Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1266
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1266, 537 aa
1>>>pF1KSDA1266 537 - 537 aa - 537 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0999+/-0.000871; mu= 14.3014+/- 0.052
mean_var=73.7785+/-14.307, 0's: 0 Z-trim(106.7): 35 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.149317
statistics sampled from 9109 (9142) to 9109 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS62900.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 537) 3596 784.1 0
CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 594) 3584 781.5 0
CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 515) 3008 657.4 1.1e-188
CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 715) 1955 430.6 2.9e-120
CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 668) 1901 419.0 8.6e-117
CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 430) 1659 366.8 2.8e-101
CCDS81576.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 495) 1370 304.6 1.8e-82
CCDS95.1 RERE gene_id:473|Hs108|chr1 (1566) 386 92.8 3.3e-18
>>CCDS62900.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (537 aa)
initn: 3596 init1: 3596 opt: 3596 Z-score: 4185.1 bits: 784.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3596; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYKPNPNQISTSNGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYKPNPNQISTSNGKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSPLKSKSTRKPLACIIGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSPLKSKSTRKPLACIIGYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD EIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
490 500 510 520 530
>>CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (594 aa)
initn: 3582 init1: 1861 opt: 3584 Z-score: 4170.5 bits: 781.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3584; 99.8% identity (99.8% similar) in 538 aa overlap (1-537:57-594)
10 20 30
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLAD
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRD
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KSD AAEAESKLKQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQ
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AAEAESKLKQVYIPTYSKPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQ
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQA
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIR
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KSD AEYADRHAELSGSPLKSKSTRKPLACIIGYLEIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AEYADRHAELSGSPLKSKSTRKPLACIIGYLEIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTP
510 520 530 540 550 560
510 520 530
pF1KSD NHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
570 580 590
>>CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (515 aa)
initn: 3006 init1: 1861 opt: 3008 Z-score: 3500.9 bits: 657.4 E(32554): 1.1e-188
Smith-Waterman score: 3008; 99.8% identity (99.8% similar) in 452 aa overlap (1-451:57-508)
10 20 30
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLAD
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRD
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KSD AAEAESKLKQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQ
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAEAESKLKQVYIPTYSKPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQ
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQA
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIR
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KSD AEYADRHAELSGSPLKSKSTRKPLACIIGYLEIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTP
::
CCDS46 AECKMLLNS
510
>>CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (715 aa)
initn: 2024 init1: 1518 opt: 1955 Z-score: 2272.6 bits: 430.6 E(32554): 2.9e-120
Smith-Waterman score: 2341; 69.1% identity (84.6% similar) in 525 aa overlap (9-529:82-592)
10 20 30
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLS
::::: :. .:: .: ::::.:::::::
CCDS32 SSTLIALADKHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGP
:: ::::::::::::::.:::::::. :::..:: :::::::::. :::::::::::::
CCDS32 RQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGN
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSS
:::::: ..: ::: : :.::.::..::. ..::::.::::::::::.::::::::::::
CCDS32 RYQADITDLLKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSAS
:::::::::::::::::::::::::::... ::.:.:::.::: ::::::::::::::::
CCDS32 SVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSAS
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKL
::.:::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKL
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWG
::::::.: ::::::::..: : :.::: : :.: ::::::::.:::.::::::
CCDS32 KQVYIPNYNKPNPNQISVNNVKAGVVNG---TGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWG
360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRN
:::::::::: :: ::::::::::::. . :. :.:. ::..: .:.:.:.
CCDS32 PPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGER--PGPN------RSNMS---PHGLPARS
410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHA
.:::: :.::::::.:::: .:..::..:.. :: .:::.:.. :: :::.:: . :
CCDS32 SGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLP
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ELSGSPLKSK-STRKPLACIIGYLEIHP-AKKPNVIRSTPS-LQTPTTKRMLTTPNHTSL
: : ::: : ..:::: .. ::: :: ::. ..:. : :.. : .. . :. :
CCDS32 EASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSP
520 530 540 550 560 570
520 530
pF1KSD SILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
.:::::.: .:::.:
CCDS32 TILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLLMPSRGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRG
580 590 600 610 620 630
>>CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 (668 aa)
initn: 2011 init1: 1515 opt: 1901 Z-score: 2210.2 bits: 419.0 E(32554): 8.6e-117
Smith-Waterman score: 2155; 63.4% identity (82.5% similar) in 530 aa overlap (2-527:58-567)
10 20 30
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLK
:::..:.:.::::. . ....:.::::
CCDS80 EELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLADSNAREFEEESK---QPGVSEQQRHQLK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD HRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADK
:::::::::.::::::::::::::.:::::. . .::.::: ::::::.:: ::::::.
CCDS80 HRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQ
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFA
:::::: .:::.::. :.:::::.:.:.:.:.:::::..:::::::::::::::::::::
CCDS80 GEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFA
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDE
::::::::.::::::::::::::::::::::::: :..:::..:.:.::: :::::::::
CCDS80 RALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDE
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKA
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.::...::::::::::.:::::::
CCDS80 MEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKA
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AEAESKLKQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQS
:::.::::::::::: ::::::: . ..::: .::: : :: : .::::..:::
CCDS80 AEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPG-MNGA-G--FQK-----GLTCESCHTTQS
330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAM
:::.:::::::::::: ::.::::::::: ::: : . . : .:. :.:.::
CCDS80 AQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLE----GATRGTTEPHSRGHLSRPEA
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440
pF1KSD QGMPVRNTGSPKSAV--KTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAI
:.. .:.. .. . :.::.:.:.:: .:..::..:.. :. :.:::::.. :: ::
CCDS80 QSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAI
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RAEYADRHAELSGSPLKSKS-TRKPLACIIGYLEIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLT
.:: . : . . .::: . .: ::: :. : . ::.. :.: .:: .. .:.
CCDS80 KAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGT---KTPINRNQLS
500 510 520 530 540
510 520 530
pF1KSD TPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
:. .:. :: : :
CCDS80 Q-NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVF
550 560 570 580 590 600
>>CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (430 aa)
initn: 1692 init1: 1518 opt: 1659 Z-score: 1931.6 bits: 366.8 E(32554): 2.8e-101
Smith-Waterman score: 1659; 79.4% identity (90.3% similar) in 321 aa overlap (9-328:82-399)
10 20 30
pF1KSD MLADKHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLS
::::: :. .:: .: ::::.:::::::
CCDS55 SSTLIALADKHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGP
:: ::::::::::::::.:::::::. :::..:: :::::::::. :::::::::::::
CCDS55 RQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGN
120 130 140 150 160 170
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CCDS55 SVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSAS
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CCDS55 EANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKL
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CCDS81 SQ-NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVV
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CCDS95 KNRELFISDYVDTYHAAALRGKCNISHFSDIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNST
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CCDS95 QGEIRVGPSHQAKLPDLQPFPSPDGDTVTQHEELVWMPG--VNDCDLLMYLRAARSMAAF
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CCDS95 AGMCDGGST------EDGCVAASRDDTTLNALNTLHESGYDAGKALQRLVKKPVPKLIE-
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]