Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1281
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1281, 1512 aa
  1>>>pF1KSDA1281 1512 - 1512 aa - 1512 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5592+/-0.000947; mu= 5.4302+/- 0.057
 mean_var=223.0325+/-45.500, 0's: 0 Z-trim(113.1): 17  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.085880
 statistics sampled from 13719 (13731) to 13719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time:  5.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34219.1 ZNF608 gene_id:57507|Hs108|chr5        (1512) 10029 1256.4       0
CCDS32270.1 ZNF609 gene_id:23060|Hs108|chr15       (1411) 1328 178.4 1.4e-43


>>CCDS34219.1 ZNF608 gene_id:57507|Hs108|chr5             (1512 aa)
 initn: 10029 init1: 10029 opt: 10029  Z-score: 6721.7  bits: 1256.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10029; 99.9% identity (100.0% similar) in 1512 aa overlap (1-1512:1-1512)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD NSKDCGGPASSGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSKDCGGPASSGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SAALYGIPEISSTGKRQEVQGRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAALYGIPEISSTGKRQEVQGRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKSRKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKSRKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSMLVKKEEEEEESHRRIKKLKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSMLVKKEEEEEESHRRIKKLKT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD EKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSVGVNTCEVGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSVGVNTCEVGVV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD TPPNCAAEDIKASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPPNCAAEDIKASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPET
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TFLDQGCSSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFLDQGCSSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGAGNPPGTPKGKRELMSNGPGSIIGAKAGKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGAGNPPGTPKGKRELMSNGPGSIIGAKAGKNS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKLEAEGLIDKKNLGDKEKGKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKLEAEGLIDKKNLGDKEKGKKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD NNCKTDKNLSKLKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGLPSLTTTVVQATP
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNCKTDKNLSKLKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGLPSLTTTVVQATP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETGSPKMDAKLGKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETGSPKMDAKLGKLE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD DSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYTFTDNAPSPSIGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYTFTDNAPSPSIGS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD ASRLECSTLVNGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADDGGSDSRSEGMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASRLECSTLVNGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADDGGSDSRSEGMRS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD KASSPSDIISSKDSVVKGHSSTTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSPSYMHPGQVGAPAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KASSPSDIISSKDSVVKGHSSTTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSPSYMHPGQVGAPAAG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NSGSTQGMKIKKESEEDAEKKDKAEQLDSKKVDHNSASLQPQHQSVITQRHPALAQSLYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSGSTQGMKIKKESEEDAEKKDKAEQLDSKKVDHNSASLQPQHQSVITQRHPALAQSLYY
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD GQYAYGLYMDQKSLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAEQKMAQTGRGDCERKSELPLKELGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GQYAYGLYMDQKSLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAEQKMAQTGRGDCERKSELPLKELGK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD EETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQQQLQADSFKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQQQLQADSFKA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD KQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEEL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD DREKKLKEDSPRKTPNKESGVPSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQSMEESKLKNDDRKTPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DREKKLKEDSPRKTPNKESGVPSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQSMEESKLKNDDRKTPV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD NWKDSRGTRVAVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NWKDSRGTRVAVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GFHYPVYGKMSGREETEKVNTSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GFHYPVYGKMSGREETEKVNTSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAE
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD REREAERERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGMGYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REREAERERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGMGYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510  
pF1KSD SASGMFPGQRRE
       ::::::::::::
CCDS34 SASGMFPGQRRE
             1510  

>>CCDS32270.1 ZNF609 gene_id:23060|Hs108|chr15            (1411 aa)
 initn: 2082 init1: 665 opt: 1328  Z-score: 895.9  bits: 178.4 E(32554): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 3453; 44.6% identity (67.0% similar) in 1570 aa overlap (6-1511:7-1411)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSS
             ...::::: : :.::::::.:.:::::::::::::::::.::.::         
CCDS32 MSLSSGASGGKGVDANPVETYDSGDEWDIGVGNLIIDLDADLEKDQQKLEM---------
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD SNSKDCGGPASSGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSL
       :.::. : :: .   :.:.: :..::..  . .:::   :: .::: ::::..::..:  
CCDS32 SGSKEVGIPAPN---AVATLPDNIKFVT-PVPGPQG---KE-GKSKSKRSKSGKDTSKPT
              60           70         80            90       100   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD PSAALYGIPEISSTGKRQEVQGRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATA
       :...:.   : ...  ..::::: :.  : :.  :  :.. .   :...  ....: ..:
CCDS32 PGTSLFTPSEGAAS--KKEVQGRSGD--GANA--GGLVAAIA---PKGSEKAAKASRSVA
           110         120         130            140       150    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GAGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKSRKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFG
       :      ::.:: ..:..:.  .:.. .:   .    .::         .: ::.    :
CCDS32 G------SKKEKENSSSKSK-KERSEGVGTCSEKDPGVLQ--------PVPLGGR----G
                160        170       180               190         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD AKSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSMLVKKEEEEEESH-RRIKKL
       .. .:..       :. .:.:   : .   : . :   : . .: : :: :.. : .::.
CCDS32 GQYDGSA-------GVDTGAVEPLGSI---AIEPGAALNPLGTKPEPEEGENECRLLKKV
         200              210          220       230       240     

      300       310       320        330        340       350      
pF1KSD KTEKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYF-SPSSSN-IAAPVEQLLVRTRSVGVNTCE
       :.::..          :.:   :: .:: ..  :  .: :..: ::..:::::::::::.
CCDS32 KSEKMES---------PVS---TPAVLPIHLLVPVVNNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCD
         250                   260       270       280       290   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD VGVVTEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPP
       :...::::::::::::::::::::::.:::.:.::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 VALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPP
           300       310       320       330       340       350   

        420       430       440        450         460       470   
pF1KSD RFCESPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSE-ASFTESRGLQN--KNRGGANGKGRRGS
       :::.:::::::::.::::::: :  . .: .: :. ..:.: .:  :.:.:::.::::::
CCDS32 RFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETATASDSKGTSNSSKTRAGANSKGRRGS
           360       370       380       390       400       410   

           480       490       500       510       520       530   
pF1KSD LNASGRRTPPNCAAEDIKASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTT
        :.: .: : . ..::.::::::.:::::::  ...:::::::.: .::::::: .. : 
CCDS32 QNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATG
           420       430       440       450       460       470   

             540       550       560       570       580       590 
pF1KSD P-QG-KPETTFLDQGCSSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDS
       :  : : : : ::..: ::::::::::::::::::::::.::::::: : ..: : . ::
CCDS32 PLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDS
           480       490       500       510       520       530   

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pF1KSD EDKISDCEEGLSNVAL-ECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGAGNPPGTPKGKR-ELMSNGPG
       :      :: . .. :  :.  ..:::   .: .::        .::: .  :  : .:.
CCDS32 EYG----EEPILHADLGSCN--GASVSQKGSL-SPAR------SATPKVRLVEPHSPSPS
               540         550        560             570       580

     650       660       670       680       690       700         
pF1KSD SIIGAKAGKNSGKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKLEAEGLIDKK
       : ...: :  . : .: ..  ..: ..::     :  .. ::  . .  . .:   ...:
CCDS32 SKFSTK-GLCKKKLSGEGD--TDLGALSN-----D--GSDDGPSVMDETSNDAFDSLERK
               590         600              610       620       630

     710       720       730        740       750       760        
pF1KSD NLGDKEKGKKANNCKTDKNLSK-LKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGL
        . .::: :: .. : .:  :: ::::::::::  : : :. .. :::::... :.  ::
CCDS32 CM-EKEKCKKPSSLKPEKIPSKSLKSARPIAPA-IP-PQQIYTFQTATFTAASPGSSSGL
               640       650       660         670       680       

      770       780       790       800       810       820        
pF1KSD PSLTTTVVQATPKSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETG
          :.::.:: :.:: :::::::::.::::.::::::.  ::::::.:.:   . .::  
CCDS32 ---TATVAQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKK--KESSKELE
          690       700       710       720       730         740  

      830       840       850       860       870       880        
pF1KSD SPKMDAKLGKLEDSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYT
       ::   .:. . :..:.  ..  :    : . : ::: :: :. ..::.:::::::::.:.
CCDS32 SPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSG----DGM-KMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYS
            750       760            770       780       790       

      890       900       910       920       930       940        
pF1KSD FTDNAPSPSIGSASRLECSTLVNGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADD
       :::::::::::..:::: .: ..   :..::::.::::::.:..::.::::::::::..:
CCDS32 FTDNAPSPSIGGSSRLENTTPTQ---PLTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGED
       800       810       820          830       840       850    

      950       960       970         980       990      1000      
pF1KSD GGSDSRSEGMRSKASSPSDIISSKDS--VVKGHSSTTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSP
       :      ::         : ..:::.  .::  .. :    : . . ::::.... ::::
CCDS32 G------EG-------KVDSVKSKDAEQLVKEGAKKTLFPPQPQSKDSPYYQGFESYYSP
                       860       870       880       890       900 

       1010        1020      1030       1040      1050      1060   
pF1KSD SYMH--PGQVGAPAAGNSGSTQGMKIKKESE-EDAEKKDKAEQLDSKKVDHNSASLQPQH
       :: .  :: .. :..  .  .:..: :.. : :. : : : .  . :: . .:.: ::  
CCDS32 SYAQSSPGALN-PSSQAGVESQALKTKRDEEPESIEGKVKNDICEEKKPELSSSSQQP--
             910        920       930       940       950          

          1070      1080          1090         1100      1110      
pF1KSD QSVITQRHPALAQSLYYGQYAY----GLYMDQK---SLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAE
        ::: ::     :::::.::::    : : ::.    :..:. :::::::   :.:.  .
CCDS32 -SVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYG-YSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYE---EQQK--R
       960       970       980        990      1000         1010   

       1120      1130         1140      1150      1160      1170   
pF1KSD QKMAQTGRGDCERKSELPLKELG---KEETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSV
       :.. :  ::  ..:.:. :::     ::: :::     :..::::  .       :  : 
CCDS32 QSLEQQQRG-VDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTD-------LVKSG
            1020       1030      1040      1050             1060   

          1180            1190         1200      1210      1220    
pF1KSD PNKTEETG----KSQLLS--NHQQQL--QA-DSFKAKQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQ
       :.:..: :    :: ..   . ...:  :: ...:.:  .  .: ::: : :.  .  .:
CCDS32 PGKAKEPGADPAKSVIIPKLDDSSKLPGQAPEGLKVKLSDASHLSKEASEAKTGAECGRQ
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

         1230      1240      1250      1260         1270      1280 
pF1KSD TGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEEL---DREKKLKEDSPRKTPNKESGV
       . .::   ..:. . : :  :::  :: : .. .:    .:..::::.  :   .:.: :
CCDS32 AEMDPILWYRQEAEPRMWT-YVYPAKYSDIKSEDERWKEERDRKLKEERSR---SKDS-V
          1130      1140       1150      1160      1170            

            1290      1300        1310      1320      1330         
pF1KSD PSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQ--SMEESKLKNDDRKTPVNWKDSRGTRVAVSSPMSQH
       :         ::. ::.   : .  . :::.: . . .  :.        : ::::..::
CCDS32 P---------KEDGKESTSSDCKLPTSEESRLGSKEPRPSVH--------VPVSSPLTQH
              1180      1190      1200      1210              1220 

    1340      1350      1360      1370      1380       1390        
pF1KSD QSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSPGFHYPVYG-KMSGREETEK
       :::: :.:.: : : :::.::.::..  :.:..:::.::  .. .  :: :.:: :...:
CCDS32 QSYIPYMHGYSYSQSYDPNHPSYRSMPAVMMQNYPGSYLPSSYSFSPYGSKVSGGEDADK
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

     1400      1410      1420      1430      1440                  
pF1KSD VNTSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAEREREA-------------
       . .::::. :...::::::.:::::..:.::::.  .:.. ::.: .             
CCDS32 ARASPSVTCKSSSESKALDILQQHASHYKSKSPTISDKTSQERDRGGCGVVGGGGSCSSV
            1290      1300      1310      1320      1330      1340 

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pF1KSD ------ER--ERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGMGYPLIPGQYD-PFQ-GLTSAALVASQQ
             ::  .: : :: .:: . :::: :  .:: :.:.::. :.  ::.:.:.:::::
CCDS32 GGASGGERSVDRPRTSP-SQRLMSTHHHHH-HLGYSLLPAQYNLPYAAGLSSTAIVASQQ
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           .:. ...:  :: 
CCDS32 ----GSTPSLYPPPRR 
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1512 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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