FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1410, 4265 aa
1>>>pF1KSDA1410 4265 - 4265 aa - 4265 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0429+/-0.00145; mu= 15.6761+/- 0.088
mean_var=139.1147+/-27.425, 0's: 0 Z-trim(103.0): 31 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.108740
statistics sampled from 7210 (7228) to 7210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 12.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46842.1 DNAH1 gene_id:25981|Hs108|chr3 (4265) 28411 4471.2 0
CCDS10594.1 DNAH3 gene_id:55567|Hs108|chr16 (4116) 9949 1574.9 0
CCDS42794.1 DNAH7 gene_id:56171|Hs108|chr2 (4024) 6430 1022.8 0
CCDS75447.1 DNAH8 gene_id:1769|Hs108|chr6 (4707) 4194 672.1 3.2e-191
CCDS3882.1 DNAH5 gene_id:1767|Hs108|chr5 (4624) 4189 671.3 5.4e-191
CCDS32551.1 DNAH2 gene_id:146754|Hs108|chr17 (4427) 2147 350.9 1.4e-94
CCDS64602.1 DNAH11 gene_id:8701|Hs108|chr7 (4516) 1903 312.7 4.7e-83
CCDS46348.1 DNAH6 gene_id:1768|Hs108|chr2 (4158) 1818 299.3 4.6e-79
CCDS53701.1 DYNC2H1 gene_id:79659|Hs108|chr11 (4307) 1787 294.5 1.4e-77
CCDS44717.1 DYNC2H1 gene_id:79659|Hs108|chr11 (4314) 1787 294.5 1.4e-77
CCDS11161.1 DNAH9 gene_id:1770|Hs108|chr17 ( 798) 1657 273.8 4.3e-72
CCDS11160.1 DNAH9 gene_id:1770|Hs108|chr17 (4486) 1584 262.6 5.5e-68
CCDS9255.2 DNAH10 gene_id:196385|Hs108|chr12 (4471) 1510 251.0 1.7e-64
CCDS9966.1 DYNC1H1 gene_id:1778|Hs108|chr14 (4646) 587 106.2 6.8e-21
>>CCDS46842.1 DNAH1 gene_id:25981|Hs108|chr3 (4265 aa)
initn: 28411 init1: 28411 opt: 28411 Z-score: 24079.4 bits: 4471.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 28411; 100.0% identity (100.0% similar) in 4265 aa overlap (1-4265:1-4265)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
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CCDS46 MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
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CCDS46 HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QNLLRQADLDKFTPRVGSFEVPEDFQERMEQQCIGSTTRLLAQTDFPLQAYEPKMQVPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QNLLRQADLDKFTPRVGSFEVPEDFQERMEQQCIGSTTRLLAQTDFPLQAYEPKMQVPFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VLPGQHPRKIEIERRKQQYLSLDIEQLLFSQGIDSNKLMPRHLDHQHPQTIEQGHDPIFP
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CCDS46 VLPGQHPRKIEIERRKQQYLSLDIEQLLFSQGIDSNKLMPRHLDHQHPQTIEQGHDPIFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IYLPLKVFDNEDFDCRTPREWINMGLEPGSLDRKPVPGKALLPTDDFLGHEDPKSQKLKY
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CCDS46 IYLPLKVFDNEDFDCRTPREWINMGLEPGSLDRKPVPGKALLPTDDFLGHEDPKSQKLKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KWCEVGVLDYDEEKKLYLVHKTDEKGLVRDEMGRPILNAGVTTEGRPPLQVCQYWVPRIQ
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CCDS46 KWCEVGVLDYDEEKKLYLVHKTDEKGLVRDEMGRPILNAGVTTEGRPPLQVCQYWVPRIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLFCAEDPCMFAQRVVQANALRKNTEALLLYNLYVDCMPSDGQHVISEQSLSKIKQWALS
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CCDS46 LLFCAEDPCMFAQRVVQANALRKNTEALLLYNLYVDCMPSDGQHVISEQSLSKIKQWALS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
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CCDS46 TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RGLVSVPKYHFWEQKEDFTFVSLLTRPEVITALSKVRAECNKVTAMSLFHSSLSKYSHLE
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CCDS46 RGLVSVPKYHFWEQKEDFTFVSLLTRPEVITALSKVRAECNKVTAMSLFHSSLSKYSHLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
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CCDS46 EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ELVKYMLQDTLRFLVQDSLASFSQFISDTCCSVLNCTDDMVWGDDLINSPYRPRKNPLFI
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CCDS46 ELVKYMLQDTLRFLVQDSLASFSQFISDTCCSVLNCTDDMVWGDDLINSPYRPRKNPLFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD MDLVLDSSGVHYSTPLEQFEASLLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVG
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CCDS46 MDLVLDSSGVHYSTPLEQFEASLLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
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CCDS46 LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
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CCDS46 EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD DSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELREWMKGIPERLVGLEERIVKVMDDYQVMDEFLY
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CCDS46 DSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELREWMKGIPERLVGLEERIVKVMDDYQVMDEFLY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NLSSDDFNDKWIASNWPSKILGQIELVQQQHVEDEEKFRKIQIMDQNNFQEKLEGLQLVV
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CCDS46 NLSSDDFNDKWIASNWPSKILGQIELVQQQHVEDEEKFRKIQIMDQNNFQEKLEGLQLVV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AGFSIHVEISRAHEIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFSLPITNYDKLSRMVKEF
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CCDS46 AGFSIHVEISRAHEIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFSLPITNYDKLSRMVKEF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD QPYLDLWTTASDWLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVVEAFKTMHKCVKQFKDMPACQEV
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CCDS46 QPYLDLWTTASDWLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVVEAFKTMHKCVKQFKDMPACQEV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
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CCDS46 ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
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CCDS46 HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD IVMTQNMSFSPYKKPFEQRINSWENKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFSSEDINQQL
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CCDS46 IVMTQNMSFSPYKKPFEQRINSWENKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFSSEDINQQL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
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CCDS46 PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDLEITHMYSAEGE
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CCDS46 KRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDLEITHMYSAEGE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD EVQLCFSIYPSSNVEDWLREVERSMKASVHDIIEKAIRAYPTMPRTQWVLNWPGQVTIAG
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CCDS46 EVQLCFSIYPSSNVEDWLREVERSMKASVHDIIEKAIRAYPTMPRTQWVLNWPGQVTIAG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD CQTYWTMEVAEALEAGNLRSQLFPQLCQQLSDLVALVRGKLSRMQRAVLSALIVIEVHAK
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CCDS46 CQTYWTMEVAEALEAGNLRSQLFPQLCQQLSDLVALVRGKLSRMQRAVLSALIVIEVHAK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD DVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLT
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CCDS46 DVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLT
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD DRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFF
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CCDS46 DRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
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CCDS46 KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
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CCDS46 ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD SSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPSMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKL
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CCDS46 SSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPSMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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CCDS46 FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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CCDS46 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KSD EWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLT
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CCDS46 EWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KSD EAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHFKAL
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CCDS46 EAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHFKAL
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KSD FVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIV
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CCDS46 FVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIV
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KSD ELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMENEQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGI
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CCDS46 ELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMENEQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGI
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KSD SGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYCNIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNK
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CCDS46 SGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYCNIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNK
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KSD KPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFSARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGV
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CCDS46 KPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFSARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KSD FGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFV
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KSD CAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRIFSTILGNWLDGLLGEKSYRERVP
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CCDS46 CAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRIFSTILGNWLDGLLGEKSYRERVP
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KSD GAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGMLMADPAKVED
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CCDS46 GAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGMLMADPAKVED
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KSD QVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCMEQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMS
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CCDS46 QVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCMEQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMS
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KSD PGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLKLVLFMDAMSHICRISRTLRQALG
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CCDS46 PGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLKLVLFMDAMSHICRISRTLRQALG
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KSD NALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYGMSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPIT
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CCDS46 NALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYGMSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPIT
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KSD FLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQIVSTMRPYIQEQGLQPTKANLMA
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CCDS46 FLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQIVSTMRPYIQEQGLQPTKANLMA
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KSD AYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPAEALKSVATVFLNE
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CCDS46 AYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPAEALKSVATVFLNE
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KSD IPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELTRHNYVTPKSYLELLHIFSILIGQ
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CCDS46 IPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELTRHNYVTPKSYLELLHIFSILIGQ
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KSD KKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMHPLLEEAAKDTMLTMEQIKVDTAI
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CCDS46 KKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMHPLLEEAAKDTMLTMEQIKVDTAI
2830 2840 2850 2860 2870 2880
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CCDS10 GPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMNSKMSLIFEPADLEQASPATVSRCGMIYM
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pF1KSD VEAFKTMHKCVKQFKDMPACQEVALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQ
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CCDS42 GNYWRGLYKLEKTFHDSPYALAMTKKVRSKVEDFKQHIPLIQVICNPGLRPRHWEAMSAI
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pF1KSD ININVRPKANLTFARCLEMNLQDHIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVL
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CCDS42 VGYPLQPSDDSTVSSFLDMNLEPYIDRFEGISEAASKEYSLEKAMEKMITEWDAVEFVIH
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD PYKATDTYILKSPDEASQLLDDHIVMTQNMSFSPYKKPFEQRINSWENKLKLTQEVLEEW
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CCDS42 SYRETGTFILASVDEIQMLLDDHIIKTQTMRGSPFIKPYEKQMREWEGKLLLLQEILDEW
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pF1KSD LNCQRSWLYLEPIFSSEDINQQLPVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRML
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CCDS42 LKVQATWLYLEPIFSSPDIMSQMPEEGRRFTAVDKTWRDIMRSVMQDKHVLTVVTIDRML
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pF1KSD DSLRDCNKILDLVQKGLSEYLETKRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCF
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CCDS42 ERLKKSNELLELILKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQPHLKKCF
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pF1KSD ENIARLLFQEDLEITHMYSAEGEEVQLCFSIYPSS---NVEDWLREVERSMKASVHDIIE
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CCDS42 EGIAKVEFTETLDITHMKSSEGEVVELIEIISTAKARGQVEKWLVELERVMINSIHKVTG
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pF1KSD KAIRAYPTMPRTQWVLNWPGQVTIAGCQTYWTMEVAEALEAGNLRSQLFPQLC-QQLSDL
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CCDS42 DATFAYTKYERINWVRDWPGQTVLCVSQIFWTKEVQTAIPMGIKALEQYLKTCNRQIDDI
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pF1KSD VALVRGKLSRMQRAVLSALIVIEVHAKDVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLY
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CCDS42 TKMINAGLRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLFGALHLHLGGAPEGPAGTGKTETTKD
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CCDS42 LAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLLSCGAWACFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTI
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CCDS42 QRGINAGADILMFEGTELKLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRTVAMMVPDYAM
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pF1KSD ITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKLSSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENP
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CCDS42 IAEIVLYSCGFVTARPLSVKIVATYRLCSEQLSSQHHYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKYP
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pF1KSD SMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNS
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CCDS42 NENEEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGVKLPKPDYNDLLAAIKDNCASM
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pF1KSD NLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMY
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CCDS42 NLQMTAFFSEKILQVYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYRVLAGALNDICEK----GLME
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pF1KSD EA-VNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVD
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CCDS42 ENKVQITVLNPKSVTMGQLYGQFDSVSHEWSDGVLAVSFRAFASSVTPDRKWLIFDGPVD
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pF1KSD AIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSI
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CCDS42 AVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVASPATVSRCGMIYMEPHM
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pF1KSD LGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHF-KALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSL
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CCDS42 LGWRPLMLSWVNLLPASVSVIQKEFIMGLFDRMVPVSVEFIRKHTKELSPTSDTNLVRSL
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pF1KSD LKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSR-IVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHW
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CCDS42 MNLIDCFMDDFADEVKLK----ERNDRETYSLLEGIFLFSLIWSVGASCTDDDRLKFNKI
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pF1KSD LRLKMEN----------------EQ-----LTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDE
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CCDS42 LRELMESPISDRTRNTFKLQSGTEQTSSKALTVPFPEKGTIYDYQFVTEGIG--------
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CCDS42 ----KWEPWIKKLKEAPP---IPKDVMFNEIIVPTLDTIRYSALMELLTTHQKPSIFVGP
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pF1KSD TGTGKTLTISDKLLKNLALD-YISHFLTFSARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGR
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CCDS42 TGTGKSVYITNFLLNQLNKEIYKPLLINFSAQTTAAQTQNIVMSKLDKRRKGVFGPPLGK
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CCDS42 RMVVFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHWNWYDLKDCSMIK-LVDIQIMCAMGPPG
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pF1KSD GGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRIFSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAH
:::: :::: ::::: ... :... : ::: :: .: : :. : ..
CCDS42 GGRNPVTPRYMRHFNIITINEFSDKSMYTIFSRIL-TWHL----EICYK--FP--DEFLD
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CCDS42 LTTQIVNGTMTLYKEAMKNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETTETTEVIKRL
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pF1KSD WYHENCRVFRDRLVNEEDRSWF----DQLLKRCM-EQWEVTFNKVC----------PFQP
: :: ::. :::... ::::. ...:. : :... :... ..
CCDS42 WVHEVLRVYYDRLLDNTDRSWLINYIQEILRNYMYEDFHELFQRLDFDNDGMVEADDLRS
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... :: .: . .:. :.. ... ...: ..:.::.:. ..:::: :. :: :::
CCDS42 LMFCDFHDPKREDTNYREIADVDNLRMIVEIHLEEYNNISKKPMNLVLFRFAIEHISRIS
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pF1KSD RTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYGMSEWRDDVKKVLLKA
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CCDS42 RILKQPRSHALLVGVGGSGRQSVTRLAAHMADYSVFQVEISKGYDTTEWHEDLKVILRKC
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. .. .:::.:::::.::::::..:.::.:.::::.. ::...: . :: :..
CCDS42 AEGEMQGVFLFTDTQIKEESFLEDVSNLLNAGEIPNLFALDEKQEICDKMRQLDRQRDKT
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. : .. :. . . ::..:.:: :::::..:: :::.::.::::::::::. :: .
CCDS42 KQTDGSPIALFNMFIDHCRSQLHVVLAMSPIGDAFRNRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPED
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CCDS42 ALQAVASRFLEEI---EMSEEIRDGCIDMCKSFHTSTIDLSKSFFVELQRYNYVTPTSYL
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::. :..:. .:. :. :.:.. ::.:: .: .:: :: .::..:: :. :.:..
CCDS42 ELISTFKLLLEKKRSEVMKMKKRYEVGLEKLDSASSQVATMQMELEALHPQLKVASKEVD
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CCDS42 EMMIMIEKESVEVAKTEKIVKADETIANEQAMASKAIKDECDADLAGALPILESALAALD
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CCDS42 DM-RFLQSLHEYDKDNIPPAYMNIIRKNYIPNPDFVPEKIRNASTAAEGLCKWVIAMDSY
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CCDS42 DKVAKIVAPKKIKLAAAEGELKIAMDGLRKKQAALKEVQDKLARLQDTLELNKQKKADLE
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CCDS42 NQVDLCSKKLERAEQLIGGLGGEKTRWSHTALELGQLYINLTGDILISSGVVAYLGAFTS
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CCDS42 TYRQNQTKEWTTLCKGRDIPCSDDCSLMGTLGEAVTIRTWNIAGLPSDSFSIDNGIIIMN
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CCDS42 ARRWPLMIDPQSQANKWIKNMEKANSLYVIKLSEPDYVRTLENCIQFGTPVLLENVGEEL
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:: :::.:::::.:: :.: ..:::..: : :::.:::::: :::: :: :.:.::.::
CCDS42 DPILEPLLLKQTFKQGGSTCIRLGDSTIEYAPDFRFYITTKLRNPHYLPETSVKVTLLNF
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..: :..::::: :::.::::::: :. ::...:. ...::.:::.:: ::::::: .
CCDS42 MITPEGMQDQLLGIVVAQERPDLEEEKQALILQGAENKRQLKEIEDKILEVLSSSEGNIL
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CCDS42 EDETAIKILSSSKALANEISQKQEVAEETEKKIDTTRMGYRPIAIHSSILFFSLADLANI
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CCDS42 EPMYQYSLTWFINLFILSIENSEKSEILAKRLQILKDHFTYSLYVNVCRSLFEKDKLLFS
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CCDS42 FCLTINLLLHERAINKAEWRFLLTGG---IGLDNPYANLCTWLPQKSWDEICRLDDLPAF
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CCDS42 KTIRREFMRLKDGWKKVYDSLEPHHEVFPEEWEDKANEFQRMLIIRCLRPDKVIPMLQEF
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pF1KSD VATNLEPRFIEPQTANLSVVFKDSNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFS-KKLSA
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CCDS42 IINRLGRAFIEPPPFDLAKAFGDSNCCAPLIFVLSPGADPMAALLKFADDQGYGGSKLSS
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CCDS42 LSLGQGQGPIAMKMLEKAVKEGTWVVLQNCHLATSWMPTLEKVCEELSPESTHPDFRMWL
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pF1KSD TSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVRANLLKSY--SSLGE-DFLNSCHKVMEFKSLLL
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CCDS42 TSYPSPNFPVSVLQNGVKMTNEAPKGLRANIIRSYLMDPISDPEFFGSCKKPEEFKKLLY
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CCDS42 GLCFFHALVQERRKFGPLGWNIPYEFNETDLRISVQQLHMFLNQYEELPYEALRYMTGEC
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CCDS42 NYGGRVTDDWDRRTLRSILNKFFNPELVENSDYKFDSSGIYF-VPPSGDHKSYIEYTKTL
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pF1KSD PLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALLGTIIQLQPKSSSAGSQGREEIVEDVTQNILLK
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CCDS42 PLTPAPEIFGMNANADITKDQSETQLLFDNILLTQSRSAGAGAKSSDEVVNEVASDILGK
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CCDS46 EDEATAKVKAEETQAIADDAQRDLDEALPALDAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVM
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CCDS46 TVMEAISILLNAKPD--------------WPSAKQLLGD-SNFLKRLLEYDKENIKPQIL
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CCDS46 QVRWEESIQKFEEEISNITGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQSLIECWIQDCQSLEIPIDP
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CCDS46 SFSLINILGDPYEIRQWNTDGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKES
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