Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1318
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1318, 1388 aa
1>>>pF1KSDA1318 1388 - 1388 aa - 1388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9866+/-0.00145; mu= -2.2807+/- 0.086
mean_var=332.9728+/-68.076, 0's: 0 Z-trim(107.5): 80 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.070286
statistics sampled from 9535 (9590) to 9535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 5.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14552.1 RGAG1 gene_id:57529|Hs108|chrX (1388) 8922 920.3 0
CCDS34711.1 MUC17 gene_id:140453|Hs108|chr7 (4493) 615 78.4 5.1e-13
>>CCDS14552.1 RGAG1 gene_id:57529|Hs108|chrX (1388 aa)
initn: 8922 init1: 8922 opt: 8922 Z-score: 4906.6 bits: 920.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8922; 100.0% identity (100.0% similar) in 1388 aa overlap (1-1388:1-1388)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSTQLMTSPVFDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSTQLMTSPVFDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASDSGALSPLLMPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSSEAMSPLQITDEDTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPTSTQNSGGIPTPLMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AMSKVLMTALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPTSTQNSGGIPTPLMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPALMTALPSGVMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLDSGIMSSLLMSSPGSEVMSTPLLSVPDAGEMSTLPKPAPDAEAMSPALMTALPSGVMP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDSGAMSTPLMGAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDSGAMSTPLMGAPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVMSTEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVPSSGVMSTEQMSATASRVMSAQLTMAKTSGAMPTGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MKAVAKQYKRATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKAVAKQYKRATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD MRAPVSEAMSMPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MRAPVSEAMSMPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTEKMTTTASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTEKMTTTASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQDPGVMPASLMRAKVSGKMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQDPGVMPASLMRAKVSGKMLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTSETMSTPLMRTSDPGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTSETMSTPLMRTSDPGER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPLRSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSRVTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LVRAPASGTMSTPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVRAPASGTMSTPLRRPSACETVSTELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TMPMPLMSAMASGEMSMPLMETMASGATSTLQTSVANSRSMSLSQTTYTVSGRMATAPIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TMPMPLMSAMASGEMSMPLMETMASGATSTLQTSVANSRSMSLSQTTYTVSGRMATAPIR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATASGCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLPRATASGCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPTSHMTATTPETAKPPPKEVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPTSHMTATTPETAKPPPKEVPS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD FGMLTPALCYLLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FGMLTPALCYLLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD FILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVRQYATDFLLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FILQMEVGEPLSHENKSFLRRSQGIYDSLSEIDILSAVLCHPKQGQKSVRQYATDFLLLA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD RHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKELIDRSLYTECQLAEEKDSPGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RHLSWSDAILRTRFLEGLSEAVTTKMGRIFLKVAGSLKELIDRSLYTECQLAEEKDSPGN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD SSQVLPTACKRNNEEAMGNELSSQQQTEEHQHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSQVLPTACKRNNEEAMGNELSSQQQTEEHQHVSKRCYYLKEHGDPQEGLHDHLGQSTGH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD HQKAHTNK
::::::::
CCDS14 HQKAHTNK
>>CCDS34711.1 MUC17 gene_id:140453|Hs108|chr7 (4493 aa)
initn: 101 init1: 59 opt: 615 Z-score: 347.2 bits: 78.4 E(32554): 5.1e-13
Smith-Waterman score: 681; 25.9% identity (52.1% similar) in 1166 aa overlap (31-1146:139-1214)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSA--SDP
: : .:: . . . : :: : :
CCDS34 RMTPTESRTTSESTSDSTTLFPSSTEDTSSPTTPEGTDVP-MSTPSEESISSTMAFVSTA
110 120 130 140 150 160
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GGTSTQLMTSPVFDT-MSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPAS-DSGALSPL
: . .:: .. . ::.:: . .. : : : : : . .: : .: . .::
CCDS34 PLPSFEAYTSLTYKVDMSTPL--TTSTQASSSPTTPESTT-------IPKSTNSEGSTPL
170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KSD L-MPALDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSG
::: .:.. : . . .: .. : :.:: .: .:: :. :::.:
CCDS34 TSMPA---STMKVASSEAITLLTTPVEISTP--VTISAQASSSPTTAEGPSLSNSAPSGG
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VVCTPIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSS-EAMS-PLQ
::. . .:. :... ... :: : . ::. .:.. :. : : .
CCDS34 --STPL----TRMPLSVMLVVSSEASTLSTTPAATNIPVITSTEASSSPTTAEGTSIPTS
280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ITDEDTEAMSKVLMTAL--ASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPTSTQNS
: . .... ... :..:.:.: .. .:. :.:. :: .:.: ..
CCDS34 TYTEGSTPLTSTPASTMPVATSEMSTLSITPVDT---STLVT-------TSTEPSSLPTT
330 340 350 360 370
300 310 320 330 340
pF1KSD GGIPTPLMSDLDSG--------IMSSLLMSSPGSEVMSTPLLS---VPDAGEMSTLPKPA
. . : : :. : . . :. :: .: . . :. : : :.: :. : :
CCDS34 AEATSMLTSTLSEGSTPLTNMPVSTILVASSEASTTSTIPVDSKTFVTTASEASSSPTTA
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390
pF1KSD PDAE-AMSPALMTALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMS
:. : : . : ::..: :. .: : : :: :::. . . ..:..:
CCDS34 EDTSIATSTPSEGSTPLTSMPVSTTPVASSEA-SNLSTTPVDSKTQVTTSTEASSS----
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD APPVRALDSGAMSTPLMGAPASGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVP---SSGVMSTEQMS
::. ..: ::: :. .::. .:.:.... ...: :.: :. : .. . :
CCDS34 -PPTAEVNSMPTSTPSEGSTPLTSMSV--STMPVASSEASTLSTTPVDTSTPVTTSSEAS
500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ATASRVMSAQL-TMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKRATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPV
.... .... : . . :. : .: . .. . :: .:: . :
CCDS34 SSSTTPEGTSIPTSTPSEGSTPLTNMPVSTRLVVSSEASTTSTTPADSNTFVTTSSEASS
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KSD TATASETMSMPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMSMPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAM
..:..: ::: : :. .. .: . .. . : . :... ... . .. :
CCDS34 SSTTAEGTSMPTSTYSERGT-TITSMSVSTTLVAS-SEASTLSTTPVDSNTPVTTSTEAT
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KSD STPLMTAQTSGSTSTLLMRDTASGVMSCPQMRSLASGALSKPL-MTPKASGTMFTEKMTT
:. . :: ::: . . .. . : : .:.... .. : :: ..: : :.
CCDS34 SSSTTAEGTSMPTST--YTEGSTPLTSMPVNTTLVASSEASTLSTTPVDTSTPVT---TS
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KSD TASEAMPTLLMRDTVSGALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSM
: . . :: :..:: ::: :.: : : :. : .: .. ::. ..:.: .
CCDS34 TEASSSPT-----TADGA-SMP--TSTPSEG-STPLTSMPVSKTLLTSSEASTLS---TT
730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PLMRAQDPGVMPASLMRAKVSGKML---SQPMSTQDPGGMSMSPM-KSMTAGGMQMNSPT
:: : .. .. .:. : :.:.:: . : ::. :. .. ..::
CCDS34 PL----DTSTHITTSTEASCSPTTTEGTSMPISTPSEG----SPLLTSIPVSITPVTSPE
780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SDVMSTPTVRAWTSETMSTPLMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPLMRAPASGEIATPL
....:: : . . : :: . . :.: :. : . : :. :: :.: .: .
CCDS34 ASTLSTTPVDSNSPVTTSTEVSSSPTPAEGTSMPTSTYSEGR--TPLTSMPVS---TTLV
830 840 850 860 870
820 830 840 850 860
pF1KSD RSPAYGAMSAPQMTATASGMMSSMPQVKAPISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAPDSR-
. : ...:. . ... :. . . : . ::: ... : : :: :::
CCDS34 ATSAISTLSTTPVDTSTPVTNSTEARSSPTTSEGTSMP---TSTPGEGSTPLTSMPDSTT
880 890 900 910 920 930
870 880 890 900 910 920
pF1KSD --VTSTSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSPLVRAPASGTMSTPLR--RPSACETVST
:.: .. . .. : : :: . .. ..::: . .: ::: . : . ::
CCDS34 PVVSSEARTLSATPVDTST-PV-TTSTEATSSPTTAEGTSIPTSTPSEGTTPLTSTPVSH
940 950 960 970 980 990
930 940 950 960 970 980
pF1KSD ELMRASASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAP--ASGT-MPMPLMSAMASGEMSMPLMET
:. : .. .::. . . . : : : :: :: : .. ::. :
CCDS34 TLVANSEASTLSTTPVDSNTPLTTSTEASSPPPTAEGTSMPTSTPSEGSTPLTRMPVSTT
1000 1010 1020 1030 1040 1050
990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD M-ASGATSTLQTSVANSRS--MSLSQ-TTYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSG
: ::. ::::.:. :.. . . :: .. .... .. : . . : :: . . ::
CCDS34 MVASSETSTLSTTPADTSTPVTTYSQASSSSTTADGTSMPTSTYSEG--STPLTSVPVST
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD SMPMPLPRATASGCGMGMSMPQMTATDS-------RGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGV
. . .: : . :.: :.:.. .: : : .: :. .:: ... :
CCDS34 RLVVSSEASTLSTTPVDTSIPVTTSTEASSSPTTAEGTSIP---TSPPSEGTTPLASMPV
1120 1130 1140 1150 1160
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD MSTPEIKATDSGEASTSHINITASGSKPTSHMTATTPETAKPPPK-EVPSFGMLTPALCY
.: . :.::.: .. : :: ..::. :...::: :: :. ::
CCDS34 STTLVV----SSEANT--LSTTPVDSKT---QVATSTEASSPPPTAEVTSMPTSTPGERS
1170 1180 1190 1200 1210
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LLEEQEAARGSCSVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERWFILQMEVGEP
CCDS34 TPLTSMPVRHTPVASSEASTLSTSPVDTSTPVTTSAETSSSPTTAEGTSLPTSTTSEGST
1220 1230 1240 1250 1260 1270
>--
initn: 91 init1: 56 opt: 606 Z-score: 342.2 bits: 77.5 E(32554): 9.6e-13
Smith-Waterman score: 623; 23.6% identity (55.2% similar) in 1143 aa overlap (31-1135:1269-2321)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSIPLHSLRFNNTMREENVEPQNKQMAFCRPMTETRADVQILHSHVQLPIVSTSASDPGG
: . : .: : .:. .: ...: .
CCDS34 LSTSPVDTSTPVTTSAETSSSPTTAEGTSLPTSTTSEGSTLLTS---IPVSTTLVTSPEA
1240 1250 1260 1270 1280 1290
70 80 90 100 110
pF1KSD TSTQLMTSPVFDTMSAPLMGVPNSGALSPPLMPASDSGALSPLLMPASD-SGALSPLLMP
.. :.:.:: :: ..: : .:. .: :: .. ::.: : . .::
CCDS34 ST--LLTTPV-DT-KGP---VVTSNEVSSSPTPAEGTS------MPTSTYSEGRTPLTSI
1300 1310 1320 1330 1340
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ALDSGTLSPLLSTSEYGVMSPGMMTIPDFGTMSATLMVAPDSAEISPLAMPAPSSGVVCT
... :...: ...: . : :. .: ..: . . :: :. :
CCDS34 PVNT----TLVASSAISILSTTPVDNSTPVTTSTEACSSPTTSEGTSMPNSNPSEGT--T
1350 1360 1370 1380 1390
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PIMSTSSSEAMSTPLMLAPDSGELSPILMQDMNPGVMSTQPVPAPSS-EAMS-PLQITDE
:. : : .::.. . ... :: .. .::. :.. . .:.. :..: : . .:
CCDS34 PLTSIPVS---TTPVV-SSEASTLSATPVDTSTPGTTSAEATSSPTTAEGISIPTSTPSE
1400 1410 1420 1430 1440 1450
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DTEAMSKVLM--TALASGEISSLLMSGTDSEAISSLIMSAVASGGTSPQPT-STQNSGGI
.... . : .:..: :.: . .::. : .. :...: .:: :. .:. . .
CCDS34 GKTPLKSIPVSNTPVANSEASTLSTTPVDSN--SPVVTSTAVS--SSPTPAEGTSIAIST
1460 1470 1480 1490 1500
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PTPLMSDLDS-GIMSSLLMSSPGSEVMSTP-LLSVP--DAGEMSTLPKPAPDAEAMSPAL
:. . : : . .. . :: . . .:: . :.: .. :. : : :. .:. .
CCDS34 PSEGSTALTSIPVSTTTVASSEINSLSTTPAVTSTPVTTYSQASSSPTTA-DGTSMQTST
1510 1520 1530 1540 1550 1560
360 370 380 390 400
pF1KSD MT--ALPSGVMPTQTMPAPGSGAMSPWSTQNVDSEMMSNPPVRATASGVMSAPPVRALDS
.. . : .:..:: . .: : . :: .::. ...::: :. . .:
CCDS34 YSEGSTPLTSLPVSTMLVVSSEA-NTLSTTPIDSK------TQVTASTEASSSTTAEGSS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GAMSTPLMGAPASGNMSTLQKTVPASGAMTTSLMTVP---SSGVMSTEQMSATASRVMSA
..::: :.: .. . .:.:... ...: :.: .: :... ..:.. . . ..
CCDS34 MTISTPSEGSPLLTSIPV--STTPVASPEASTLSTTPVDSNSPVITSTEVSSSPTPAEGT
1630 1640 1650 1660 1670
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QL-TMAKTSGAMPTGSMKAVAKQYKRATASGKMSTPLRRAPTSGAMSTQPVTATASETMS
.. : . : : : :. . . .. : .::. . . . . :.:: :
CCDS34 SMPTSTYTEGRTPLTSITVRTTPVASSAISTLSTTPVDNSTPVTTSTEARSSPTTSEGTS
1680 1690 1700 1710 1720 1730
530 540 550 560 570 580
pF1KSD MPQLTVPASGSMSMLQMRAPVSEAMSMPQMRTMASGLTSAAQMKAMTSGAMSTPLMTAQT
::. ..:. :. . .. . .. ..: :. . ... . . : : :.: . :
CCDS34 MPN-STPSEGTTPLTSIPVSTTPVLSSEASTLSATPIDTSTPVTTSTE-ATSSPTTAEGT
1740 1750 1760 1770 1780 1790
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SGSTSTLLMRDTASGVMSCPQMRSLASGALSKPLMTPKASGTMFTEKMTTTASEAMPTLL
: :::: . . . : : ..:.... .. : : .... . .:.:: . ::
CCDS34 SIPTSTL--SEGMTPLTSTPVSHTLVANSEASTLSTTPVDSN--SPVVTSTAVSSSPT--
1800 1810 1820 1830 1840 1850
650 660 670 680 690 700
pF1KSD MRDTVSGALSMPQMTDTASGGLSASLMRDTASGAMSTSQMTATVSGGMSMPLMRAQDPGV
. .: : : :. .:: .. .: :.. : : .. .:. . : :. . .
CCDS34 PAEGTSIATSTPSEGSTALTSIPVS----TTTVASSETNTLSTTPAVTSTPVTTYAQVSS
1860 1870 1880 1890 1900
710 720 730 740 750 760
pF1KSD MPASLMRAKVSGKMLSQPMSTQDPGGMSMSPMKSMTAGGMQMNSPTSDVMSTPTVRAWTS
:.. : :. : : . : .. :... :... ..:. .. . .: : . :
CCDS34 SPTT---ADGSSMPTSTPREGRPP--LTSIPVSTTTVASSEINTLSTTLADTRTPVTTYS
1910 1920 1930 1940 1950 1960
770 780 790 800 810
pF1KSD ETMSTPLMRTSDPGERPSLLTRASSSGEMSLPL-----MRAPASGEIATPL--RSPAYGA
.. :.: :.: :. .:. :.:: . . :: .::. .:: .
CCDS34 QASSSPT--TADGTSMPTPAYSEGSTPLTSMPLSTTLVVSSEASTLSTTPVDTSTPATTS
1970 1980 1990 2000 2010
820 830 840 850 860 870
pF1KSD MSAPQMTATASG--MMSSMPQVKA-PISGAMSMPLTRSTASGGMSMPLMRAP-DSR--VT
. . .::.: ...: :. .. :..: ::.. . . .. . : .: ::. ::
CCDS34 TEGSSSPTTAGGTSIQTSTPSERTTPLAG---MPVSTTLVVSSEGNTLSTTPVDSKTQVT
2020 2030 2040 2050 2060 2070
880 890 900 910 920 930
pF1KSD STSQMMPTASGDMCTLPVRAPASGGVSSPLVRA-PASGTMSTPLRRPSACETVSTELMRA
.... .:... .. . ::. : :::. . : : .::. : : :.:: . .
CCDS34 NSTEASSSATAEGSSMTISAPSEG---SPLLTSIPLS---TTPVASPEAS-TLSTTPVDS
2080 2090 2100 2110 2120
940 950 960 970 980
pF1KSD SASGHMSTAQTTAMVSGGMSKPLMRAPASGT-MPMPLMSAMASGEMSMPLMETM-ASGAT
. : . :.. :: :.:. :. :: : .: . :::. :. ::.:
CCDS34 N-----SPVITSTEVS---SSPI---PTEGTSMQTSTYSDRRTPLTSMPVSTTVVASSAI
2130 2140 2150 2160 2170
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD STLQTSVANSRSMSLSQT---TYTVSGRMATAPIRASASGARSTSFMRASVSGSMPMPLP
:::.:. ... . ..: . .... .. : . . : :: : :: .::.
CCDS34 STLSTTPVDTSTPVTNSTEARSSPTTSEGTSMPTSTPSEG--STPFTSMPVS-TMPVVTS
2180 2190 2200 2210 2220 2230
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RA-TASGCGMGMSMPQMTATDSRGMSTPLMRASGPGTMSTPQTAFGVMSTPEIKATDSGE
.: : :. . : : :.:.. :.: ... :: : : .... .:: . . ..
CCDS34 EASTLSATPVDTSTPVTTSTEA--TSSP---TTAEGT-SIPTSTLSEGTTP-LTSIPVSH
2240 2250 2260 2270 2280
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD ASTSHINITASGSKPTSHMT--ATTPETAKPPPKEVPSFGMLTPALCYLLEEQEAARGSC
. ... .... .. :.. : .:. :...:::
CCDS34 TLVANSEVSTLSTTPVDSNTPFTTSTEASSPPPTAEGTSMPTSTSSEGNTPLTRMPVSTT
2290 2300 2310 2320 2330 2340
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD SVEEEMEIDEEKQMKGFLDDSERMAFLVSLHLGAAERWFILQMEVGEPLSHENKSFLRRS
CCDS34 MVASFETSTLSTTPADTSTPVTTYSQAGSSPTTADDTSMPTSTYSEGSTPLTSVPVSTMP
2350 2360 2370 2380 2390 2400
1388 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:48:40 2016 done: Thu Nov 3 05:48:41 2016
Total Scan time: 5.010 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]