Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1349
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1349, 739 aa
1>>>pF1KSDA1349 739 - 739 aa - 739 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8110+/-0.00111; mu= 15.4973+/- 0.068
mean_var=338.8460+/-70.195, 0's: 0 Z-trim(107.5): 2107 B-trim: 131 in 2/51
Lambda= 0.069674
statistics sampled from 13285 (15600) to 13285 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.46), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 10.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2624 280.1 2.5e-74
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2605 278.4 1.1e-73
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2605 278.4 1.1e-73
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2605 278.4 1.1e-73
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2605 278.4 1.1e-73
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2605 278.4 1.1e-73
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2605 278.5 1.1e-73
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2605 278.5 1.1e-73
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2586 276.6 4.3e-73
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2582 275.9 4.7e-73
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2582 276.0 4.9e-73
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2582 276.0 4.9e-73
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2568 274.7 1.5e-72
NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 2491 266.8 2.7e-70
NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 2491 266.8 2.7e-70
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2490 266.7 2.9e-70
XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 2482 265.8 4.9e-70
XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 2482 265.8 4.9e-70
XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 2481 265.7 5.1e-70
XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 2481 265.7 5.2e-70
XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2481 265.7 5.2e-70
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2480 265.6 5.4e-70
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2480 265.6 5.4e-70
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 2609 init1: 2609 opt: 2624 Z-score: 1455.7 bits: 280.1 E(85289): 2.4e-74
Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:120-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
.. ....... ..: : .: ..: :
NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120 130
pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
:.: : :: . : . .: :. :.: . .. . ... .. : . . . :
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
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NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
. ::::::::::.::::.: .: : .:.:::: ::::.:: :::.: . :. :: :.
NP_001 QVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIH
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
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NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
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NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
:::.:.:.. .....:.:::::::::::::::::: : ::.:. .:.::::::: :::
NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
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NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
.: :: :::: :::::..::: :: .::: .:.: :::::::::::: :::. :.
NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
::.:. ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.:::::: .: :
NP_001 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
690 700 710 720 730 740
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
:::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
750 760 770 780
pF1KSD QLI
>>NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:120-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
.. ....... ..: : .: ..: :
NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
:.: : :: . : . .: :. :.: . .. . ... .. : . . . :
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
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NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
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200 210 220 230 240 250
pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
. ::::::::::.::::.: .: : .:.:::: ::::.:: :::.: . :. :: :.
NP_001 QVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIH
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260 270 280 290 300 310
pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
:::::.::.:::: :...:.: : . :.:::::::..::::: .: :..:: :: ::
NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
::.:::::: :. .. .. :.:.::::::..:::::::. .:.: .: ::: ::..:
NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
:::.:.:.. .....:.:::::::::::::::::: : ::.:. .:.::::::: :::
NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
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NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
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pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
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NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
::.:. ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.:::::: .: :
NP_001 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
:::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
750 760 770 780
pF1KSD QLI
>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 2609 init1: 2609 opt: 2624 Z-score: 1455.7 bits: 280.1 E(85289): 2.4e-74
Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:120-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
.. ....... ..: : .: ..: :
NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
:.: : :: . : . .: :. :.: . .. . ... .. : . . . :
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
:: .:.:. :::::. : ::: : : .:.: :. ::::.:.::::::. : :. :
NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
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pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
. ::::::::::.::::.: .: : .:.:::: ::::.:: :::.: . :. :: :.
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pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
:::::.::.:::: :...:.: : . :.:::::::..::::: .: :..:: :: ::
NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
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pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
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NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
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pF1KSD QLI
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pF1KSD QLI
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NP_942 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
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NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD QLI
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NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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pF1KSD QLI
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pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
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NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
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NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
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NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
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NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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560 570 580 590 600 610
pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
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NP_001 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
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NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
pF1KSD QLI
739 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:56:44 2016 done: Thu Nov 3 05:56:46 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]