKTHPQGHSYNSYTYPRLSEPTMCIPKVDYDRAQMVLSPPLSGSDTYPRGPAKLP : :. . .: :. . .:: : .: :. :. . . .:. : :. : CCDS82 FTD---KSAEDYNSSNALNVKAVSE-TPAVPPVSEDEDD-------DDDDATP-PPVIAP 150 160 170 180 190 360 370 380 390 400 410 pF1KSD QSQ-SKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWG . . .:: :. : . : : :. . ... :: . ..: :: . CCDS82 RPEHTKSVYTRSVIE-P-------LPVTPTRDVATSPISPTE--------NNTTPPDALT 200 210 220 230 420 430 440 450 460 470 pF1KSD SSSDQQPSR--VSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQV ....: .. .: :.. :. .:: :::.. . : :::.:..: : : . ::..: CCDS82 RNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEV 240 250 260 270 280 290 480 490 500 510 520 530 pF1KSD AVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIV :.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::::.: ::.:::.: CCDS82 AIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVV 300 310 320 330 340 350 540 550 560 570 580 590 pF1KSD THTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSK :.: :.: :::.:: :.:: .::.. :::::::::.::: :: .::.:::::::.. CCDS82 TETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITP 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 pF1KSD EVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRI : ::...:::::::::::..: :: .:::::::::.::::.:::::.:: ::.:. : CCDS82 EQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLI 420 430 440 450 460 470 660 670 680 690 700 710 pF1KSD RDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQ . :.... .:.:...: ::. : . .:..:.::: : :::.: : : ..::. CCDS82 ATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAA 480 490 500 510 520 530 pF1KSD YRHH CCDS82 AKEATKNNH 540 >>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (544 aa) initn: 1212 init1: 1036 opt: 1064 Z-score: 685.8 bits: 137.1 E(32554): 7e-32 Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (374-713:193-532) 350 360 370 380 390 400 pF1KSD LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS : : ..: . ..: .. . .. CCDS14 EPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP 170 180 190 200 210 220 410 420 430 440 450 460 pF1KSD LSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIV : ... ... ... :... :.. :. .:: :::.. . : :::.:..: : CCDS14 PSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTV 230 240 250 260 270 280 470 480 490 500 510 520 pF1KSD CIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVM : . ::..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::: CCDS14 YTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVM 290 300 310 320 330 340 530 540 550 560 570 580 pF1KSD EFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIK :.: ::.:::.::.: :.: :::.:: :.::..::.. :::::::::.::: :: .: CCDS14 EYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVK 350 360 370 380 390 400 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPY :.:::::::.. : ::...:::::::::::..: :: .:::::::::.:::..::::: CCDS14 LTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPY 410 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 700 pF1KSD FNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLA .:: ::.:. : . :.... ...:.:.: ::. : . ..:..:.::: ::::::: CCDS14 LNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLA 470 480 490 500 510 520 710 pF1KSD GPPSCIVPLMRQYRHH : : ..::. CCDS14 KPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR 530 540 >>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (559 aa) initn: 1187 init1: 1036 opt: 1064 Z-score: 685.7 bits: 137.1 E(32554): 7.2e-32 Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (374-713:208-547) 350 360 370 380 390 400 pF1KSD LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS : : ..: . ..: .. . .. 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CCDS48 KPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR 540 550 >>CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (565 aa) initn: 1171 init1: 1036 opt: 1064 Z-score: 685.6 bits: 137.1 E(32554): 7.2e-32 Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (374-713:214-553) 350 360 370 380 390 400 pF1KSD LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS : : ..: . ..: .. . .. 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