Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1392, 926 aa
1>>>pF1KSDA1392 926 - 926 aa - 926 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7025+/-0.000882; mu= 11.6033+/- 0.053
mean_var=151.7254+/-29.536, 0's: 0 Z-trim(111.9): 24 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.104123
statistics sampled from 12747 (12767) to 12747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 3.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47167.1 STOX2 gene_id:56977|Hs108|chr4 ( 926) 6227 947.6 0
CCDS41535.1 STOX1 gene_id:219736|Hs108|chr10 ( 989) 843 138.9 4.6e-32
CCDS44417.1 STOX1 gene_id:219736|Hs108|chr10 ( 227) 419 74.8 2.1e-13
>>CCDS47167.1 STOX2 gene_id:56977|Hs108|chr4 (926 aa)
initn: 6227 init1: 6227 opt: 6227 Z-score: 5060.5 bits: 947.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6227; 100.0% identity (100.0% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKKTRSTTLRRAWPSSDFSDRASDRMRSRSEKDYRLHKRFPAAFAPQASRGYMTSGDVSP
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CCDS47 MKKTRSTTLRRAWPSSDFSDRASDRMRSRSEKDYRLHKRFPAAFAPQASRGYMTSGDVSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ISMSPISQSQFIPLGEILCLAISAMNSARKPVTQEALMEHLTTCFPGVPTPSQEILRHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISMSPISQSQFIPLGEILCLAISAMNSARKPVTQEALMEHLTTCFPGVPTPSQEILRHTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NTLVRERKIYPTPDGYFIVTPQTYFITPSLIRTNSKWYHLDERIPDRSQCTSPQPGTITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NTLVRERKIYPTPDGYFIVTPQTYFITPSLIRTNSKWYHLDERIPDRSQCTSPQPGTITP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SASGCVRERTLPRNHCDSCHCCREDVHSTHAPTLQRKSAKDCKDPYCPPSLCQVPPTEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SASGCVRERTLPRNHCDSCHCCREDVHSTHAPTLQRKSAKDCKDPYCPPSLCQVPPTEKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KSTVNFSYKTETLSKPKDSEKQSKKFGLKLFRLSFKKDKTKQLANFSAQFPPEEWPLRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSTVNFSYKTETLSKPKDSEKQSKKFGLKLFRLSFKKDKTKQLANFSAQFPPEEWPLRDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DTPATIPREVEMEIIRRINPDLTVENVMRHTALMKKLEEEKAQRSKAGSSAHHSGRSKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DTPATIPREVEMEIIRRINPDLTVENVMRHTALMKKLEEEKAQRSKAGSSAHHSGRSKKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RTHRKSHGKSRSHSKTRVSKGDPSDGSHLDIPAEREYDFCDPLTRVPREGCFIIEHKGDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTHRKSHGKSRSHSKTRVSKGDPSDGSHLDIPAEREYDFCDPLTRVPREGCFIIEHKGDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FIMHSNTNVLESHFPMTPEWDVSGELAKRRTEMPFPEPSRGSSHSKVHRSHSHTQDRRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FIMHSNTNVLESHFPMTPEWDVSGELAKRRTEMPFPEPSRGSSHSKVHRSHSHTQDRRSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NERSNKAKERSRSMDNSKGPLGASSLGTPEDLAEGCSQDDQTPSQSYIDDSTLRPAQTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NERSNKAKERSRSMDNSKGPLGASSLGTPEDLAEGCSQDDQTPSQSYIDDSTLRPAQTVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LQRAHISSTSYKEVCIPEIVSGSKEPSSACSLLEPGKPPESLPSYGELNSCPTKTATDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LQRAHISSTSYKEVCIPEIVSGSKEPSSACSLLEPGKPPESLPSYGELNSCPTKTATDDY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FQCNTSSETVLTAPSPLGKNKEDHDTLTLAEGVKKLSPSDRQVPHSSREPVGHKEESPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQCNTSSETVLTAPSPLGKNKEDHDTLTLAEGVKKLSPSDRQVPHSSREPVGHKEESPKG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGGGPAASGGVAEGIANGRLVQHHGAEPSSLDKRKEIFSKDTLFKPLHSTLSVNSYHKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGGGPAASGGVAEGIANGRLVQHHGAEPSSLDKRKEIFSKDTLFKPLHSTLSVNSYHKSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSLLKSHPKTPADTLPGRCEKLEPSLGTSAAQAMPASQRQQESGGNQEASFDYYNVSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSLLKSHPKTPADTLPGRCEKLEPSLGTSAAQAMPASQRQQESGGNQEASFDYYNVSDDD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DSEEGANKNTEEEKNREDVGTMQWLLEREKERDLQRKFEKNLTLLAPKETDSSSNQRATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSEEGANKNTEEEKNREDVGTMQWLLEREKERDLQRKFEKNLTLLAPKETDSSSNQRATH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SARLDSMDSSSITVDSGFNSPRTRESLASNTSSIVESNRRQNPALSPAHGGAGPAFNFRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SARLDSMDSSSITVDSGFNSPRTRESLASNTSSIVESNRRQNPALSPAHGGAGPAFNFRA
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD SAEPPTNEAEKLQKPSNCLQASVTSV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAEPPTNEAEKLQKPSNCLQASVTSV
910 920
>>CCDS41535.1 STOX1 gene_id:219736|Hs108|chr10 (989 aa)
initn: 920 init1: 418 opt: 843 Z-score: 689.1 bits: 138.9 E(32554): 4.6e-32
Smith-Waterman score: 958; 29.1% identity (56.2% similar) in 921 aa overlap (50-882:96-961)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD DRASDRMRSRSEKDYRLHKRFPAAFAPQASRGYMTS--GDVSPISMSPISQSQFIPLGEI
::. ::: :..:.::.::::.::::.
CCDS41 LRRGVLLVRAPPACLQVLRDAWRRRALRPPRGFRIRAVGDVFPVQMNPITQSQFVPLGEV
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LCLAISAMNSARKPVTQEALMEHLTTCFPGVPTPSQEILRHTLNTLVRERKIYPTPDGYF
:: ::: ::.:. ::::.:.:.: .::. ::..:: ::.::..::::: : .:::
CCDS41 LCCAISDMNTAQIVVTQESLLERLMKHYPGIAIPSEDILYTTLGTLIKERKIYHTGEGYF
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IVTPQTYFITPSLIRTNSKWYHLDERIPDRSQCTSPQPGTITPSASGCV---RERTLPRN
:::::::::: . . :.. .:. . : : : .:. .: . : .
CCDS41 IVTPQTYFITNTTTQENKRM------LPSDESRLMPASMTYLVSMESCAESAQENAAPIS
190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KSD HCDSCHCCREDVHST---HAPTLQRKSAKDCKDPYCPPSLCQVPPTEKSKSTVNFSYKTE
::.::.: : :.:. .::. . . :. . : : . : . .. .:.
CCDS41 HCQSCQCFR-DMHTQDVQEAPVAAEVTRKSHRGLGESVSWVQNGAVSVS-AEHHICESTK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KSD TLSKPKDSEKQSKKFGLKLFRLSF-KKDKTK-QLANFSAQFPPEEWPLRDEDTPATIPRE
: .:.:: .::::..:. :. .:.: : . ..:::::::::::.:::: .:::.
CCDS41 PLPYTRDKEK-GKKFGFSLLWRSLSRKEKPKTEHSSFSAQFPPEEWPVRDEDDLDNIPRD
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEMEIIRRINPDLTVENVMRHTALMKKLEEEKAQRSKAGSSAH----HSGRSKKSRTHRK
:: :::.:::: :::.:...::.::.: ::.: :.. :. :. ::.. .:.
CCDS41 VEHEIIKRINPILTVDNLIKHTVLMQKYEEQKKYNSQGTSTDMLTIGHKYPSKEGVKKRQ
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410
pF1KSD S-------HGKSRSHSKTRVSKGDPSDGSHLDIPAEREYDFCDPLTRV--PREGCFIIEH
. .:.:: . ..:. . . . . . . .:. :. : : .. .
CCDS41 GLSAKPQGQGHSRRDRHKARNQGSEFQPGSIRLEKHPKLPATQPIPRIKSPNE---MVGQ
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KGDNFIMHSNTNVLESHFPMTPEWDVSGELAKRRTEMPFPEPS-RGSSHSKVHRSHSHTQ
: . : :.:: ::. . :.: :: : :::. :: :. .. ..
CCDS41 KPLGEI----TTVLGSHL-----------IYKKRISNPFQGLSHRGSTISKGHKIQKTSD
480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DRRSRNERSNKAKERSRSMDNSKGPLGASSLGTPEDLAEGCSQDDQTPSQS-YIDDSTLR
. :.. ..: .. ::.:.:. : .. : :: . .:. ..: ::.: :..
CCDS41 LKPSQTGPKEKPFQKPRSLDSSRIFDGKAK----EPYAE--QPNDKMEAESIYINDPTVK
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570
pF1KSD PAQTVSLQRAHISSTSYKEV------CIP--------EIVSGSKE--P-------SSACS
: . . :.:. : . . : : :. .: .: : : .
CCDS41 PIN--DDFRGHLFSHPQQSMLQNDGKCCPFMESMLRYEVYGGENEVIPEVLRKSHSHFDK
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620
pF1KSD LLEPGKPPESLPSYGELNS--CPTKTATDDYFQCNTSSETVLTAP---SPLGKN-KEDHD
: : . :.:::: : : :. : . .. .: : .:: . ..:.:
CCDS41 LGETKQTPHSLPSRGASFSDRTPSACRLVDNTIHQFQNLGLLDYPVGVNPLRQAARQDKD
640 650 660 670 680 690
630 640 650 660
pF1KSD TLTL-----AEGVKKLSPSDRQVPHSSREPVGHKEESPKG--------------------
. : .. .. : ..:. .... .. :. :
CCDS41 SEELLRKGFVQDAETTSLENEQLSNDDQALYQNEVEDDDGACSSLYLEEDDISENDDLRQ
700 710 720 730 740 750
670 680 690 700 710
pF1KSD --PGGGPAASGGVAEG--IANGRLVQHHGAEPSSLDKRKE--IFSKDTLFKP--LHSTLS
:: . . : ..: ... ..... .: .: .: : ..... .:: ::.:
CCDS41 MLPGHSQYSFTGGSQGNHLGKQKVIERSLTEYNSTMERVESQVLKRNECYKPTGLHAT--
760 770 780 790 800
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VNSYHKSSLSLLKSHPKTPADTLPGRCEKLEPSLGTSAAQAMPASQRQQESGGNQEASFD
. .. .:: . .. :. : . :::.. . . ::..: . . ..:::.
CCDS41 PGESQEPNLSAESCGLNSGAQF--GFNYEEEPSVAKCVQASAPADERIFDYYSARKASFE
810 820 830 840 850 860
780 790 800 810 820 830
pF1KSD YYNVSDDDDSEEGANKNTEEEKNREDVGTMQWLLEREKERDLQRKFEKNLTLLAPKETDS
.: .: .. : . . : . ........: ... :. ..
CCDS41 A-EVIQDTIGDTGKKPAS-------------WS-QSPQNQEMRKHFPQKFQLFNTSHMPV
870 880 890 900 910
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SSNQRATHSARLDSMDSSSITVDSGFNSPRTRESLASNTSSIVES-NRRQNPALSPAHGG
... . ..:.. .. :.. :::..:::: .::.::.: :... .::::
CCDS41 LAQDVQYEHSHLEGTENHSMAGDSGIDSPRT-QSLGSNNSVILDGLKRRQNFLQNVEGTK
920 930 940 950 960 970
900 910 920
pF1KSD AGPAFNFRASAEPPTNEAEKLQKPSNCLQASVTSV
CCDS41 SSQPLTSNSLLPLTPVINV
980
>>CCDS44417.1 STOX1 gene_id:219736|Hs108|chr10 (227 aa)
initn: 418 init1: 418 opt: 419 Z-score: 354.1 bits: 74.8 E(32554): 2.1e-13
Smith-Waterman score: 419; 55.7% identity (76.5% similar) in 115 aa overlap (50-162:96-210)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD DRASDRMRSRSEKDYRLHKRFPAAFAPQASRGYMTS--GDVSPISMSPISQSQFIPLGEI
::. ::: :..:.::.::::.::::.
CCDS44 LRRGVLLVRAPPACLQVLRDAWRRRALRPPRGFRIRAVGDVFPVQMNPITQSQFVPLGEV
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LCLAISAMNSARKPVTQEALMEHLTTCFPGVPTPSQEILRHTLNTLVRERKIYPTPDGYF
:: ::: ::.:. ::::.:.:.: .::. ::..:: ::.::..::::: : .:::
CCDS44 LCCAISDMNTAQIVVTQESLLERLMKHYPGIAIPSEDILYTTLGTLIKERKIYHTGEGYF
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IVTPQTYFITPSLIRTNSKWYHLDERIPDRSQCTSPQPGTITPSASGCVRERTLPRNHCD
:::::::::: . . :.. ::
CCDS44 IVTPQTYFITNTTTQENKRMLPSDESRLMPASMTYLDTESGI
190 200 210 220
926 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:06:30 2016 done: Thu Nov 3 06:06:31 2016
Total Scan time: 3.580 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]