FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1410, 4265 aa
1>>>pF1KSDA1410 4265 - 4265 aa - 4265 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1672+/-0.000618; mu= 15.2764+/- 0.038
mean_var=158.6118+/-32.577, 0's: 0 Z-trim(110.5): 148 B-trim: 525 in 1/50
Lambda= 0.101837
statistics sampled from 18748 (18896) to 18748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 28.820
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016861619 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heav (4265) 28411 4189.0 0
NP_056327 (OMIM: 603332) dynein heavy chain 1, axo (4265) 28411 4189.0 0
XP_016861618 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heav (4288) 15621 2309.9 0
XP_016861622 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heav (3233) 12805 1896.1 0
XP_016861621 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heav (3376) 12805 1896.1 0
XP_016861620 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heav (4246) 12805 1896.2 0
XP_011544188 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3740) 10146 1505.5 0
XP_006721125 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (4070) 10146 1505.5 0
XP_011544184 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (4077) 10146 1505.5 0
XP_011544185 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (4077) 10146 1505.5 0
XP_016878921 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (4130) 10124 1502.3 0
XP_016878916 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3996) 10087 1496.8 0
NP_060009 (OMIM: 603334) dynein heavy chain 3, axo (4116) 9949 1476.5 0
XP_016861350 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3460) 9909 1470.6 0
XP_011531769 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3949) 9909 1470.7 0
XP_011531768 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3960) 9909 1470.7 0
NP_001278590 (OMIM: 603340) dynein heavy chain 12, (3964) 9844 1461.1 0
XP_011544190 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3211) 9825 1458.3 0
XP_011544191 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3211) 9825 1458.3 0
XP_016861349 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3816) 9271 1376.9 0
XP_011544187 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3771) 8956 1330.6 0
XP_016861351 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (2824) 8791 1306.3 0
XP_011531771 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3913) 7253 1080.4 0
XP_016878915 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (4032) 7025 1046.9 0
XP_011509799 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (2148) 6430 959.4 0
XP_016859993 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (3933) 6430 959.5 0
XP_011509791 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (3978) 6430 959.5 0
XP_011509790 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (3984) 6430 959.5 0
XP_011509789 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (4024) 6430 959.5 0
NP_061720 (OMIM: 610061) dynein heavy chain 7, axo (4024) 6430 959.5 0
XP_011509792 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (3949) 6390 953.7 0
XP_011531773 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3144) 6306 941.3 0
XP_016878919 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (2095) 6276 936.7 0
XP_016878917 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (3884) 5664 847.0 0
XP_011509796 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (2929) 5628 841.6 0
XP_011509795 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (2942) 5628 841.6 0
XP_011509794 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (2995) 5628 841.6 0
XP_011509793 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (3004) 5628 841.6 0
XP_011509797 (OMIM: 610061) PREDICTED: dynein heav (2812) 5616 839.9 0
XP_016878918 (OMIM: 603334) PREDICTED: dynein heav (2324) 4552 683.5 1.5e-194
XP_011531770 (OMIM: 603340) PREDICTED: dynein heav (3939) 4436 666.6 3.2e-189
XP_011512623 (OMIM: 603337) PREDICTED: dynein heav (4490) 4194 631.0 1.8e-178
XP_011512622 (OMIM: 603337) PREDICTED: dynein heav (4628) 4194 631.1 1.8e-178
XP_011512621 (OMIM: 603337) PREDICTED: dynein heav (4671) 4194 631.1 1.8e-178
XP_011512620 (OMIM: 603337) PREDICTED: dynein heav (4686) 4194 631.1 1.8e-178
NP_001193856 (OMIM: 603337) dynein heavy chain 8, (4707) 4194 631.1 1.8e-178
XP_016864677 (OMIM: 603335,608644) PREDICTED: dyne (2653) 4189 630.2 1.9e-178
XP_016864675 (OMIM: 603335,608644) PREDICTED: dyne (2874) 4189 630.2 2e-178
XP_016864674 (OMIM: 603335,608644) PREDICTED: dyne (3023) 4189 630.2 2.1e-178
XP_016864668 (OMIM: 603335,608644) PREDICTED: dyne (4295) 4189 630.3 2.8e-178
>>XP_016861619 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heavy ch (4265 aa)
initn: 28411 init1: 28411 opt: 28411 Z-score: 22554.4 bits: 4189.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 28411; 100.0% identity (100.0% similar) in 4265 aa overlap (1-4265:1-4265)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QNLLRQADLDKFTPRVGSFEVPEDFQERMEQQCIGSTTRLLAQTDFPLQAYEPKMQVPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNLLRQADLDKFTPRVGSFEVPEDFQERMEQQCIGSTTRLLAQTDFPLQAYEPKMQVPFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VLPGQHPRKIEIERRKQQYLSLDIEQLLFSQGIDSNKLMPRHLDHQHPQTIEQGHDPIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLPGQHPRKIEIERRKQQYLSLDIEQLLFSQGIDSNKLMPRHLDHQHPQTIEQGHDPIFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD IYLPLKVFDNEDFDCRTPREWINMGLEPGSLDRKPVPGKALLPTDDFLGHEDPKSQKLKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IYLPLKVFDNEDFDCRTPREWINMGLEPGSLDRKPVPGKALLPTDDFLGHEDPKSQKLKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KWCEVGVLDYDEEKKLYLVHKTDEKGLVRDEMGRPILNAGVTTEGRPPLQVCQYWVPRIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KWCEVGVLDYDEEKKLYLVHKTDEKGLVRDEMGRPILNAGVTTEGRPPLQVCQYWVPRIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLFCAEDPCMFAQRVVQANALRKNTEALLLYNLYVDCMPSDGQHVISEQSLSKIKQWALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLFCAEDPCMFAQRVVQANALRKNTEALLLYNLYVDCMPSDGQHVISEQSLSKIKQWALS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RGLVSVPKYHFWEQKEDFTFVSLLTRPEVITALSKVRAECNKVTAMSLFHSSLSKYSHLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGLVSVPKYHFWEQKEDFTFVSLLTRPEVITALSKVRAECNKVTAMSLFHSSLSKYSHLE
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550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELVKYMLQDTLRFLVQDSLASFSQFISDTCCSVLNCTDDMVWGDDLINSPYRPRKNPLFI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDLVLDSSGVHYSTPLEQFEASLLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
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XP_016 EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD DSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELREWMKGIPERLVGLEERIVKVMDDYQVMDEFLY
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XP_016 DSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELREWMKGIPERLVGLEERIVKVMDDYQVMDEFLY
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XP_016 NLSSDDFNDKWIASNWPSKILGQIELVQQQHVEDEEKFRKIQIMDQNNFQEKLEGLQLVV
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XP_016 QPYLDLWTTASDWLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVVEAFKTMHKCVKQFKDMPACQEV
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XP_016 ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
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XP_016 HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
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XP_016 IVMTQNMSFSPYKKPFEQRINSWENKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFSSEDINQQL
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XP_016 PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
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XP_016 KRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDLEITHMYSAEGE
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XP_016 CQTYWTMEVAEALEAGNLRSQLFPQLCQQLSDLVALVRGKLSRMQRAVLSALIVIEVHAK
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XP_016 DVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLT
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XP_016 DRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFF
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XP_016 KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
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XP_016 ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
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XP_016 SSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPSMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKL
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XP_016 FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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XP_016 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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pF1KSD EWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLT
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XP_016 EWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
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XP_016 EAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHFKAL
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KSD FVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIV
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XP_016 FVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIV
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XP_016 ELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMENEQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGI
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XP_016 SGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYCNIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNK
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XP_016 CALDY
>>NP_056327 (OMIM: 603332) dynein heavy chain 1, axonema (4265 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
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NP_056 TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
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pF1KSD EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISSLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLM
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pF1KSD ELVKYMLQDTLRFLVQDSLASFSQFISDTCCSVLNCTDDMVWGDDLINSPYRPRKNPLFI
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NP_056 ELVKYMLQDTLRFLVQDSLASFSQFISDTCCSVLNCTDDMVWGDDLINSPYRPRKNPLFI
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pF1KSD MDLVLDSSGVHYSTPLEQFEASLLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVG
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NP_056 MDLVLDSSGVHYSTPLEQFEASLLNLFDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPLLESVG
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pF1KSD LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
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NP_056 LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
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pF1KSD EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELREWMKGIPERLVGLEERIVKVMDDYQVMDEFLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 NLSSDDFNDKWIASNWPSKILGQIELVQQQHVEDEEKFRKIQIMDQNNFQEKLEGLQLVV
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NP_056 AGFSIHVEISRAHEIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFSLPITNYDKLSRMVKEF
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NP_056 QPYLDLWTTASDWLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVVEAFKTMHKCVKQFKDMPACQEV
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NP_056 ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
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NP_056 PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
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NP_056 EAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHFKAL
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NP_056 FVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIV
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NP_056 NALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYGMSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPIT
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NP_056 SVVFKDSNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFSKKLSAISLGQGQGPRAEAMMRSS
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NP_056 IERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLWLTSLPSNKFPVSILQNGSK
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NP_056 MTIEPPRGVRANLLKSYSSLGEDFLNSCHKVMEFKSLLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFN
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NP_056 IPYEFTDGDLRICISQLKMFLDEYDDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDDWDRRCIMNILED
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NP_056 FYNPDVLSPEHSYSASGIYHQIPPTYDLHGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQN
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NP_056 ETFALLGTIIQLQPKSSSAGSQGREEIVEDVTQNILLKVPEPINLQWVMAKYPVLYEESM
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pF1KSD NTVLVQEVIRYNRLLQVITQTLQDLLKALKGLVVMSSQLELMAASLYNNTVPELWSAKAY
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NP_056 NTVLVQEVIRYNRLLQVITQTLQDLLKALKGLVVMSSQLELMAASLYNNTVPELWSAKAY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PSLKPLSSWVMDLLQRLDFLQAWIQDGIPAVFWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKFVISID
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pF1KSD TISFDFKVMFEAPSELTQRPQVGCYIHGLFLEGARWDPEAFQLAESQPKELYTEMAVIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TISFDFKVMFEAPSELTQRPQVGCYIHGLFLEGARWDPEAFQLAESQPKELYTEMAVIWL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LPTPNRKAQDQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPTHQPQRHWIKRGVALI
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pF1KSD CALDY
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NP_056 CALDY
>>XP_016861618 (OMIM: 603332) PREDICTED: dynein heavy ch (4288 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 VLPGQHPRKIEIERRKQQYLSLDIEQLLFSQGIDSNKLMPRHLDHQHPQTIEQGHDPIFP
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XP_016 IYLPLKVFDNEDFDCRTPREWINMGLEPGSLDRKPVPGKALLPTDDFLGHEDPKSQKLKY
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XP_016 LLFCAEDPCMFAQRVVQANALRKNTEALLLYNLYVDCMPSDGQHVISEQSLSKIKQWALS
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XP_016 ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
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XP_016 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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XP_016 NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
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XP_016 FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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XP_016 FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
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XP_016 EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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XP_016 NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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pF1KSD ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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XP_016 ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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pF1KSD DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
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XP_016 DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
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pF1KSD FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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XP_016 FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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pF1KSD FNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCM
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XP_016 FNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCM
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pF1KSD EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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XP_016 EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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pF1KSD LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
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XP_016 LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
2590 2600 2610 2620 2630 2640
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pF1KSD MSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQ
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XP_016 MSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQ
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pF1KSD IVSTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCC
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XP_016 IVSTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCC
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pF1KSD TIDWFNEWPAEALKSVATVFLNEIPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELT
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XP_016 TIDWFNEWPAEALKSVATVFLNEIPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELT
2770 2780 2790 2800 2810 2820
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pF1KSD RHNYVTPKSYLELLHIFSILIGQKKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMH
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XP_016 RHNYVTPKSYLELLHIFSILIGQKKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMH
2830 2840 2850 2860 2870 2880
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pF1KSD PLLEEAAKDTMLTMEQIKVDTAIAEETRNSVQTEEIKANEKAKKAQAIADDAQKDLDEAL
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XP_016 PLLEEAAKDTMLTMEQIKVDTAIAEETRNSVQTEEIKANEKAKKAQAIADDAQKDLDEAL
2890 2900 2910 2920 2930 2940
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pF1KSD PALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKPGTKVDD
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XP_016 PALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKPGTKVDD
2950 2960 2970 2980 2990 3000
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pF1KSD YWEPGKGLLQDPGHFLESLFKFDKDNIGDVVIKAIQPYIDNEEFQPATIAKVSKACTSIC
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XP_016 YWEPGKGLLQDPGHFLESLFKFDKDNIGDVVIKAIQPYIDNEEFQPATIAKVSKACTSIC
3010 3020 3030 3040 3050 3060
3040 3050 3060 3070 3080 3090
pF1KSD QWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALLEAQDDLGVTQRILDEAKQRLREVEDGIATMQAKYRE
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XP_016 QWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALLEAQDDLGVTQRILDEAKQRLREVEDGIATMQAKYRE
3070 3080 3090 3100 3110 3120
3100 3110 3120 3130 3140 3150
pF1KSD CITKKEELELKCEQCEQRLGRAGKLINGLSDEKVRWQETVENLQYMLNNISGDVLVAAGF
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XP_016 CITKKEELELKCEQCEQRLGRAGKLINGLSDEKVRWQETVENLQYMLNNISGDVLVAAGF
3130 3140 3150 3160 3170 3180
3160 3170 3180 3190 3200 3210
pF1KSD VAYLGPFTGQYRTVLYDSWVKQLRSHNVPHTSEPTLIGTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLS
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XP_016 VAYLGPFTGQYRTVLYDSWVKQLRSHNVPHTSEPTLIGTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLS
3190 3200 3210 3220 3230 3240
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pF1KSD VENGVINQFSQRWTHFIDPQSQANKWIKNMEKDNGLDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPC
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XP_016 VENGVINQFSQRWTHFIDPQSQANKWIKNMEKDNGLDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPC
3250 3260 3270 3280 3290 3300
3280 3290 3300 3310 3320 3330
pF1KSD LLENVGEELDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYTPEI
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XP_016 LLENVGEELDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYTPEI
3310 3320 3330 3340 3350 3360
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pF1KSD STKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYR
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XP_016 STKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYR
3370 3380 3390 3400 3410 3420
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pF1KSD LSSSEGNPVDDMELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAIRTQILF
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XP_016 LSSSEGNPVDDMELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAIRTQILF
3430 3440 3450 3460 3470 3480
3460 3470 3480 3490 3500 3510
pF1KSD FCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRISNINRYLTYSLYSNVCRSL
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XP_016 FCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRISNINRYLTYSLYSNVCRSL
3490 3500 3510 3520 3530 3540
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XP_016 FEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKINQSEWRYLLSGGSISIMTENPAPDWLSDRAWRDILAL
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XP_016 SNLPTFSSFSSDFVKHLSEFRVIFDSLEPHREPLPGIWDQYLDQFQKLLVLRCLRGDKVT
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XP_016 NAMQDFVATNLEPRFIEPQTANLSVVFKDSNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFS
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XP_016 VIAVEIPTHQPQRHWIKRGVALICALDY
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XP_016 MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
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XP_016 TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
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XP_016 EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
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XP_016 ALDIRARIEEFKPYIPLIQGLRNPGMRIRHWETLSNQININVRPKANLTFARCLEMNLQD
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XP_016 HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
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XP_016 PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
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XP_016 DVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLT
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XP_016 DRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFF
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XP_016 KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
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XP_016 ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
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XP_016 SSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPSMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKL
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pF1KSD FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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XP_016 FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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pF1KSD VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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XP_016 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KSD EW-----------------------TDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIE
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XP_016 EWRRFRSLRLDQAQHLHQPYQPLPWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIE
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pF1KSD NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
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XP_016 NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2020 2030 2040 2050 2060 2070
pF1KSD FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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XP_016 FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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pF1KSD FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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pF1KSD EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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XP_016 EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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pF1KSD NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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XP_016 NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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pF1KSD ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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XP_016 ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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pF1KSD DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
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pF1KSD FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCM
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pF1KSD EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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XP_016 LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
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XP_016 HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
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XP_016 DVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLT
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XP_016 KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
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XP_016 ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
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XP_016 FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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XP_016 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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XP_016 EWRRFRSLRLDQAQHLHQPYQPLPWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIE
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XP_016 NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
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pF1KSD FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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pF1KSD FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
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XP_016 FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
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XP_016 EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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pF1KSD NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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XP_016 NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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XP_016 ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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XP_016 DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
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pF1KSD FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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XP_016 FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCM
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pF1KSD EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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XP_016 EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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pF1KSD LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
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pF1KSD MSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSEWRDDVKKVLLKAGLQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQ
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XP_016 IVSTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCC
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XP_016 TIDWFNEWPAEALKSVATVFLNEIPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELT
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XP_016 RHNYVTPKSYLELLHIFSILIGQKKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMH
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XP_016 STKLTLINFTLSPSPF
3370
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XP_016 MEQPNSKGYSLGRTPQGPECSSAPAVQVGTHRGLEYNPGKILPGSDYGLGNPPALDPKLP
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XP_016 HLPLPPAPPTLSDLGQPRKSPLTGTDKKYPLMKQRGFYSDILSPGTLDQLGEVCRGPRMS
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XP_016 TPRMRKGPSVLEHLSSLAREVSLDYERSMNKINFDHVVSSKPETFSYVTLPKKEEEQVPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHEPLVEELRATIASAVSKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDIASFLKTYQTQGLLAQEVR
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XP_016 EVVLTHLREKEILDSSLPSSIIIGPFYINTDNVKQSLSKKRKALATSVLDILAKNLHKEV
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XP_016 HIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWSTILFNVLPYKATDTYILKSPDEASQLLDDH
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XP_016 PVESKRYQTMERIWKKIMKNAYENREVINVCSDLRMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLET
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XP_016 DRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFF
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XP_016 KGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVF
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XP_016 ITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKL
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XP_016 FSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLML
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XP_016 VGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH
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pF1KSD EW-----------------------TDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIE
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XP_016 EWRRFRSLRLDQAQHLHQPYQPLPWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPVDAIWIE
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pF1KSD NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMP
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2020 2030 2040 2050 2060 2070
pF1KSD FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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XP_016 FIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMSLLKLLDC
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pF1KSD FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSHWLRLKMEN
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pF1KSD EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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XP_016 EQLTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSEDEEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVPDTNYC
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pF1KSD NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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XP_016 NIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIGPTGTGKTLTISDKLLKNLALDYISHFLTFS
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XP_016 ARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRI
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pF1KSD FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIAHFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWFDQLLKRCM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EQWEVTFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLK
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pF1KSD LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
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XP_016 LVLFMDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYG
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:::::.:..:::::: . : :: .. :::. :::. ::: .:. ::.::.::::: .
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:: .. ... . .. .:. : :. : ::.:: .:::: :.:: .::.. :.:
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