Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1355
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1355, 1179 aa
1>>>pF1KSDA1355 1179 - 1179 aa - 1179 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6543+/-0.000464; mu= -10.5757+/- 0.029
mean_var=496.3027+/-104.026, 0's: 0 Z-trim(122.8): 387 B-trim: 889 in 2/57
Lambda= 0.057571
statistics sampled from 41009 (41448) to 41009 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.486), width: 16
Scan time: 17.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001128522 (OMIM: 609738) protein turtle homolog (1179) 8122 690.3 1.9e-197
NP_065840 (OMIM: 609738) protein turtle homolog A (1163) 5819 499.0 7e-140
XP_016857373 (OMIM: 609738) PREDICTED: protein tur ( 801) 5419 465.7 5.4e-130
XP_011540997 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1441) 2499 223.4 8.4e-57
XP_016872884 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1444) 2485 222.2 1.9e-56
XP_016872883 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1451) 2485 222.2 1.9e-56
XP_011540996 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1475) 2485 222.2 1.9e-56
XP_016872882 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1508) 2485 222.2 1.9e-56
XP_011540993 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1539) 2485 222.2 2e-56
NP_001264214 (OMIM: 613773) protein turtle homolog (1437) 2233 201.3 3.7e-50
XP_011540994 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1535) 2219 200.1 8.8e-50
XP_016872885 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur (1140) 1357 128.4 2.5e-28
XP_006718858 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein tur ( 913) 534 60.0 8.1e-08
NP_001240316 (OMIM: 607416) neural cell adhesion m (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_016861059 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_011531596 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_016861058 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_011531597 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_016861060 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 492 56.6 1.1e-06
XP_011531598 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1171) 452 53.3 1.1e-05
XP_016861062 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1171) 452 53.3 1.1e-05
NP_001240317 (OMIM: 607416) neural cell adhesion m (1171) 452 53.3 1.1e-05
XP_016861061 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1171) 452 53.3 1.1e-05
XP_006713003 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_006713002 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_016861056 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
NP_006605 (OMIM: 607416) neural cell adhesion mole (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_016861057 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_016861055 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_006713001 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_011531594 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1224) 452 53.3 1.1e-05
XP_016856229 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1164) 449 53.0 1.3e-05
NP_055905 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 4 pre (1169) 449 53.0 1.3e-05
NP_001153804 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 3 (1174) 449 53.0 1.3e-05
XP_016856225 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1180) 449 53.0 1.3e-05
XP_005245050 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1234) 449 53.0 1.3e-05
XP_005245049 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1246) 449 53.0 1.4e-05
XP_005245048 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1251) 449 53.0 1.4e-05
XP_016856228 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1271) 449 53.0 1.4e-05
XP_016856227 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1276) 449 53.0 1.4e-05
XP_011507617 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1332) 449 53.1 1.4e-05
XP_011507615 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1349) 449 53.1 1.4e-05
XP_016856223 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1403) 449 53.1 1.5e-05
XP_016856222 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1420) 449 53.1 1.5e-05
XP_011519762 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin ( 683) 421 50.5 4.4e-05
XP_011519761 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin ( 701) 421 50.5 4.5e-05
XP_016856226 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1133) 424 50.9 5.3e-05
NP_001153803 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 2 (1189) 424 50.9 5.5e-05
XP_011507627 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1190) 424 50.9 5.5e-05
NP_001122401 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1394) 426 51.2 5.5e-05
>>NP_001128522 (OMIM: 609738) protein turtle homolog A i (1179 aa)
initn: 8122 init1: 8122 opt: 8122 Z-score: 3666.0 bits: 690.3 E(85289): 1.9e-197
Smith-Waterman score: 8122; 100.0% identity (100.0% similar) in 1179 aa overlap (1-1179:1-1179)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDGGYLQRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDGGYLQRFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FSPTGKSAAPSALGSGSPDSVAKLKLQGSPVPSLRQSLLWGDPAGTPSPHPDPPSSRGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSPTGKSAAPSALGSGSPDSVAKLKLQGSPVPSLRQSLLWGDPAGTPSPHPDPPSSRGPL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EDISPVAPPPAAPPSPLPGPGPLLQYLSLPFFREMNVDGDWPPLEEPSPAAPPDYMDTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDISPVAPPPAAPPSPLPGPGPLLQYLSLPFFREMNVDGDWPPLEEPSPAAPPDYMDTRR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CPTSSFLRSPETPPVSPRESLPGAVVGAGATAEPPYTALADWTLRERLLPGLLPAAPRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPTSSFLRSPETPPVSPRESLPGAVVGAGATAEPPYTALADWTLRERLLPGLLPAAPRGS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LTSQSSGRGSASFLRPPSTAPSAGGSYLSPAPGDTSSWASGPERWPRREHVVTVSKRRNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTSQSSGRGSASFLRPPSTAPSAGGSYLSPAPGDTSSWASGPERWPRREHVVTVSKRRNT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEPELGVKTPEEGCLLNTAHVTGPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEPELGVKTPEEGCLLNTAHVTGPEA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KSD RCAALREEFLAFRRRRDATRARLPAYRQPVPHPEQATLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCAALREEFLAFRRRRDATRARLPAYRQPVPHPEQATLL
1150 1160 1170
>>NP_065840 (OMIM: 609738) protein turtle homolog A isof (1163 aa)
initn: 5808 init1: 5808 opt: 5819 Z-score: 2632.3 bits: 499.0 E(85289): 7e-140
Smith-Waterman score: 7956; 98.6% identity (98.6% similar) in 1179 aa overlap (1-1179:1-1163)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_065 CVPSNGLLHPPSASAYLTVLC----------------MPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEA
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDGGYLQRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDGGYLQRFS
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
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pF1KSD SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FSPTGKSAAPSALGSGSPDSVAKLKLQGSPVPSLRQSLLWGDPAGTPSPHPDPPSSRGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FSPTGKSAAPSALGSGSPDSVAKLKLQGSPVPSLRQSLLWGDPAGTPSPHPDPPSSRGPL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCI
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EDISPVAPPPAAPPSPLPGPGPLLQYLSLPFFREMNVDGDWPPLEEPSPAAPPDYMDTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EDISPVAPPPAAPPSPLPGPGPLLQYLSLPFFREMNVDGDWPPLEEPSPAAPPDYMDTRR
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CPTSSFLRSPETPPVSPRESLPGAVVGAGATAEPPYTALADWTLRERLLPGLLPAAPRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CPTSSFLRSPETPPVSPRESLPGAVVGAGATAEPPYTALADWTLRERLLPGLLPAAPRGS
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LTSQSSGRGSASFLRPPSTAPSAGGSYLSPAPGDTSSWASGPERWPRREHVVTVSKRRNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LTSQSSGRGSASFLRPPSTAPSAGGSYLSPAPGDTSSWASGPERWPRREHVVTVSKRRNT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEPELGVKTPEEGCLLNTAHVTGPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEPELGVKTPEEGCLLNTAHVTGPEA
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170
pF1KSD RCAALREEFLAFRRRRDATRARLPAYRQPVPHPEQATLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RCAALREEFLAFRRRRDATRARLPAYRQPVPHPEQATLL
1130 1140 1150 1160
>>XP_016857373 (OMIM: 609738) PREDICTED: protein turtle (801 aa)
initn: 5418 init1: 5418 opt: 5419 Z-score: 2454.9 bits: 465.7 E(85289): 5.4e-130
Smith-Waterman score: 5419; 99.5% identity (99.6% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVWCLGLAVLSLVISQGADGRGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPAGRPPLHVIEWLRF
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFLDQHIPED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQG
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pF1KSD QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDGGYLQRFS
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pF1KSD VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
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XP_016 VWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVL
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pF1KSD SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVPKRLDGYVLEG
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNTANVSTSGLEV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRRKRLRQDPPLI
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pF1KSD FSPTGKSAAPSALGSGSPDSVAKLKLQGSPVPSLRQSLLWGDPAGTPSPHPDPPSSRGPL
::::::::::::: .:
XP_016 FSPTGKSAAPSALLFTKPLKA
790 800
>>XP_011540997 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein turtle (1441 aa)
initn: 2561 init1: 1565 opt: 2499 Z-score: 1140.8 bits: 223.4 E(85289): 8.4e-57
Smith-Waterman score: 2745; 41.2% identity (63.7% similar) in 1164 aa overlap (1-1081:1-1143)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQG--ADG----RGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPA-GRPPLH
:.: .. . :.. ..: :.: : .:: :. .:::::::: ::.. :. :.:: .
XP_011 MIWYVATFIASVIGTRGLAAEGAHGLREEPEFVT--ARAGESVVLRCDVIHPVTGQPPPY
10 20 30 40 50
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pF1KSD VIEWLRFGFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFL
:.::..:: .::::.:: : :..::.:.::. :. :::..: .: ::::::::.:..:
XP_011 VVEWFKFGVPIPIFIKFGYYPPHVDPEYAGRASLHDKASLRLEQVRSEDQGWYECKVLML
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD DQHIPEDDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLR
::. : : ::::::::.:.:: : :::: .:..: .:. :.: :.: : ::: .
XP_011 DQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNPKPIVTWLKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GKDLGQGQGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPP
: :: ..:. ::..:.: . : : . :.:::.: : .: :.:.:.::: ::: :: ::
XP_011 GTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQGPPFIVSPP
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD KNSTVNASQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQP
.: ::: :::. :.:.:::::.::::.:. .. ::. . :. :::::.::.: .. ..:
XP_011 ENITVNISQDALLTCRAEAYPGNLTYTWYWQDENVYFQNDLKLRVRILIDGTLIIFRVKP
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD DDAGCYTCVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLL
.:.: :::::::.: . ::::::::: :::.: ::: .:.:. : ::::: :.::
XP_011 EDSGKYTCVPSNSLGRSPSASAYLTVQYPARVLNMPPVIYVPVGIHGYIRCPVDAEPPAT
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD FVSWTKDGKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVL
:.:.:::. ::..: ::. .::. : ..:.::: :.:.:::.::: : : .:..
XP_011 VVKWNKDGRPLQVEKNLGWTLMEDGSIRIEEATEEALGTYTCVPYNTLGTMGQSAPARLV
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD LKAPPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLIL
:: :: : : :: ::.::::::::.: ::: ::..: :::. ... .. ..:: .
XP_011 LKDPPYFTVLPGWEYRQEAGRELLIPCAAAGDPFPVITWRKVGKPSRSKHSALPSGSLQF
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD RPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDG
: :.:: ::.::: :.:.:. ...::.. :.:::::. .: : . ::::::::.::
XP_011 RALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTANVSWEPGYDG
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD GYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSG
:: : ::::: :: :: . :::.:: :: : . ::: :.:.: ::::::::::::..
XP_011 GYEQTFSVWYGPLMKRAQFGPHDWLSLPVPPGPSWLLVDTLEPETAYQFSVLAQNKLGTS
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD PFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPL---SPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVP
:::.: ..: : : :: .::: :.: :: .:::: : ::
XP_011 AFSEVVTVNTLAFPITT----------PEPLVLVTPPRCLIANRTQQGVLLSWLPPANHS
600 610 620 630 640
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pF1KSD KRLDGYVLEGRQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNT
.: :..: : .. ::.:: .. ::: :... : .:. ::::..: ...:.:::
XP_011 FPIDRYIMEFRV-AERWELLDDGIPGTEGEFFAKDLSQDTWYEFRVLAVMQDLISEPSNI
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD ANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRR
:.::.. ...:. : .:::::.:. .:::..:.: : ::.:..:..: .:.
XP_011 AGVSST--DIFPQPDLTEDGLARPVLAGIVATICFLAAAILFSTLAACFVNKQR--KRKL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810
pF1KSD KRLRQDPPLIFSPTGKS-AAPSALGSGSPDSVAKLKL-------QGSPV------PSLRQ
:: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:. :. ..
XP_011 KR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRMLSPTREK
770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KSD SL-LWGDPAGTPSPHP-----DPPSSRGPLPLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQ
: :. . : . ... :.: : ::::::::: :. :. .: : .
XP_011 ELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSLKSRRIE
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910
pF1KSD AEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCIE----DISPVA-------PPPA-AP---PS
. : . . : :. : . ...:.. :::: .: :
XP_011 GFPFAEETDMYPEFRQSDEENEDPLVPTSVAALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYSPRFQPR
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960
pF1KSD PLPGPGPLLQYLSL------PFFREMNVDGDWPPLEEPSPAA---PPDYMDTRRCPTSSF
: ::: : :. : : .. . : ::. :: :. : ::
XP_011 GLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVGSPLSSV
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000
pF1KSD LRSPETP-------PVSPRE--------SLPGAVVGAGA-TAEP---PYTALADWTLRER
. :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
XP_011 MSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGGLETPAM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD LLPGLLPA--APRGSLTSQSSGRG-SASFLRPPSTAPS-----AGGSYLSPAPGDTSSWA
..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .:: :
XP_011 MFPHQLPPCDVPESLQPKAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPGRGPVPA
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD SGPERWPRR--EHVVTVSKRRNTSVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEP
.: : . .:. .. :.::
XP_011 PPAAKWQDRPMQPLVSQGQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTRWYEPQP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>XP_016872884 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein turtle (1444 aa)
initn: 2561 init1: 1565 opt: 2485 Z-score: 1134.5 bits: 222.2 E(85289): 1.9e-56
Smith-Waterman score: 2731; 41.7% identity (63.9% similar) in 1140 aa overlap (17-1081:120-1241)
10 20 30 40
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADG-RGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLP
:: : : .:: :. .:::::::: ::..
XP_016 CAPEMERGPVTCTQAQTVRGRTGHRRRFGPGAHGLREEPEFVT--ARAGESVVLRCDVIH
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD PA-GRPPLHVIEWLRFGFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQG
:. :.:: .:.::..:: .::::.:: : :..::.:.::. :. :::..: .: ::::
XP_016 PVTGQPPPYVVEWFKFGVPIPIFIKFGYYPPHVDPEYAGRASLHDKASLRLEQVRSEDQG
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KSD WYECRVFFLDQHIPEDDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSP
::::.:..:::. : : ::::::::.:.:: : :::: .:..: .:. :.: :.:
XP_016 WYECKVLMLDQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNP
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LPHVTWKLRGKDLGQGQGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVL
: ::: .: :: ..:. ::..:.: . : : . :.:::.: : .: :.:.:.:::
XP_016 KPIVTWLKEGTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQ
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GPPVIVVPPKNSTVNASQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDG
::: :: ::.: ::: :::. :.:.:::::.::::.:. .. ::. . :. :::::.::
XP_016 GPPFIVSPPENITVNISQDALLTCRAEAYPGNLTYTWYWQDENVYFQNDLKLRVRILIDG
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD SLRLLATQPDDAGCYTCVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRC
.: .. ..:.:.: :::::::.: . ::::::::: :::.: ::: .:.:. : :::
XP_016 TLIIFRVKPEDSGKYTCVPSNSLGRSPSASAYLTVQYPARVLNMPPVIYVPVGIHGYIRC
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KSD PVRANPPLLFVSWTKDGKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTA
:: :.:: :.:.:::. ::..: ::. .::. : ..:.::: :.:.:::.:::
XP_016 PVDAEPPATVVKWNKDGRPLQVEKNLGWTLMEDGSIRIEEATEEALGTYTCVPYNTLGTM
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD GPSPVTRVLLKAPPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQ
: : .:..:: :: : : :: ::.::::::::.: ::: ::..: :::. ... .
XP_016 GQSAPARLVLKDPPYFTVLPGWEYRQEAGRELLIPCAAAGDPFPVITWRKVGKPSRSKHS
510 520 530 540 550 560
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VDSNSSLILRPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGAN
. ..:: .: :.:: ::.::: :.:.:. ...::.. :.:::::. .: : . ::
XP_016 ALPSGSLQFRALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTAN
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSWEPGFDGGYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSV
::::::.:::: : ::::: :: :: . :::.:: :: : . ::: :.:.: :::::
XP_016 VSWEPGYDGGYEQTFSVWYGPLMKRAQFGPHDWLSLPVPPGPSWLLVDTLEPETAYQFSV
630 640 650 660 670 680
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LAQNKLGSGPFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWD
:::::::.. :::.: ..: : : . ..::: :.: :: .:::: :
XP_016 LAQNKLGTSAFSEVVTVNTLAFPITTPEPLV-------LVTPPRCLIANRTQQGVLLSWL
690 700 710 720 730
650 660 670 680 690 700
pF1KSD PPELVPKRLDGYVLEGRQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFV
:: .: :..: : .. ::.:: .. ::: :... : .:. ::::..: ...
XP_016 PPANHSFPIDRYIMEFRV-AERWELLDDGIPGTEGEFFAKDLSQDTWYEFRVLAVMQDLI
740 750 760 770 780 790
710 720 730 740 750 760
pF1KSD SDPSNTANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRR
:.::: :.::.. ...:. : .:::::.:. .:::..:.: : ::.:..:..:
XP_016 SEPSNIAGVSST--DIFPQPDLTEDGLARPVLAGIVATICFLAAAILFSTLAACFVNKQR
800 810 820 830 840 850
770 780 790 800 810
pF1KSD AARRRRKRLRQDPPLIFSPTGKS-AAPSALGSGSPDSVAKLKL-------QGSPV-----
.:. :: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:.
XP_016 --KRKLKR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRML
860 870 880 890 900 910
820 830 840 850 860
pF1KSD -PSLRQSL-LWGDPAGTPSPHP-----DPPSSRGPLPLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQE
:. .. : :. . : . ... :.: : ::::::::: :. :.
XP_016 SPTREKELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSL
920 930 940 950 960 970
870 880 890 900 910
pF1KSD RSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCIE----DISPVA-------PPPA-A
.: : .. : . . : :. : . ...:.. :::: .
XP_016 KSRRIEGFPFAEETDMYPEFRQSDEENEDPLVPTSVAALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYS
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XP_016 PRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVG
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pF1KSD CPTSSFLRSPETP-------PVSPRE--------SLPGAVVGAGA-TAEP---PYTALAD
: :: . :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
XP_016 SPLSSVMSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGG
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..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .::
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1060 1070 1080 1090 1100 1110
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: .: : . .:. .. :.::
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pF1KSD VSWEPGFDGGYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSV
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pF1KSD LAQNKLGSGPFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWD
:::::::.. :::.: ..: : : . ..::: :.: :: .:::: :
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pF1KSD SDPSNTANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRR
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XP_016 PRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVG
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: :: . :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
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..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .::
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XP_011 WYECKVLMLDQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNP
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XP_011 KPIVTWLKEGTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQ
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XP_011 ALPSGSLQFRALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTAN
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XP_011 LAQNKLGTSAFSEVVTVNTLAFPITTPEPLV-------LVTPPRCLIANRTQQGVLLSWL
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.:. :: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:.
XP_011 --KRKLKR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRML
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XP_011 SPTREKELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSL
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XP_011 PRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVG
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: :: . :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
XP_011 SPLSSVMSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGG
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XP_011 LETPAMMFPHQLPPCDVPESLQPKAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPG
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XP_011 RGPVPAPPAAKWQDRPMQPLVSQGQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTR
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pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADG-RGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLP
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XP_016 PVTGQPPPYVVEWFKFGVPIPIFIKFGYYPPHVDPEYAGRASLHDKASLRLEQVRSEDQG
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XP_016 WYECKVLMLDQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNP
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pF1KSD LPHVTWKLRGKDLGQGQGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVL
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XP_016 KPIVTWLKEGTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQ
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XP_016 GPPFIVSPPENITVNISQDALLTCRAEAYPGNLTYTWYWQDENVYFQNDLKLRVRILIDG
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XP_016 GQSAPARLVLKDPPYFTVLPGWEYRQEAGRELLIPCAAAGDPFPVITWRKVGKPSRSKHS
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VDSNSSLILRPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGAN
. ..:: .: :.:: ::.::: :.:.:. ...::.. :.:::::. .: : . ::
XP_016 ALPSGSLQFRALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTAN
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSWEPGFDGGYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSV
::::::.:::: : ::::: :: :: . :::.:: :: : . ::: :.:.: :::::
XP_016 VSWEPGYDGGYEQTFSVWYGPLMKRAQFGPHDWLSLPVPPGPSWLLVDTLEPETAYQFSV
600 610 620 630 640 650
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LAQNKLGSGPFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWD
:::::::.. :::.: ..: : : . ..::: :.: :: .:::: :
XP_016 LAQNKLGTSAFSEVVTVNTLAFPITTPEPLV-------LVTPPRCLIANRTQQGVLLSWL
660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KSD PPELVPKRLDGYVLEGRQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFV
:: .: :..: : .. ::.:: .. ::: :... : .:. ::::..: ...
XP_016 PPANHSFPIDRYIMEFRV-AERWELLDDGIPGTEGEFFAKDLSQDTWYEFRVLAVMQDLI
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KSD SDPSNTANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRR
:.::: :.::.. ...:. : .:::::.:. .:::..:.: : ::.:..:..:
XP_016 SEPSNIAGVSST--DIFPQPDLTEDGLARPVLAGIVATICFLAAAILFSTLAACFVNKQR
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800 810
pF1KSD AARRRRKRLRQDPPLIFSPTGKS-AAPSALGSGSPDSVAKLKL-------QGSPV-----
.:. :: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:.
XP_016 --KRKLKR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRML
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860
pF1KSD -PSLRQSL-LWGDPAGTPSPHP-----DPPSSRGPLPLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQE
:. .. : :. . : . ... :.: : ::::::::: :. :.
XP_016 SPTREKELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSL
890 900 910 920 930 940
870 880 890 900 910
pF1KSD RSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCIE----DISPVA-------PPPA-A
.: : .. : . . : :. : . ...:.. :::: .
XP_016 KSRRIEGFPFAEETDMYPEFRQSDEENEDPLVPTSVAALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYS
950 960 970 980 990 1000
920 930 940 950 960
pF1KSD P---PSPLPGPGPLLQYLSL------PFFREMNVDGDWPPLEEPSPAA---PPDYMDTRR
: : : ::: : :. : : .. . : ::. :: :.
XP_016 PRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
970 980 990 1000
pF1KSD CPTSSFLRSPETP-------PVSPRE--------SLPGAVVGAGA-TAEP---PYTALAD
: :: . :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
XP_016 SPLSSVMSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD WTLRERLLPGLLPA--APRGSLTSQSSGRG-SASFLRPPSTAPS-----AGGSYLSPAPG
..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .::
XP_016 LETPAMMFPHQLPPCDVPESLQPKAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD DTSSWASGPERWPRR--EHVVTVSKRRNTSVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRL
: .: : . .:. .. :.::
XP_016 RGPVPAPPAAKWQDRPMQPLVSQGQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
>>XP_011540993 (OMIM: 613773) PREDICTED: protein turtle (1539 aa)
initn: 2561 init1: 1565 opt: 2485 Z-score: 1134.1 bits: 222.2 E(85289): 2e-56
Smith-Waterman score: 2731; 41.7% identity (63.9% similar) in 1140 aa overlap (17-1081:120-1241)
10 20 30 40
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQGADG-RGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLP
:: : : .:: :. .:::::::: ::..
XP_011 CAPEMERGPVTCTQAQTVRGRTGHRRRFGPGAHGLREEPEFVT--ARAGESVVLRCDVIH
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KSD PA-GRPPLHVIEWLRFGFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQG
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XP_011 PVTGQPPPYVVEWFKFGVPIPIFIKFGYYPPHVDPEYAGRASLHDKASLRLEQVRSEDQG
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KSD WYECRVFFLDQHIPEDDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSP
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XP_011 WYECKVLMLDQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNP
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LPHVTWKLRGKDLGQGQGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVL
: ::: .: :: ..:. ::..:.: . : : . :.:::.: : .: :.:.:.:::
XP_011 KPIVTWLKEGTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQ
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GPPVIVVPPKNSTVNASQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDG
::: :: ::.: ::: :::. :.:.:::::.::::.:. .. ::. . :. :::::.::
XP_011 GPPFIVSPPENITVNISQDALLTCRAEAYPGNLTYTWYWQDENVYFQNDLKLRVRILIDG
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLRLLATQPDDAGCYTCVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRC
.: .. ..:.:.: :::::::.: . ::::::::: :::.: ::: .:.:. : :::
XP_011 TLIIFRVKPEDSGKYTCVPSNSLGRSPSASAYLTVQYPARVLNMPPVIYVPVGIHGYIRC
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KSD PVRANPPLLFVSWTKDGKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTA
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XP_011 PVDAEPPATVVKWNKDGRPLQVEKNLGWTLMEDGSIRIEEATEEALGTYTCVPYNTLGTM
450 460 470 480 490 500
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GPSPVTRVLLKAPPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQ
: : .:..:: :: : : :: ::.::::::::.: ::: ::..: :::. ... .
XP_011 GQSAPARLVLKDPPYFTVLPGWEYRQEAGRELLIPCAAAGDPFPVITWRKVGKPSRSKHS
510 520 530 540 550 560
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VDSNSSLILRPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGAN
. ..:: .: :.:: ::.::: :.:.:. ...::.. :.:::::. .: : . ::
XP_011 ALPSGSLQFRALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTAN
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSWEPGFDGGYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSV
::::::.:::: : ::::: :: :: . :::.:: :: : . ::: :.:.: :::::
XP_011 VSWEPGYDGGYEQTFSVWYGPLMKRAQFGPHDWLSLPVPPGPSWLLVDTLEPETAYQFSV
630 640 650 660 670 680
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LAQNKLGSGPFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRGVLLHWD
:::::::.. :::.: ..: : : . ..::: :.: :: .:::: :
XP_011 LAQNKLGTSAFSEVVTVNTLAFPITTPEPLV-------LVTPPRCLIANRTQQGVLLSWL
690 700 710 720 730
650 660 670 680 690 700
pF1KSD PPELVPKRLDGYVLEGRQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFV
:: .: :..: : .. ::.:: .. ::: :... : .:. ::::..: ...
XP_011 PPANHSFPIDRYIMEFRV-AERWELLDDGIPGTEGEFFAKDLSQDTWYEFRVLAVMQDLI
740 750 760 770 780 790
710 720 730 740 750 760
pF1KSD SDPSNTANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRR
:.::: :.::.. ...:. : .:::::.:. .:::..:.: : ::.:..:..:
XP_011 SEPSNIAGVSST--DIFPQPDLTEDGLARPVLAGIVATICFLAAAILFSTLAACFVNKQR
800 810 820 830 840 850
770 780 790 800 810
pF1KSD AARRRRKRLRQDPPLIFSPTGKS-AAPSALGSGSPDSVAKLKL-------QGSPV-----
.:. :: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:.
XP_011 --KRKLKR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRML
860 870 880 890 900 910
820 830 840 850 860
pF1KSD -PSLRQSL-LWGDPAGTPSPHP-----DPPSSRGPLPLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQE
:. .. : :. . : . ... :.: : ::::::::: :. :.
XP_011 SPTREKELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSL
920 930 940 950 960 970
870 880 890 900 910
pF1KSD RSGREQAEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCIE----DISPVA-------PPPA-A
.: : .. : . . : :. : . ...:.. :::: .
XP_011 KSRRIEGFPFAEETDMYPEFRQSDEENEDPLVPTSVAALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYS
980 990 1000 1010 1020 1030
920 930 940 950 960
pF1KSD P---PSPLPGPGPLLQYLSL------PFFREMNVDGDWPPLEEPSPAA---PPDYMDTRR
: : : ::: : :. : : .. . : ::. :: :.
XP_011 PRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
970 980 990 1000
pF1KSD CPTSSFLRSPETP-------PVSPRE--------SLPGAVVGAGA-TAEP---PYTALAD
: :: . :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
XP_011 SPLSSVMSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD WTLRERLLPGLLPA--APRGSLTSQSSGRG-SASFLRPPSTAPS-----AGGSYLSPAPG
..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .::
XP_011 LETPAMMFPHQLPPCDVPESLQPKAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPG
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD DTSSWASGPERWPRR--EHVVTVSKRRNTSVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRL
: .: : . .:. .. :.::
XP_011 RGPVPAPPAAKWQDRPMQPLVSQGQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTR
1220 1230 1240 1250 1260 1270
>>NP_001264214 (OMIM: 613773) protein turtle homolog B p (1437 aa)
initn: 2325 init1: 1329 opt: 2233 Z-score: 1021.4 bits: 201.3 E(85289): 3.7e-50
Smith-Waterman score: 2707; 41.0% identity (63.5% similar) in 1164 aa overlap (1-1081:1-1139)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVWCLGLAVLSLVISQG--ADG----RGKPEVVSVVGRAGESVVLGCDLLPPA-GRPPLH
:.: .. . :.. ..: :.: : .:: :. .:::::::: ::.. :. :.:: .
NP_001 MIWYVATFIASVIGTRGLAAEGAHGLREEPEFVT--ARAGESVVLRCDVIHPVTGQPPPY
10 20 30 40 50
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pF1KSD VIEWLRFGFLLPIFIQFGLYSPRIDPDYVGRVRLQKGASLQIEGLRVEDQGWYECRVFFL
:.::..:: .::::.:: : :..::.:.::. :. :::..: .: ::::::::.:..:
NP_001 VVEWFKFGVPIPIFIKFGYYPPHVDPEYAGRASLHDKASLRLEQVRSEDQGWYECKVLML
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD DQHIPEDDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLR
::. : : ::::::::.:.:: : :::: .:..: .:. :.: :.: : ::: .
NP_001 DQQY--DTFHNGSWVHLTINAPPTFTETPPQYIEAKEGGSITMTCTAFGNPKPIVTWLKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GKDLGQGQGQVQVQNGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPP
: :: ..:. ::..:.: . : : . :.:::.: : .: :.:.:.::: ::: :: ::
NP_001 GTLLG-ASGKYQVSDGSLTVTSVSREDRGAYTCRAYSIQGEAVHTTHLLVQGPPFIVSPP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KNSTVNASQDVSLACHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQP
.: ::: :::. :.:.:::::.::::.:. .. ::. . :. :::::.::.: .. ..:
NP_001 ENITVNISQDALLTCRAEAYPGNLTYTWYWQDENVYFQNDLKLRVRILIDGTLIIFRVKP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DDAGCYTCVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLL
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NP_001 EDSGKYTCVPSNSLGRSPSASAYLTVQYPARVLNMPPVIYVPVGIHGYIRCPVDAEPPAT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FVSWTKDGKALQLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVL
:.:.:::. ::..: ::. .::. : ..:.::: :.:.:::.::: : : .:..
NP_001 VVKWNKDGRPLQVEKNLGWTLMEDGSIRIEEATEEALGTYTCVPYNTLGTMGQSAPARLV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LKAPPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLIL
:: :: : : :: ::.::::::::.: ::: ::..: :::. ... .. ..:: .
NP_001 LKDPPYFTVLPGWEYRQEAGRELLIPCAAAGDPFPVITWRKVGKPSRSKHSALPSGSLQF
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD RPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFDG
: :.:: ::.::: :.:.:. ...::.. :.:::::. .: : . ::::::::.::
NP_001 RALSKEDHGEWECVATNVVTSITASTHLTVIGTSPHAPGSVRVQVSMTTANVSWEPGYDG
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD GYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAAHLLVPGLQPHTQYQFSVLAQNKLGSG
:: : ::::. :: . :::.:: :: : . ::: :.:.: ::::::::::::..
NP_001 GYEQTFSVWM----KRAQFGPHDWLSLPVPPGPSWLLVDTLEPETAYQFSVLAQNKLGTS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPL---SPPRGLVAVRTPRGVLLHWDPPELVP
:::.: ..: : : :: .::: :.: :: .:::: : ::
NP_001 AFSEVVTVNTLAFPITT----------PEPLVLVTPPRCLIANRTQQGVLLSWLPPANHS
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KRLDGYVLEGRQGSQGWEVLDPAVAGTETELLVPGLIKDVLYEFRLVAFAGSFVSDPSNT
.: :..: : .. ::.:: .. ::: :... : .:. ::::..: ...:.:::
NP_001 FPIDRYIMEFRV-AERWELLDDGIPGTEGEFFAKDLSQDTWYEFRVLAVMQDLISEPSNI
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ANVSTSGLEVYPSRTQLPGLLPQPVLAGVVGGVCFLGVAVLVSILAGCLLNRRRAARRRR
:.::.. ...:. : .:::::.:. .:::..:.: : ::.:..:..: .:.
NP_001 AGVSST--DIFPQPDLTEDGLARPVLAGIVATICFLAAAILFSTLAACFVNKQR--KRKL
710 720 730 740 750
780 790 800 810
pF1KSD KRLRQDPPLIFSPTGKS-AAPSALGSGSPDSVAKLKL-------QGSPV------PSLRQ
:: ..:::: .. :: .: . :. ::.:. :. ::.:. :. ..
NP_001 KR-KKDPPLSITHCRKSLESPLSSGKVSPESIRTLRAPSESSDDQGQPAAKRMLSPTREK
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KSD SL-LWGDPAGTPSPHP-----DPPSSRGPLPLEPICRGPDGRFVMGPTVAAPQERSGREQ
: :. . : . ... :.: : ::::::::: :. :. .: : .
NP_001 ELSLYKKTKRAISSKKYSVAKAEAEAEATTPIELISRGPDGRFVMDPAEMEPSLKSRRIE
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910
pF1KSD AEPRTPAQRLARSFDCSSSSPSGAPQPLCIE----DISPVA-------PPPA-AP---PS
. : . . : :. : . ...:.. :::: .: :
NP_001 GFPFAEETDMYPEFRQSDEENEDPLVPTSVAALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYSPRFQPR
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960
pF1KSD PLPGPGPLLQYLSL------PFFREMNVDGDWPPLEEPSPAA---PPDYMDTRRCPTSSF
: ::: : :. : : .. . : ::. :: :. : ::
NP_001 GLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQYYGYLSSSSPGEVEPPPFYVPEVGSPLSSV
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000
pF1KSD LRSPETP-------PVSPRE--------SLPGAVVGAGA-TAEP---PYTALADWTLRER
. :: : :. :.: .:: . . .:. . :: : ..
NP_001 MSSPPLPTEGPFGHPTIPEENGENASNSTLPLTQTPTGGRSPEPWGRPEFPFGGLETPAM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD LLPGLLPA--APRGSLTSQSSGRG-SASFLRPPSTAPS-----AGGSYLSPAPGDTSSWA
..: :: .:.. . . :: . :. :.. :. : .. . .:: :
NP_001 MFPHQLPPCDVPESLQPKAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPGRGPVPA
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD SGPERWPRR--EHVVTVSKRRNTSVDENYEWDSEFPGDMELLETLHLGLASSRLRPEAEP
.: : . .:. .. :.::
NP_001 PPAAKWQDRPMQPLVSQGQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTRWYEPQP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1179 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:58:13 2016 done: Thu Nov 3 05:58:16 2016
Total Scan time: 17.930 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]