FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1349, 739 aa 1>>>pF1KSDA1349 739 - 739 aa - 739 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4140+/-0.00232; mu= 11.3129+/- 0.136 mean_var=263.7417+/-53.878, 0's: 0 Z-trim(100.9): 968 B-trim: 3 in 1/49 Lambda= 0.078974 statistics sampled from 5285 (6310) to 5285 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.472), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 2.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 5216 609.8 5.7e-174 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2624 314.4 4.3e-85 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2624 314.4 4.4e-85 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2605 312.5 2.4e-84 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2605 312.5 2.5e-84 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2600 311.8 3.4e-84 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2600 311.9 3.5e-84 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2596 311.3 4.4e-84 CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2587 310.2 8.1e-84 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2588 310.4 8.4e-84 CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2587 310.3 8.8e-84 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2586 310.4 1.2e-83 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2582 309.7 1.3e-83 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2579 309.3 1.6e-83 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2579 309.3 1.6e-83 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2540 304.8 3.3e-82 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2530 303.7 7.4e-82 CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2530 303.7 7.5e-82 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2527 303.3 8.5e-82 CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2521 302.9 1.9e-81 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2490 299.1 1.6e-80 CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 2491 299.3 1.7e-80 CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2490 299.1 1.7e-80 CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 2491 299.3 1.7e-80 CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2490 299.2 1.8e-80 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2488 298.9 2e-80 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2480 298.0 3.8e-80 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2480 298.0 3.8e-80 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2480 298.0 3.8e-80 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 2476 297.7 6e-80 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2472 297.2 7.7e-80 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2470 297.0 9.8e-80 CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2409 290.0 1.1e-77 CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2400 288.9 2.2e-77 CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2385 287.2 6.8e-77 CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2385 287.2 7e-77 CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2385 287.2 7.1e-77 CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 2376 286.0 1.2e-76 CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 2376 286.1 1.4e-76 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2370 285.4 2e-76 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2371 285.6 2.1e-76 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2370 285.4 2.2e-76 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2313 278.9 1.9e-74 CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 2292 276.5 1e-73 CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 2292 276.5 1e-73 CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2288 276.0 1.3e-73 CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2288 276.0 1.3e-73 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2277 274.8 3.2e-73 CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 2257 272.5 1.6e-72 CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 2256 272.4 1.7e-72 >>CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 (865 aa) initn: 5216 init1: 5216 opt: 5216 Z-score: 3236.8 bits: 609.8 E(32554): 5.7e-174 Smith-Waterman score: 5216; 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CCDS12 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 600 610 pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH ::.:. ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.:::::: .: : CCDS12 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH 670 680 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH : ::.:.:::::. :::.: ....:. : : ::::::: : ::::. . :.:: :. :: CCDS12 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH 730 740 750 760 770 780 680 690 700 710 720 730 pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET :::. :::.::::.:: .:... : :::::::::: CCDS12 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK 790 800 810 pF1KSD QLI >>CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159 aa) initn: 17682 init1: 2585 opt: 2605 Z-score: 1627.7 bits: 312.5 E(32554): 2.4e-84 Smith-Waterman score: 2605; 55.8% identity (75.9% similar) in 663 aa overlap (75-735:409-1071) 50 60 70 80 90 100 pF1KSD WNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFRFESILIPEPGIATEELHSRCQTQEEN ..: . : : . . :.: .:. . CCDS74 CGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKA 380 390 400 410 420 430 110 120 130 140 150 160 pF1KSD FTENLNLITDT--HLGKIICKEMKGSKAIRQTSELTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYR : . .: : :. : . .::.::.: :: : .. ::::: : :::. CCDS74 FIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQS 440 450 460 470 480 490 170 180 190 200 210 220 pF1KSD SLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQHKKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLM : .:. :..::::.:.::::.:.: : :. :: ::.:.: :::.:::::: :::: CCDS74 LTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLS 500 510 520 530 540 550 230 240 250 260 270 280 pF1KSD VHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQE .:. ::: :: :.:. :::.: . : .:.::.:::::::: ::::::: .: ::.:.. CCDS74 THKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKR 560 570 580 590 600 610 290 300 310 320 330 340 pF1KSD THNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTG :.::::::: .::::: :.: :. :. ::::::::.:.:: :.:: . .. :. ::.: CCDS74 IHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAG 620 630 640 650 660 670 350 360 370 380 390 400 pF1KSD EKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPY :: ..:.:::::. .:.: .: :::::::.:.::::::: ...:.:.:::: :::. CCDS74 EKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPF 680 690 700 710 720 730 410 420 430 440 450 460 pF1KSD KCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNE ::.::::::: : :: :.:.::::::::: :::::: :::.: :. ::: :::: :.: CCDS74 KCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKE 740 750 760 770 780 790 470 480 490 500 510 520 pF1KSD CGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKS ::..:. .: :. :. ::.::: ::: .: .::.. :: :. ::: :: : .: :. CCDS74 CGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKA 800 810 820 830 840 850 530 540 550 560 570 580 pF1KSD FRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSN : .: : :.: :: :: :::.:: :::.. :.::.:.: :::::::::.::::.:... 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CCDS74 RDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGICPHFPQDFWPEQSME--DSFQ 20 30 40 50 60 70 330 340 350 360 370 380 pF1KSD NTTIFNVHQRIHTGEKPFR-C---NECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFN .. . . .. : . . . : .:: :... . . . . : . : ..:.. :.: CCDS74 KVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDEC-KVHKEGYNKLNQCLTTAQSKVFQCGKYLKVFY 80 90 100 110 120 130 390 400 410 420 430 440 pF1KSD RIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHT----GEKPYKCTECGKAFM .. : ..: :::.: .::..: :.: :. .:. .: :: :: :: :.: CCDS74 KFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSF----CIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFH 140 150 160 170 180 450 460 470 480 490 500 pF1KSD RSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVN ::.: :..::::.::: :.:::..:. : ::.:. : . :: ::: .: .:: . 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CCDS42 CGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKA 420 430 440 450 460 470 110 120 130 140 150 160 pF1KSD FTENLNLITDT--HLGKIICKEMKGSKAIRQTSELTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYR : . .: : :. : . .::.::.: :: : .. ::::: : :::. CCDS42 FIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQS 480 490 500 510 520 530 170 180 190 200 210 220 pF1KSD SLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQHKKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLM : .:. :..::::.:.::::.:.: : :. :: ::.:.: :::.:::::: :::: CCDS42 LTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLS 540 550 560 570 580 590 230 240 250 260 270 280 pF1KSD VHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQE .:. ::: :: :.:. :::.: . : .:.::.:::::::: ::::::: .: ::.:.. CCDS42 THKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKR 600 610 620 630 640 650 290 300 310 320 330 340 pF1KSD THNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEKPYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTG :.::::::: .::::: :.: :. :. ::::::::.:.:: :.:: . .. :. ::.: CCDS42 IHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAG 660 670 680 690 700 710 350 360 370 380 390 400 pF1KSD EKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPY :: ..:.:::::. .:.: .: :::::::.:.::::::: ...:.:.:::: :::. CCDS42 EKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPF 720 730 740 750 760 770 410 420 430 440 450 460 pF1KSD KCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNE ::.::::::: : :: :.:.::::::::: :::::: :::.: :. ::: :::: :.: CCDS42 KCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKE 780 790 800 810 820 830 470 480 490 500 510 520 pF1KSD CGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKS ::..:. .: :. :. ::.::: ::: .: .::.. :: :. ::: :: : .: :. CCDS42 CGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKA 840 850 860 870 880 890 530 540 550 560 570 580 pF1KSD FRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSN : .: : :.: :: :: :::.:: :::.. :.::.:.: :::::::::.::::.:... 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