Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1400, 1040 aa
1>>>pF1KSDA1400 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8198+/-0.00111; mu= 16.5681+/- 0.068
mean_var=161.6469+/-32.138, 0's: 0 Z-trim(109.4): 188 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.100877
statistics sampled from 10682 (10875) to 10682 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 4.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34063.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 (1040) 6944 1023.7 0
CCDS75192.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 ( 896) 5841 863.2 0
CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148) 1541 237.5 1.3e-61
CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100) 1498 231.2 9.5e-60
CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101) 1498 231.2 9.5e-60
CCDS4242.1 PCDHAC2 gene_id:56134|Hs108|chr5 (1007) 1441 222.9 2.8e-57
CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134) 1431 221.5 8.3e-57
CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135) 1431 221.5 8.3e-57
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 1401 216.9 1.4e-55
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 1401 217.0 1.5e-55
CCDS31986.1 PCDH17 gene_id:27253|Hs108|chr13 (1159) 1401 217.1 1.7e-55
CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5 ( 937) 1389 215.3 5.1e-55
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 1377 213.4 1.5e-54
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 1377 213.5 1.7e-54
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 1376 213.4 1.9e-54
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 1368 212.1 3.8e-54
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 1368 212.2 4.2e-54
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 1367 212.0 4.2e-54
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 1367 212.0 4.2e-54
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 1367 212.0 4.6e-54
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 1367 212.0 4.6e-54
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 1365 211.7 5.1e-54
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 1361 211.1 8e-54
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 1361 211.2 8.5e-54
CCDS54917.1 PCDHA5 gene_id:56143|Hs108|chr5 ( 936) 1360 211.0 9.4e-54
CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5 ( 947) 1359 210.9 1.1e-53
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 1358 210.7 1.1e-53
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 1358 210.7 1.1e-53
CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5 ( 950) 1354 210.2 1.7e-53
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 1349 209.4 2.6e-53
CCDS75326.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 810) 1346 208.9 3.5e-53
CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 949) 1346 209.0 3.9e-53
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 1345 208.8 3.9e-53
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 1345 208.8 4.3e-53
CCDS64269.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 808) 1344 208.6 4.3e-53
CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 948) 1344 208.7 4.8e-53
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 1337 207.6 8.6e-53
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 1337 207.7 9.5e-53
CCDS54913.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5 ( 950) 1333 207.1 1.4e-52
CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5 ( 950) 1333 207.1 1.4e-52
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 1331 206.7 1.6e-52
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 1330 206.6 1.8e-52
CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5 ( 950) 1331 206.8 1.8e-52
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 1330 206.6 1.8e-52
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 1330 206.7 1.9e-52
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 1330 206.7 1.9e-52
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 1327 206.2 2.6e-52
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 1317 204.7 6.5e-52
CCDS54920.1 PCDHA9 gene_id:9752|Hs108|chr5 ( 950) 1318 204.9 6.6e-52
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 1312 204.0 1.1e-51
>>CCDS34063.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 (1040 aa)
initn: 6944 init1: 6944 opt: 6944 Z-score: 5469.9 bits: 1023.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6944; 100.0% identity (100.0% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MIVLLLFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITKLSARGFQTVPNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MIVLLLFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITKLSARGFQTVPNSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQVEIEVLDINDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQVEIEVLDINDNPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQTQGDGNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQTQGDGNRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLPPQQQRTGTALLTIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLPPQQQRTGTALLTIRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRAREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRAREL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD STVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSFKNYYTIVTEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSFKNYYTIVTEAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSINSENGYLYALRSFDYEQLKDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSINSENGYLYALRSFDYEQLKDFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPAKRDPQRPYELVIEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPAKRDPQRPYELVIEV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSGGGETSLDLTLILII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSGGGETSLDLTLILII
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGGGGSTCCGRQARARKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGGGGSTCCGRQARARKK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KLSKSDIMLVQSSNVPSNPAQVPIEESGGFGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLSKSDIMLVQSSNVPSNPAQVPIEESGGFGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIISNGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIISNGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSAF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHDATNRAQSAGMDLFSNCTEECKALGHSDRCWMPSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHDATNRAQSAGMDLFSNCTEECKALGHSDRCWMPSFVP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SDGRQAADYRSNLHVPGMDSVPDTEVFETPEAQPGAERSFSTFGKEKALHSTLERKELDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDGRQAADYRSNLHVPGMDSVPDTEVFETPEAQPGAERSFSTFGKEKALHSTLERKELDG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD LLTNTRAPYKPPYLTRKRIC
::::::::::::::::::::
CCDS34 LLTNTRAPYKPPYLTRKRIC
1030 1040
>>CCDS75192.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 (896 aa)
initn: 6232 init1: 5841 opt: 5841 Z-score: 4603.2 bits: 863.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5841; 99.3% identity (99.8% similar) in 884 aa overlap (1-884:1-884)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MIVLLLFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITKLSARGFQTVPNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MIVLLLFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITKLSARGFQTVPNSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQVEIEVLDINDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQVEIEVLDINDNPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQTQGDGNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQTQGDGNRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLPPQQQRTGTALLTIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLPPQQQRTGTALLTIRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRAREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRAREL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD STVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSFKNYYTIVTEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 STVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSFKNYYTIVTEAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSINSENGYLYALRSFDYEQLKDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSINSENGYLYALRSFDYEQLKDFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPAKRDPQRPYELVIEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPAKRDPQRPYELVIEV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSGGGETSLDLTLILII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSGGGETSLDLTLILII
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGGGGSTCCGRQARARKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGGGGSTCCGRQARARKK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KLSKSDIMLVQSSNVPSNPAQVPIEESGGFGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLSKSDIMLVQSSNVPSNPAQVPIEESGGFGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIISNGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSAF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: .
CCDS75 SPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIISNGSILSNEVRLKRKDHHLSSPPSESLL
850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHDATNRAQSAGMDLFSNCTEECKALGHSDRCWMPSFVP
>>CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148 aa)
initn: 1264 init1: 560 opt: 1541 Z-score: 1219.8 bits: 237.5 E(32554): 1.3e-61
Smith-Waterman score: 2462; 40.8% identity (67.7% similar) in 1086 aa overlap (3-1020:8-1035)
10 20 30 40 50
pF1KSD MIVLLLFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDL---GLDITKLSARG
::::.:.:: ... .:.:.:.:::. :: ..:.:.: :. . .: .
CCDS55 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FQTVPNSRTPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQVEIEV
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CCDS55 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEV-MSSSMEICVIKVEI
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pF1KSD LDINDNPPSFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQ
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120 130 140 150 160 170
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... ::.... :::: :.:.::. ::: : : :...::. : ..: ::: :.::.: :.
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::..:: : : :.: :.:.: : .: .:::: ..:.: :::.:.:.:: : ::: :.
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: .: : : :.: .. .:::.::.:: ::
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CCDS55 SDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVS
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CCDS48 --VNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEYSY----------
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CCDS48 EAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSE
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CCDS43 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEV-MSSSMEICVIKVEI
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pF1KSD LDINDNPPSFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQ
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CCDS43 TRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGD----------------PP---RLG
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pF1KSD TALLTIRVLDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSH
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CCDS43 TVGLSIKVTDSNDNNPVFSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGY
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pF1KSD ISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDAN
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CCDS43 VNDRTRELFQIDPHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTN
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KSD DNAPEISFSTVKEA---VSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSF
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CCDS43 DNPPVINLLSVNSELVEVSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-Y
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pF1KSD KNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYD
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CCDS43 ESFSTILVDGRLDREQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQ
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CCDS43 VIVQENNTPGAYLLSVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALR
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pF1KSD SFDYEQLKDFSFQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREV
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CCDS43 SFNHEQTKAFEFKVLAKDGGLP-SLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAP-PLINGT-AEVY
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pF1KSD LPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPAKRD
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CCDS43 IPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTF--GES
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pF1KSD PQRPYELVIEVRDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSGGGE
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CCDS43 SKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLIYL-SPALDAQESMGS------------------
640 650 660 670
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CCDS43 --VNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEYSY----------
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CCDS43 ---GHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETD--KMNVVSCSSLTSSLNYFDY-HQQTLPL
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pF1KSD ESAKTDLMFLK-PCSPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIISNGSILSNETKHQRAELS
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CCDS43 GCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHIYHHSF-NSQGPQQPDLIINGVPLP-ETENYSFDSN
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CCDS43 VEAYD--DCGP-TKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNG
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CCDS43 CEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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10 20 30
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CCDS42 MEQAGTRPAATEHPRLRRPMPWLLLLPLLLLLLLLLPGPAASQLRYSVPEEQAPGALVGN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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CCDS42 VARALGLELRRLGP-GCLRINHLGAPSPRYLELDLTSGALFVNERIDREALCEQRPRCLL
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
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CCDS42 SLEVLAHNPVAVSAVEVEILDINDNSPRFPRPNYQLQVSESVAPGARFHIESAQDPDVGA
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160 170 180 190 200 210
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CCDS42 NSVQTYELSPSEHFELDLKPLQENSKVLELVLRKGLDREQAALHHLVLTAVDG-------
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220 230 240 250 260 270
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CCDS42 ---------GIPA---RSGTAQISVRVLDTNDNSPAFDQSTYRVQLREDSPPGTLVVKLN
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280 290 300 310 320 330
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CCDS42 ASDPDEGSNGELRYSLSSYTSDRERQLFSIDASTGEVRVIGGLDYEEASSYQIYVQATDR
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CCDS42 GPVPMAGHCKVLVDIVDVNDNAPEVVLTDLYSPVPENATPNTIVAVLSVNDQDSGPNRKV
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CCDS42 SLGLEATLPFRL-NGFGNSYTLVVSGPLDRERVAVYNITVTATDGGIPQLTSLRTLKVEI
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CCDS42 SDINDNPPSFLEDSYSIYIQENNLPGVLLCTVQATDPDEKENAEVTYSLLEREIQGLPVT
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CCDS42 SYVSINSASGSLYAVNSFDYEKFREFFVTVEAQDKGSPP-LSSTVTANVYVVDMNDHAPH
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pF1KSD IVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDW
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CCDS42 ILYPT-STNSSAAFEMVPRTAPAGYLVTKVIAMDSDSGQNAWLFYHLAQTSDLDLFKVEL
580 590 600 610 620 630
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CCDS42 HTGEIRTTRKMGDESGS--TFNLTVVVRDNGEPSLSASVAITVAVVDRVSKILP------
640 650 660 670 680
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CCDS42 ------DTQRHVKSP--RTYSEITLYLIIALSTVSFIFLLTIIILSIIKCYR------YT
690 700 710 720 730
760 770 780 790 800
pF1KSD CLASDCCLCCCCCGGGGSTCCGRQARARKKKLSKSDIMLVQSSNVPSN-PAQVPIEESGG
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CCDS42 AYGT------ACCGG----FCGVRERSPAELYKQANNNI--DARIPHGLKVQPHFIEVRG
740 750 760 770 780
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pF1KSD FGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKP---CSPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPD
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CCDS42 NGSL--TKTYCYKACLTAGSGSDTFMFYNTGAQTGPGPSGAQAAVTDSRNLTGQSGQNAG
790 800 810 820 830 840
870 880 890 900 910 920
pF1KSD ---IISNGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSA-FQEADIVSSKDSGHGDSEQGDSD
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CCDS42 NLIILKNEAVSQNEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGIL--RAGPGGPDQQWPTV
850 860 870 880 890
930 940 950 960 970 980
pF1KSD HDATNRAQSAGMDLFSNCTEECKALGHSDRCWMPSFVPSDGRQAA--DYRSNLHVPGMDS
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CCDS42 SSATPEPE-AG-----EVSPPVGA-GVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPA
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pF1KSD VPDTEVFETPEAQPGAERSFSTFGKEKALHSTLERKELDGLLTNTRAPYKPPYLTRKRIC
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CCDS42 I--ISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
960 970 980 990 1000
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10 20 30 40
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CCDS75 MHQMNAKMHFRFVFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPN
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50 60 70 80 90 100
pF1KSD -SARGFQTVPNSRTPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFL--ENPLEL
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CCDS75 PSTVRFRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQL
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CCDS75 FHIEVEVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSAND
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CCDS75 FFNIEVRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASD----------------MGVP
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
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CCDS75 ---QRSGSSILKISISDSNDNSPAFEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKI
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD VYSFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVL
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CCDS75 VYSFSSHVSPKIMETFKIDSERGHLTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKII
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KSD VRVLDANDNAPEISFSTV---KEAVS---EGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLG
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CCDS75 IKVVDVNDNKPEININLMSPGKEEISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHG
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pF1KSD DVPFRLKSSFKNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDN
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CCDS75 HGHFKLQKTYENNYLILTNATLDREKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDN
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CCDS75 PPHFQRSRYEFVISENNSPGAYITTVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTID
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD SENGYLYALRSFDYEQLKDFSFQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLP
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CCDS75 PSNGAIYALRIFDHEEVSQITFVVEARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGP-A
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD GRNGTPAREVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELR
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CCDS75 LRNNT-AEITIPKGAESGFHVTRIRAIDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIH
590 600 610 620 630
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: : : .:: . ..:.:.: : . . : .. . : .
CCDS75 T--NVSMDSVPYTEWELSVIIQDKGNPQLHTKVLLKCMIFEYAESVTS------------
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pF1KSD QRPSRSGGGETSLDLTLILIIALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKK-LNIYTCLASDCCL
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CCDS75 --TAMTSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLFATRCNREKKDTRSYNCRVAE---
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pF1KSD CCCCCGGGGSTCCGRQARARKKKLSKSDIMLVQSSN--VP------SNPAQVPIEESGGF
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CCDS75 ---------STYQHHPKRP-SRQIHKGDITLVPTINGTLPIRSHHRSSPSSSPTLERGQM
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pF1KSD GSHH-HNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPCSPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIIS
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CCDS75 GSRQSHNSHQSLNSLVTISSNHVPENF--------SLELTHATPAVEVS----QLLSMLH
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pF1KSD NGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSAFQEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHD-----
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CCDS75 QG--------QYQPRPSFRGNKYSRSYRYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDYDLGRDS
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.: . :. ::: . :::::..:::::.:::: . :: ..:::::.
CCDS75 PIDRLLGEGFSDLFLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMPPL-PSP---SSDYRSNM
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pF1KSD HVPGMDSVPDTEVFETP------EAQPG----AERSFSTFGKEKALHSTLERKELDGLLT
.:: . : . : .:::. ..:::::::.. ..::.
CCDS75 FIPG-EEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPNDEDTGDTSTSSLLS
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1030 1040
pF1KSD NTRAPYK---PPYLTRKRIC
. . .. :: : :
CCDS75 EMSSVFQRLLPPSLDTYSECSEVDRSNSLERRKGPLPAKTVGYPQGVAAWAASTHFQNPT
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10 20 30 40
pF1KSD MIVLLLFALLWMV--EGVFSQ-LHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITKL--
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CCDS34 MHQMNAKMHFRFVFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD -SARGFQTVPNSRTPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFL--ENPLEL
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CCDS34 PSTVRFRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQL
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pF1KSD FQVEIEVLDINDNPPSFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNS
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CCDS34 FHIEVEVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSAND
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YFSLDVQTQGDGNRFAELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLP
.:...:.:. :: ..:::.. . :::: .. .. ::: : :.:
CCDS34 FFNIEVRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASD----------------MGVP
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PQQQRTGTALLTIRVLDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEV
::.:...: : . ::::: :::.: : ..: :::: :::...::::::::: ::..
CCDS34 ---QRSGSSILKISISDSNDNSPAFEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKI
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VYSFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVL
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CCDS34 VYSFSSHVSPKIMETFKIDSERGHLTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKII
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KSD VRVLDANDNAPEISFSTV---KEAVS---EGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLG
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CCDS34 IKVVDVNDNKPEININLMSPGKEEISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHG
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD DVPFRLKSSFKNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDN
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CCDS34 HGHFKLQKTYENNYLILTNATLDREKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDN
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD APRFSQPVYDVYVTENNVPGAYIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSIN
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CCDS34 PPHFQRSRYEFVISENNSPGAYITTVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTID
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SENGYLYALRSFDYEQLKDFSFQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLP
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CCDS34 PSNGAIYALRIFDHEEVSQITFVVEARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGP-A
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GRNGTPAREVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELR
::.: :. ..:..:: :. .::. :.: :.: ::.:. .:: ::: :.: .: :. ...
CCDS34 LRNNT-AEITIPKGAESGFHVTRIRAIDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIH
590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KSD TARRVPAKRDPQRPYELVIEVRDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEH
: : : .:: . ..:.:.: : . . : .. . : .
CCDS34 T--NVSMDSVPYTEWELSVIIQDKGNPQLHTKVLLKCMIFEYAESVTS------------
640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QRPSRSGGGETSLDLTLILIIALGSVSFIFLLAMIVLAVRCQKEKK-LNIYTCLASDCCL
. .. ...:::...:.::.::.. ..:. :...:.::..::: :.: ...
CCDS34 --TAMTSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLFATRCNREKKDTRSYNCRVAE---
690 700 710 720 730 740
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CCCCCGGGGSTCCGRQARARKKKLSKSDIMLVQSSN--VP------SNPAQVPIEESGGF
:: . : .... :.:: :: . : .: :.:.. : : : .
CCDS34 ---------STYQHHPKRP-SRQIHKGDITLVPTINGTLPIRSHHRSSPSSSPTLERGQM
750 760 770 780 790
820 830 840 850 860
pF1KSD GSHH-HNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPCSPSRSTDTEHNPCGAIVTGYTDQQPDIIS
::.. ::.. . .: : .. : : . : .: ..: ...:
CCDS34 GSRQSHNSHQSLNSLVTISSNHVPENF--------SLELTH------ATPAVEQVSQLLS
800 810 820 830
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pF1KSD NGSILSNETKHQRAELSYLVDRPRRVNSSAFQEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHD-----
. .. ..: . :. .. : :.:. : : ::::.:::: ::::.:
CCDS34 ----MLHQGQYQ-PRPSFRGNKYSRSYRYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDYDLGRDS
840 850 860 870 880 890
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pF1KSD ATNRAQSAGM-DLFSN----------CTEECKALGHSDRCWMPSFVPSDGRQAADYRSNL
.: . :. ::: . :::::..:::::.:::: . :: ..:::::.
CCDS34 PIDRLLGEGFSDLFLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMPPL-PSP---SSDYRSNM
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pF1KSD HVPGMDSVPDTEVFETP------EAQPG----AERSFSTFGKEKALHSTLERKELDGLLT
.:: . : . : .:::. ..:::::::.. ..::.
CCDS34 FIPG-EEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPNDEDTGDTSTSSLLS
950 960 970 980 990 1000
1030 1040
pF1KSD NTRAPYK---PPYLTRKRIC
. . .. :: : :
CCDS34 EMSSVFQRLLPPSLDTYSECSEVDRSNSLERRKGPLPAKTVGYPQGVAAWAASTHFQNPT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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CCDS75 -VRTGTARIRVMVLDANDNAPAFAQPEYRASVPENLALGTQLLVVNATDPDEGVNAEVRY
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:: ... .: ..: :. .: . . ::::.::: ::. ::: : :: :. :::.
CCDS75 SFR-YVDDKAAQVFKLDCNSGTISTIGELDHEESGFYQMEVQAMD---NAGYSARAKVLI
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:::.::::::. .... .: :.. ::..::..:.:.:::::::: : . :..::.:.
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pF1KSD SSFKNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQP
.:. :::..::. :::: ::..::.: ::: : ::: :...:.:.::: : : :
CCDS75 KSYGNYYSLVTDIVLDREQVPSYNITVTATDRGTPPLSTETHISLNVADTNDNPPVFPQA
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:..:. ::: :. . .:.: : : :::..::. : ::: :. .::::::..: ::
CCDS75 SYSAYIPENNPRGVSLVSVTAHDPDCEENAQITYSLAENTIQGASLSSYVSINSDTGVLY
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ALRSFDYEQLKDFSFQVEARDAGSPQALAGNATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPA
:: ::::::..:.. .: ::: : : :..:........::::::: :. : .:. .
CCDS75 ALSSFDYEQFRDLQVKVMARDNGHPP-LSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTG
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590 600 610 620 630 640
pF1KSD REVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPA
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CCDS75 VELAPRSAEPGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARAL-L
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD KRDPQRPYELVIEVRDHGQPPLSSTATLVVQLVDGAVEPQGGGGSGGGGSGEHQRPSRSG
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CCDS75 DRDALKQ-SLVVAVQDHGQPPLSATVTLTVAVADSI--PQVLADLGS-----LESPANS-
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pF1KSD GGETSLDLTLILIIALGSVSFIFL-LAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGG
::: :::: :..:...:: .:: .....::.: .. .:
CCDS75 --ETS-DLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVILLLALRLRRWHKSRLLQASGGGLTGAPASHFV
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CCDS75 GVDGVQAFLQTYSHEVSLTTDSRKSHLIFPQPNYADMLVSQESFEKSEPLLLSGDSVFSK
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10 20 30 40
pF1KSD MIVLL--LFALLWMVEGVFSQLHYTVQEEQEHGTFVGNIAEDLGLDITK
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CCDS42 MIPARLHRDYKGLVLLGILLGTLW--ETGCTQIRYSVPEELEKGSRVGDISRDLGLEPRE
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pF1KSD LSARGFQTVPNSRTPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLENPLELFQ
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CCDS42 LAERGVRIIPRGRTQLFALNPRSGSLVTAGRIDREELCMGAIKCQLNLDILMEDKVKIYG
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pF1KSD VEIEVLDINDNPPSFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYF
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CCDS42 VEVEVRDINDNAPYFRESELEIKISENAATEMRFPLPHAWDPDIGKNSLQSYELSPNTHF
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170 180 190 200 210 220
pF1KSD SLDVQTQGDGNRFAELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGVGEGGGGGGGAGLPPQ
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CCDS42 SLIVQNGADGSKYPELVLKRALDREEKAAHHLVLTASDGGD----------------PV-
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CCDS42 --RTGTARIRVMVLDANDNAPAFAQPEYRASVPENLALGTQLLVVNATDPDEGVNAEVRY
230 240 250 260 270
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pF1KSD SFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDLGPNA-VPAHCKVLV
:: ... .: ..: :. .: . . ::::.::: ::. ::: : :: :. :::.
CCDS42 SFR-YVDDKAAQVFKLDCNSGTISTIGELDHEESGFYQMEVQAMD---NAGYSARAKVLI
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pF1KSD RVLDANDNAPEISFSTVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLK
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CCDS42 TVLDVNDNAPEVVLTSLASSVPENSPRGTLIALLNVNDQDSEENGQVICFIQGNLPFKLE
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KSD SSFKNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVARDRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQP
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CCDS42 KSYGNYYSLVTDIVLDREQVPSYNITVTATDRGTPPLSTETHISLNVADTNDNPPVFPQA
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pF1KSD VYDVYVTENNVPGAYIYAVSATDRDEGANAQLAYSILECQIQGMSVFTYVSINSENGYLY
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CCDS42 SYSAYIPENNPRGVSLVSVTAHDPDCEENAQITYSLAENTIQGASLSSYVSINSDTGVLY
460 470 480 490 500 510
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CCDS42 ALSSFDYEQFRDLQVKVMARDNGHPP-LSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTG
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pF1KSD REVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARLTYSIVRGNEMNLFRMDWRTGELRTARRVPA
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CCDS42 VELAPRSAEPGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARAL-L
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CCDS42 DRDALKQ-SLVVAVQDHGQPPLSATVTLTVAVADSI--PQVLADLGSLES-----PANS-
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710 720 730 740 750 760
pF1KSD GGETSLDLTLILIIALGSVSFIFL-LAMIVLAVRCQKEKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGG
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CCDS42 --ETS-DLTLYLVVAVAAVSCVFLAFVILLLALRLRRWHKSRLLQ--AS----------G
690 700 710 720
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pF1KSD GGSTCCGRQARARKKKLSKSDIMLVQSSNVPSNPAQVPIEESGGFGSHHHNQNYCYQVCL
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CCDS42 GGLT---------------------------GAPASHFV---GVDGVQAFLQTYSHEVSL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]